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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
17/10/2018 |
Data da última atualização: |
18/10/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MARCHESI, J. A. P.; BUZANSKAS, M. E.; CANTAO, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; JOAQUIM, L. B.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; SBARDELLA, A. P.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P.; LEDUR, M. C. |
Afiliação: |
JORGE AUGUSTO PETROLI MARCHESI, UNESP/Jaboticabal; MARCOS ELI BUZANSKAS, UFPB; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; LETÍCIA BORGES JOAQUIM, UNESP/Jaboticabal; GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, ESALQ; THAIS FERNANDA GODOY, ESALQ; ANA PAULA SBARDELLA, UNESP/Jaboticabal; ELSIO ANTONIO PEREIRA DE FIGUEIREDO, CNPSA; LUIZ LEHMMAN COUTINHO, ESALQ; DANÍSIO PRADO MUNARI, UNESP/Jaboticabal; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
Título: |
Relationship of runs of homozygosity with adaptive and production traits in a paternal broiler line. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
Animal, v. 12, n. 6, p. 1126-1134, 2018. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract: Genomic regions under high selective pressure present specific runs of homozygosity (ROH), which provide valuable information on the genetic mechanisms underlying the adaptation to environment imposed challenges. In broiler chickens, the adaptation to conventional production systems in tropical environments lead the animals with favorable genotypes to be naturally selected, increasing the frequency of these alleles in the next generations. In this study, ~1400 chickens from a paternal broiler line were genotyped with the 600 K Affymetrix® Axiom® high-density (HD) genotyping array for estimation of linkage disequilibrium (LD), effective population size (Ne), inbreeding and ROH. The average LD between adjacent single nucleotide polymorphisms (SNPs) in all autosomes was 0.37, and the LD decay was higher in microchromosomes followed by intermediate and macrochromosomes. The Ne of the ancestral population was high and declined over time maintaining a sufficient number of animals to keep the inbreeding coefficient of this population at low levels. The ROH analysis revealed genomic regions that harbor genes associated with homeostasis maintenance and immune system mechanisms, which may have been selected in response to heat stress. Our results give a comprehensive insight into the relationship between shared ROH regions and putative regions related to survival and production traits in a paternal broiler line selected for over 20 years. These findings contribute to the understanding of the effects of environmental and artificial selection in shaping the distribution of functional variants in the chicken genome. Resumo: As regiões genômicas sob alta pressão seletiva apresentam corridas específicas de homozigose (ROH), que fornecem informações valiosas sobre os mecanismos genéticos subjacentes à adaptação aos desafios impostos pelo ambiente. Em frangos de corte, a adaptação a sistemas convencionais de produção em ambientes tropicais leva os animais com genótipos favoráveis ??a serem naturalmente selecionados, aumentando a freqüência desses alelos nas próximas gerações. Neste estudo, ~ 1400 galinhas de uma linhagem de frangos de corte foram genotipadas com o arranjo de genótipos de alta densidade (HD) Affymetrix® Axiom® 600 K para estimativa do desequilíbrio de ligação (LD), tamanho efetivo da população (Ne), endogamia e ROH. A LD média entre os polimorfismos de nucleotídeo único adjacentes (SNPs) em todos os autossomos foi de 0,37, e o decaimento LD foi maior nos microcromossomos, seguido por intermediários e macrocromossomos. O Ne da população ancestral era alto e declinou com o tempo mantendo um número suficiente de animais para manter o coeficiente de endogamia desta população em níveis baixos. A análise da ROH revelou regiões genômicas que abrigam genes associados à manutenção da homeostase e mecanismos do sistema imunológico, que podem ter sido selecionados em resposta ao estresse térmico. Nossos resultados fornecem uma visão abrangente sobre a relação entre regiões ROH compartilhadas e regiões putativas relacionadas a características de sobrevivência e produção em uma linha de frangos de corte paterna selecionada por mais de 20 anos. Estes resultados contribuem para a compreensão dos efeitos da seleção ambiental e artificial na formação da distribuição de variantes funcionais no genoma da galinha. MenosAbstract: Genomic regions under high selective pressure present specific runs of homozygosity (ROH), which provide valuable information on the genetic mechanisms underlying the adaptation to environment imposed challenges. In broiler chickens, the adaptation to conventional production systems in tropical environments lead the animals with favorable genotypes to be naturally selected, increasing the frequency of these alleles in the next generations. In this study, ~1400 chickens from a paternal broiler line were genotyped with the 600 K Affymetrix® Axiom® high-density (HD) genotyping array for estimation of linkage disequilibrium (LD), effective population size (Ne), inbreeding and ROH. The average LD between adjacent single nucleotide polymorphisms (SNPs) in all autosomes was 0.37, and the LD decay was higher in microchromosomes followed by intermediate and macrochromosomes. The Ne of the ancestral population was high and declined over time maintaining a sufficient number of animals to keep the inbreeding coefficient of this population at low levels. The ROH analysis revealed genomic regions that harbor genes associated with homeostasis maintenance and immune system mechanisms, which may have been selected in response to heat stress. Our results give a comprehensive insight into the relationship between shared ROH regions and putative regions related to survival and production traits in a paternal broiler line selected for over 20 years. These findings contribute to the und... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Frango de Corte; Melhoramento Genético Animal. |
