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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
07/02/2024 |
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Data da última atualização: |
07/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, H. A. da; PESSÔA, D. D. V.; MENESES, C. H. G. de; CAETANTO, V. S.; PACHECO, R. S.; ARAUJO, J. L. S. de. |
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Afiliação: |
HELDER ANDERSON DA SILVA, UFRJ; DANIELLA DUARTE VILLARINHO PESSÔA, UFRJ; CARLOS HENRIQUE GADELHA DE MENESES, UFPB; VANESSA SANTANA CAETANO, UFRJ; RAFAEL SANCHES PACHECO, UFRRJ; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB. |
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Título: |
Unraveling the drought-responsive transcriptomes in nodules of two common bean genotypes during biological nitrogen fixation. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v. 15, 134539, jan. 2024. Sec. Plant Symbiotic Interactions |
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ISSN: |
1664-462X |
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DOI: |
https://doi.org/10.3389/fpls.2024.1345379 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
ommon bean (Phaseolus vulgaris) can efficiently fix atmospheric nitrogen when associated with Rhizobia. However, drought stress impairs plant metabolic processes, especially the biological nitrogen fixation (BNF). Here, we assessed transcriptional responses in nodules of two common bean genotypes to drought stress under BNF reliance. The RNA-Seq analysis yielded a total of 81,489,262 and 72,497,478 high quality reads for Negro Argel and BAT 477 genotypes, respectively. The reads were mapped to the Phaseolus vulgaris reference genome and expression analysis identified 145 and 1451 differentially expressed genes (DEGs) for Negro Argel and BAT 477 genotypes, respectively. Although BAT 477 had more DEGs, both genotypes shared certain drought-responsive genes, including an up-regulated heat shock protein (HSP) and a down-regulated peroxidase, indicating shared pathways activated during drought in nodule tissue. Functional analysis using MapMan software highlighted the up-regulation of genes involved in abiotic stress responses, such as HSPs and specific transcription factors (TFs), in both genotypes. There was a significant down-regulation in metabolic pathways related to antioxidant protection, hormone signaling, metabolism, and transcriptional regulation. To validate these findings, we conducted RT-qPCR experiments for ten DEGs in nodules from both genotypes, for which the expression profile was confirmed, thus reinforcing their functional relevance in the nodule responses to drought stress during BNF. BAT 477 genotype exhibited more pronounced response to drought, characterized by a high number of DEGs. The strong down-regulation of DEGs leads to transcriptional disturbances in several pathways related to stress acclimation such as hormone and antioxidant metabolism. Additionally, we identified several genes that are known to play key roles in enhancing drought tolerance, such as HSPs and crucial TFs. Our results provide new insights into the transcriptional responses in root-nodules, an