| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Café. Para informações adicionais entre em contato com biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Café; Embrapa Unidades Centrais. |
|
Data corrente: |
01/03/2011 |
|
Data da última atualização: |
04/03/2011 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
PRIOLLI, R. H. G.; RAMOS, L. C. S.; POT, D.; MOLLER, M.; GALLO, P. B.; PASTINA, M. M.; GARCIA, A. A. F.; YAMAMOTO, P. Y.; LANNES, S. D.; FERREIRA, L. P.; SCHOLZ, M. B. S.; MAZZAFERA, P.; PEREIRA, L. F. P.; COLOMBO, L. F. P. |
|
Afiliação: |
ESALQ/USP; IAC; IAPAR/CIRAD; IAC; IAC; ESALQ/USP; EEALQ/USP; IAC; IAPAR; IAPAR; IAPAR; UNICAMP; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC; IAC. |
|
Título: |
Construction of a genetic map based on an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora and its usefulness for quality related traits. |
|
Ano de publicação: |
2008 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Genetic maps based on molecular markers have been developed in a large set of plants and this strategy has proven its efficiency towards the identification of tools for marker assisted selection. In the present study, AFLP and SSR markers were used to build a genetic map of an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora. It was identified 349 AFLP markers and 50 SSR alleles segregating in 90 F2 plants from forty four AFLP combinations and 19 SSR loci. For the map construction, only single dose markers segregating 3:1 in the F2 were considered (248 AFLP markers and 27 SSR alleles, standing for to 68.9% of the polymorphic markers). The genetic map was build and one hundred and sixty nine markers were mapped, corresponding to 155 AFLP markers and 14 SSR loci. Thirty seven linkage groups corresponding to a total map length of 1011 cM were obtained, with an average distance between the markers of 5.98 cM and an average of 4.58 markers per linkage group. Forty-six marker trait associations were found; of which, nineteen were associated with sugar content, eight for caffeine, eight for CGA, one for caffeine and CGA and ten for total production per plant. Only four single markers associations were detected at both years of determinations. The single markers analysis for QTL detection allowed us to obtain previous information of putative QTL association for coffee quality and productivity. Additional markers are being added to this working linkage map for more complete coverage of the coffee genome. MenosGenetic maps based on molecular markers have been developed in a large set of plants and this strategy has proven its efficiency towards the identification of tools for marker assisted selection. In the present study, AFLP and SSR markers were used to build a genetic map of an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora. It was identified 349 AFLP markers and 50 SSR alleles segregating in 90 F2 plants from forty four AFLP combinations and 19 SSR loci. For the map construction, only single dose markers segregating 3:1 in the F2 were considered (248 AFLP markers and 27 SSR alleles, standing for to 68.9% of the polymorphic markers). The genetic map was build and one hundred and sixty nine markers were mapped, corresponding to 155 AFLP markers and 14 SSR loci. Thirty seven linkage groups corresponding to a total map length of 1011 cM were obtained, with an average distance between the markers of 5.98 cM and an average of 4.58 markers per linkage group. Forty-six marker trait associations were found; of which, nineteen were associated with sugar content, eight for caffeine, eight for CGA, one for caffeine and CGA and ten for total production per plant. Only four single markers associations were detected at both years of determinations. The single markers analysis for QTL detection allowed us to obtain previous information of putative QTL association for coffee quality and productivity. Additional markers are being added to this working linkage map for ... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Genetic maps. |
|
Thesagro: |
Coffea Arábica; Coffea Canephora. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02502nam a2200301 a 4500
001 1880087
005 2011-03-04
008 2008 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aPRIOLLI, R. H. G.
