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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
02/12/2020 |
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Data da última atualização: |
11/01/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PEREIRA, V. M.; FERREIRA FILHO, J. A.; LEAO, A. P.; VARGAS, L. H. G.; FARIAS, M. P. de; RIOS, S. de A.; CUNHA, R. N. V. da; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; SOUZA JUNIOR, M. T. |
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Afiliação: |
Valquíria Martins Pereira, Universidade Federal de Lavras; Jaire Alves Ferreira Filho, Universidade Federal de Lavras; ANDRE PEREIRA LEAO, CNPAE; Luiz Henrique Galli Vargas, Universidade Federal de Lavras; Marcelo Picanço de Farias, Universidade Federal de Lavras; SARA DE ALMEIDA RIOS, CNPMS; RAIMUNDO NONATO VIEIRA DA CUNHA, CPAA; EDUARDO FERNANDES FORMIGHIERI, CNPAE; ALEXANDRE ALONSO ALVES, CNPAE; MANOEL TEIXEIRA SOUZA JUNIOR, CNPAE. |
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Título: |
American oil palm from Brazil: Genetic diversity, population structure, and core collection. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Science, v. 60, p. 3212-3227, Nov./Dec. 2020. |
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Descrição Física: |
il. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1002/csc2.20276 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The American oil palm [Elaeis oleifera (Knuth) Cortés] has pronounced importance in oil palm breeding programs. Here, a germplasm bank (GB) of E. oleifera plants collected in the Amazon rainforest in Brazil was submitted to single nucleotide polymorphism (SNP) marker identification, selection, and use, aiming to characterize genetic diversity and population structure and to design a core collection (CC). Five hundred and fifty-three plants from 206 subsamples, collected at 19 localities spread throughout six geographic regions, were submitted to genotyping-by-sequencing analysis. A set of 1,827 high-quality SNP markers was then selected and used to run the genetic diversity and population structure analysis. The genetic diversity found is of moderate degree, and probably only a small portion of the species diversity is represented in the collection. The possible reason for that is the collecting strategy used, which collected subsamples only around the most prominent watercourses in the region. The average degree of genetic differentiation among subsamples is very high, indicating the presence of high interpopulation differentiation. The collection showed a low level of endogamy. The low average gene flow found indicates that genetic isolation caused by drift is occurring, and there is a need to review the conservation strategy. A set of 245 SNPs distributed throughout all 16 chromosomes was used to design CC based on maximizing the strategy of diversity. The optimal adjustment of the validated parameters, maintained while taking fewest subsamples, led to the choice of a model containing 20% of the entire collection as the ideal to form the CC. MenosThe American oil palm [Elaeis oleifera (Knuth) Cortés] has pronounced importance in oil palm breeding programs. Here, a germplasm bank (GB) of E. oleifera plants collected in the Amazon rainforest in Brazil was submitted to single nucleotide polymorphism (SNP) marker identification, selection, and use, aiming to characterize genetic diversity and population structure and to design a core collection (CC). Five hundred and fifty-three plants from 206 subsamples, collected at 19 localities spread throughout six geographic regions, were submitted to genotyping-by-sequencing analysis. A set of 1,827 high-quality SNP markers was then selected and used to run the genetic diversity and population structure analysis. The genetic diversity found is of moderate degree, and probably only a small portion of the species diversity is represented in the collection. The possible reason for that is the collecting strategy used, which collected subsamples only around the most prominent watercourses in the region. The average degree of genetic differentiation among subsamples is very high, indicating the presence of high interpopulation differentiation. The collection showed a low level of endogamy. The low average gene flow found indicates that genetic isolation caused by drift is occurring, and there is a need to review the conservation strategy. A set of 245 SNPs distributed throughout all 16 chromosomes was used to design CC based on maximizing the strategy of diversity. The optimal adjustm... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
American oil palm; Brazilian Elaeis oleifera; Diversidade genética. |
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Thesagro: |
Banco de Germoplasma; Dendê; Melhoramento Genético Vegetal; Óleo. |
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Thesaurus Nal: |
Breeding and Genetic Improvement; Genetic improvement. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/220143/1/American-oil-palm-2020.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/225602/1/American-oil.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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| Registros recuperados : 57 | |
