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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
24/07/2019 |
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Data da última atualização: |
09/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. da S.; SOUZA, M. de S.; ANDRADE, B. G.; KOLTES, J. E.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REECY, J. M.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
PRISCILA S. N. DE OLIVEIRA, CPPSE; LUIZ L. COUTINHO, Esalq/USP; ALINE S. M. CESAR, Esalq/USP; WELLISON J. DA SILVA DINIZ, UFSCar; MARCELA M. DE SOUZA, Iowa State University; BRUNO G. ANDRADE, CPPSE; JAMES E. KOLTES, Iowa State University; GERSON B. MOURÃO, Esalq/USP; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; JAMES M. REECY, Iowa State University; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Co-expression networks reveal potential regulatory roles of miRNAs in fatty acid composition of nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Genetics, v. 10, p. 1-14, July 2019. |
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DOI: |
10.3389/fgene.2019.00651 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Article 651. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana C.A. Regitano. |
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Conteúdo: |
Fatty acid (FA) content affects the sensorial and nutritional value of meat and plays a significant role in biological processes such as adipogenesis and immune response. It is well known that, in beef, the main FAs associated with these biological processes are oleic acid (C18:1 cis9, OA) and conjugated linoleic acid (CLA-c9t11), which may have beneficial effects on metabolic diseases such as type 2 diabetes and obesity. Here, we performed differential expression and co-expression analyses, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) and partial correlation with information theory (PCIT), to uncover the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in skeletal muscle associated with FA content. miRNA and mRNA expression data were obtained from skeletal muscle of Nelore cattle that had extreme genomic breeding values for OA and CLA. Insulin and MAPK signaling pathways were identified by WGCNA as central pathways associated with both of these fatty acids. Co-expression network analysis identified bta-miR-33a/b, bta-miR-100, bta-miR-204, bta-miR-365-5p, btamiR-660, bta-miR-411a, bta-miR-136, bta-miR-30-5p, bta-miR-146b, bta-let-7a-5p, bta-let-7f, bta-let-7, bta-miR 339, bta-miR-10b, bta-miR 486, and the genes ACTA1 and ALDOA as potential regulators of fatty acid synthesis. This study provides evidence and insights into the molecular mechanisms and potential target genes involved in fatty acid content differences in Nelore beef cattle, revealing new candidate pathways of phenotype modulation that could positively benefit beef production and human consumption. MenosFatty acid (FA) content affects the sensorial and nutritional value of meat and plays a significant role in biological processes such as adipogenesis and immune response. It is well known that, in beef, the main FAs associated with these biological processes are oleic acid (C18:1 cis9, OA) and conjugated linoleic acid (CLA-c9t11), which may have beneficial effects on metabolic diseases such as type 2 diabetes and obesity. Here, we performed differential expression and co-expression analyses, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) and partial correlation with information theory (PCIT), to uncover the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in skeletal muscle associated with FA content. miRNA and mRNA expression data were obtained from skeletal muscle of Nelore cattle that had extreme genomic breeding values for OA and CLA. Insulin and MAPK signaling pathways were identified by WGCNA as central pathways associated with both of these fatty acids. Co-expression network analysis identified bta-miR-33a/b, bta-miR-100, bta-miR-204, bta-miR-365-5p, btamiR-660, bta-miR-411a, bta-miR-136, bta-miR-30-5p, bta-miR-146b, bta-let-7a-5p, bta-let-7f, bta-let-7, bta-miR 339, bta-miR-10b, bta-miR 486, and the genes ACTA1 and ALDOA as potential regulators of fatty acid synthesis. This study provides evidence and insights into the molecular mechanisms and potential target genes involved in fatty acid content differences in Nelore beef cattle, revealing new candidate... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Ácido linoleico conjugado; Ácido oleico; Ácidos graxos; Genômica; Integrative genomics; MiRNA; MRNA; Redes de co-expressão. |
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Thesagro: |
Bos Indicus; Gado de Corte. |
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Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Conjugated linoleic acid; Oleic acid. |
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Categoria do assunto: |
--
