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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
02/07/2021 |
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Data da última atualização: |
02/07/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PAZ VENTERO, M.; CUADRAT, R. R. C.; VIDAL, I.; ANDRADE, B. G. N.; MOLINA-PARDINES, C.; HARI-MORENO, J. M.; COUTINHO, F. H.; MERINO, E.; REGITANO, L. C. de A.; SILVEIRA, C. B.; AFLI, H.; LÓPEZ-PÉREZ, M.; RODRÍGUEZ, J. C. |
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Afiliação: |
MARIA PAZ VENTERO, ISABIAL; RAFAEL R. C. CUADRAT, German Institute of Human Nutrition Potsdam-Rehbrücke; INMACULADA VIDAL, ISABIAL; BRUNO G. N. ANDRADE, Munster Technological University; CARMEN MOLINA-PARDINES, ISABIAL; JOSE M. HARO-MORENO, Universidad Miguel Hernández; FELIPE H. COUTINHO, Universidad Miguel Hernández; ESPERANZA MERINO, ISABIAL; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; CYNTHIA B. SILVEIRA, University of Miami; HAITHEM AFLI, Munster Technological University; MARIO LÓPEZ-PÉREZ, ISABIAL; JUAN CARLOS RODRÍGUEZ, ISABIAL. |
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Título: |
Nasopharyngeal microbial communities of patients infected with SARS-CoV-2 that developed COVID-19. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Microbiology, v.12, 637430, mar. 2021 |
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Páginas: |
10 p. |
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DOI: |
10.3389/fmicb.2021.637430 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: SARS-CoV-2 is an RNA virus causing COVID-19. The clinical characteristics and epidemiology of COVID-19 have been extensively investigated, however, only one study so far focused on the patient?s nasopharynx microbiota. In this study we investigated the nasopharynx microbial community of patients that developed different severity levels of COVID-19. We performed 16S ribosomal DNA sequencing from nasopharyngeal swab samples obtained from SARS-CoV-2 positive (56) and negative (18) patients in the province of Alicante (Spain) in their first visit to the hospital. Positive SARS-CoV-2 patients were observed and later categorized in mild (symptomatic without hospitalization), moderate (hospitalization), and severe (admission to ICU). We compared the microbiota diversity and OTU composition among severity groups and built bacterial co-abundance networks for each group. Results: Statistical analysis indicated differences in the nasopharyngeal microbiome of COVID19 patients. 62 OTUs were found exclusively in SARS-CoV-2 positive patients, mostly classified as members of the phylum Bacteroidota (18) and Firmicutes (25). OTUs classified as Prevotella were found to be significantly more abundant in patients that developed more severe COVID-19. Furthermore, co-abundance analysis indicated a loss of network complexity among samples from patients that later developed more severe symptoms. Conclusion: Our study shows that the nasopharyngeal microbiome of COVID-19 patients showed differences in the composition of specific OTUs and complexity of co-abundance networks. Taxa with differential abundances among groups could serve as biomarkers for COVID-19 severity. Nevertheless, further studies with larger sample sizes should be conducted to validate these results. MenosBackground: SARS-CoV-2 is an RNA virus causing COVID-19. The clinical characteristics and epidemiology of COVID-19 have been extensively investigated, however, only one study so far focused on the patient?s nasopharynx microbiota. In this study we investigated the nasopharynx microbial community of patients that developed different severity levels of COVID-19. We performed 16S ribosomal DNA sequencing from nasopharyngeal swab samples obtained from SARS-CoV-2 positive (56) and negative (18) patients in the province of Alicante (Spain) in their first visit to the hospital. Positive SARS-CoV-2 patients were observed and later categorized in mild (symptomatic without hospitalization), moderate (hospitalization), and severe (admission to ICU). We compared the microbiota diversity and OTU composition among severity groups and built bacterial co-abundance networks for each group. Results: Statistical analysis indicated differences in the nasopharyngeal microbiome of COVID19 patients. 62 OTUs were found exclusively in SARS-CoV-2 positive patients, mostly classified as members of the phylum Bacteroidota (18) and Firmicutes (25). OTUs classified as Prevotella were found to be significantly more abundant in patients that developed more severe COVID-19. Furthermore, co-abundance analysis indicated a loss of network complexity among samples from patients that later developed more severe symptoms. Conclusion: Our study shows that the nasopharyngeal microbiome of COVID-19 patients showed d... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Coronavirus; COVID 19; NGS next generation sequencing; SARS CoV 2. |
