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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste.
Data corrente:  30/04/2021
Data da última atualização:  05/05/2021
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  CARDOSO, T. F.; COUTINHO, L. L.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; PETRINI, J.; ANDRADE, B. G. N.; OLIVEIRA, P. S. N. de; POLETI, M. D.; CESAR, A. S. M.; SILVEIRA, J. C. DA; CHIARATTI, M. R.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A.
Afiliação:  TAINÃ FIGUEIREDO CARDOSO; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ/USP; JENNIFER JESSICA BRUSCADIN, UFSCAR; WELLISON JARLES DA SILVA DINIZ, North Dakota State University; JULIANA PETRINI, ESALQ/USP; BRUNO GABRIEL NASCIMENTO ANDRADE; PRISCILA SILVA NEUBERN DE OLIVEIRA, UFSCAR; MIRELE DAIANA POLETI, USP; ALINE SILVA MELLO CESAR, ESALQ/USP; JULIANO COELHO DA SILVEIRA, USP; MARCOS ROBERTO CHIARATTI, UFSCAR; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; GERSON BARRETO MOURÃO, ESALQ/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE.
Título:  Multi-omics approach reveals miR-SNPs affecting muscle fatty acids profile in Nelore cattle.
Ano de publicação:  2021
Fonte/Imprenta:  Genes, v. 12, n. 1, p. 1-18, Jan. 2021.
DOI:  https://doi.org/10.3390/genes12010067
Idioma:  Inglês
Notas:  Article 67. Na publicação: Adhemar Zerlotini.
Conteúdo:  MicroRNAs (miRNAs) are key regulators of gene expression, potentially affecting several biological processes, whose function can be altered by sequence variation. Hence, the integration of single nucleotide polymorphisms (SNP) and miRNAs can explain individual differences in economic traits. To provide new insights into the effects of SNPs on miRNAs and their related target genes, we carried out a multi-omic analysis to identify SNPs in miRNA mature sequences (miR-SNPs) associated with fatty acid (FA) composition in the Nelore cattle. As a result, we identified 3 miR-SNPs in different miRNAs (bta-miR-2419-3p, bta-miR-193a-2, and bta-miR-1291) significantly associated with FA traits (p-value < 0.02, Bonferroni corrected). Among these, the rs110817643C>T, located in the seed sequence of the bta-miR-1291, was associated with different ?6 FAs, polyunsaturated FA, and polyunsaturated:saturated FA ratios. Concerning the other two miR-SNPs, the rs43400521T>C (located in the bta-miR-2419-3p) was associated with C12:0 and C18:1 cis-11 FA, whereas the rs516857374A>G (located in the bta-miR-193a-2) was associated with C18:3 ?6 and ratio of ?6/?3 traits. Additionally, to identify potential biomarkers for FA composition, we described target genes affected by these miR-SNPs at the mRNA or protein level. Our multi-omics analysis outlines the effects of genetic polymorphism on miRNA, and it highlights miR-SNPs and target candidate genes that control beef fatty acid composition.
Palavras-Chave:  Análise multiômica; Association analysis; Expressão gênica; MiRNAs; Polimorfismo de nucleotídeo único.
Thesagro:  Bos Indicus.
Thesaurus Nal:  Beef quality; Gene expression; Polymorphism; Single nucleotide polymorphism.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/223016/1/AP-Multi-omics-approach-2021.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA20912 - 1UPCAP - DD
CPPSE25319 - 1UPCAP - DDPROCI-2021.00062CAR2021.00065
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21.Imagem marcado/desmarcadoKOCHHANN, R. A.; DENARDIN, J. E. Sistema plantio direto no Brasil. In: CONGRESO INTERAMERICANO DE SIEMBRA DIRECTA, 1.: JORNADAS BINACIONALES DE CERO LABRANZA, 2., 1992, Villa Giardino, Córdoba, Argentina. Trabajos presentados... [S.l.]: Asociación Argentina Productores en Siembra Directa; Sociedad de Conservación de Suelos de Chile; Clube Amigos da Terra, Brasil; Fundação ABC, Brasil; Asociación Uruguaya Pro Siembra Directa, 1992. p. 277-315.
