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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
21/03/2014 |
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Data da última atualização: |
18/02/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; ROCHA, G. S.; DUARTE, D. A. S.; LOPES, P. S.; BRUSTOLIN, O. J. B.; THUS, S.; VIANA, J. M. S.; GUIMARÃES, S. E. F. |
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Afiliação: |
FABIANO FONSECA E SILVA, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; GILSON SILVÉRIO ROCHA, UVF; DARLENE ANA S. DUARTE, UFV; PAULO SÁVIO LOPES, UFV; OTÁVIO J. B. BRUSTOLIN, UFV; SANDER THUS, WAGENINGEN UNIVERSITY; JOSÉ MARCELO S. VIANA, UFV; SIMONE E. F. GUIMARÃES, UFV. |
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Título: |
Genomic growth curves of an outbred pig population. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, v. 36, n. 4, p. 520-527, 2013. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
In the current post-genomic era, the genetic basis of pig growth can be understood by assessing SNP marker effects and genomic breeding values (GEBV) based on estimates of these growth curve parameters as phenotypes. Although various statistical methods, such as random regression (RR-BLUP) and Bayesian LASSO (BL), have been applied to genomic selection (GS), none of these has yet been used in a growth curve approach. In this work, we compared the accuracies of RR-BLUP and BL using empirical weight-age data from an outbred F2 (Brazilian Piau X commercial) population. The phenotypes were determined by parameter estimates using a nonlinear logistic regression model and the halothane gene was considered as a marker for evaluating the assumptions of the GS methods in relation to the genetic variation explained by each locus. BL yielded more accurate values for all of the phenotypes evaluated and was used to estimate SNP effects and GEBV vectors. The latter allowed the construction of genomic growth curves, which showed substantial genetic discrimination among animals in the final growth phase. The SNP effect estimates allowed identification of the most relevant markers for each phenotype, the positions of which were coincident with reported QTL regions for growth traits. |
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Palavras-Chave: |
Melhoramento genético. |
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Thesagro: |
Curva de Crescimento; Porco. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/99868/1/2013-API-GenomicGrowth.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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| Registros recuperados : 13 | |
| 2. |  | MELO, C. L. P. de; CARNEIRO, J. E. de S.; CARNEIRO, P. C. S.; PEREIRA, A. C.; ROCHA, G. S. da; CRUZ, C. D. Avaliação de metodologia de escolha de populações segregantes de feijoeiro baseado em parâmetros genéticos e fenotípicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 1 CD ROM. Organizado por Romário Gava Ferrão, Frederico de Pina Matta, Maria Amélia Gava Ferrão, João Cândido de Souza, Adelaide de F. S. da Costa, Liliâm Maria Ventorim Ferrão.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 3. | | DUARTE, P. V. L.; ALMEIDA, L. B. de; SOUZA, A. R. M. de; BASTOS, D. C.; PEREIRA, M. C. T.; FERNANDES, M. B.; ROCHA, G. S. da. Análise das características físicas de lima ácida Tahiti provenientes de diferentes porta-enxertos. In: FÓRUM DE ENSINO, PESQUISA, EXTENSÃO E GESTÃO, 11., 2017, Montes Claro. Universidade, Políticas públicas e sociedade. Montes Claro: Unimontes, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 4. | | ROCHA, G. S. da; CARNEIRO, J. E. de S.; CARNEIRO, P. C. S.; MELO, C. L. P.; PEREIRA, A. C.; CINTRA, J. E. V. Avaliação preliminar de famílias de feijão do grupo carioca quanto a produtividade. