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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
Data corrente: |
18/10/2019 |
Data da última atualização: |
18/10/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
PORTO, B. N.; CAIXETA, E. T.; MATHIONI, S. M.; VIDIGAL, P. M. P.; ZAMBOLIM, L.; ZAMBOLIM, E. M.; DONOFRIO, N.; POLSON, S. W.; MAIA, T. A.; CHEN, C.; ADETUNJI, M.; KINGHAM, B.; DALIO, R. J. D.; RESENDE, M. L. V. de. |
Afiliação: |
Brenda Neves Porto, Universidade Federal de Lavras - UFLA. Progama de Pós-graduação em Biotecnologia Vegetal; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCa; Sandra Marisa Mathioni, Universidade Federal de Lavras - UFLA/Departamento de Fitopatologia; Pedro Marcus Pereira Vidigal, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Núcleo de Análises de Biomoléculas; Laércio Zambolim, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Fitopatologia; Eunize Maciel Zambolim, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Fitopatologia; Nicole Donofrio, University of Delaware/Department of Plant and Soil Sciences; Shawn W. Polson, Delaware Biotechnology Institute/Center for Bioinformatics and Computational Biology; Thiago Andrade Maia, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Fitopatologia; Chuming Chen, Delaware Biotechnology Institute/Center for Bioinformatics and Computational Biology; Modupe Adetunji, Delaware Biotechnology Institute/Center for Bioinformatics and Computational Biology; Brewster Kingham, University of Delaware, Newark/Delaware Biotechnology Institute/Sequencing and Genotyping Center; Ronaldo José Durigan Dalio, Instituto Agronoˆmico de Campinas - IAC/Centro de Citricultura “Sylvio Moreira”; Mário Lúcio Vilela de Resende, Departamento de Fitopatologia, Universidade Federal de Lavras. |
Título: |
Genome sequencing and transcript analysis of Hemileia vastatrix reveal expression dynamics of candidate effectors dependent on host compatibility. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
PLOSONE, April 18, 2019. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Coffee leaf rust caused by the fungus Hemileia vastatrix is one of the most important leaf diseases of coffee plantations worldwide. Current knowledge of the H. vastatrix genome is limited and only a small fraction of the total fungal secretome has been identified. In order to obtain a more comprehensive understanding of its secretome, we aimed to sequence and assemble the entire H. vastatrix genome using two next-generation sequencing platforms and a hybrid assembly strategy. This resulted in a 547 Mb genome of H. vastatrix race XXXIII (Hv33), with 13,364 predicted genes that encode 13,034 putative proteins with transcriptomic support. Based on this proteome, 615 proteins contain putative secretion peptides, and lack transmembrane domains. From this putative secretome, 111 proteins were identified as candidate effectors (EHv33) unique to H. vastatrix, and a subset consisting of 17 EHv33 genes was selected for a temporal gene expression analysis during infection. Five genes were significantly induced early during an incompatible interaction, indicating their potential role as pre-haustorial effectors possibly recognized by the resistant coffee genotype. Another nine genes were significantly induced after haustorium formation in the compatible interaction. Overall, we suggest that this fungus is able to selectively mount its survival strategy with effectors that depend on the host genotype involved in the infection process. |
Thesagro: |
Ferrugem; Fungo; Hemileia Vastatrix. |
Thesaurus Nal: |
Genome; Infection; Leaf rust. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/203101/1/Genome-sequencing-and-transcript.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Registros recuperados : 19 | |
1. | | RESENDE, M. L. V. de; ARAUJO, J. C. A. de; BEZERRA, J. L.; FRAGA, L. S. Anel vermelho: principal problema fitossanitário do dendezeiro na Bahia. Fitopatologia Brasileira, v. 11, n. 2, p. 314, jun. 1986. Suplemento. Edição dos resumos das palestras e trabalhos apresentados no 19º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 1986, Brasília, DF. Resumo 68.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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6. | | PEREIRA, R. B.; ALVES, E.; RIBEIRO JÚNIOR, P. M.; RESENDE, M. L. V. de; LUCAS, G. C.; FERREIRA, J. B. Extrato de casca de café, óleo essencial de tomilho e acibenzolar-S-metil no manejo da cercosporiose-do-cafeeiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 10, p. 1287-1296, out. 2008. Título em inglês: Coffee berry husk extract, thyme essential oil and acibenzolar-S-methyl in the control of brown eye spot of coffee tree.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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7. | | GADAGA, S. J. C.; ABREU, M. S. de; RESENDE, M. L. V. de; RIBEIRO JUNIOR, P. M. Phosphites for the control of anthracnose in common bean. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 52, n. 1, p. 36-44, jan. 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Unidades Centrais. |