| 41. |  | RIOS, S. de A.; PAES, M. C. D.; KARAM, D.; BOREM, A.; PIRES, C. H. de P.; MATIAS, J. P.; LOPES, C. de O. Efeito da aplicação de herbicidas no teor de carotenóides em milho verde. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 26.; CONGRESO DE LA ASOCIACIÓN LATINO-AMERICANA DE MALEZAS, 18., 2008, Ouro Preto. Trabalhos apresentados. Sete Lagoas: SBCPD: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 42. | | RIOS, S. de A.; PAES, M. C. D.; KARAM, D.; BOREM, A.; PIRES, C. H. de P.; MATIAS, J. P.; LOPES, C. de O. Efeito da aplicação de herbicidas no teor de carotenóides em milho verde. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 26.; CONGRESO DE LA ASOCIACIÓN LATINO-AMERICANA DE MALEZAS, 18., 2008, Ouro Preto. Resumos... Sete Lagoas: SBCPD: Embrapa Milho e Sorgo, 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 43. | | CARDOSO, W. S.; PAES, M. C. D.; GALVÃO, J. C. C.; RIOS, S. de A.; GUIMARAES, P. E. de O.; SCHAFFERT, R. E.; BORÉM, A. Variabilidade de genótipos de milho quanto à composição de carotenoídes nos grãos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 44, n. 2, p. 164-173, fev. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 44. | | PEREIRA, V. M.; FILHO, J. A. F.; LEAO, A. P.; FORMIGHIERI, E. F.; SOUZA JUNIOR, M. T.; RIOS, S. de A.; ALVES, A. A. Molecular characterization and genetic structure of american oil palm (Elaeis oleifera) based on genome-wide SNP markers. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. p. 122-124.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 45. | | PEREIRA, V. M.; FILHO, J. A. F.; LEAO, A. P.; FORMIGHIERI, E. F.; SOUZA JUNIOR, M. T.; RIOS, S. de A.; ALVES, A. A. Molecular characterization and genetic structure of american oil palm (Elaeis oleifera) based on genome-wide SNP markers. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. p. 122-124| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 47. | | PEREIRA, V. M.; FERREIRA FILHO, J. A.; LEAO, A. P.; VARGAS, L. H. G.; FARIAS, M. P. de; RIOS, S. de A.; CUNHA, R. N. V. da; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; SOUZA JUNIOR, M. T. American oil palm from Brazil: Genetic diversity, population structure, and core collection. Crop Science, v. 60, p. 3212-3227, Nov./Dec. 2020. il.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 48. | | RIOS, S. de A.; CUNHA, R. N. V. da; LOPES, R.; BARCELOS, E.; KRUG, C.; BITTENCOURT, D. M. de C.; RODRIGUES, M. do R. L.; LIMA, W. A. A. de; QUEIROZ, A. C. Diversidade genética em germoplasma de palma de óleo (Elaeis guineensis). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 3167-3170.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 49. | | MAGALHAES, P. C.; BORGHI, E.; KARAM, D.; PEREIRA FILHO, I. A.; RIOS, S. de A.; ABREU, S. C.; LANDAU, E. C.; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M.; DURAES, F. O. M. Desenvolvimento do milho segunda safra: fatores genético-fisiológicos, plataforma de conhecimento e práticas de manejo de cultivo e uso, visando sustentabilidade de produção e produtividade no binômio soja/milho. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2020. 42 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Documentos, 258).| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 50. | | CUNHA, R. N. V. da; LOPES, R.; ROCHA, R. N. C. da; LIMA, W. A. A. de; TEIXEIRA, P. C.; BARCELOS, E.; RODRIGUES, M. do R. L.; RIOS, S. de A. Domestication and breeding of the American oil palm. In: BORÉM, A.; LOPES, M. T. G.; CLEMENT, C. R.; NODA, H. (Ed.). Domestication and breeding: amazonian species. Viçosa: Universidade Federal de Viçosa, 2012. p. 275-296.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 51. | | DURAES, F. O. M.; MENEZES, C. B. de; RODRIGUES, J. A. S.; PARRELLA, R. A. da C.; SCHAFFERT, R. E.; TARDIN, F. D.; QUEIROZ, V. A. V.; RIOS, S. de A. Sorghum in Brazil: market perspectives for uses in food, feed, and biomass for soil conditioning and bioenergy. In: SORGHUM IN THE 21st CENTURY, Cape Town, 2018. Food, feed and fuel in a rapidly changing world: abstracts. Cape Town: [s.n], 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 52. | | PEREIRA, V. M.; LEAO, A. P.; VARGAS, L. H.; FARIAS, M. P. de; FORMIGHERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T.; RIOS, S. de A.; ALVES, A. A. Extensão e organização da diversidade genética da coleção brasileira de germoplasma de Elaeis oleifera. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE BIOENERGIA, 8., 2013, São Paulo, SP. Anais... São Paulo: CIPA, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 53. | | PEREIRA, V. M.; LEAO, A. P.; VARGAS, L. H.; FARIAS, M. P. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T.; RIOS, S. de A.; ALVES, A. A. Extensão e organização da diversidade genética da coleção brasileira de germoplasma de Elaeis oleifera. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE BIOENERGIA, 8., 2013, São Paulo, SP. Anais... São Paulo: CIPA, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 55. | | RIOS, S. de A.; DIAS, M. S. C.; CORDEIRO, Z. J. M.; SOUZA, W. M. de; SILVA, J. J. C.; BARBOSA, J. A. A.; PINHO, R. S. C. de; ABREU, S. C.; SANTOS, L. O. Sistema de pré-aviso para controle de Sigatoka-amarela no norte de Minas Gerais. Biotemas, v. 26, n. 3, p. 109-115, set. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 56. | | RIOS, S. de A.; CUNHA, R. N. V. da; LOPES, R.; BARCELOS, E.; LIMA, W. A. A. de; RODRIGUES, M. do R. L.; KRUG, C.; BITTENCOURT, D. M. de C.; QUISEN, R. C.; GOMES JUNIOR, R. A.; ROCHA, R. N. C. da. Caiaué. In: LOPES, R.; OLIVEIRA, M. do S. P. de; CAVALLARI, M. M.; BARBIERI, R. L.; CONCEIÇÃO, L. D. H. C. S. da. (Ed.). Palmeiras nativas do Brasil. Brasília, DF: Embrapa, 2015. p. 211-245.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 57. | | KRUG, C.; BITTENCOURT, D. M. de C.; BARCELOS, E.; RODRIGUES, M. do R. L.; ANGELO, P. C. da S.; ROCHA, R. N. C. da; CUNHA, R. N. V. da; QUISEN, R. C.; LOPES, R.; RIOS, S. de A.; LIMA, W. A. A. de. Plano estratégico da Embrapa Amazônia Ocidental para a cultura do dendezeiro. Manaus: Embrapa Amazônia Ocidental, 2013. 73 p. (Embrapa Amazônia Ocidental. Documentos, 102).| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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