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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Instrumentação. |
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Data corrente: |
19/10/2021 |
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Data da última atualização: |
09/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOARES, J. C.; SOARES, A. C.; RODRIGUES, V. C.; OITICICA, P. R. A.; RAYMUNDO-PEREIRA, P. A.; BOTT-NETO, J. L.; BUSCAGLIA, L. A.; CASTRO, L. D. C. de; RIBAS, L. C.; SCABINI, L.; BRAZACA, L. C.; CORREA, D. S.; MATTOSO, L. H. C.; OLIVEIRA, M. C. F. de; CARVALHO, A. C. P. L. de; CARRILHO, E.; BRUNO, O. M.; MELENDEZ, M. E.; OLIVEIRA JR, O. N. |
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Afiliação: |
DANIEL SOUZA CORREA, CNPDIA; LUIZ HENRIQUE CAPPARELLI MATTOSO, CNPDIA. |
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Título: |
Detection of a SARS-CoV-2 sequence with genosensors using data analysis based on information visualization and machine learning techniques. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Materials Chemistry Frontiers, v. 5, 2021. |
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Páginas: |
5658-5670 |
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DOI: |
10.1039/d1qm00665g |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
We report on genosensors to detect an ssDNA sequence from the SARS-CoV-2 genome, which mimics the GU280 gp10 gene (coding the viral nucleocapsid phosphoprotein), using four distinct principles of detection and treating the data with information visualization and machine learning techniques. Genosensors were fabricated on either gold (Au) interdigitated electrodes for electrical and electrochemical measurements or on Au nanoparticles on a glass slide for optical measurements. They contained a matrix of 11-mercaptoundecanoic acid (11-MUA) self-assembled monolayer (SAM) onto which a layer of capture probe (cpDNA) sequence was immobilized. Detection was performed using electrical and electrochemical impedance spectroscopies and localized surface plasmon resonance (LSPR). The highest sensitivity was reached with impedance spectroscopy, including using a low-cost (US$ 100) homemade impedance analyzer. Complementary ssDNA sequences were detected with a detection limit of 0.5 aM (0.3 copy per mL). This performance may be attributed to the high sensitivity of the electrical impedance technique combined with an appropriate arrangement of the sequences on the electrodes and hybridization between the complementary sequences, as inferred from polarizationmodulated infrared reflection absorption spectroscopy (PM-IRRAS). The selectivity of the genosensor was confirmed by plotting the impedance spectroscopy data with a multidimensional projection technique (interactive document mapping, IDMAP), where a clear separation was observed among the samples of the complementary DNA sequence at various concentrations and from buffer samples containing a non-complementary sequence and other DNA biomarkers. The diagnosis of SARS-CoV-2 mimicking sequences was also achieved with machine learning techniques applied to scanning electron microscope images taken from genosensors exposed to distinct concentrations of the complementary ssDNA sequences. In summary, the genosensors proposed here are promising for detecting SARS-CoV2 genetic material (RNA) in biological fluids in point-of-care settings MenosWe report on genosensors to detect an ssDNA sequence from the SARS-CoV-2 genome, which mimics the GU280 gp10 gene (coding the viral nucleocapsid phosphoprotein), using four distinct principles of detection and treating the data with information visualization and machine learning techniques. Genosensors were fabricated on either gold (Au) interdigitated electrodes for electrical and electrochemical measurements or on Au nanoparticles on a glass slide for optical measurements. They contained a matrix of 11-mercaptoundecanoic acid (11-MUA) self-assembled monolayer (SAM) onto which a layer of capture probe (cpDNA) sequence was immobilized. Detection was performed using electrical and electrochemical impedance spectroscopies and localized surface plasmon resonance (LSPR). The highest sensitivity was reached with impedance spectroscopy, including using a low-cost (US$ 100) homemade impedance analyzer. Complementary ssDNA sequences were detected with a detection limit of 0.5 aM (0.3 copy per mL). This performance may be attributed to the high sensitivity of the electrical impedance technique combined with an appropriate arrangement of the sequences on the electrodes and hybridization between the complementary sequences, as inferred from polarizationmodulated infrared reflection absorption spectroscopy (PM-IRRAS). The selectivity of the genosensor was confirmed by plotting the impedance spectroscopy data with a multidimensional projection technique (interactive document mapping, IDM... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genetic material (RNA); SsDNA; Viral nucleocapsid phosphoprotein). |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Instrumentação (CNPDIA) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