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8. | | CAVALCANTI, F. R.; RESENDE, M. L. V. de; PEREIRA, R. B.; COSTA, J. de C. do B.; CARVALHO, C. P. da S. Atividades de quitinase e beta-1,3-glucanase após eliciação das defesas do tomateiro contra a mancha-bacteriana. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 41, n. 12, p. 1721-1730, dez. 2006 Título em inglês: Chitinase and beta-1,3-glucanase activities after the elicitation of tomato defenses against bacterial spot.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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9. | | ISHIDA, A. K. N.; COSTA, R. C. da; MIRANDA, V. S.; BONFIM, K.; OLIVEIRA, L. C. de; RIBEIRO JÚNIOR, P. M.; RESENDE, M. L. V. de. Indução de resistência no controle da mancha bacteriana do maracujazeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE DEFENSIVOS AGRÍCOLAS NATURAIS, 6., 2013, João Pessoa. Anais... João Pessoa: UEPB: Embrapa, 2013. p. 134.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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10. | | TAVARES, G. M.; LARANJEIRA, D.; LUZ, E. D. M. N.; SILVA, T. R.; PIROVANI, C. P.; RESENDE, M. L. V. de; RIBEIRO JÚNIOR, P. M. Indução de resistência do mamoeiro à podridão radicular por indutores bióticos e abióticos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 44, n. 11, p. 1416-1423, nov. 2009. Título em inglês: Resistance induction to root rot in papaya by biotic and abiotic elicitors.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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11. | | PORTO, B. N.; CAIXETA, E. T.; VIDIGAL, P. M. P.; LELIS, D. T.; ZAMBOLIM, E. M.; RESENDE, M. L. V. de. Predição do secretoma de Hemileia vastatrix RAÇA XXXIII. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRSIL, 9., 2015, Curitiba. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2015.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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14. | | PEREIRA, V. F.; RESENDE, M. L. V. de; RIBEIRO JÚNIOR, P. M.; REGINA, M. de A.; MOTA, R. V. da; VITORINO, L. R. R. Fosfito de potássio no controle do míldio da videira e características físico-químicas de uva Merlot. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 11, p. 1581-1588, nov. 2012. Título em inglês: Potassium phosphite on the control of downy mildew of grapevine and physicochemical characteristics of Merlot grapes.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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15. | | ISHIDA, A. K. N.; SOUZA, R. M. de; RESENDE, M. L. V. de; ZACARONI, A. B.; VILAS BÔAS, C. H.; SOUZA, J. T. de. Rizobactérias no controle da mancha angular do algodoeiro. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 32, n. 1, p. 149-156, jan./fev. 2008. Título em inglês: Rhizobacteria to control cotton bacterial blight.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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16. | | PEREIRA, V. F.; RESENDE, M. L. V. de; MONTEIRO, A. C. A.; RIBEIRO JÚNIOR, P. M.; REGINA, M. de A.; MEDEIROS, F. C. L. Produtos alternativos na proteção da videira contra o míldio. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 45, n. 1, p. 25-31, jan. 2010. Titulo em inglês: Alternative products for the protection of vine against downy mildew.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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17. | | MONTEIRO, A. C. A.; RESENDE, M. L. V. de; VALENTE, T. C. T.; RIBEIRO JUNIOR, P. M.; PEREIRA, V. F.; COSTA, J. R. da; SILVA, J. A. G. da. Manganese phosphite in Coffee defence against Hemileia vastatrix, the coffee rust fungus: biochemical and molecular analyses. Journal of Phytopathology, v. 164, p. 1043-1053, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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18. | | PORTO, B. N.; CAIXETA, E. T.; MATHIONI, S. M.; VIDIGAL, P. M. P.; ZAMBOLIM, L.; ZAMBOLIM, E. M.; DONOFRIO, N.; POLSON, S. W.; MAIA, T. A.; CHEN, C.; ADETUNJI, M.; KINGHAM, B.; DALIO, R. J. D.; RESENDE, M. L. V. de. Genome sequencing and transcript analysis of Hemileia vastatrix reveal expression dynamics of candidate effectors dependent on host compatibility. PLOSONE, April 18, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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19. | | ARIYOSHI, C.; SANT'ANA, G. C.; FELICIO, M. S.; SERA, G. H.; NOGUEIRA, L. M.; RODRIGUES, L. M. R.; FERREIRA, R. V.; SILVA, B. S. R. da; RESENDE, M. L. V. de; DESTÉFANO, S. A. L.; DOMINGUES, D. S.; PEREIRA, L. F. P. Genome-wide association study for resistance to Pseudomonas syringae pv. garcae in Coffea arabica. Frontiers in Plant Science, v. 13, article 989847, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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