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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22.Imagem marcado/desmarcadoDENARDIN, J. E.; KOCHHANN, R. A. Plantio direto ou sistema plantio direto. In: REUNIÃO DA COMISSÃO CENTRO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO, 10., 1998, Uberaba. Ata e resumos expandidos... Belo Horizonte: EPAMIG, 1999. p. 31-33 (EPAMIG. Documentos, 34).
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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23.Imagem marcado/desmarcadoKOCHHANN, R. A.; DENARDIN, J. E.; FAGANELLO, A. Avaliação de degradação de um latossolo roxo muito argiloso, manejado sob sistema plantio direto. (b) In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO SUL, 27., 1999, Chapecó. Ata e resumos... Chapecó: Epagri - Centro de Pesquisa para Pequenas Propriedades, 1999. p. 194.
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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24.Imagem marcado/desmarcadoKOCHHANN, R. A.; DENARDIN, J. E.; FAGANELLO, A. Avaliação de degradação de um latossolo roxo muito argiloso, manejado sob sistema plantio direto. In: EMBRAPA. Centro Nacional de Pesquisa de Trigo. Soja: resultados de pesquisa, 1998/99. Passo Fundo, 1999. p. 95-101 (Embrapa Trigo. Documentos, 4). Trabalho apresentado na XXVII Reunião de Pesquisa de Soja da Região Sul, Chapecó, 1999.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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25.Imagem marcado/desmarcadoDENARDIN, J. E.; KOCHHANN, R. A.; FAGANELLO, A. 15 de abril dia nacional da conservação do solo: a agricultura desenvolvida no Brasil é conservacionista ou não? Boletim Informativo da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, v. 36, n. 1, p. 10-15, jan./abr. 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 5
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26.Imagem marcado/desmarcadoKOCHHANN, R. A.; DENARDIN, J. E.; FAGANELLO, A. Adubação profunda no sistema plantio direto. (b) In: EMBRAPA. Centro Nacional de Pesquisa de Trigo. Soja: resultados de pesquisa 1997/1998. Passo Fundo, 1998. p. 234-238 (EMBRAPA-CNPT. Documentos, 51).
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27.Imagem marcado/desmarcadoKOCHHANN, R. A.; DENARDIN, J. E.; FAGANELLO, A. Adubação profunda no sistema plantio direto. (c) In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO SUL, 26., 1998, Cruz Alta. Ata e resumos... Cruz Alta: UNICRUZ - Faculdade de Agronomia, 1998. p. 182
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28.Imagem marcado/desmarcadoKOCHHANN, R. A.; DENARDIN, J. E.; FAGANELLO, A. Adubação profunda no sistema plantio direto. (a) Plantio Direto, Passo Fundo, n. 46, p. 35-36, jul./ago. 1998.
