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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
10/11/2020 |
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Data da última atualização: |
10/11/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, H. C. de; IBELLI, A. M. G.; GUIMARÃES, S. E. F.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO. L. L.; LEDUR, M. C. |
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Afiliação: |
HANIEL CEDRAZ DE OLIVEIRA, UFL; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARÃES, UFL; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; LUIZ LEHMANN COUTINHO, USP; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
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Título: |
RNA-seq reveals downregulated osteochondral genes potentially related totibia bacterial chondronecrosis with osteomyelitis in broilers. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genetics, v. 21, n. 58, 2020. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1186/s12863-020-00862-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract Background: Bacterial chondronecrosis with osteomyelitis (BCO) develops in the growth plate (GP) of the proximal femur and tibia and is initiated by damage to the less mineralized chondrocytes followed by colonization of opportunistic bacteria. This condition affects approximately 1% of all birds housed, being considered one of the major causes of lameness in fast growing broilers. Although several studies have been previously performed aiming to understand its pathogenesis, the molecular mechanisms involved with BCO remains to be elucidated. Therefore, this study aimed to generate a profile of global differential gene expression involved with BCO in the tibia of commercial broilers, through RNA sequencing analysis to identity genes and molecular pathways involved with BCO in chickens. Results: Our data showed 192 differentially expressed (DE) genes: 63 upregulated and 129 downregulated in the GP of the tibia proximal epiphysis of BCO-affected broilers. Using all DE genes, six Biological Processes (BP) were associated with bone development (connective tissue development, cartilage development, skeletal system development, organ morphogenesis, system development and skeletal system morphogenesis). The analyses of the upregulated genes did not indicate any significant BP (FDR < 0.05). However, with the downregulated genes, the same BP were identified when using all DE genes in the analysis, with a total of 26 coding genes explaining BCO in the tibia: ACAN, ALDH1A2, CDH7, CHAD, CHADL, COL11A1, COMP, CSGALNACT1, CYR61, FRZB, GAL3ST1, HAPLN1, IHH, KIF26B, LECT1, LPPR1, PDE6B, RBP4A, SERINC5, SFRP1, SOX8, SOX9, TENM2, THBS1, UCHL1 and WFIKKN2. In addition, seven transcription factors were also associated to BCO: NFATC2, MAFB, HIF1A-ARNT, EWSR1-FLI1, NFIC, TCF3 and NF-KAPPAB. Conclusions: Our data show that osteochondral downregulated genes are potential molecular causes of BCO in broilers, and the bacterial process seems to be, in fact, a secondary condition. Sixteen genes responsible for bone and cartilage formation were downregulated in BCO-affected broilers being strong candidate genes to trigger this disorder. MenosAbstract Background: Bacterial chondronecrosis with osteomyelitis (BCO) develops in the growth plate (GP) of the proximal femur and tibia and is initiated by damage to the less mineralized chondrocytes followed by colonization of opportunistic bacteria. This condition affects approximately 1% of all birds housed, being considered one of the major causes of lameness in fast growing broilers. Although several studies have been previously performed aiming to understand its pathogenesis, the molecular mechanisms involved with BCO remains to be elucidated. Therefore, this study aimed to generate a profile of global differential gene expression involved with BCO in the tibia of commercial broilers, through RNA sequencing analysis to identity genes and molecular pathways involved with BCO in chickens. Results: Our data showed 192 differentially expressed (DE) genes: 63 upregulated and 129 downregulated in the GP of the tibia proximal epiphysis of BCO-affected broilers. Using all DE genes, six Biological Processes (BP) were associated with bone development (connective tissue development, cartilage development, skeletal system development, organ morphogenesis, system development and skeletal system morphogenesis). The analyses of the upregulated genes did not indicate any significant BP (FDR < 0.05). However, with the downregulated genes, the same BP were identified when using all DE genes in the analysis, with a total of 26 coding genes explaining BCO in the tibia: ACAN, ALDH1A2, CD... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