06/08/2008 |
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Data da última atualização: |
02/09/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
SOUZA FILHO, H. M. de; ROSA, F. T.; VINHOLIS, M. de M. B. |
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Afiliação: |
Hildo M. de Souza Filho, UFSCar/SÃO CARLOS,SP.; Fabiano Tito Rosa, UFSCar/SÃO CARLOS,SP.; MARCELA DE MELLO BRANDAO VINHOLIS, CPPSE. |
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Título: |
Diagnóstico e recomendações para aumento da competitividade da cadeia produtiva de carne bovina do Estado de São Paulo. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ECONOMIA, ADMINISTRAÇÃO E SOCIOLOGIA RURAL, 46., 2008, Rio Branco, AC. Anais... Rio Branco: SOBER, 2008. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O Brasil é o principal player do mercado mundial de carne bovina, sendo que São Paulo se destaca como maior exportador e segundo maior produtor nacional do produto. Porém, o Estado vem perdendo market share, pois nos últimos anos a maior parte dos investimentos produtivos têm se concentrado no Centro-Norte do país. Através do levantamento de dados estatísticos, de revisão bibliográfica e de entrevistas com agentes-chave, o presente estudo identificou os principais aspectos críticos da competitividade da cadeia produtiva da carne bovina de São Paulo. Entre os desfavoráveis, destacam-se a reduzida oferta relativa de matéria-prima (animais para abate), a "guerra fiscal" entre Estados (questão tributária) e os custos de produção relativamente elevados. Os favoráveis são, principalmente, as boas condições de infra-estrutura logística e de P&D, a qualidade da mão de obra e a proximidade do principal mercado consumidor. Entre as ações recomendadas para o aumento da competitividade da cadeia produtiva do Estado destacam-se aquelas relacionadas ao incentivo à pesquisa e à difusão de tecnologias, às estratégias de agregação de valor à carne paulista, as certificações e a melhoria dos status/padrão sanitário e, por fim, a revisão do sistema tributário. |
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Palavras-Chave: |
Carne bovina; Competitividade; São Paulo. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/41015/1/PROCIMMBV2008.00021.pdf
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Marc: |
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245 $aDiagnóstico e recomendações para aumento da competitividade da cadeia produtiva de carne bovina do Estado de São Paulo.
260 $aIn: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ECONOMIA, ADMINISTRAÇÃO E SOCIOLOGIA RURAL, 46., 2008, Rio Branco, AC. Anais... Rio Branco: SOBER$c2008
300 $c1 CD-ROM.
520 $aO Brasil é o principal player do mercado mundial de carne bovina, sendo que São Paulo se destaca como maior exportador e segundo maior produtor nacional do produto. Porém, o Estado vem perdendo market share, pois nos últimos anos a maior parte dos investimentos produtivos têm se concentrado no Centro-Norte do país. Através do levantamento de dados estatísticos, de revisão bibliográfica e de entrevistas com agentes-chave, o presente estudo identificou os principais aspectos críticos da competitividade da cadeia produtiva da carne bovina de São Paulo. Entre os desfavoráveis, destacam-se a reduzida oferta relativa de matéria-prima (animais para abate), a "guerra fiscal" entre Estados (questão tributária) e os custos de produção relativamente elevados. Os favoráveis são, principalmente, as boas condições de infra-estrutura logística e de P&D, a qualidade da mão de obra e a proximidade do principal mercado consumidor. Entre as ações recomendadas para o aumento da competitividade da cadeia produtiva do Estado destacam-se aquelas relacionadas ao incentivo à pesquisa e à difusão de tecnologias, às estratégias de agregação de valor à carne paulista, as certificações e a melhoria dos status/padrão sanitário e, por fim, a revisão do sistema tributário.
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653 $aCompetitividade
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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