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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
16/10/2023 |
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Data da última atualização: |
19/10/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
LEONI, G.; BUZANSKAS, M. E.; MARCONDES, C. R.; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P.; BERNARDES, P. A. |
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Afiliação: |
GABRIELA LEONI, Universidade Federal de Santa Catarina; MARCOS ELI BUZANSKAS, Universidade Federal da Paraíba; CINTIA RIGHETTI MARCONDES, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; DANÍSIO PRADO MUNARI, Universidade Estadual Paulista; PRISCILA ARRIGUCCI BERNARDES, University Institute for Future Farming System. |
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Título: |
Imputação utilizando painéis personalizados em bovinos da raça Canchim. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 15., 2023, Jataí. O reinado dos fenótipos: novos desafios. Anais.... Jataí: SBMA, 2023. |
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Páginas: |
p. 120-122. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Uma alternativa para reduzir o custo da aplicação da seleção genômica é a realização da imputação dos genótipos. No entanto, para raças em que a população é pequena, há indisponibilidade de grande quantidade de animais genotipados com alta densidade, como observado para raça Canchim. A utilização de raças fundadoras pode colaborar com a imputação, porém algumas vezes resulta em baixa acurácia. Assim, o objetivo deste estudo foi comparar a acurácia de imputação de painéis comerciais com painéis personalizados de baixa densidade imputados para um painel de alta densidade em bovinos da raça Canchim, utilizando população referência formada por animais da raça Nelore. Foram utilizados 400 animais Nelore na população referência e 396 animais Canchim e do grupo genético MA na população de imputação. Os painéis comerciais de baixa densidade considerados continham 20 mil e 50 mil SNPs (polimorfismos de nucleotídeo único) e 3 tipos de personalizações foram aplicadas com o objetivo de obter as mesmas densidades dos painéis comerciais, formando assim 8 diferentes cenários. A acurácia de imputação apresentou valores superiores nos painéis personalizados quando comparados com os comerciais e também, conforme a densidade dos painéis eram maiores, as acurácias tiveram seu valor aumentado. Houve pequena diferença entre a primeira forma de personalizar o painel comparado com a segunda e terceira, indicando que a maneira como o painel é construído interfere nas acurácias de imputação. |
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Palavras-Chave: |
Bovino de corte; Genômica; Marcadores moleculares. |
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Thesagro: |
Gado Canchim. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1157271/1/ImputacaoUtilizandoPaineis.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Registro |
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Status |
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| Registros recuperados : 630 | |
| 8. |  | REGITANO, L. C. de A. Quantificação em espectrofotômetro. In: REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M.; IBELLI, A. M. G.; GOUVEIA, J. J. de S. Protocolos em biologia molecular aplicada à produção animal. São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2007. p. 12-13.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 10. | | REGITANO, L. C. de A. Regras de segurança em laboratórios. In: REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M.; IBELLI, A. M. G.; GOUVEIA, J. J. de S. Protocolos em biologia molecular aplicada à produção animal. São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2007. p. 1-2.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 17. | | GOUVEIA, J. J. de S.; REGITANO, L. C. de A. Extração de DNA. In: REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M.; IBELLI, A. M. G.; GOUVEIA, J. J. de S. Protocolos em biologia molecular aplicada à produção animal. São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2007. p. 3-8.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| Registros recuperados : 630 | |
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