BCO; RNA-Seq. |
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Thesagro: |
Cartilagem; Claudicação; Frango de Corte; Genética Animal; Osteomielite. |
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Thesaurus Nal: |
Animal genetics; Broiler chickens; Cartilage; Gallus gallus; Lameness. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| 81. |  | PEIXOTO, J. de O.; KAWSKI, V. L.; IBELLI, A. M. G.; ZANELLA, R.; MAZZUCO, H.; SOUZA, C. G.; MUNARI, D. P.; JAENISCH, F. R. F.; LEDUR, M. C. Genetic evaluation of body weight and tibia resistance in broilers. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: WCGALP: American Society of Animal Science, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 82. | | VENDRUSCOLO, A.; MARCELINO, D. E. P.; PEIXOTO, J. de O.; TAVERNARI, F. de C.; IBELLI, A. M. G.; LEDUR, M. C. Genes referência para estudos de expressão gênica em íleo de frangos de corte aos 21 dias de idade. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 14., 2020, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2020. p. 17-18.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 83. | | ZANELLA, R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; SILVA, M. V. G. B.; GIACHETTO, P. F.; FREITAS, M.; LOPES, J.; LEDUR, M. C. Genetic associations of farrowing length in two maternal lines of pigs. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: WCGALP: American Society of Animal Science, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 86. | | CRUZ, V. A. R.; GRUPIONI, N. V.; MENDONÇA, G. G.; VENTURINI, G. C.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P. Genetic parameters for performance and carcass traits in a paternal 1 lineage of broiler. Anais da Academia Brasileira de Ciências, v. 92 (suppl. 1), n. e20180697, 2020. Anais da Academia Brasileira de Ciências, v. 92 (suppl. 1), n. e20180697, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 87. | | VENTURINI, G. C.; CRUZ, V. A. R. da; ROSA, J. O.; BALDI, F.; EL FARO, L.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P. Genetic and phenotypic parameters of carcass and organ traits of broiler chickens. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 4, p. 10294-10300.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 88. | | FEDDERN, V.; GRESSLER, V.; AROEIRA, C. N.; DALLA COSTA, O. A.; CASTILLO, C. J. C.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. A dinâmica do resíduo de ractopamina na produção de suínos: farinha de carne e ossos, tecidos e urina. In: NOGUEIRA, W. V. (Org.) Tópicos em ciência dos alimentos. Nova Xavantina: Pantanal, 2021. v. 2. p. 55-70.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 89. | | XAVIER SILVA, J.; ARAÚJO, A. C.; BRITO, L.; LEDUR, M. C.; PAIVA, S. R.; BARROS JÚNIOR, P.; PEIXOTO, J. de O.; CARNEIRO, P. L. S. Diversidade genética em populações de galinhas comerciais e nativas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 6., 2020. Recursos genéticos e bioeconomia: inovação para um futuro sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2020. Trabalho 666. Evento online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 90. | | ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; CARDOSO, F. F.; FREITAS, L.; OTAVIANO, A.; CAETANO, A. R.; LEDUR, M. C. Detecting levels of autozygosity in two pure lines of pigs using genomic and pedigree data. In: INTERNATIONAL PIG VETERINARY SOCIETY CONGRESS, 23., Cancun. Proceedings... León, México: IPVS, 2014. p. 140. p. 140| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 94. | | MARCIANO, C. M. M.; SAVOLDI, I. R.; KARMO, K. B. do; CUCCO, D. de C.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Expressão diferencial do gene MYLK2 em frangos de corte normais e afetados com White striping. In: SEMINÁRIO DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO DA UDESC OESTE, 8.; VIGÉSSIMO OITAVO SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 28.; PRIMEIRO ENCONTRO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UDESC OESTE, 2018, Chapecó. Anais... Chapecó: UDESC Oeste, 2019. 8º SEPE. 28º SIC. 1 º EPG.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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