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Melhoramento de plantas e agronegócio: anais. São Lourenço: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 5. | | FREITAS, A. S. de; ZAGATTO, L. F. G.; ROCHA, G. S.; MUCHALAK, F.; SILVA, S. dos S.; MUNIZ, A. W.; HANADA, R. E.; TSAI, S. M. Amazonian dark earths enhance the establishment of tree species in forest ecological restoration. Frontiers in Soil Science, v. 3, art. 1161627, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 6. | | NASCIMENTO, M.; ROCHA, G. S. da; PINTO, D. S.; BARROSO, L. M. A.; NASCIMENTO, A. C. C.; FERREIRA, R. de P.; SILVA, F. F. e. Correlação de Spearman aplicada ao estudo de adaptabilidade e estabilidade em genótipos de alfafa. Investigacion Agrária, v. 15, n. 2, p. 83-90, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 7. | | SILVA, F. F.; ROCHA, G. S.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PETERNELLI, L. A.; DUARTE, D. A. S.; AZEVEDO, C. Seleção genômica ampla para curvas de crescimento. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 65, n. 5, p. 1519-1526, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 8. | | RIEDER, A.; DORES, E. F. G. de C.; NUNES, V. da S.; OLIVEIRA, M. D. de; MOZETO, A. A.; MODRO, A. F. H.; SANTOS, J. L. dos; ROCHA, G. S. Classes de potencial de Periculosidade Ambiental (PPA) dos pesticidas receitados em Municípios do Pantanal Norte, Mato Grosso (MT), Brasil, no biênio 1999-2000. In: SIMPÓSIO SOBRE RECURSOS NATURAIS E SÓCIO-ECONÔMICOS DO PANTANAL, 4., 2004, Corumbá, MS. Sustentabilidade regional: anais. Corumbá: Embrapa Pantanal: UCDB: UFMS: SEBRAE-MS, 2004. (CD-ROM).| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 9. | | SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; ROCHA, G. S.; DUARTE, D. A. S.; LOPES, P. S.; BRUSTOLIN, O. J. B.; THUS, S.; VIANA, J. M. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Genomic growth curves of an outbred pig population. Genetics and Molecular Biology, v. 36, n. 4, p. 520-527, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 10. | | FREITAS, A. S. de; ROCHA, G. S.; ZAGATTO, F. G.; LARA, V. M. de; ALVES, L. de C. M.; MUCHALAK, F.; MARTINS, G. L.; MUNIZ, A. W.; SILVA, G. F. da; HANADA, R. E.; MUI, T. S. Impacts of successive cultivations in microbial diversity of Amazonian dark earths. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 32., 2023, Foz do Iguaçu. Resumos. São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2023. Resumo: 1159-1.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 11. | | MELO, C. L.; CARNEIRO, J. E. de S.; PEREIRA, A. C.; CARNEIRO, P. C. S.; CINTRA, J. E. V.; SILVA, L. C. da; ROCHA, G. S. da; BARROS, E. G. de. Seleçao assistida por meio de marcadores específicos de alelos de resistência a patógenos em populaçoes segregantes de feijoeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Melhoramento de plantas e agronegócio: anais. São Lourenço: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 12. | | PELLEGRINETTI, T. A.; SILVA, A. V. R. DA; CUNHA, I. C. M.; BOLETA, E. M.; ROCHA, G. S.; MAFRA, T. M. L.; MENDES, R.; TSAI, S. M.; MENDES, L. W. From susceptibility to resilience: uncovering the rhizosphere microbial contributions to drought tolerance in common bean. In: PLANT MICROBIOME SYMPOSIUM, 4., 2023, Quito. Abstracts... Quito, Equador: Universidad San Francisco de Quito, 2023. Ref. P-11. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 13. | | FREITAS, A. S. de; ZAGATTO, L. F. G.; ROCHA, G. S.; PELLEGRINETTI, T. A.; ALVES, L. de C. M.; LARA, V. M. de; MANDRO, J. A.; MARTINS, G. L.; MUNIZ, A. W.; HANADA, R. E.; ROESCH, L. F. W.; TSAI, S. M. Bacterial genomes recovered from litter’s metagenomes in Amazonian Dark Earths. Microbiology Resource Announcements, 2024. Online first.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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