underexplored tissue of plants mainly under drought conditions. This research paves the way for potential improvements in plant-bacteria interactions, contributing to common bean adaptations in the face of challenging environmental conditions. Menosommon bean (Phaseolus vulgaris) can efficiently fix atmospheric nitrogen when associated with Rhizobia. However, drought stress impairs plant metabolic processes, especially the biological nitrogen fixation (BNF). Here, we assessed transcriptional responses in nodules of two common bean genotypes to drought stress under BNF reliance. The RNA-Seq analysis yielded a total of 81,489,262 and 72,497,478 high quality reads for Negro Argel and BAT 477 genotypes, respectively. The reads were mapped to the Phaseolus vulgaris reference genome and expression analysis identified 145 and 1451 differentially expressed genes (DEGs) for Negro Argel and BAT 477 genotypes, respectively. Although BAT 477 had more DEGs, both genotypes shared certain drought-responsive genes, including an up-regulated heat shock protein (HSP) and a down-regulated peroxidase, indicating shared pathways activated during drought in nodule tissue. Functional analysis using MapMan software highlighted the up-regulation of genes involved in abiotic stress responses, such as HSPs and specific transcription factors (TFs), in both genotypes. There was a significant down-regulation in metabolic pathways related to antioxidant protection, hormone signaling, metabolism, and transcriptional regulation. To validate these findings, we conducted RT-qPCR experiments for ten DEGs in nodules from both genotypes, for which the expression profile was confirmed, thus reinforcing their functional relevance in the nodule responses to d... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Nodule; Plant-Bacteria Association; Transcriptome analysis. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 35 | |
| 7. |  | SOUZA, F. C. de; CHAGAS, E. C.; DAIRIKI, J. K.; ALMEIDA, F. F. L. de; BOIJINK, C. de L. Heparina e EDTA como anticoagulantes para matrinxã (Brycon amazonicus). In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA OCIDENTAL, 8., 2011, Manaus. Anais... Manaus: Embrapa Amazônia Ocidental, 2012. p. 53-60. (Embrapa Amazônia Ocidental. Documentos, 99).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 8. | | SOUZA, F. C. de; CARVALHO, M. R. M.; PADRÃO, M. C. de V.; MELO, P. E. de. Melhoramento de batata para cultivo orgânico: três anos de seleção em campo. Horticultura Brasíleira, Brasília, DF, v. 27, n. 2, p. S3852-S3859, ago. 2009. CD-ROM. Suplemento. Trabalho apresentado no 49. Congresso Brasileiro de Olericultura, Águas de Lindóia, SP.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 9. | | CAMILO, B. G.; RODRIGUES, L. dos S.; SOUZA, F. C. de; PENA JUNIOR, J.; CALDEIRA, D. C. D.; MARRIEL, I. E. Atividade biológica de solo de cerrado adicionado de resíduo umido de cervejaria e cultivado com milho: I. Atividade da urease e arginase. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 34., 2013, Florianópolis. Ciência do solo: para quê e para quem: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 10. | | FLOSS, E. L.; MOREIRA, J. C. S.; SOUZA, F. C. de; CARVALHO, F. I. de; BARRETO, I. L.; ZAMBRA, J.; GOELLNER, C. I. Ensaio regional de rendimento de grãos de aveia, em 1979. In: UNIVERSIDADE DE PASSO FUNDO. Faculdade de Agronomia. Produção científica da Faculdade de Agronomia da Universidade de Passo Fundo (1971 a 1983). Passo Fundo, 1983. p. 61-62 (UPF-Agronomia. Boletim de Pesquisa, 6).| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 11. | | FLOSS, E. L.; MOREIRA, J. C. S.; SOUZA, F. C. de; CARVALHO, F. I. de; BARRETO, I. L.; ZAMBRA, J.; GOELNER, C. Ensaio regional de rendimento de grãos de aveia, em 1979. In: UNIVERSIDADE DE PASSO FUNDO. Faculdade de Agronomia. Resultados de pesquisa de aveia obtidos na Faculdade de Agronomia da Universidade de Passo Fundo, em 1979. Passo Fundo, 1980. p. 42-56 (UPF-Agronomia. Relatório de Pesquisa, 3).| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 12. | | CACAU, F. V.; REIS, G. G. dos; REIS, M. das G. F.; LEITE, H. G.; ALVES, F. de F.; SOUZA, F. C. de. Decepa de plantas jovens de eucalipto e manejo de brotações, em um sistema agroflorestal. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 11, p. 1457-1465, nov. 2008. Título em inglês: Juvenile eucalypt plant coppicing and sprout management in agroforestry system.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 15. | | SILVA, C. V. J.; ARAGÃO, L. E. O. C.; BARLOW, J.; ESPIRITO-SANTO, F.; YOUNG, P. J.; ANDERSON, L. O.; BERENGUER, E.; BRASIL, I.; BROWN, I. F.; CASTRO, B.; FARIAS, R.; FERREIRA, J. N.; FRANÇA, F.; GRAÇA, P. M. L. A.; KIRSTEN, L.; LOPES, A. P.; SALIMON, C.; SCARANELLO, M. A.; SEIXAS, M.; SOUZA, F. C.; XAUD, H. A. M. Drought-induced Amazonian wildfires instigate a decadal-scale disruption of forest carbon dynamics. Philosophical Transactions of the Royal Society B, v. 373, n. 1760, p. 1-12, Nov. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Roraima. |
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| 16. | | NEVES, D. M.; DEXTER, K. G.; BAKER, T. R.; SOUZA, F. C. de; OLIVEIRA-FILHO, A. T.; QUEIROZ, L. P.; LIMA, H. C.; SIMON, M. F.; LEWIS, G. P.; SEGOVIA, R. A.; ARROYO, L.; REYNEL, C.; MARCELO-PEÑA, J. L.; HUAMANTUPA-CHUQUIMACO, I.; VILLARROEL, D.; PARADA, G. A.; DAZA, A.; LINARES-PALOMINO, R.; FERREIRA, L. V.; SALOMÃO, R. P.; SIQUEIRA, G. S.; NASCIMENTO, M. T.; FRAGA, C. N.; PENNINGTON, R. T. Evolutionary diversity in tropical tree communities peaks at intermediate precipitation. Scientific Reports, v. 10, n. 1, 1188, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 17. | | TAVARES, J. V.; OLIVEIRA, R. S.; MENCUCCINI, M.; SIGNORI-MÜLLER , C.; PEREIRA, L.; DINIZ, F. C.; GILPIN, M.; ZEVALLOS, M. J. M.; SALAS YUPAYCCANA, C. A.; ACOSTA, M.; PÉREZ MULLISACA, F. M.; BARROS, F. de V.; BITTENCOURT, P.; JANCOSKI, H.; SCALON, M. C.; MARIMON, B. S.; MENOR, I. O.; MARIMON JUNIOR, B. H.; FANCOURT, M.; CHAMBERS-OSTLER, A.; ESQUIVEL-MUELBERT, A.; ROWLAND, L.; MEIR, P.; COSTA, A. C. L. da; NINA, A.; SANCHEZ, J. M. B.; TINTAYA, J. S.; CHINO, R. S. C.; BACA, J.; FERNANDES, L.; CUMAPA, E. R. M.; SANTOS, J. A. R.; TEIXEIRA, R.; TELLO, L.; UGARTECHE, M. T. M.; CUELLAR, G. A.; MARTINEZ, F.; ARAUJO-MURAKAMI, A.; ALMEIDA, E.; CRUZ, W. J. A. da; PASQUEL, J. del