245 $aConstruction of a genetic map based on an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora and its usefulness for quality related traits.$h[electronic resource]
260 $aIn: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas.$c2008
520 $aGenetic maps based on molecular markers have been developed in a large set of plants and this strategy has proven its efficiency towards the identification of tools for marker assisted selection. In the present study, AFLP and SSR markers were used to build a genetic map of an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora. It was identified 349 AFLP markers and 50 SSR alleles segregating in 90 F2 plants from forty four AFLP combinations and 19 SSR loci. For the map construction, only single dose markers segregating 3:1 in the F2 were considered (248 AFLP markers and 27 SSR alleles, standing for to 68.9% of the polymorphic markers). The genetic map was build and one hundred and sixty nine markers were mapped, corresponding to 155 AFLP markers and 14 SSR loci. Thirty seven linkage groups corresponding to a total map length of 1011 cM were obtained, with an average distance between the markers of 5.98 cM and an average of 4.58 markers per linkage group. Forty-six marker trait associations were found; of which, nineteen were associated with sugar content, eight for caffeine, eight for CGA, one for caffeine and CGA and ten for total production per plant. Only four single markers associations were detected at both years of determinations. The single markers analysis for QTL detection allowed us to obtain previous information of putative QTL association for coffee quality and productivity. Additional markers are being added to this working linkage map for more complete coverage of the coffee genome.
650 $aCoffea Arábica
650 $aCoffea Canephora
653 $aGenetic maps
700 1 $aRAMOS, L. C. S.
700 1 $aPOT, D.
700 1 $aMOLLER, M.
700 1 $aGALLO, P. B.
700 1 $aPASTINA, M. M.
700 1 $aGARCIA, A. A. F.
700 1 $aYAMAMOTO, P. Y.
700 1 $aLANNES, S. D.
700 1 $aFERREIRA, L. P.
700 1 $aSCHOLZ, M. B. S.
700 1 $aMAZZAFERA, P.
700 1 $aPEREIRA, L. F. P.
700 1 $aCOLOMBO, L. F. P.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 64 | |
| 2. |  | TISKI, I.; PEREIRA, L. F. P.; POT, D.; MARRACCINI, P. R.; VIEIRA, L. G. E. Análise in silico e in vivo da via de isoprenóides em café. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
|    |
| 3. | | TISKI, I.; PEREIRA, L. F. P.; POT, D.; MARRACCINI, P.; VIEIRA, L. G. E. Análise in silico e in vivo da via de isoprenóides em café. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. Biotecnologia aplicada à cadeia agroindustrial do café.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 4. | | YANAGUL, K.; VIEIRA, L. G.; POT, D.; PEREIRA, L. F. P. Avaliação da diversidade nucleotídica para identificação e análise de expressãode haplótipos em Coffea arabica (Nucleotide diversity evaluation for identification and expression analysis of Coffea arabica haplotypes) In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE GENÉTICA, 14.; CONGRESO DE LA ASSOCIACIÓN LATINOAMERICANA DE MUTAGÊNESIS, CARCINOGÉNESES Y TERATOGÉNESIS AMBIENTAL, 8.; CONGRESO DE LA SOCIEDAD DE GENÉTICA DE CHILE,42.; CONGRESO DE LA SOCIEDAD ARGENTINA DE GENÉTICA, 39.; 2010, Vinã del Mar, Chile. p. 266| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
|  |
| 6. | | PEREIRA, L. F. P.; YANAGUI, K.; FERREIRA, L. P.; DOMINGUES, D. S.; VIEIRA, L. G. E.; POT, D. Analysis Of Nucleotide Diversity In Coffea spp. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 19, 2011, San Diego, CA.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 7. | | IVAMOTO, S. T.; POT, D.; LANNES, S. D.; DOMINGUES, D. S.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P. Diversidade nucleotídica de genes envolvidos na biossíntese de ácidos clorogênicos de cafeeiros. Coffee Science, Lavras, v. 8, n. 2, p. 148-156, abr./jun. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 9. | | FERREIRA, L. P.; PLENER, L.; MARRACCINI, P.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E.; POT, D. Identificação e caracterização molecular de genes envolvidos no metabolismo de diterpenos específicos do cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. Biotecnologia aplicada à cadeia agroindustrial do café.