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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
28/07/2022 |
Data da última atualização: |
31/08/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
LIMA, A. O.; MALHEIROS, J. M.; AFONSO, J.; PETRINI, J.; COUTINHO, L. L.; DINIZ, W. J. da S.; DONATONI, F. A. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; RIBEIRO, J. A. S.; OLIVEIRA, K. S. de; ROCHA, M. I. P.; ANDRADE, B. G. N.; FUKUMASU, H.; BEIKI, H.; REECY, J. M.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURAO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. |
Afiliação: |
ANDRESSA OLIVEIRA LIMA, UFSCAR; JESSICA MORAES MALHEIROS; JULIANA AFONSO; JULIANA PETRINI, ESALQ/USP; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ/USP; WELLISON JARLES DA SILVA DINIZ, UFSCAR; FLAVIA ALINE BRESSANI DONATONI, CPPSE; POLYANA CRISTINE TIZIOTO, NGS SOLUÇÕES GENÔMICAS, PIRACICABA; PRISCILA SILVA NEUBERN DE OLIVEIRA; JANSSEN AYNA SILVA RIBEIRO, UFSCAR; KARINA SANTOS DE OLIVEIRA, UFSCAR; MARINA IBELLI PEREIRA ROCHA, UFSCAR; BRUNO GABRIEL NASCIMENTO ANDRADE, MUNSTER TECHNOLOGICAL UNIVERSITY; HEIDGE FUKUMASU, USP; HAMID BEIKI, IOWA STATE UNIVERSITY; JAMES MARK REECY, IOWA STATE UNIVERSITY; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; GERSON BARRETO MOURAO, ESALQ/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Título: |
Prune homolog 2 with BCH domain (PRUNE2) gene expression is associated with feed efficiency related traits in Nelore steers. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, 2022. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-022-09960-1 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract. Animal feeding is a critical factor in increasing producer profitability. Improving feed efficiency can help reduce feeding costs and reduce the environmental impact of beef production. Candidate genes previously identified for this trait in differential gene expression studies (e.g., case?control studies) have not examined continuous gene-phenotype variation, which is a limitation. The aim of this study was to investigate the association between the expression of five candidate genes in the liver, measured by quantitative real-time PCR and feed-related traits. We adopted a linear mixed model to associate liver gene expression from 52 Nelore steers with the following production traits: average daily gain (ADG), body weight (BW), dry matter intake (DMI), feed conversion ratio (FCR), feed efficiency (FE), Kleiber index (KI), metabolic body weight (MBW), residual feed intake (RFI), and relative growth ratio (RGR). The total expression of the prune homolog 2 (PRUNE2) gene was significantly associated with DMI, FCR, FE, and RFI (P < 0.05). Furthermore, we have identified a new transcript of PRUNE2 (TCONS_00027692, GenBank MZ041267) that was inversely correlated with FCR and FE (P < 0.05), in contrast to the originally identified PRUNE2 transcript. The cytochrome P450 subfamily 2B (CYP2B6), early growth response protein 1 (EGR1), collagen type I alpha 1 chain (COL1A1), and connective tissue growth factor (CTGF) genes were not associated with any feed efficiency-related traits (P > 0.05). The findings reported herein suggest that PRUNE2 expression levels affects feed efficiency-related traits variation in Nelore steers. MenosAbstract. Animal feeding is a critical factor in increasing producer profitability. Improving feed efficiency can help reduce feeding costs and reduce the environmental impact of beef production. Candidate genes previously identified for this trait in differential gene expression studies (e.g., case?control studies) have not examined continuous gene-phenotype variation, which is a limitation. The aim of this study was to investigate the association between the expression of five candidate genes in the liver, measured by quantitative real-time PCR and feed-related traits. We adopted a linear mixed model to associate liver gene expression from 52 Nelore steers with the following production traits: average daily gain (ADG), body weight (BW), dry matter intake (DMI), feed conversion ratio (FCR), feed efficiency (FE), Kleiber index (KI), metabolic body weight (MBW), residual feed intake (RFI), and relative growth ratio (RGR). The total expression of the prune homolog 2 (PRUNE2) gene was significantly associated with DMI, FCR, FE, and RFI (P < 0.05). Furthermore, we have identified a new transcript of PRUNE2 (TCONS_00027692, GenBank MZ041267) that was inversely correlated with FCR and FE (P < 0.05), in contrast to the originally identified PRUNE2 transcript. The cytochrome P450 subfamily 2B (CYP2B6), early growth response protein 1 (EGR1), collagen type I alpha 1 chain (COL1A1), and connective tissue growth factor (CTGF) genes were not associated with any feed efficiency-related t... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Apoptose; Características relacionadas à alimentação; Expressão gênica no fígado de Nelore; Reação em cadeia da polimerase; Reação em cadeia da polimerase em tempo real; Real-time quantitative PCR. |
Thesagro: |
Fígado; Gado de Corte; Gado Nelore. |
Thesaurus Nal: |
Apoptosis; Beef cattle; Gene expression; Liver; Polymerase chain reaction. |
Categoria do assunto: |
-- G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 03224naa a2200517 a 4500 001 2145028 005 2022-08-31 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00335-022-09960-1$2DOI 100 1 $aLIMA, A. O. 245 $aPrune homolog 2 with BCH domain (PRUNE2) gene expression is associated with feed efficiency related traits in Nelore steers.$h[electronic resource] 260 $c2022 520 $aAbstract. Animal feeding is a critical factor in increasing producer profitability. Improving feed efficiency can help reduce feeding costs and reduce the environmental impact of beef production. Candidate genes previously identified for this trait in differential gene expression studies (e.g., case?control studies) have not examined continuous gene-phenotype variation, which is a limitation. The aim of this study was to investigate the association between the expression of five candidate genes in the liver, measured by quantitative real-time PCR and feed-related traits. We adopted a linear mixed model to associate liver gene expression from 52 Nelore steers with the following production traits: average daily gain (ADG), body weight (BW), dry matter intake (DMI), feed conversion ratio (FCR), feed efficiency (FE), Kleiber index (KI), metabolic body weight (MBW), residual feed intake (RFI), and relative growth ratio (RGR). The total expression of the prune homolog 2 (PRUNE2) gene was significantly associated with DMI, FCR, FE, and RFI (P < 0.05). Furthermore, we have identified a new transcript of PRUNE2 (TCONS_00027692, GenBank MZ041267) that was inversely correlated with FCR and FE (P < 0.05), in contrast to the originally identified PRUNE2 transcript. The cytochrome P450 subfamily 2B (CYP2B6), early growth response protein 1 (EGR1), collagen type I alpha 1 chain (COL1A1), and connective tissue growth factor (CTGF) genes were not associated with any feed efficiency-related traits (P > 0.05). The findings reported herein suggest that PRUNE2 expression levels affects feed efficiency-related traits variation in Nelore steers. 650 $aApoptosis 650 $aBeef cattle 650 $aGene expression 650 $aLiver 650 $aPolymerase chain reaction 650 $aFígado 650 $aGado de Corte 650 $aGado Nelore 653 $aApoptose 653 $aCaracterísticas relacionadas à alimentação 653 $aExpressão gênica no fígado de Nelore 653 $aReação em cadeia da polimerase 653 $aReação em cadeia da polimerase em tempo real 653 $aReal-time quantitative PCR 700 1 $aMALHEIROS, J. M. 700 1 $aAFONSO, J. 700 1 $aPETRINI, J. 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aDINIZ, W. J. da S. 700 1 $aDONATONI, F. A. B. 700 1 $aTIZIOTO, P. C. 700 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. de 700 1 $aRIBEIRO, J. A. S. 700 1 $aOLIVEIRA, K. S. de 700 1 $aROCHA, M. I. P. 700 1 $aANDRADE, B. G. N. 700 1 $aFUKUMASU, H. 700 1 $aBEIKI, H. 700 1 $aREECY, J. M. 700 1 $aZERLOTINI NETO, A. 700 1 $aMOURAO, G. B. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 773 $tMammalian Genome, 2022.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
Data corrente: |
23/03/2006 |
Data da última atualização: |
03/12/2015 |
Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Autoria: |
FIGUEIREDO, J. E. F.; COELHO, V. T. da S.; COELHO, E. A. F.; OLIVEIRA, J. S. de; SANTORO, M. M.; ALMEIDA, P. L. B. de; De PAOLI, H. C.; CORREA, G. V.; TEIXEIRA, M. A.; MOTTA, A. C. F. |
Afiliação: |
JOSE EDSON FONTES FIGUEIREDO, CNPMS. |
Título: |
Bioquímica molecular como ferramenta para conservação e uso da biodiversidade agrícola tropical: desenvolvimento de marcador imunoquímico para identificação da bactérias endofíticas do milho. |
Ano de publicação: |
2005 |
Fonte/Imprenta: |
Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2005. |
Páginas: |
12 p. |
Série: |
(Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 2). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Marcadores moleculares estão sendo amplamente utilizados na agricultura. Entre as várias aplicações práticas, destacam-se a identificação de raças, linhagens e estirpes, eliminação de réplicas em bancos de germoplasma, identificação de genes associados com a performance da planta, entre outros. Em todos esses casos, a definição da estratégia que deverá ser adotada precisa considerar os custos para a obtenção dos marcadores. Ênfase crescente tem sido dada para identificar marcadores menos onerosos. Marcadores bioquímicos constituem um tipo especial de marcador molecular que se caracteriza pela análise do produto da expressão gênica. Destacam-se dois tipos principais: isoenzimas e proteínas. Esses marcadores também são definidos como marcadores fenotípicos, pois podem resultar da interação genótipo/ambiente. Embora de aplicação limitada, o uso desses marcadores em algumas áreas ou em casos especiais fornece informações seguras e úteis para a identificação de indivíduos. Recentemente, as técnicas de SDS-PAGE, RAPD-PCR, ARDRA e seqüenciamento de genes ribossomais foram empregadas no Laboratório de Bioquímica Molecular de Microrganismos da Embrapa Milho e Sorgo, para identificar bactérias endofíticas isoladas do milho. Naquele estudo, foi verificada, em todos os isolados, a presença de um polipeptídio de aproximadamente 42 kDa e cuja expressão era bastante elevada. O objetivo deste trabalho consistiu em aprofundar os estudos sobre o polipeptídio de 42 kDa, visando o desenvolvimento de marcadores imunoquímicos para identificar e estudar a dinâmica de colonização bactérias endofíticas em plantas de milho. MenosMarcadores moleculares estão sendo amplamente utilizados na agricultura. Entre as várias aplicações práticas, destacam-se a identificação de raças, linhagens e estirpes, eliminação de réplicas em bancos de germoplasma, identificação de genes associados com a performance da planta, entre outros. Em todos esses casos, a definição da estratégia que deverá ser adotada precisa considerar os custos para a obtenção dos marcadores. Ênfase crescente tem sido dada para identificar marcadores menos onerosos. Marcadores bioquímicos constituem um tipo especial de marcador molecular que se caracteriza pela análise do produto da expressão gênica. Destacam-se dois tipos principais: isoenzimas e proteínas. Esses marcadores também são definidos como marcadores fenotípicos, pois podem resultar da interação genótipo/ambiente. Embora de aplicação limitada, o uso desses marcadores em algumas áreas ou em casos especiais fornece informações seguras e úteis para a identificação de indivíduos. Recentemente, as técnicas de SDS-PAGE, RAPD-PCR, ARDRA e seqüenciamento de genes ribossomais foram empregadas no Laboratório de Bioquímica Molecular de Microrganismos da Embrapa Milho e Sorgo, para identificar bactérias endofíticas isoladas do milho. Naquele estudo, foi verificada, em todos os isolados, a presença de um polipeptídio de aproximadamente 42 kDa e cuja expressão era bastante elevada. O objetivo deste trabalho consistiu em aprofundar os estudos sobre o polipeptídio de 42 kDa, visando o desenvolvimen... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Bacteria endofitica; Marcador imunoquímico. |
Thesagro: |
Milho. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPMS/18461/1/Bol_02.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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