A.; ARAGÃO, L.; BAKER, T. R.; CAMARGO, P. B. de; BRIENEN, R.; CASTRO, W.; RIBEIRO, S. C.; SOUZA, F. C. de; COSIO, E. G.; CARDOZO, N. D.; SILVA, R. da C.; DISNEY, M.; ESPEJO, J. S.; FELDPAUSCH, T. R.; FERREIRA, L.; GIACOMIN, L.; HIGUCHI, N.; HIROTA, M.; HONORIO, E.; HUASCO, W. H.; LEWIS, S.; FLORES LLAMPAZO, G.; MALHI, Y.; MONTEAGUDO MENDOZA, A.; MORANDI, P.; MOSCOSO, V. C.; MUSCARELLA, R.; PENHA, D.; ROCHA, M. C.; RODRIGUES, G.; RUSCHEL, A. R.; SALINAS, N.; SCHLICKMANN, M.; SILVEIRA, M.; TALBOT, J.; VÁSQUEZ, R.; VEDOVATO, L.; VIEIRA, S. A.; PHILLIPS, O. L.; GLOOR, E.; GALBRAITH, D. R. Basin-wide variation in tree hydraulic safety margins predicts the carbon balance of Amazon forests. Nature, v. 617, p. 111-117, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 18. | | POORTER, L.; SANDE, M. T. van der; THOMPSON, J.; ARETS, E. J. M. M.; ALARCÓN, A.; ÁLVAREZ-SÁNCHEZ, J.; ASCARRUNZ, N.; BALVANERA, P.; BARAJAS-GUZMÁN, G.; BOIT, A.; BONGERS, F.; CARVALHO, F. A.; CASANOVES, F.; CORNEJO-TENORIO, G.; COSTA, F. R. C.; CASTILHO, C. V. de; DUIVENVOORDEN, J. F.; DUTRIEUX, L. P.; ENQUIST, J. P.; FERNÁNDEZ-MÉNDEZ, F.; FINEGAN, B.; GORMLEY, L. H. L.; HEALEY, J. R.; HOOSBEEK, M. R.; IBARRA-MANRÍQUEZ, G.; JUNQUEIRA, A. B.; LEVIS, C.; LICONA, J. C.; LISBOA, L. S.; MAGNUSSON, W. E.; MARTÍNEZ-RAMOS, M.; MARTÍNEZ-YRIZAR, A.; MARTORANO, L. G.; MASKELL, L. C.; MAZZEI, L.; MEAVE, J. A.; MORA, F.; MUÑOZ, R.; NYTCH, C.; PANSONATO, M. P.; PARR, T. W.; PAZ, H.; PÉREZ-GARCIA, E. A.; RENTERÍA, L. Y.; RODRÍGUEZ-VELÁZQUEZ, J.; ROZENDAAL, D. M. A.; RUSCHEL, A. R.; SAKSCHEWSKI, B.; SALGADO-NEGRET, B.; SCHIETT, J.; SIMÕES, M.; SINCLAIR, F. L.; SOUZA, P. F.; SOUZA, F. C.; STROPP, J.; STEEGE, H. ter; SWENSON, N. G.; THONICKE, K.; TOLEDO, M.; URIARTE, M.; HOUT, P. van der; WALKER, P.; ZAMORA, N.; PEÑA-CLAROS, M. Diversity enhances carbon storage in tropical forests. Global Ecology and Biogeography, v. 24, n. 11, p. 1314-1328, Nov. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Roraima; Embrapa Solos. |
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| 19. | | MARCA-ZEVALLOS, M. J.; MOULATLET, G. M.; SOUSA, T. R.; SCHIETTI, J.; COELHO, L. de S.; RAMOS, J. F.; LIMA FILHO, D. de A.; AMARAL, I. L.; MATOS, F. D. de A.; RINCÓN, L. M.; REVILLA, J. D. C.; PANSONATO, M. P.; GRIBEL, R.; BARBOSA, E. M.; MIRANDA, I. P. de A.; BONATES, L. C. de M.; GUEVARA, J. E.; SALOMÃO, R. P.; FERREIRA, L. V.; AMARAL, D. D. do; PITMAN, N. C. A.; VRIESENDORP, C.; BAKER, T. R.; BRIENEN, R.; CARIM, M. de J. V.; GUIMARÃES, J. R. da S.; VARGAS, P. N.; HUAMANTUPA-CHUQUIMACO, I.; LAURANCE, W. F.; LAURANCE, S. G. W.; ANDRADE, A.; CAMARGO, J. L.; MENDOZA, A. M.; VASQUEZ, R.; GAMARRA, L. V.; MOGOLLÓN, H. F.; MARIMON-JUNIOR, B. H.; MARIMON, B. S.; KILLEEN, T. J.; FARIAS, E. de S.; NEILL, D.; MEDEIROS, M. B. de; SIMON, M. F.; TERBORGH, J.; MONTERO, J. C.; LICONA, J. C.; MOSTACEDO, B.; GARCÍA-VILLACORTA, R.; ARAUJO-MURAKAMI, A.; ARROYO, L.; VILLARROEL, D.; DÁVILA, N.; SOUZA, F. C. de; CARVALHO, F. A.; COMISKEY, J. A.; ALONSO, A.; DALLMEIER, F.; OLIVEIRA, A. A.; CASTILHO, C. V. de; LLOYD, J.; FELDPAUSCH, T. R.; PAREDES, M. R.; ARBOLEDA, N. C.; LÓPEZ, D. C.; CORREDOR, G. A. A.; FIORE, A. di; RUDAS, A.; PRIETO, A.; BARBOSA, F. R.; NORONHA, J. C.; RODRIGUES, D. de