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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
19/12/2022 |
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Data da última atualização: |
19/12/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OSBORNE, O. G.; DOBREVA, M. P.; PAPADOPULOS, A. S. T.; MOURA, M. S. B. de; BRUNELLO, A. T.; QUEIROZ, L. P. de; PENNINGTON, R. T.; LLOYD, J.; SAVOLAINEN, V. |
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Afiliação: |
OWEN G. OSBORNE, Georgina Mace Centre for the Living Planet, Department of Life Sciences, Imperial College London; MARIYA P. DOBREVA, Georgina Mace Centre for the Living Planet, Department of Life Sciences, Imperial College London; ALEXANDER S. T. PAPADOPULOS, Molecular Ecology and Evolution Bangor, School of Natural Sciences, Bangor University, Environment Centre Wales; MAGNA SOELMA BESERRA DE MOURA, CPATSA; ALEXANDRE T. BRUNELLO, Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo; LUCIANO P. DE QUEIROZ, Universidade Estadual de Feira de Santana; R. TOBY PENNINGTON, Geography, University of Exeter, Amory Building; JON LLOYD, School of Biological Sciences, The University of Western Australia; VINCENT SAVOLAINEN, Royal Botanic Gardens. |
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Título: |
Mapping the root systems of individual trees in a natural community using genotyping-by-sequencing |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
New Phytologist, Nov. 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1111/nph.18645 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
On-line. |
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Conteúdo: |
The architecture of root systems is an important driver of plant fitness, competition and ecosystem processes. However, the methodological difficulty of mapping roots hampers the study of these processes. Existing approaches to match individual plants to belowground samples are low-throughput and species-specific. Here, we developed a scalable sequencing-based method to map the root systes of individual trees across multiple species. We successfully applied it to a tropical dry forest community in the Brazilian Caatinga containing 14 species We sequenced all 42 individual shrubs and trees in a 14 by 14 m plot using double-digest restriction-site associated sequencing (ddRADseq). We identified species-specific markers and individual-specific haplotypes from the data. We matched these markers to ddRADseq data from 100 mixed root samples from across the centre (10 by 10 m) of the plot at four different depths, using a newly developed R package We identified individual root samples for all species and all but one individual. There was a strong significant correlation between below and aboveground size measurements, and we also detected significant species-level root-depth preference for two species.? The method is more scalable and less labour-intensive than current techniques, and is broadly applicable to ecology, forestry and agricultural biology. |
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Palavras-Chave: |
Comunidade tropical; DdRADseq; Distribuição de densidade de raízes individuais; Genotipagem; Mapeamento dos sistemas radiculares. |
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Thesagro: |
Árvore Florestal; Caatinga; Ecologia Vegetal; Floresta Tropical. |
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Thesaurus Nal: |
Plant ecology; Tropical forests. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/244008/1/Mapping-the-root-systems-of-individual-trees-in-a-natural-community-using-genotyping-2022.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 26 | |