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 10. | | FERREIRA, L. P.; PLENER, L.; MARRACCINI, P.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E.; POT, D. Identificação e caracterização molecular de genes envolvidos no metabolismo de diterpenos específicos do cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. Biotecnologia aplicada à cadeia agroindustrial do café.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 11. | | BUDZINSKI, I. G. F.; SANTOS, T. B.; SERA, T.; POT, D.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P. Expression patterns of three a-expansin isoforms in Coffea arabica during fruit development. Plant Biology, Germany, v.13, n. 3, p. 462?471, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 12. | | IVAMOTO, S. T.; POT, D.; FERREIRA, L. P.; ALVES, L. C.; DOMINGUES, D. S.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P. Análise in silico da expressão gênica de citocromo p450 relacionada ao metabolismo de diterpenos em Coffea. In.: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 13. | | VIDAL, R.; FERREIRA, L. P.; LANNES, S. D.; VIEIRA, L. G. E.; MONDEGO, J.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A.; POT, D.; PEREIRA, L. F. P. Analise in silico e in vivo da diversidade nucleotidica em Coffea ssp. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Resumos expandidos. Brasília, DF: Embrapa Café.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 14. | | SCHOLZ, M. B. dos S.; KITZBERGER, C. S. G.; PEREIRA, L. F. P.; DAVRIEUX, F.; POT, D.; CHARMETANT, P.; LEROY, T. Application of near infrared spectroscopy for green coffee biochemical phenotyping. Journal of Near Infrared Spectroscopy, v. 22, n. 6, p. 411-421, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 15. | | MARRACCINI, P.; RODRIGUES, G. C.; ROCHA, O. C.; GUERRA, A. F.; ANDRADE, A. C.; LEROY, T.; POT, D.; JOURDAN, C.; GION, J.-M. Analysis of phenotypic plasticity in response to water constraints in coffee plants growing in field conditions. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas. Programme abstracts. Montpellier, France: Association for Science and Information on Coffee, 2008. p. 173.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 16. | | MARRACCINI, P.; RODRIGUES, G. C.; ROCHA, O. C.; GUERRA, A. F.; ANDRADE, A. C.; LEROY, T.; POT, D.; JOURDAN, C.; GION, J. M. Analysis of phenotypic plasticity in response to water constraints in coffee plants growing in field conditions. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas, Brazil. Programme abstracts. Montpellier, France: Association for Science and Information on Coffee, 2008. Também publicado como resumo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 17. | | MARRACCINI, P.; RODRIGUES, G. C.; ROCHA, O. C.; GUERRA, A. F.; ANDRADE, A. C.; LEROY, T.; POT, D.; JOURDAN, C.; GION, J.-M. Analysis of phenotypic plasticity in response to water constraints in coffee plants growing under field conditions. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas. [Anais]. Montpellier, France: Association for Science and Information on Coffee, 2008. p. 950-953.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 18. | | SCHOLZ, M. B. dos S.; KITZBERGER, C. S. G.; PAGIATTO, N. F.; PEREIRA, L. F. P.; DAVRIEUX, F.; POT, D.; CHARMETANT, P.; LEROY, T. Chemical composition in wild ethiopian Arabica coffee accessions. Euphytica, v. 209, n. 2 p. 429-438, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 19. | | ALVES, G. S. C.; DECHAMP, E.; FREIRE, L. P.; POT, D.; THIS, D.; PAIVA, L. V.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H. Characterization of CcDREB1D promoter region from contrasting genotypes of Coffea canephora by homologous transformation in Coffea Arabica. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 25., 2014, Armenia, Colombia. [Proceedings...]. [Armenia]: ASIC, 2015. p. 42-47.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 20. | | GEROMEL, C.; FERREIRA, L. P.; GUERREIRO, S. M. C.; CAVALARI, A. A.; POT, D.; PEREIRA, L. F. P.; LEROY, T.; VIEIRA, L. G. E.; MAZZAFERA, P.; MARRACCINI, P. Biochemical and genomic analysis of sucrose metabolism during coffee (Coffea arabica) fruit development. Journal of Experimental Botany, v. 57, n. 12, p. 3243-3258, 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| Registros recuperados : 64 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