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/199817/1/AP-Coexpression-networks.pdf
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Marc: |
LEADER 02877naa a2200421 a 4500
001 2110872
005 2020-01-09
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520 $aFatty acid (FA) content affects the sensorial and nutritional value of meat and plays a significant role in biological processes such as adipogenesis and immune response. It is well known that, in beef, the main FAs associated with these biological processes are oleic acid (C18:1 cis9, OA) and conjugated linoleic acid (CLA-c9t11), which may have beneficial effects on metabolic diseases such as type 2 diabetes and obesity. Here, we performed differential expression and co-expression analyses, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) and partial correlation with information theory (PCIT), to uncover the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in skeletal muscle associated with FA content. miRNA and mRNA expression data were obtained from skeletal muscle of Nelore cattle that had extreme genomic breeding values for OA and CLA. Insulin and MAPK signaling pathways were identified by WGCNA as central pathways associated with both of these fatty acids. Co-expression network analysis identified bta-miR-33a/b, bta-miR-100, bta-miR-204, bta-miR-365-5p, btamiR-660, bta-miR-411a, bta-miR-136, bta-miR-30-5p, bta-miR-146b, bta-let-7a-5p, bta-let-7f, bta-let-7, bta-miR 339, bta-miR-10b, bta-miR 486, and the genes ACTA1 and ALDOA as potential regulators of fatty acid synthesis. This study provides evidence and insights into the molecular mechanisms and potential target genes involved in fatty acid content differences in Nelore beef cattle, revealing new candidate pathways of phenotype modulation that could positively benefit beef production and human consumption.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| Registros recuperados : 124 | |
| 82. |  | MORAIS, S. L. de; TRENTIN, G.; VOLK, L. B. da S.; TRINDADE, J. P. P.; SILVEIRA, M. C. T. da; LEMOS, J. M.; JASKULSKI, G. F. Conteúdo de água da parte área de Paspalum notatum, Paspalum pauciciliatum e Paspalum dilatatum submetidos a diferentes condições hídricas. In: JORNADA DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA, 11.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 11.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA JÚNIOR, 9., 2013, Sant'Ana do Livramento. Anais... Bagé: Ediurcamp, 2013. 1 pen drive. CONGREGA 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 83. | | ROSSETTO, J.; FARIA, B. M.; GENRO, T. C. M.; TRINDADE, J. P. P.; SILVA, M. A. P. da; SANTOS, A. G. M. dos; MELLO, G. L. Comportamento ingestivo de novilhos de corte mantidos em pastagem nativa manejada com diferentes graus de intensificação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 24., 2014, Vitória. A zootecnia fazendo o Brasil crescer: anais... Vitória: Universidade Federal do Espírito Santo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 84. | | GOULART, C. G.; BOAVISTA, L. da R.; QUADROS, F. L. F. de; TRINDADE, J. P. P.; BORBA, M. F. S.; SOARES, L. S. U. Dinâmica vegetacional campestre sob adubação e pastejo. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE AGROPECUÁRIA SUSTENTÁVEL, 4,; CONGRESSO INTERNACIONAL DE AGROPECUÁRIA SUSTENTÁVEL, 1., 2012, Porto Alegre. A sustentabilidade dentro de sistemas associativistas de produção: anais de resumos expandidos. Porto Alegre: UFRGS, 2012. p. 471-474. IV SIMBRAS. Disponível online.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 85. | | NUNES, G. D.; TRINDADE, J. P. P.; BORBA, M. F. S.; BOAVISTA, L. DA R.; GOULART, C. G.; VIDART, R. D. Diagnóstico do sistema de produção da pecuária familiar realizado no municÍpio de Pinheiro Machado pertencente ao território do Alto Camaquã. In: JORNADA DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA, 8.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 8.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA JÚNIOR, 6.; MINICURSOS, 2010, Bagé. Educação e sustentabilidade: anais. Bagé: LEB, 2010. Título da capa: Anais CONGREGA URCAMP 2010. Código 97. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 86. | | SOARES, L. S. U.; BOAVISTA, L. da R.; QUADROS, F. L. F. de; TRINDADE, J. P. P.; BORBA, M. F. S.; SANTOS, A. B. dos. Dinâmica florística de uma pastagem natural submetida a diferentes adubações e manejo do pastoreio na Região do Alto Camaquã In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE AGROPECUÁRIA SUSTENTÁVEL, 4,; CONGRESSO INTERNACIONAL DE AGROPECUÁRIA SUSTENTÁVEL, 1., 2012, Porto Alegre. A sustentabilidade dentro de sistemas associativistas de produção: anais de resumos expandidos. Porto Alegre: UFRGS, 2012. IV SIMBRAS. Disponível online.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 88. | | SOARES, A. B.; CARVALHO, P. C. de F.; NABINGER, C.; TRINDADE, J. P. P.; DA TRINDADE, J. K.; MEZZALIRA, J. C. Dinâmica da composição botânica numa pastagem natural sob efeito de diferentes ofertas de forragem. Ciência Rural, Santa Maria, v. 41, n. 8, p. 1459-1465, ago. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