| 4. |  | SIMON, M. F.; GRETHER, R.; QUEIROZ, L. P. DE; SARKINEN, T. E.; DUTRA, V. F.; HUGHES, C. E. The evolutionary history of Mimosa (Leguminosae): towards a phylogeny of the sensitive plants. In: INTERNATIONAL CONGRESS ON LEGUME, GENETICS AND GENOMICS, 5.; ASILOMAR CONFERENCE GROUNDS, 2010, Pacific Grove, California. [Proceedings...]. [S.l.: s. n.], 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 5. | | SIMON, M. F.; GRETHER, R.; QUEIROZ, L. P. de; SARKINEN, T. E.; DUTRA, V. F.; HUGHES, C. E. The evolutionary history of Mimosa (Leguminosae): towards a phylogeny of the sensitive plants. American Journal of Botany, v.98, n. 7, p. 1201-1221, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 6. | | SIMON, M. F.; GRETHER, R.; QUEIROZ, L. P. DE; SKEMA, C.; PENNINGTON, R, T.; HUGHES, C. E. The historical assembly of the cerrado based on legume dated phylogenies. In: INTERNATIONAL CONGRESS ON LEGUME, GENETICS AND GENOMICS, 5.; ASILOMAR CONFERENCE GROUNDS, 2010, Pacific Grove, California. [Proceedings...]. [S.l.: s. n.], 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 8. | | SIMON, M. F.; GRETHER, R.; QUEIROZ, L. P. de; SKEMA, C.; PENNINGTON, R. T.; HUGHES, C. E. Recent assembly of the Cerrado, a neotropical plant diversity hotspot, by in situy evolution of adaptations to fire. PNAS. Proceedings of the Nacional Academy of Sciences of the United of the States of America, v. 105, n. 48, p. 20359-20364, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | QUEIROZ, L. P. DE; SOUZA, E. R. DE; SIMON, M. F.; ADILVA S. CONCEIÇÃO; CARNEIRO, D. S.; SANTOS, A. K. A. Why are there species in the moutains of eastern Brazil? What phylogenies could answer. In: INTERNATIONAL CONGRESS ON LEGUME, GENETICS AND GENOMICS, 5.; ASILOMAR CONFERENCE GROUNDS, 2010, Pacific Grove, California. [Proceedings...]. [S.l.: s. n.], 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 10. | | RIBEIRO, P. G.; LUCKOW, M.; LEWIS, G. P.; SIMON, M. F.; CARDOSO, D.; SOUZA, E. R. de; SILVA, A. P. C.; JESUS, M. C.; SANTOS, F. A. R. dos; AZEVEDO, V.; QUEIROZ, L. P. de. Lachesiodendron, a new monospecific genus segregated from Piptadenia (Leguminosae: Caesalpinioideae: mimosoid clade): evidence from morphology and molecules. Taxon, v. 67, n. 1, p. 37-54, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | LIMA, A. G. de; PAULA-SOUZA, J. de; RINGELBERG, J. J.; SIMON, M. F.; QUEIROZ, L. P. de; BORGES, L. M.; MANSANO, V. de F.; SOUZA, V. C.; SCALON, V. R. New segregates from the Neotropical genus Stryphnodendron (Leguminosae, Caesalpinioideae, mimosoid clade). PhytoKeys, v. 205, p. 203-237, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 12. | | OSBORNE, O. G.; DOBREVA, M. P.; PAPADOPULOS, A. S. T.; MOURA, M. S. B. de; BRUNELLO, A. T.; QUEIROZ, L. P. de; PENNINGTON, R. T.; LLOYD, J.; SAVOLAINEN, V. Mapping the root systems of individual trees in a natural community using genotyping-by-sequencing New Phytologist, Nov. 2022. On-line.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 13. | | QUEIROZ, L. P. de; CARDOSO, D. B. O. S.; CONCEIÇÃO, A. de S.; SOUZA, E. R. de; TOZZI, A. M. G. A.; PÉREZ, A. P. F.; SILVA, M. J. da; SIMON, M. F.; MANSANO, V. de F.; COSTA, J. A. S.; RODRIGUES, W. A.; LIMA, L. C. P.; BOCAGE, A. du. Leguminosae. In: GIULIETTI, A. M.; RAPINI, A.; ANDRADE, M. J. G. de; QUEIROZ, L. P. de; SILVA, J. M. C. da (Org.). Plantas raras do Brasil. Belo horizonte: Conservação Internacional, 2009. p. 212-237| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | REIS JUNIOR, F. B. dos; SIMON, M. F.; GROSS, E.; BODDEY, R. M.; ELLIOT, G. N.; ELIAS NETO, N.; LOUREIRO, M. de F.; QUEIROZ, L. P. de; CHEN, W-M.; NORÉM, A.; FARIA, S. M. de; BONTEMPS, C.; GOI, S. R. de; YOUNG, P. W.; SPRENT, J. I.; JAMES, E. K. Nodulation and nitrogen fixation by Mimosa spp. in the cerrado and caatinga biomes of