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Thesaurus Nal: |
Microbiome; Prevotella. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/224271/1/NasopharyngealMicrobialCommunities.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| Registros recuperados : 16 | |
| 4. |  | BELLOTE, A. F. J.; ROCHA, A. A.; DEDECEK, R. A. SILVA, H. D. da; MENEGOL, O.; GOMES, F. S. Concentração dos nutrientes N, K, Ca e Mg em Pinus taeda em função da idade das árvores e do material amostrado. SBPN - Scientific Journal, São Paulo, v. 6, p. 48-50, 2002. Edição dos Anais da 10ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Pesquisadores Nikkeis, São Paulo, 2002.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 5. | | DICKOW, K. M. C.; ROCHA, A. A.; MAREQUES, R.; HOFER, H.; SCHEUERMANN, L.; ROMBKE, J.; FORSTER, B.; SCHMIDT, P. Soil macrofauna contribution in decomposition processes of different plant species in the southern Mata Atlântica. In: INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON SOIL ZOOLOGY, 15; INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON APTERYGOTA, 12., 2008, Curitiba. Biodiversity, conservation and sustainabele management of soil animal: abstracts. Colombo: Embrapa Florestas. Editors: George Gardner Brown; Klaus Dieter Sautter; Renato Marques; Amarildo Pasini. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 6. | | AZÊVEDO, H. S. F. da S.; AZEVEDO, J. M. A. de; ROCHA, A. A. da; WADT, L. H. de O.; CAMPOS, T. de. Extrativismo do açaizeiro Euterpe precatoria Mart. no Acre. In: SIVIERO, A.; SANTOS, R. C. dos; MATTAR, E. P. L. (Org.). Conservação e tecnologias para o desenvolvimento agrícola e florestal no Acre. Rio Branco, AC: Ifac, 2019. Cap. 5, p. 147-172.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Rondônia. |
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| 7. | | ROCHA, A. A.; DECO, T. A. de; ALONSO, G. M. M.; BERBARA, R. L. L.; GUERRA, J. G. M.; SAGGIN JUNIOR, O. J.; ARAUJO, E. da S. Dupla inoculação de sementes de feijão-de-porco com rizóbios e fungos micorrízicos arbusculares. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 8. | | ROCHA, A. A.; SOUZA, F. H. de; SILVA, B. F. da; CAMPOS, D. V. B. de; POLIDORO, J. C.; ARAUJO, E. da S. Efeito residual de fertilizante organomineral obtido a partir de resíduos de suínos sobre o desempenho agronômico do feijão-caupi. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 9. | | GOULART, J. M.; ROCHA, A. A.; SILVA, B. F. da; ESPINDOLA, J. A. A.; GUERRA, J. G. M.; ARAUJO, E. da S. Desempenho da bata-doce em sucessão a diferentes tipos de cobertura vegetal. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 10. | | ROCHA, A. A.; ARAÚJO, S. N. de; COSTA, L. S.; GUERRA, J. G. M.; ESPINDOLA, J. A. A.; ARAUJO, E. da S. Efeito da adubação orgânica nitrogenada de diferentes fontes sobre o desempenho agronômico do Feijão-Vagem In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 15., 2015, Seropédica. Solo, Ciência e vida: caderno de resumos... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2015| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 11. | | SILVA, C. S. R. de A. da; SOUZA, D. G.; ROCHA, A. A.; GUERRA, J. G. M.; ESPINDOLA, J. A. A.; ARAUJO, E. da S. Produtividade do repolho em sistema de plantio direto sem uso de herbicida. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 17., 2017, Seropédica. Ciência e inovação transformando a sociedade. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 12. | | ROCHA, A. A.; SOUZA, D. G. de; SILVA, C. S. R de A.; GUERRA, J. G. M.; ESPINDOLA, J. A. A.; ARAUJO, E. da S. Volatilização de amônia a partir de diferentes adubos orgânicos em função do tempo após a aplicação no solo. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 17., 2017, Seropédica. Ciência e inovação transformando a sociedade. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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