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29.Imagem marcado/desmarcadoKOCHHANN, R. A.; DENARDIN, J. E.; FAGANELLO, A. Adubação profunda no sistema plantio direto. In: CURSO SOBRE ASPECTOS BASICOS DE FERTILIDADE E MICROBIOLOGIA DO SOLO SOB PLANTIO DIRETO, 3., 1999, Cruz Alta. Fertilidade do solo em plantio direto: resumos de palestras. Passo Fundo: Aldeia Norte, 1999. p. 67-69
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30.Imagem marcado/desmarcadoKOCHHANN, R. A.; DENARDIN, J. E.; FAGANELLO, A. Avaliação da eficiência da adubação profunda no sistema plantio direto. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E DA ÁGUA, 12., 1998, Fortaleza. Agricultura e sustentabilidade no semi-árido: resumos expandidos. Fortaleza: UFCE: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 1998. p. 150-151
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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31.Imagem marcado/desmarcadoGASSEN, D. N.; KOCHHANN, R. A.; SCHNEIDER, S. Beneficios da presença de Diloboderus abderus em lavouras sob sistema plantio direto. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE TRIGO, 17., 1994, Passo Fundo. Resumos... Passo Fundo: EMBRAPA-CNPT, 1994. p. 21
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32.Imagem marcado/desmarcadoGASSEN, D. N.; KOCHHANN, R. A.; SCHNEIDER, S. Benefícios da presença de Diloboderus abderus em lavouras sob sistema plantio direto. In: REUNIÃO SUL-BRASILEIRA DE INSETOS DO SOLO, 4., 1993, Passo Fundo. Anais e ata. Passo Fundo: EMBRAPA-CNPT / SEB, 1997. p. 152-154
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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33.Imagem marcado/desmarcadoKOCHHANN, R. A.; DENARDIN, J. E.; BERTON, A. L. Compactação e descompactação de solos. Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2000. 20 p. (Embrapa Trigo. Documentos, 19).
Tipo: Documentos
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34.Imagem marcado/desmarcadoDENARDIN, J. E.; KOCHHANN, R. A.; DENARDIN, N. D'A. Considerações sobre adensamento e compactação em manejo de latossolos. In: WORKSHOP COESÃO EM SOLOS DOS TABULEIROS COSTEIROS, 2001, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2001. 339 p. p. 317-325.
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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35.Imagem marcado/desmarcadoFAGANELLO, A.; DENARDIN, J. E.; KOCHHANN, R. A.; SATTLER, A. Efeito de tipos de dosadores de semente em semeadoras para plantio direto em pequenas unidades produtivas. Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2007. 12 p. html. (Embrapa Trigo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento Online, 44).
Tipo: Boletim de Pesquisa e DesenvolvimentoCirculação/Nível: -- - --
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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36.Imagem marcado/desmarcadoKLEIN, V. A.; KOCHHANN, R. A.; BOLLER, W. Desenvolvimento da haste para escarificação em área sob plantio direto. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 20., 1992, Londrina. Anais... [Londrina]: SBEA / IAPAR, [1992]. v. 2 p. 906-917
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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37.Imagem marcado/desmarcadoFAGANELLO, A.; KOCHHANN, R. A.; PORTELLA, J. A. Desenvolvimento de mecanismos de corte para semeadora de plantio direto. Jornal do Plantio Direto, Passo Fundo, v. 2, n. 11, p. 12, jul./ago. 1992.
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38.Imagem marcado/desmarcadoFAGANELLO, A.; KOCHHANN, R. A.; PORTELLA, J. A. Desenvolvimento de mecanismos de corte para semeadoras de plantio direto. (b) Jornal do Plantio Direto, Passo Fundo, v. 2, n. 11, p. 12, jul./ago. 1992.
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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39.Imagem marcado/desmarcadoFAGANELLO, A.; KOCHHANN, R. A.; PORTELLA, J. A. Desenvolvimento de mecanismos de corte para semeadoras de plantio direto. (a) In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 21. / SIMPÓSIO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA DO CONE SUL, 1., 1992, Santa Maria. Anais... Santa Maria: Sociedade Brasileira de Engenharia Agrícola: Universidade Federal de Santa Maria - Centro de Ciências Rurais - Departamento de Engenharia Rural, 1992. v. 3 p. 1262-1271
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40.Imagem marcado/desmarcadoKOCHHANN, R. A.; DENARDIN, J. E.; FAGANELLO, A. Efeito da descontinuidade do sistema plantio direto, dez anos apos sua adoção, sobre o rendimento de trigo. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE TRIGO, 18., 1999, Passo Fundo. Anais... Passo Fundo: Embrapa Trigo, 1999. v. 2 p. 674-678
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