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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
20/12/2018 |
Data da última atualização: |
05/02/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A. |
Afiliação: |
PRISCILA SILVA NEUBERN DE OLIVEIRA, Bolsista/Embrapa Pecuária Sudeste; LUIZ L. COUTINHO, USP; POLYANA C. TIZIOTO, NGS Genomic Solutions; ALINE S. M. CESAR, USP; GABRIELLA B. DE OLIVEIRA, USP; WELLISON J. DA S. DINIZ, UFSCar; ANDRESSA O. DE LIMA, UFSCar; JAMES M. REECY, Iowa State University; GERSON B. MOURÃO, USP; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Título: |
An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 8, p. 1-12, 2018. |
DOI: |
10.1038/s41598-018-35315-5 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Article number: 17072. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana C. A. Regitano. |
Conteúdo: |
Residual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21, bta-miR 29, btamiR-30b, bta-miR-106b, bta-miR-199a-3p, bta-miR-204, and bta-miR 296 may have a potential role in variation of RFI. Functional enrichment analysis of differentially expressed (DE) miRNA?s target genes and miRNA?mRNA correlated modules revealed that insulin, lipid, immune system, oxidative stress and muscle development signaling pathways might potentially be involved in RFI in this population. Our study identified DE miRNAs, miRNA - mRNA regulatory networks and hub miRNAs related to RFI. These findings suggest a possible role of miRNAs in regulation of RFI, providing new insights into the potential molecular mechanisms that control feed efficiency in Nelore cattle. |
Palavras-Chave: |
MicroRNAs; Residual Feed Intake. |
Thesagro: |
Gado Nelore. |
Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Nellore; Skeletal muscle. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/189126/1/AP-Integrative-Adhemar-etal.pdf
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Marc: |
LEADER 02518naa a2200337 a 4500 001 2102149 005 2019-02-05 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1038/s41598-018-35315-5$2DOI 100 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. de 245 $aAn integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle.$h[electronic resource] 260 $c2018 500 $aArticle number: 17072. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana C. A. Regitano. 520 $aResidual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21, bta-miR 29, btamiR-30b, bta-miR-106b, bta-miR-199a-3p, bta-miR-204, and bta-miR 296 may have a potential role in variation of RFI. Functional enrichment analysis of differentially expressed (DE) miRNA?s target genes and miRNA?mRNA correlated modules revealed that insulin, lipid, immune system, oxidative stress and muscle development signaling pathways might potentially be involved in RFI in this population. Our study identified DE miRNAs, miRNA - mRNA regulatory networks and hub miRNAs related to RFI. These findings suggest a possible role of miRNAs in regulation of RFI, providing new insights into the potential molecular mechanisms that control feed efficiency in Nelore cattle. 650 $aBeef cattle 650 $aNellore 650 $aSkeletal muscle 650 $aGado Nelore 653 $aMicroRNAs 653 $aResidual Feed Intake 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aTIZIOTO, P. C. 700 1 $aCESAR, A. S. M. 700 1 $aOLIVEIRA, G. B. de 700 1 $aDINIZ, W, J. da S. 700 1 $aLIMA, A. O. de 700 1 $aREECY, J. M. 700 1 $aMOURÃO, G. B. 700 1 $aZERLOTINI NETO, A. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 773 $tScientific Reports$gv. 8, p. 1-12, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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21. | | ANDRADE, B. G. N.; DONATONI, F. A. B.; CUADRAT, R. R.; CARDOSO, T. F.; MALHEIROS, J. M.; OLIVEIRA, P. S. N. DE; PETRINI, J.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REECY, J. M.; KOLTES, J. E.; ZERLOTINI NETO, A.; MEDEIROS, S. R. de; BERNDT, A.; PALHARES, J. C. P.; AFLI, H.; REGITANO, L. C. de A. Stool and ruminal microbiome components associated with methane emission and feed efficiency in Nelore beef cattle. Frontiers in Genetics, v. 13, 812828, may, 2022. 12 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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22. | | TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; DECKER, J. E.; GROMBONI, C. F.; MUDADU, M. de A.; SCHNABEL, R. D.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; NASSU, R. T.; DONATONI, F. A. B.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; REECY, J. M.; NOGUEIRA, A. R. de A.; REGITANO, L. C. de A. Effects of quantitative trait loci on iron content of bovine longissimus dorsi muscle. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: American Society of Animal Science, 2014. