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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
Data corrente: |
22/02/2008 |
Data da última atualização: |
06/06/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
GRISI, M. C. M.; BLAIR, M. W.; GEPTS, P.; BRONDANI, C.; PEREIRA, P. A. A.; BRONDANI, R. P. V. |
Afiliação: |
M. C. M. GRISI, UFG; M. W. BLAIR, CIAT; P. GEPTS, University of California, Davis; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; PEDRO ANTONIO ARRAES PEREIRA, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
Título: |
Genetic mapping of a new set of microsatellite markers in a reference common bean (Phaseolus vulgaris) population BAT93 x Jalo EEP558. |
Ano de publicação: |
2007 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 6, n. 3, p. 691-706, Sept. 2007. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The present study describes a new set of 61 polymorphic microsatellite markers for beans and the construction of a genetic map using the BAT93 x Jalo EEP558 (BJ) population for the purpose of developing a reference linkage map for common bean (Phaseolus vulgaris). The main objectives were to integrate new microsatellites on the existing framework map of the BJ population, and to develop the first linkage map for the BJ population based exclusively on microsatellites. Of the total of 264 microsatellites evaluated for polymorphism, 42.8% showed polymorphism between the genitors. An integrated map was created totaling 199 mapped markers in 13 linkage groups, with an observed length of 1358 cM and a mean distance between markers of 7.23 cM. For the map constructed exclusively with microsatellites, 106 markers were placed in 12 groups with a total length of 606.8 cM and average distance of 6.8 cM. Linkage group designation and marker order for BM microsatellites generally agreed with previous mapping, while the new microsatellites were well distributed across the genome, corroborating the utility of the BJ population for a reference map. The extensive use of the microsatellites and the availability of a reference map can help in the development of other genetic maps for common bean through the transfer of information of marker order and linkage, which will allow comparative analysis and map integration, especially for future quantitative trait loci and association mapping studies. |
Palavras-Chave: |
Legume genome; Reference map; Simple sequence repeat. |
Thesagro: |
Feijão; Marcador Molecular; Phaseolus Vulgaris. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/216119/1/gmr-2007.pdf
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Marc: |
LEADER 02297naa a2200253 a 4500 001 1216119 005 2022-06-06 008 2007 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aGRISI, M. C. M. 245 $aGenetic mapping of a new set of microsatellite markers in a reference common bean (Phaseolus vulgaris) population BAT93 x Jalo EEP558.$h[electronic resource] 260 $c2007 520 $aThe present study describes a new set of 61 polymorphic microsatellite markers for beans and the construction of a genetic map using the BAT93 x Jalo EEP558 (BJ) population for the purpose of developing a reference linkage map for common bean (Phaseolus vulgaris). The main objectives were to integrate new microsatellites on the existing framework map of the BJ population, and to develop the first linkage map for the BJ population based exclusively on microsatellites. Of the total of 264 microsatellites evaluated for polymorphism, 42.8% showed polymorphism between the genitors. An integrated map was created totaling 199 mapped markers in 13 linkage groups, with an observed length of 1358 cM and a mean distance between markers of 7.23 cM. For the map constructed exclusively with microsatellites, 106 markers were placed in 12 groups with a total length of 606.8 cM and average distance of 6.8 cM. Linkage group designation and marker order for BM microsatellites generally agreed with previous mapping, while the new microsatellites were well distributed across the genome, corroborating the utility of the BJ population for a reference map. The extensive use of the microsatellites and the availability of a reference map can help in the development of other genetic maps for common bean through the transfer of information of marker order and linkage, which will allow comparative analysis and map integration, especially for future quantitative trait loci and association mapping studies. 650 $aFeijão 650 $aMarcador Molecular 650 $aPhaseolus Vulgaris 653 $aLegume genome 653 $aReference map 653 $aSimple sequence repeat 700 1 $aBLAIR, M. W. 700 1 $aGEPTS, P. 700 1 $aBRONDANI, C. 700 1 $aPEREIRA, P. A. A. 700 1 $aBRONDANI, R. P. V. 773 $tGenetics and Molecular Research$gv. 6, n. 3, p. 691-706, Sept. 2007.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