J.; CARPANEDO, R. de S.; CORONADO, E. N. H.; PERES, C. A.; MILLIKEN, W.; FUENTES, A.; TELLO, J. S.; CERÓN, C.; KLITGAARD, B.; TIRADO, M.; SIERRA, R.; YOUNG, K. R.; RIVAS-TORRES, G. F.; STEVENSON, P. R.; CANO, A.; WANG, O.; BAIDER, C.; BARLOW, J.; FERREIRA, J. N.; BERENGUER, E.; STROPP, J.; BALSLEV, H.; REATEGUI, M. A. A.; MESONES, I.; SANDOVAL, E. H. V.; GONZALES, T.; PANSINI, S.; REIS, N. F. C.; SAMPAIO, A. F.; VOS, V. A.; CUENCA, W. P.; MANZATTO, A. G.; FARFAN-RIOS, W.; SILMAN, M. R.; GARCIA-CABRERA, K.; HILDEBRAND, P. von; GUEDES, M. C.; COSTA, J. B. P.; PHILLIPS, J. F.; VELA, C. I. A.; TOLEDO, J. J. de; PAULETTO, D.; VALVERDE, F. C.; UMAÑA, M. N.; PHILLIPS, O. L.; MAGNUSSON, W. E.; STEEGE, H. ter; COSTA, F. R. C. Local hydrological conditions influence tree diversity and composition across the Amazon basin. Ecography, v. 11, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Roraima. |
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| 20. | | BENNETT, A. C.; SOUSA, T. R. de; MONTEAGUDO-MENDOZA , A.; ESQUIVEL-MUELBERT, A.; MORANDI, P. S.; SOUZA, F. C. de; CASTRO, W.; DUQUE, L. F.; LLAMPAZO, G. F.; SANTOS, R. M. dos; RAMOS, E.; TORRE, E. V.; ALVAREZ-DAVILA, E.; BAKER, T. R.; COSTA, F. R, C.; LEWIS, S. L.; MARIMON, B. S.; SCHIETTI, J.; BURBAN, B.; BERENGUER, E.; ARAUJO-MURAKAMI, A.; CORREA, Z. R.; LOPEZ, W.; SANTANA, F. D.; VISCARRA, L. J.; ELIAS, F.; VASQUEZ MARTINEZ, R.; MARIMON-JUNIOR, B. H.; GALBRAITH, G.; SULLIVAN, M. J. P.; EMILIO, T.; PRESTES, N. C. C. S.; BARLOW, J.; FAGUNDES, N. C. A.; OLIVEIRA, E. A. de; LOAYZA, P. A.; ALVES, L. F.; VIEIRA, S. A.; MAIA, V. A.; ARAGÃO, L. E. O. C.; ARETS, E. J. M. M.; ARROYO, L.; BÁNKI, O.; BARALOTO, C.; CAMARGO, P. B.; BARROSO, J.; SILVA, W. B. da; BONAL, D.; SANTOS, A. B. M.; BRIENEN, R. J. W.; BROWN, F.; CASTILHO, C. V. de; RIBEIRO, S. C.; MOSCOSO, V. C.; CHAVEZ, E.; COMISKEY, J. A.; VALVERDE, F. C.; CARDOZO, N. D.; MELO, L. de O.; AGUILA PASQUEL, J. del; DERROIRE, D.; DISNEY, M.; AURÉLIE DOURDAIN, M. do S.; FELDPAUSCH, T. R.; FERREIRA, J. N.; MARTINS, V. F.; GARDNER, T.; GLOOR, E.; SIBAUTY, G. G.; GUILLEN, R.; HASE, E.; HÉRAULT, B.; CORONADO, E. N. H.; HUARACA HUASCO, W.; JANOVEC, J. P.; JIMENEZ-ROJAS, E.; JOLY, C.; KALAMANDEEN, M.; KILLEEN, T. J.; FARRAPO, C. L.; LEVESLEY, A.; ROMANO, L. L.; LOPEZ GONZALEZ, G.; SANTOS, F. A. M. dos; MAGNUSSON, W. E.; MALHI, Y.; REIS, S. M. de A.; MELGAÇO, K.; CRUZ, O. A. M.; MENDOZA POLO, I.; MONTAÑEZ, T.; MOREL, J. D.; NÚÑEZ VARGAS, M. P.; ARAÚJO, R. O. de; CAMACHO, N. C. P.; GUTIERREZ, A. P.; PENNINGTON, T.; PICKAVANCE, G. C.; PIPOLY, J.; PITMAN, N. C. A.; QUESADA, C.; RAMIREZ AREVALO, F.; RAMÍREZ‐ANGULO, H.; RAMOS, R. F.; RICHARDSON, J. E.; SOUZA, C. R. de; ROOPSIND, A.; SCHWARTZ, G.; SILVA. R. C.; ESPEJO, J. S.; SILVEIRA, M.; SINGH, J.; SHAREVA, Y. S.; STEININGER, M.; STROPP, J.; TALBOT, J.; STEEGE, H. Ter; TERBORGH, J.; THOMAS, R.; VALENZUELA GAMARRA, L.; HEIJDEN, G. van den; HOUT, P, van den; ZAGT, r.; PHILLIPS, O. L. Sensitivity of South American tropical forests to an extreme climate anomaly. Nature Climate Change, v. 13, p. 967-974, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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