| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
|
Data corrente: |
11/08/2014 |
|
Data da última atualização: |
25/05/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
RAPOSO, R. S.; SOUZA, I. G. B.; VELOSO, M. E. da C.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; DINIZ, F. M. |
|
Afiliação: |
R.S. Raposo, Universidade Federal do Ceara, Núcleo de Biologia Experimental.; I.G.B. Souza, Universidade Federal do Piauí.; MARCOS EMANUEL DA COSTA VELOSO, CPAMN; ADILSON KENJI KOBAYASHI, CNPAE; BRUNO GALVEAS LAVIOLA, CNPAE; FABIO MENDONCA DINIZ, CPAMN. |
|
Título: |
Development of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala. |
|
Ano de publicação: |
2014 |
|
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 3, p. 6099-6106, Aug. 2014. |
|
DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/2014.August.7.25 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
The last few years have seen a significant increase in the number of large-scale sequencing projects generating whole genome databases. These sequence databases can be surveyed (genome sequence survey) for tandem repeats as an alternative means to develop microsatellites for monitoring and selecting natural populations and cultivars of Jatropha curcas. A total of 100 tandem repeats were revealed from mining 368 genomic surveyed sequences available in the Kazusa DNA Research Institute database. Twenty microsatellite sequences were successfully amplified, resulting in repeatable and scorable polymerase chain reaction products. Genotyping of J. curcas accessions from the Guatemalan population revealed 18 polymorphic loci. The average number of alleles per locus was 6.9, and allelic sizes ranged from 94 to 299 bp. Expected and observed heterozygosities ranged from 0.118 to 0.906 and from 0.082 to 0.794, respectively. Polymorphic information content values ranged from 0.114 (JcSSR-34) to 0.886 (JcSSR-33) with an average of 0.627. Analysis with Micro-Checker indicated few null alleles for locus JcSSR-37 in Guatemalan populations, which may be a possible cause of its deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, even after Bonferroni?s correction. No loci showed significant linkage disequilibrium. These microsatellite loci are expected to be valuable molecular markers in J. curcas because they show high levels of polymorphism and heterozygosity. |
|
Palavras-Chave: |
Biofuel; Energy crop; Genetic diversity; Microsatellites; Microssatélite; Physic nut. |
|
Thesagro: |
Biocombustível; Cultura energética; Euphorbiaceae; Pinhão de purga; Planta oleaginosa. |
|
Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/125432/1/ArtigoMarcosFabioGMR2014.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02543naa a2200325 a 4500
001 2017730
005 2022-05-25
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.4238/2014.August.7.25$2DOI
100 1 $aRAPOSO, R. S.
245 $aDevelopment of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala.$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aThe last few years have seen a significant increase in the number of large-scale sequencing projects generating whole genome databases. These sequence databases can be surveyed (genome sequence survey) for tandem repeats as an alternative means to develop microsatellites for monitoring and selecting natural populations and cultivars of Jatropha curcas. A total of 100 tandem repeats were revealed from mining 368 genomic surveyed sequences available in the Kazusa DNA Research Institute database. Twenty microsatellite sequences were successfully amplified, resulting in repeatable and scorable polymerase chain reaction products. Genotyping of J. curcas accessions from the Guatemalan population revealed 18 polymorphic loci. The average number of alleles per locus was 6.9, and allelic sizes ranged from 94 to 299 bp. Expected and observed heterozygosities ranged from 0.118 to 0.906 and from 0.082 to 0.794, respectively. Polymorphic information content values ranged from 0.114 (JcSSR-34) to 0.886 (JcSSR-33) with an average of 0.627. Analysis with Micro-Checker indicated few null alleles for locus JcSSR-37 in Guatemalan populations, which may be a possible cause of its deviation from Hardy-Weinberg equilibrium, even after Bonferroni?s correction. No loci showed significant linkage disequilibrium. These microsatellite loci are expected to be valuable molecular markers in J. curcas because they show high levels of polymorphism and heterozygosity.
650 $aBiocombustível
650 $aCultura energética
650 $aEuphorbiaceae
650 $aPinhão de purga
650 $aPlanta oleaginosa
653 $aBiofuel
653 $aEnergy crop
653 $aGenetic diversity
653 $aMicrosatellites
653 $aMicrossatélite
653 $aPhysic nut
700 1 $aSOUZA, I. G. B.