Thesaurus Nal: |
Animal breeding; Artificial selection; Breeding and Genetic Improvement; Broiler chickens; Gallus gallus; Genomics; Inbreeding; Natural selection; Oxidative stress. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
Data corrente: |
20/10/2011 |
Data da última atualização: |
23/09/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
COSTA, H. H. A.; BARBOSA, J. dos S. R.; OLIVEIRA, D. de S.; MOTA, C. M.; COSTA, E. I. de S.; LANDIM, A. V.; VASCONCELOS, A. M. de; ROGERIO, M. C. P. |
Afiliação: |
Hélio Henrique Araújo Costa, Pós-graduando, Universidade Estadual Vale do Acaraú - UVA - Sobral, CE.; Juliana dos Santos Rodrigues Barbosa, Pós-graduanda, UVA - Sobral, CE.; Delano de Sousa Oliveira, Pós-graduando, UVA - Sobral, CE.; Carlos Mikael Mota, Graduando, UVA - Sobral, CE.; Emellinne Ingrid de Sousa Costa, Graduanda, UVA - Sobral, CE.; Aline Vieira Landim, UVA - Sobral, CE.; Ângela Maria de Vasconcelos, UVA - Sobral, CE.; MARCOS CLAUDIO PINHEIRO ROGERIO, CNPC. |
Título: |
Balanço de nitrogênio de cordeiros alimentados com dietas formuladas de acordo com o NRC (1985) e o NRC (2007). |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 21., 2011, Maceió. Inovações tecnológicas e mercado consumidor: anais. Maceió: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2011. 3 f. 1 CD-ROM. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Objetivou-se avaliar o balanço de nitrogênio (N) de cordeiros em terminação alimentados com dietas formuladas de acordo com o National Research Council - NRC (1985) e o NRC (2007). Foram utilizados dezenove cordeiros, machos, com quatro meses de idade e peso vivo médio de 17,7 kg. Os tratamentos consistiram de dietas formuladas conforme o NRC (1985) (NRC85) e o NRC (2007) considerando-se os consumos de 20%, 40% e 60% de proteína não degradável no rúmen (PNDR), aqui denominadas NRC07/20, NRC07/40 e NRC07/60, respectivamente. Foram verificados maiores valores de N ingerido para os tratamentos NRC07/20 e NRC07/40 (30,68 e 28,53 g/dia). Não houve diferenças entre os tratamentos experimentais quanto aos teores de N fecal. No que diz respeito ao N Urinário (NU) verificaram-se maiores perdas nos animais que receberam as dietas NRC07/20 e NRC07/40. Provavelmente essas maiores perdas de NU foram devido ao maior fornecimento de N. Para a dieta NRC07/60, embora tenha havido menor consumo de N, o menor valor de Nutrientes Digestíveis Totais (NDT) e maiores valores dos constituintes fibrosos e da lignina podem ter contribuído para as maiores perdas de NU. Já em relação ao N retido, foi obtido maior valor (62,02%) no tratamento NRC85. O NRC (1985) promove melhor aproveitamento do nitrogênio dietético. Nitrogen balance of lambs fed diets formulated according to NRC (1985) and NRC (2007). Abstract: The study aimed to evaluate the nitrogen (N) balance of lambs fed diets formulated according to the National Research Council - NRC (1985) and NRC (2007), in feedlot system. Nineteen male lambs with four months old, with average body weight of 17.7 kg. The treatments consisted of diets formulated according to NRC (1985) (NRC85) and NRC (2007) considering 20%, 40% and 60% of undegradable intake protein (UIP), called here NRC07/20, NRC07/40 and NRC07/60, respectively. Higher values of nitrogen intake were observed in the treatments NRC07/20 and NRC07/40 (30.68 and 28.53 g/day). There were no differences between treatments for concentrations of fecal N. Regarding to the N lost in urine, there were higher losses in the animals that received diets formulated according to NRC07/20 and NRC07/40. Probably these larger losses of N in urine were due to higher supply of N. For NRC07/60 diet, although lower N intake, the lower Total Digestible Nutrients (TDN) value and higher values of fiber constituents and lignin may have contributed to major losses of N in urine. In relation to N retention, the highest value (62.02%) was verified in the treatment NRC85. The NRC (1985) promotes better utilization of dietary nitrogen. MenosObjetivou-se avaliar o balanço de nitrogênio (N) de cordeiros em terminação alimentados com dietas formuladas de acordo com o National Research Council - NRC (1985) e o NRC (2007). Foram utilizados dezenove cordeiros, machos, com quatro meses de idade e peso vivo médio de 17,7 kg. Os tratamentos consistiram de dietas formuladas conforme o NRC (1985) (NRC85) e o NRC (2007) considerando-se os consumos de 20%, 40% e 60% de proteína não degradável no rúmen (PNDR), aqui denominadas NRC07/20, NRC07/40 e NRC07/60, respectivamente. Foram verificados maiores valores de N ingerido para os tratamentos NRC07/20 e NRC07/40 (30,68 e 28,53 g/dia). Não houve diferenças entre os tratamentos experimentais quanto aos teores de N fecal. No que diz respeito ao N Urinário (NU) verificaram-se maiores perdas nos animais que receberam as dietas NRC07/20 e NRC07/40. Provavelmente essas maiores perdas de NU foram devido ao maior fornecimento de N. Para a dieta NRC07/60, embora tenha havido menor consumo de N, o menor valor de Nutrientes Digestíveis Totais (NDT) e maiores valores dos constituintes fibrosos e da lignina podem ter contribuído para as maiores perdas de NU. Já em relação ao N retido, foi obtido maior valor (62,02%) no tratamento NRC85. O NRC (1985) promove melhor aproveitamento do nitrogênio dietético. Nitrogen balance of lambs fed diets formulated according to NRC (1985) and NRC (2007). Abstract: The study aimed to evaluate the nitrogen (N) balance of lambs fed diets formulated according ... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Nutrição animal; Ovino. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/44022/1/AAC-Balanco-de-nitrogenio-de-cordeiros-alimentados.pdf
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Marc: |
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Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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