|  |
| 90. | | VIDART, R. D.; BORBA, M. F. S.; TRINDADE, J. P. P.; BOAVISTA, L. DA R.; GOULART, C. G.; NUNES, G. D. Metodologia do triplo emparelhamento utilizada nas unidades experimentais participativas (UEPAS) dentro do território Alto Camaquã. In: JORNADA DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA, 8.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 8.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA JÚNIOR, 6.; MINICURSOS, 2010, Bagé. Educação e sustentabilidade: anais. Bagé: LEB, 2010. Título da capa: Anais CONGREGA URCAMP 2010. Código 98. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 92. | | SOARES, T. R.; DUTRA, J. G.; JASKULSKI, G. F.; LEMOS, J. M.; TRINDADE, J. P. P.; VOLK, L. B. da S.; TRENTIN, G. Variação da temperatura do solo em diferentes estruturas de vegetação do campo nativo. In: SALÃO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 3., 2013, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2013. p. 16.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 93. | | LEMOS, J. M.; TRENTIN, G.; VOLK, L. B. da S.; SILVEIRA, M. C. T. da; TRINDADE, J. P. P.; MORAIS, S. L.; KOPP, M. M.; JASKULSKI, G. F. Evapotranspiração de Paspalum notatum e Paspalum pauciciliatum submetidas a diferentes estresses hídricos. In: JORNADA DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA, 11.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 11.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA JÚNIOR, 9., 2013, Sant'Ana do Livramento. Anais... Bagé: Ediurcamp, 2013. 1 pen drive. CONGREGA 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 94. | | VIDART, R. D.; NUNES, G. D.; GOULART, C. G.; PINHEIRO, C. L.; FREITAS, R. P. de; TRINDADE, J. P. P.; BORBA, M. F. S. Estratégias de ação desenvolvidas pelo Laboratório em Estudo de Agroecologia e Recursos Naturais (LABECO). Revista Congrega Urcamp, Bagé, v. 7, n. 7, p. 26, out. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 95. | | SANTOS, A. B. dos; BOAVISTA, L. da R.; STURZA, V. S.; QUADROS, F. L. F. de; TRINDADE, J. P. P.; BORBA, M. F. S. Espécies indesejáveis em área de pastagem natural do bioma Pampa na região da Campanha do Rio Grande do Sul. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE AGROPECUÁRIA SUSTENTÁVEL, 4,; CONGRESSO INTERNACIONAL DE AGROPECUÁRIA SUSTENTÁVEL, 1., 2012, Porto Alegre. A sustentabilidade dentro de sistemas associativistas de produção: anais de resumos expandidos. Porto Alegre: UFRGS, 2012. IV SIMBRAS. Disponível online.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 96. | | GOULART, C. G.; BOAVISTA, L. da R.; VIDART, R. D.; NUNES, G. D.; TRINDADE, J. P. P.; BORBA, M. F. S. Estudo fitossociológico em área de vegetação campestre na região do Alto Camaquã. In: ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO UFPEL, 13., 2011, Pelotas, RS. Anais... Pelotas: UFPEL, 2011. Organizado por: Márcio Nunes Corrêa, Valmor João Bianchi, Jacira Bolacell Braga e Valdecir Carlos Ferri.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 97. | | SEIBERT, L.; GOULART, C. G.; BOAVISTA, L. da R.; QUADROS, F. L. F. de; TRINDADE, J. P. P.; PINHEIRO, C. L.; JASKULSKI, G. F.; DUTRA, G. M. Estudo fitossociológico de espécies nativas do bioma Pampa no período de primavera na região do Alto Camaquã. In: CONGRESSO DE ECOLOGIA DO BRASIL, 11.; CONGRESSO INTERNACIONAL DE ECOLOGIA, 1., 2013, Porto Seguro. Biodiversidade e sustentabilidade: anais. São Paulo: SEB, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 98. | | SEVERO, P. de O.; QUADROS, F. L. F. de; BOAVISTA, L. da R.; DUTRA, G. M.; TRINDADE, J. P. P.; NUNES, G. D. Fitossociologia e índices de diversidade de pastagens naturais da região do Alto Camaquã, RS. In: JORNADA ACADÊMICA INTEGRADA, 26., 2011, Santa Maria. Anais... Santa Maria: UFSM, 2011. JAI.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 99. | | GOULART, C. G.; SEIBERT, L.; BOAVISTA, L. da R.; QUADROS, F. L. F. de; TRINDADE, J. P. P.; PINHEIRO, C. L.; JASKULSKI, G. F.; DUTRA, G. M. Fitossociologia de espécies nativas no período de verão no território do Alto Camaquã URS. In: CONGRESSO DE ECOLOGIA DO BRASIL, 11.; CONGRESSO INTERNACIONAL DE ECOLOGIA, 1., 2013, Porto Seguro. Biodiversidade e sustentabilidade: anais. São Paulo: SEB, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 100. | | MARQUES, A. C. R.; OLIVEIRA, L. B. de; QUADROS, F. L. F. de; JACQUES, R. J. S.; TRINDADE, J. P. P.; VOLK, L. B. da S. The effects of phosphorous fertilization on the mycorrhizal colonization of native forage grasses in the Pampa biome. Revista Brasileira de Tecnologia Agropecuária, Frederico Westphalen, v. 1, n. 1, p. 58-64, jul. 2017.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
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