Brazil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 7 a 12 de setembro de 2009, Fortaleza. Desafios para a Produção de Alimentos e Agroenergia: anais. Fortaleza: Sociedade Brasileira de Fisiologia Vegetal, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 15. | | REIS JUNIOR, F. B. dos; SIMON, M. F.; GROSS, E.; BODDEY, R. M.; ELLIOTT, G. N.; ELIAS NETO, N.; LOUREIRO, M. de F; QUEIROZ, L. P. de; SCOTTI, M. R.; CHEN, W. -M.; NORÉN, A.; RUBIO, M. C.; FARIA, S. M. de; BONTEMPS, C.; GOI, S. R.; YOUNG, P. W.; SPRENT, J. I.; JAMES, E. K. Nodulation and nitrogen fixation by Mimosa spp. in the cerrado and caatinga biomes of Brazil. New Phytologist, v. 186, p. 934-946, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 16. | | REIS JUNIOR, F. B. dos; SIMON, M. F.; GROSS, E.; BODDEY, R. M.; ELLIOTT, G. N.; NETO, N. E.; LOUREIRO, M. de F.; QUEIROZ, L. P. de; CHEN, W. -M.; NORÉN, A.; FARIA, S. M. de; BONTEMPS, C.; GOI, S. R.; YOUNG, P. W.; SPRENT, J. I.; JAMES, W. K. Nodulation and nitrogen fixation by Mimosa spp. in the cerrado and caatinga biomes of Brazil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 2009, Fortaleza. Desafios para produção de alimentos e bioenergia: livro de resumos. Fortaleza: Sociedade Brasileira de Fisiologia Vegetal: UFC: Embrapa Agroindustria Tropical, 2009. p. 283. p. 283| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 17. | | REIS JUNIOR, F. B. dos; SIMON, M. F.; GROSS, E.; BODDEY, R. M.; ELLIOTT, G. N.; NETO, N. E.; LOUREIRO, M. de F.; QUEIROZ, L. P. de; SCOTTI, M. R.; CHEN, W. -M.; NORÉN, A.; RUBIO, M. C.; FARIA, S. M. de; BONTEMPS, C.; GOI, S. R.; YOUNG, J. P. W; SPRENT, J. I.; JAMES, E. K. Nodulation and nitrogen fixation by Mimosa spp. in the cerrado and caatinga biomes of Brazil. New Phytologist, v. 186, p. 934-946, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 18. | | REIS JUNIOR, F. B. dos; SIMON, M. F.; GROSS, E.; BODDEY, R. M.; ELLIOTT, G. N.; NETO, N. E.; LOUREIRO, M. de F.; QUEIROZ, L. P. de; SCOTTI, M. R.; CHEN, W. -M.; NORÉN, A.; RUBIO, M. C.; FARIA, S. M. de; BONTEMPS, C.; GOI, S. R.; YOUNG, J. P. W.; SPRENT, J. I.; JAMES, E. K. Nodulation and nitrogen fixation by Mimosa spp. in the cerrado and caatinga biomes of Brazil. New Phytologist, v. 186, p. 934-946, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 19. | | JOLY, C. A.; PADGURSCHI, M. C. G.; PIRES, A. P. F.; AGOSTINHO, A. A.; MARQUES, A. C.; AMARAL, A. G.; CERVONE, C. O. F. de O.; ADAMS, C.; BACCARO, F. B.; SPAROVEK, G.; OVERBECK, G. E.; ESPINDOLA, G. M. de; VIEIRA, I. C. G.; METZGER, J. P.; SABINO, J.; FARINACI, J. S.; QUEIROZ, L. P. de; GOMES, L. C.; CUNHA, M. M. C. da; PIEDADE, M. T. F.; BUSTAMANTE, M. M. da C.; MAY, P.; FEARNSIDE, P.; PRADO, R. B.; LOYOLA, R. D. Apresentando o diagnóstico brasileiro de biodiversidade e serviços ecossistêmicos. In: JOLY, C. A.; SCARANO, F. R.; SEIXAS, C. S.; METZGER, J. P.; OMETTO, J. P.; BUSTAMANTE, M. M. C.; PADGURSCHI, M. C. G.; PIRES, A. P. F.; CASTRO, P. F. D.; GADDA, T.; TOLEDO, P. (Ed.). 1° Diagnóstico brasileiro de biodiversidade e serviços ecossistêmicos. São Carlos, SP: Editora Cubo, 2019. cap. 1, p. 6-33.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 20. | | RINGELBERG, J. J.; KOENEN, E. J. M.; SAUTER, B.; AEBLI, A.; RANDO, J. G.; IGANCI, J. R.; QUEIROZ, L. P. de; MURPHY, D. J.; GAUDEUL, M.; BRUNEAU, A.; LUCKOW, M.; LEWIS, G. P.; MILLER, J. T.; SIMON, M. F.; JORDÃO, L. S. B.; MORALES, M.; BAILEY, C. D.; NAGESWARA-RAO, M.; NICHOLLS, J. A.; LOISEAU, O.; PENNINGTON, R. T.; DEXTER, K. G.; ZIMMERMANN, N. E.; HUGHES, C. E. Precipitation is the main axis of tropical plant phylogenetic turnover across space and time. Science Advances, v. 9, n. 7, 2023. eade4954.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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