700 1 $aVELOSO, M. E. da C.
700 1 $aKOBAYASHI, A. K.
700 1 $aLAVIOLA, B. G.
700 1 $aDINIZ, F. M.
773 $tGenetics and Molecular Research, Ribeirão Preto$gv. 13, n. 3, p. 6099-6106, Aug. 2014.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 16 | |
| 1. |  | TOMM, G. O.; SMIDERLE, O. J.; RAPOSO, R.; DALMAGO, G. A.; SOARES, A.; FIGER, E.; LUFT, A.; BATISTELLA, E.; SCARANTTI, V.; BENIN, F. Can canola be produced in tropical areas? (b) In: INTERNATIONAL RAPESEED CONGRESS, 13., 2011, Prague, Czech Republic. Proceedings... Prague: International Consultative research group on Rapeseed, 2011. p. 57-60.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
|    |
| 2. | | TOMM, G. O.; SMIDERLE, O. J.; RAPOSO, R.; DALMAGO, G. A.; SOARES, A.; FIGER, E.; LUFT, A.; BATISTELLA, E.; SCARANTTI, V.; BENIN, F. Can canola be produced in tropical areas? In: INTERNATIONAL RAPESEED CONGRESS, 13., 2011, Prague, Czech Republic. Abstract book... Prague: International Consultative Research Group on Rapeseed, 2011. Poster 210, p. 384.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
| |
| 3. | | FERREIRA, C. da S.; DIAS, T. J.; PEREIRA, W. E.; SOUZA, V. A. B.; RAPOSO, R. W. C.; SOUSA, V. F. de. Composição mineral de mudas de mangabeira cultivadas em substratos contendo fibra de coco e submetidos a adubação fosfatada. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 19., 2006, Cabo Frio. Frutas do Brasil: saúde para o mundo: palestras e resumos. Cabo Frio : SBF; UENF; UFRRJ, 2006. p. 523. Meta 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 4. | | SILVA, J. M. L. da; RODRIGUES, T. E.; VALENTE, M. A.; CARVALHO, E. J. M.; CAMPOS, A. G. S.; RAPOSO, R. P. Levantamento de reconhecimento de alta intensidade dos solos do município de Acrelândia, estado do Acre. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2006. 54 p. (Embrapa Amazônia Oriental. Documentos, 270). Anexo mapas: Levantamento de reconhecimento de alta intensidade dos solos do Município de Acrelândia, Estado do Acre. Versão eletrônica.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 5. | | SILVA, E. R. da; GOMES, R. dos S. S.; OLIVEIRA, R. A. de; PAIVA, A. de P. r. de; RAPOSO, R. W. C. Potencial de biomassa de plantas de girassol submetidas a doses de potásio. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 97| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
| |
| 6. | | MORAES, M. F. de; SANTOS, M. G. dos; BERMÚDEZ-ZAMBRANO, O. D.; MALAVOLTA, M.; RAPOSO, R. W. C.; CABRAL, C. P.; MALAVOLTA. E. Resposta do arroz em casa de vegetação a fontes de micronutrientes de diferentes granulometria e solubilidade. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 39, n. 6, p. 611-614, junho 2004 Notas Científicas.
