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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
28/12/2016 |
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Data da última atualização: |
03/01/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F.; VIANA, J. M. S.; VALENTE, M. S. F.; RESENDE JUNIOR, M. F. R.; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
C. F. Azevedo, Departamento de Estatística, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; F. F. Silva, Departamento de Zootecnia, Universidade Federal de Viçosa; J. M. S. Viana, Departamento de Biologia Geral, Universidade Federal de Viçosa; M. S. F. Valente, Departamento de Biologia Geral, Universidade Federal de Viçosa; M. F. R. Resende Junior, RAPID Genomics, Florida; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
New accuracy estimators for genomic selection with application in a cassava (Manihot esculenta) breeding program. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 4, gmr.15048838, Oct. 2016. |
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DOI: |
10.4238/gmr.15048838 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
ABSTRACT. Genomic selection is the main force driving applied breeding programs and accuracy is the main measure for evaluating its efficiency. The traditional estimator (TE) of experimental accuracy is not fully adequate. This study proposes and evaluates the performance and efficiency of two new accuracy estimators, called regularized estimator (RE) and hybrid estimator (HE), which were applied to a practical cassava breeding program and also to simulated data. The simulation study considered two individual narrow sense heritability levels and two genetic architectures for traits. TE, RE, and HE were compared under four validation procedures: without validation (WV), independent validation, ten-fold validation through jacknife allowing different markers, and with the same markers selected in each cycle. RE presented accuracies closer to the parametric ones and less biased and more precise ones than TE. HE proved to be very effective in the WV procedure. The estimators were applied to five traits evaluated in a cassava experiment, including 358 clones genotyped for 390 SNPs. Accuracies ranged from 0.67 to 1.12 with TE and from 0.22 to 0.51 with RE. These results indicated that TE overestimated the accuracy and led to one accuracy estimate (1.12) higher than one, which is outside of the parameter space. Use of RE turned the accuracy into the parameter space. Cassava breeding programs can be more realistically implemented using the new estimators proposed in this study, providing less risky practical inferences. MenosABSTRACT. Genomic selection is the main force driving applied breeding programs and accuracy is the main measure for evaluating its efficiency. The traditional estimator (TE) of experimental accuracy is not fully adequate. This study proposes and evaluates the performance and efficiency of two new accuracy estimators, called regularized estimator (RE) and hybrid estimator (HE), which were applied to a practical cassava breeding program and also to simulated data. The simulation study considered two individual narrow sense heritability levels and two genetic architectures for traits. TE, RE, and HE were compared under four validation procedures: without validation (WV), independent validation, ten-fold validation through jacknife allowing different markers, and with the same markers selected in each cycle. RE presented accuracies closer to the parametric ones and less biased and more precise ones than TE. HE proved to be very effective in the WV procedure. The estimators were applied to five traits evaluated in a cassava experiment, including 358 clones genotyped for 390 SNPs. Accuracies ranged from 0.67 to 1.12 with TE and from 0.22 to 0.51 with RE. These results indicated that TE overestimated the accuracy and led to one accuracy estimate (1.12) higher than one, which is outside of the parameter space. Use of RE turned the accuracy into the parameter space. Cassava breeding programs can be more realistically implemented using the new estimators proposed in this study, provi... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Accuracy estimator; Cross-validation; Genomic prediction; Mnadioca; Seleção genômica. |
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Thesagro: |
Mandioca; Manihot esculenta; Melhoramento vegetal. |
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Thesaurus Nal: |
Cassava; Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/161813/1/2016-M.Deon-GMR-NewAccuracy.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
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Registro |
Volume |
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URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
22/01/2014 |
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Data da última atualização: |
30/01/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
CARVALHO, H. W. L. de; RANGEL, M. A. S.; SANTOS, V. da S.; PINHO, J. L. N. de; SILVA, A. D. A. da; MENEZES, V. M. M. |
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Afiliação: |
HELIO WILSON LEMOS DE CARVALHO, CPATC; MARCO ANTONIO SEDREZ RANGEL, CNPMF; VANDERLEI DA SILVA SANTOS, CNPMF; JOÃO LICÍNIO NUNES DE PINHO, CENTEC, RN; ALMIR DIAS ALVES DA SILVA, Instituto Agronômico de Pernambuco; VANESSA MARISA MIRANDA MENEZES. |
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Título: |
Adaptabilidade e estabilidade de cultivares de mandioca (Manihot esculenta Crantz) para o rendimento de raízes e amido no Nordeste Brasileiro: safra 2010/2011. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MANDIOCA, 15., 2013, Salvador. Inovação e sustentabilidade: da raiz ao amido: trabalhos apresentados. Salvador: CBM: Embrapa, 2013. 1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Tendo em vista que qualquer programa de melhoramento fundamenta-se na seleção de genótipos superiores, a introdução de genótipos, seguida de avaliação e seleção, elevam as chances de se efetuar uma recomendação segura, além de constituir-se em um método de melhoramento menos oneroso (FUKUDA, 1999). Vidigal Filho et al. (2000) obtiveram aumentos significativos com a introdução e avaliação de novas cultivares, em diversas localidades do Estado do Paraná. Carvalho et al. (2009) obtiveram aumentos expressivos de raízes tuberosas em relação à média regional, em ensaios realizados no Estado de Sergipe, na safra 2005/2006, atingindo patamares de 50 ton/ha com as cultivares BRS Poti Branca, BRS Jarina e Lagoão.
Desta forma, desenvolveu-se o presente trabalho visando verificar a performance produtiva de diversas cultivares de mandioca, em diferentes épocas de colheita, para fins de recomendação daquelas superiores para a produção de farinha e fécula. |
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Thesagro: |
Mandioca. |
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Thesaurus NAL: |
Cassava. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 01768naa a2200205 a 4500
001 1977132
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520 $aTendo em vista que qualquer programa de melhoramento fundamenta-se na seleção de genótipos superiores, a introdução de genótipos, seguida de avaliação e seleção, elevam as chances de se efetuar uma recomendação segura, além de constituir-se em um método de melhoramento menos oneroso (FUKUDA, 1999). Vidigal Filho et al. (2000) obtiveram aumentos significativos com a introdução e avaliação de novas cultivares, em diversas localidades do Estado do Paraná. Carvalho et al. (2009) obtiveram aumentos expressivos de raízes tuberosas em relação à média regional, em ensaios realizados no Estado de Sergipe, na safra 2005/2006, atingindo patamares de 50 ton/ha com as cultivares BRS Poti Branca, BRS Jarina e Lagoão. Desta forma, desenvolveu-se o presente trabalho visando verificar a performance produtiva de diversas cultivares de mandioca, em diferentes épocas de colheita, para fins de recomendação daquelas superiores para a produção de farinha e fécula.
650 $aCassava
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773 $tIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE MANDIOCA, 15., 2013, Salvador. Inovação e sustentabilidade: da raiz ao amido: trabalhos apresentados. Salvador: CBM: Embrapa, 2013. 1 CD-ROM.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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