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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23. | | CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; MOURÃO, G. B.; TULLIO, R. R.; LANNA, D. P. D.; NASSU, R. T.; MUDADU, M. de A.; OLIVEIRA, P. S. N.; NASCIMENTO, M. L. do; CHAVES, A. S.; ALENCAR, M. M. de; SONSTEGRAD, T. S.; GARRICK, D. J.; REECY, J. M.; COUTINHO, L. L. Genome-wide association study for intramuscular fat deposition and composition in Nellore cattle. BMC Genetics, v. 15, p. 39, 2014Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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24. | | OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A. An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Scientific Reports, v. 8, p. 1-12, 2018. Article number: 17072. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana C. A. Regitano.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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25. | | OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A. An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Scientific Reports, v. 8, n. 17072, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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26. | | OLIVEIRA, P. S. N.; CESAR, A. S. M.; NASCIMENTO, M. L. do; CHAVES, A. S.; TIZIOTO, P. C.; TULLIO, R. R.; LANNA, D. P. D.; ROSA, A. do N.; SONSTEGARD, T. S.; MOURÃO, G. B.; REECY, J. M.; GARRICK, D. J.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Identification of genomic regions associated with feed efficiency in Nelore cattle. BMC Genetics, v. 15, n. 1, 2014 10 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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27. | | CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; REECY, J. M.; POLETI, M. D.; OLIVEIRA, P. S. N. de; OLIVEIRA, G. B. de; MOREIRA, G. C. M.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. L.; KOLTES, J. E.; Fritz-Waters, E.; KRAMER, L.; GARRICK, D.; BEIKI, H.; GEISTLINGER, L.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L. Identification of putative regulatory regions and transcription factors associated with intramuscular fat content traits. BMC Genomics, v. 19, p. 1-20, 2018. Article number: 499. Na publicação: Luciana C. A. Regitano, Maurício A. Mudadu, Adhemar Zerlotini.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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28. | | OLIVEIRA, P. S. N.; CESAR, A. S. M.; NASCIMENTO, M. L. do; SOUZA, M. M.; TULLIO, R. R.; LANNA, D. P.; SONSTEGARD, T.; MOURÃO, G. B.; REECY, J. M.; GARRICK, D. J.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L. Positional candidate genes for residual intake and gain in Nelore beef cattle. In:WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOK PRODUCTION, 10; . 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: American Society of animal Science, 2014Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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29. | | LIMA, A. O.; MALHEIROS, J. M.; AFONSO, J.; PETRINI, J.; COUTINHO, L. L.; DINIZ, W. J. da S.; DONATONI, F. A. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; RIBEIRO, J. A. S.; OLIVEIRA, K. S. de; ROCHA, M. I. P.; ANDRADE, B. G. N.; FUKUMASU, H.; BEIKI, H.; REECY, J. M.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURAO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. Prune homolog 2 with BCH domain (PRUNE2) gene expression is associated with feed efficiency related traits in Nelore steers. Mammalian Genome, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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30. | | DECKER, J. E.; MCKAY, S. D.; ROLF, M. M.; ALCALA, A. M.; SONSTEGARD, T. S.; HANOTTE, O.; GOTHERSTROM, A.; SEABURY, C. M.; PRAHARANI, L.; BABAR, M. E.; REGITANO, L. C. de A.; YILDIZ, M. A.; HEATON, M. P.; LIU, W. S.; LEI, C. Z.; REECY, J. M.; SAIF-UR-REHMAN, M.; SCHNABEL, R. D.; TAYLOR, J. F. Worldwide patterns of ancestry, divergence, and admixture in domesticated cattle. Plos Genetics, v. 10, n. 3, e1004254, 2014. 14 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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31. | | TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; DECKER, J. E.; GROMBONI, C. F.; MUDADU, M. de A.; SCHNABEL, R. D.; COUTINHO, L. L.; MOURAO, G. B.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M.; REECY, J. M.; NASSU, R. T.; DONATONI, F. A. B.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; NOGUEIRA, A. R. de A.; REGITANO, L. C. de A. Detection of quantitative trait loci for mineral content of Nelore longissimus dorsi muscle. Genetics Selection Evolution, v. 47, n. 15, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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32. | | ALMEIDA, V. V.; SILVA, J. P. M.; SCHINCKEL, A. P.; MEIRA, A. N.; MOREIRA, G. C. M.; GOMES, J. D.; POLETI, M. D.; DARGELIO, M. D. B.; PATINHO, I.; CONTRERAS-CASTILLO, C. J.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REECY, J. M.; KOLTES, D.; SERÃO, N. V. L.; REGITANO, L. C. de A.; FUKUMASU, H.; BRUSTOLINI, A. P. L.; ALENCAR, S. M.; LUCHIARI FILHO, A.; CESAR, A. S. M. Effects of increasing dietary oil inclusion from different sources on growth performance, carcass and meat quality traits, and fatty acid profile in genetically lean immunocastrated male pigs. Livestock Science, v.248, jun. 2021, 104515. 10 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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