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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
17/09/2020 |
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Data da última atualização: |
16/12/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
NERY, F. M. B.; MELO, F. L.; BOITEUX, L. S.; RIBEIRO, S. da G.; RESENDE, R. O.; ORÍLIO, A. F.; BATISTA, J. G.; LIMA, M. F.; PEREIRA-CARVALHO, R. C. |
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Afiliação: |
FLÁVIA M. B. NERY, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; FERNANDO L. MELO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; LEONARDO SILVA BOITEUX, CNPH; SIMONE DA GRACA RIBEIRO, Cenargen; RENATO O. RESENDE, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ANELISE F. ORÍLIO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; JOSIANE G. BATISTA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; MIRTES FREITAS LIMA, CNPH; RITA C. PEREIRA-CARVALHO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
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Título: |
Molecular characterization of Hovenia Dulcis-associated virus 1 (HDaV1) and 2 (HDaV2): new tentative species within the Order Picornavirales. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Viruses, v. 12, n. 9, 950, 2020 |
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DOI: |
https://doi.org/10.3390/v12090950 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
In a systematic field survey for plant-infecting viruses, leaf tissues were collected from trees showing virus-like symptoms in Brazil. After viral enrichment, total RNA was extracted and sequenced using the MiSeq platform (Illumina). Two nearly full-length picorna-like genomes of 9534 and 8158 nucleotides were found associated with Hovenia dulcis (Rhamnaceae family). Based upon their genomic information, specific primers were synthetized and used in RT-PCR assays to identify plants hosting the viral sequences. The larger contig was tentatively named as Hovenia dulcis-associated virus 1 (HDaV1), and it exhibited low nucleotide and amino acid identities with Picornavirales species. The smaller contig was related to insect-associated members of the Dicistroviridae family but exhibited a distinct genome organization with three non-overlapping open reading frames (ORFs), and it was tentatively named as Hovenia dulcis-associated virus 2 (HDaV2). Phylogenetic analysis using the amino acid sequence of RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) revealed that HDaV1 and HDaV2 clustered in distinct groups, and both viruses were tentatively assigned as new members of the order Picornavirales. HDaV2 was assigned as a novel species in the Dicistroviridae family. The 50 ends of both viruses are incomplete. In addition, a nucleotide composition analysis (NCA) revealed that HDaV1 and HDaV2 have similarities with invertebrate-infecting viruses, suggesting that the primary host(s) of these novel virus species remains to be discovered. MenosIn a systematic field survey for plant-infecting viruses, leaf tissues were collected from trees showing virus-like symptoms in Brazil. After viral enrichment, total RNA was extracted and sequenced using the MiSeq platform (Illumina). Two nearly full-length picorna-like genomes of 9534 and 8158 nucleotides were found associated with Hovenia dulcis (Rhamnaceae family). Based upon their genomic information, specific primers were synthetized and used in RT-PCR assays to identify plants hosting the viral sequences. The larger contig was tentatively named as Hovenia dulcis-associated virus 1 (HDaV1), and it exhibited low nucleotide and amino acid identities with Picornavirales species. The smaller contig was related to insect-associated members of the Dicistroviridae family but exhibited a distinct genome organization with three non-overlapping open reading frames (ORFs), and it was tentatively named as Hovenia dulcis-associated virus 2 (HDaV2). Phylogenetic analysis using the amino acid sequence of RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) revealed that HDaV1 and HDaV2 clustered in distinct groups, and both viruses were tentatively assigned as new members of the order Picornavirales. HDaV2 was assigned as a novel species in the Dicistroviridae family. The 50 ends of both viruses are incomplete. In addition, a nucleotide composition analysis (NCA) revealed that HDaV1 and HDaV2 have similarities with invertebrate-infecting viruses, suggesting that the primary host(s) of these novel viru... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
HDaV1; HDaV2; Virome. |
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Thesagro: |
Hovenia Dulcis. |
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Thesaurus Nal: |
Metagenomics; Picornavirales; Viruses. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/219297/1/ARTIGO-MolecularCharacterizationHoveniaDulcis.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Hortaliças (CNPH) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
19/01/2011 |
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Data da última atualização: |
14/03/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SANT'ANA, J. A. do V.; COELHO, E. F.; CONCEIÇÃO, B. S.; SANTOS, C. da C.; FARIA, M. A. de; COTRIM, C. E. |
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Afiliação: |
José Antonio do Vale Sant'ana, UFLA; EUGENIO FERREIRA COELHO, CNPMF; Beatriz Santos Conceição, UFRB; Carmem da Cruz Santos, UFRB; Manoel Alves de Faria, UFLA; Carlos Elísio Cotrim, EAFAJT. |
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Título: |
Sistema radicular de bananeira irrigada por aspersão convencional em duas fases fenológicas. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
pdf 2071 |
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Conteúdo: |
A informação da distância e profundidade das zonas de atuação do sistema radicular permite definir a área na superfície do solo onde deve ser feita a adubação de modo que o fertilizante aplicado seja eficientemente utilizado pela cultura. De acordo com Santos et al. (2005), o conhecimento da área onde ocorre a maior atividade do sistema radicular das culturas é importante para estudos de fornecimento de nutrientes via solo, uma vez que a absorção de água e de nutrientes ocorre simultaneamente. As raízes finas têm curto período de vida (menos que um ano) e são as principais responsáveis pela absorção de água e nutrientes pelas plantas (RYLTER, 1997). No atual estado da arte, nota-se que há poucos estudos referentes ao sistema radicular correlacionado com as fases fenológicas da cultura. O presente estudo teve como objetivo avaliar a distribuição do sistema radicular da bananeira cv. Prata Anã irrigada por aspersão convencional em duas fases fenológicas. |
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Thesagro: |
Adubação; Banana; Irrigação; Nutriente; Solo. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/36262/1/ID27209pdf2071.pdf
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Marc: |
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520 $aA informação da distância e profundidade das zonas de atuação do sistema radicular permite definir a área na superfície do solo onde deve ser feita a adubação de modo que o fertilizante aplicado seja eficientemente utilizado pela cultura. De acordo com Santos et al. (2005), o conhecimento da área onde ocorre a maior atividade do sistema radicular das culturas é importante para estudos de fornecimento de nutrientes via solo, uma vez que a absorção de água e de nutrientes ocorre simultaneamente. As raízes finas têm curto período de vida (menos que um ano) e são as principais responsáveis pela absorção de água e nutrientes pelas plantas (RYLTER, 1997). No atual estado da arte, nota-se que há poucos estudos referentes ao sistema radicular correlacionado com as fases fenológicas da cultura. O presente estudo teve como objetivo avaliar a distribuição do sistema radicular da bananeira cv. Prata Anã irrigada por aspersão convencional em duas fases fenológicas.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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