Título em inglês: Response of greenhouse grown rice plant to sources of micronutrients with different granulometry and solubility.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 7. | | LIMA, V. I. de; BELTRAO, N. E. de M.; DANTAS, J. P.; RAPOSO, R. W. C.; SILVA, J. R. P. da. Crescimento e produção de gergelim cv. g3 em função de boro e zinco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 1., 2010, João Pessoa. Inclusão social e energia: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
| |
| 8. | | RAPOSO, R. S.; SOUZA, I. G. B.; VELOSO, M. E. da C.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; DINIZ, F. M. Development of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 3, p. 6099-6106, Aug. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 9. | | RAPOSO, R. da S.; BRITTO, F. B.; SOUZA, I. G. de B; CARVALHO, A. M. F. de; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Development and use of novel microsatellite markers from double-enriched genomic libraries in Guatemalan Jatropha curcas. Biochemical Systematics and Ecology, v. 59, p. 168-173, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
|  |
| 10. | | SOUZA, T. A. F. de; RAPOSO, R. W. C.; OLIVEIRA, J. T. de L.; SILVA NETO, C. P. da; TOMM, G. O. Desempenho de genótipos de canola (Brassica napus L.) no município de Areia - PB. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURA E BIODIESEL, 5., 2008, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2008. 1 CD-ROM. 10 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
| |
| 11. | | SOUZA, T. A. F. de; RAPOSO, R. W. C.; DANTAS, A. J. de A.; SILVA, C. V. e; GOMES NETO, A. D.; SANTOS, L. C. N. dos; ARAÚJO, R. D. de A.; RODRIGUES, H. R. N.; ANDRADE, D. A. de; MEDEIROS, D. A.; DIAS, J. A.; SILVA, E. S. da; LIMA, G. K.; LUCENA, E. H. L. de; PRATES, C. da S. F. Análise da cadeia produtiva do girassol no município de Esperança - PB. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 1., 2010, João Pessoa. Inclusão social e energia: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
| |
| 12. | | SOUZA, T. A. F. de; RAPOSO, R. W. C.; DANTAS, A. J. de A.; SILVA, C. V. e.; GOMES NETO, A. D.; SANTOS, L. C. N. dos; ARAÚJO, R. C. de A.; RODRIGUES, H. R. N.; ANDRADE, D. A. de; MEDEIROS, D. A.; DIAS, J. A.; SILVA, E. S. da; LIMA, G. K.; LUCENA, E. H. L. de; PRATES, C. da S. F. Qualidade da fibra do algodão colorido em função da aplicação foliar de N e B. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 1., 2010, João Pessoa. Inclusão social e energia: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
| |
| 13. | | SOUZA, T. A. F. de; RAPOSO, R. W. C.; DANTAS, A. J. de A.; SILVA, C. V. e; GOMES NETO, A. D.; SANTOS, L. C. N. dos; ARAÚJO, R. C. de A.; RODRIGUES, H. R. N.; ANDRADE, D. A. de; MEDEIROS, D. A.; DIAS, J. A.; SILVA, E. S. da; LIMA, G. K.; LUCENA, E. H. L. de; PRATES, C. da S. F. Doses e modos de aplicação de nitrogênio e seus efeitos sobre a produção do gergelim. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 1., 2010, João Pessoa. Inclusão social e energia: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
| |
| 14. | | SOUZA, T. A. F. de; RAPOSO, R. W. C.; DANTAS, A. J. de A.; SILVA, C. V. e S.; GOMES NETO, A. D.; SANTOS, L. C. N. dos; ARAÚJO, R. C. de A.; RODRIGUES, H. R. N.; ANDRADE, D. A. de; MEDEIROS, D. A.; DIAS, J. A.; SILVA, E. S. da; LIMA, G. K.; LUCENA, E. H. L. de; PRATES, C. da S. F. Crescimento do gergelim influenciado pelo manejo da adubação nitrogenada. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 1., 2010, João Pessoa. Inclusão social e energia: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
| |
| 15. | | TOMM, G. O.; RAPOSO, R. W. C.; SOUZA, T. A. F. de; OLIVEIRA, J. T. de L.; RAPOSO, E. H. S.; SILVA NETO, C. P. da; BRITO, A. C.; NASCIMENTO, R. de S.; RAPOSO, A. W. S.; SOUZA, C. F. de. Desempenho de genótipos de canola (Brassica napus L.) no Nordeste do estado da Paraíba, Nordeste do Brasil. Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2008. 15 p. html. (Embrapa Trigo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento Online, 65).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
| |
| 16. | | SOUZA, T. A. F. de; RAPOSO, R. W. C.; DANTAS, A. J. de A.; SILVA, C. V. e; GOMES NETO, A. D.; SANTOS, L. C. N. dos; ARAÚJO, R. D. de A.; RODRIGUES, H. R. N.; ANDRADE, D. A. de; MEDEIROS, D. A.; DIAS, J. A.; SILVA, E. S. da; LIMA, G. K.; LUCENA, E. H. L. de; PRATES, C. da S. F. Nitrogênio e seus efeitos sobre o crescimento inicial do gergelim. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 1., 2010, João Pessoa. Inclusão social e energia: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
| |
| Registros recuperados : 16 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