Data corrente: |
03/02/2011 |
Data da última atualização: |
30/01/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
B - 3 |
Autoria: |
SELLE, G. L.; VUADEN, E.; ALBERNARD, L. A. J. de; BRAZ, E. M. |
Afiliação: |
GERSON LUIZ SELLE, UFSM; ELISABETE VUADEN, UFSM; LUIZ ANTÔNIO JACQUES DE ALBERNARD; EVALDO MUNOZ BRAZ, CNPF. |
Título: |
Simulação de desbaste em povoamento de Hovenia dulcis mediante dendograma de manejo de densidade. |
Ano de publicação: |
2010 |
Fonte/Imprenta: |
Floresta, Curitiba, v. 40, n. 3, p. 647-662, jul./set. 2010. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de estudar a densidade e simular intervenções, por meio de dendrogramas de manejo de densidade, em uma população de Hovenia dulcis localizada na região central do estado do Rio Grande do Sul. Para tanto, foram utilizados dados de diâmetro de copa e de fuste, coletados em três estratos: dominante, intermediário e dominado, pelo método da Densidade Pontual de Spurr, num povoamento de aproximadamente 1,3 hectares de uva do Japão com 25 anos de idade. Devido o local de coleta das informações apresentar grande variação na altura dominante, este foi dividido em Sítios I e II. Entre os estratos verificou-se que somente ocorreu diferença estatística significativa entre o estrato dominante do Sítio I e os demais de ambos os sítios. O coeficiente angular do ajuste das linhas de densidade ficaram estabelecidos, para o estrato dominante do Sítio I em -2,492 e, para os demais, em -1,085. A melhor forma de conduzir o povoamento seria aplicando um desbaste, se o mesmo fosse formado somente por árvores com dimensões semelhantes às do estrato dominante do Sítio I, e quatro intervenções se fosse constituído somente de indivíduos pertencentes aos demais estratos. |
Palavras-Chave: |
Modelo; Reineke; Sítio. |
Thesagro: |
Desbaste. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 01807naa a2200205 a 4500 001 1875617 005 2018-01-30 008 2010 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSELLE, G. L. 245 $aSimulação de desbaste em povoamento de Hovenia dulcis mediante dendograma de manejo de densidade. 260 $c2010 520 $aEste trabalho foi desenvolvido com o objetivo de estudar a densidade e simular intervenções, por meio de dendrogramas de manejo de densidade, em uma população de Hovenia dulcis localizada na região central do estado do Rio Grande do Sul. Para tanto, foram utilizados dados de diâmetro de copa e de fuste, coletados em três estratos: dominante, intermediário e dominado, pelo método da Densidade Pontual de Spurr, num povoamento de aproximadamente 1,3 hectares de uva do Japão com 25 anos de idade. Devido o local de coleta das informações apresentar grande variação na altura dominante, este foi dividido em Sítios I e II. Entre os estratos verificou-se que somente ocorreu diferença estatística significativa entre o estrato dominante do Sítio I e os demais de ambos os sítios. O coeficiente angular do ajuste das linhas de densidade ficaram estabelecidos, para o estrato dominante do Sítio I em -2,492 e, para os demais, em -1,085. A melhor forma de conduzir o povoamento seria aplicando um desbaste, se o mesmo fosse formado somente por árvores com dimensões semelhantes às do estrato dominante do Sítio I, e quatro intervenções se fosse constituído somente de indivíduos pertencentes aos demais estratos. 650 $aDesbaste 653 $aModelo 653 $aReineke 653 $aSítio 700 1 $aVUADEN, E. 700 1 $aALBERNARD, L. A. J. de 700 1 $aBRAZ, E. M. 773 $tFloresta, Curitiba$gv. 40, n. 3, p. 647-662, jul./set. 2010.
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Embrapa Florestas (CNPF) |
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