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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
01/03/2013 |
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Data da última atualização: |
01/03/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PAZIANOTTO, R. A. A.; MAIA, A. de H. N.; LUIZ, A. J. B.; PRADO, J. S. M. |
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Afiliação: |
RICARDO ANTONIO ALMEIDA PAZIANOTTO, CNPMA; ALINE DE HOLANDA NUNES MAIA, CNPMA; ALFREDO JOSE BARRETO LUIZ, CNPMA; JEANNE SCARDINI MARINHO PRADO, CNPMA. |
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Título: |
Programa R para inferência sobre parâmetros populacionais de artrópodes. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA REGIÃO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA, 57., 2012, Piracicaba. Anais... Piracicaba: ESALQ, 2012. p. 326-330. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Parâmetros populacionais são importantes indicadores em estudos envolvendo a interação entre artrópodes e o meio ambiente, como, por exemplo: quantificação de efeitos de concentrações de produtos (MARINHO-PRADO et al., 2011), avaliação de risco ambiental do uso de biopesticidas (NASCIMENTO et al., 1998), culturas transgênicas sobre insetos não-alvo (LIU et al, 2005). Nesses estudos, são realizados experimentos onde dados de oviposição e sobrevivência são coletados, ao longo do tempo, e condensados em tabelas de vida e fertilidade (TBVF) para posterior estimação dos parâmetros: taxa líquida de reprodução (Ro), taxa intrínseca de crescimento (Rm), tempo de duplicação (TD), intervalo entre gerações (TMG) e razão finita de crescimento (_), para cada um dos tratamentos avaliados. Os parâmetros da TBVF são estimados para cada grupo (tratamento) e não para cada fêmea o que impossibilita a estimação da variância via métodos tradicionais. Uma abordagem largamente utilizada para quantificar a incerteza associada a esses parâmetros é o método jackknife, onde cada parâmetro em questão é recalculado retirando-se do conjunto de dados, as informações de uma fêmea a cada iteração (MEYER, 1986). Os pseudovalores, estimativas obtidas a cada iteração, são então usados na estimação da variância, informação necessária para construção de intervalos de confiança, realização de testes para comparação de tratamentos qualitativos ou ainda ajuste de modelos de regressão para avaliar o efeito de níveis de tratamentos quantitativos (ex. doses subletais de produtos) sobre os parâmetros da TBVF. HULTING et al (1990) desenvolveram um programa em linguagem Fortran para obter estimativas jackknife de Ro, Rm, DT, TMD e _, intervalo de confiança para o Rm, e testes para comparar grupos quanto ao Rm. Esse programa, no entanto, apresenta algumas limitações tais como: a) considera a sobrevivência na fase imatura igual para todos os grupos; b) o algoritmo para estimar a porcentagem de fêmeas na descendência não é adequado para casos onde algumadas fêmeas de quaisquer dos grupos avaliados tem postura zero durante todo o período de avaliação e c) não calcula os níveis de significância nominal (valores p) associados aos testes de comparação de grupos. Face a essas limitações, Maia et al (2000) desenvolveram um programa alternativo em ambiente SAS (Lifetable.sas, disponível em http://www.cnpma.embrapa.br/forms/sastat.php3) para estimação de parâmetros da TBVF e comparação entre tratamentos qualitativos. No presente trabalho, é apresentada uma versão do referido programa SAS, em linguagem R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010), acrescida das seguintes inovações: a) uso do método iterativo de Brent para estimação do Rm, ao invés da busca entre valores pontuais num intervalo arbritário em torno Rm, estimado pelo método aproximado, b) um módulo para testes de comparação múltipla e c) um módulo para ajuste de modelos de regressão linear quando os tratamentos são quantitativos, incluindo diagnósticos de resíduos e análise de influência. O programa em R é mais acessível aos usuários potenciais por tratar-se de um software livre de código aberto. Para demonstração da utilidade do programa e interpretação das análises descritivas e inferenciais implementadas, é apresentado um estudo de caso onde se avalia o efeito de concentrações de berenil, um inibidor de proteases, sobre parâmetros populacionais de Thyrinteina arnobia (Stoll) (Lepidoptera: Geometridae), lagarta desfolhadora da cultura do eucalipto (MARINHO-PRADO et al., 2011). MenosParâmetros populacionais são importantes indicadores em estudos envolvendo a interação entre artrópodes e o meio ambiente, como, por exemplo: quantificação de efeitos de concentrações de produtos (MARINHO-PRADO et al., 2011), avaliação de risco ambiental do uso de biopesticidas (NASCIMENTO et al., 1998), culturas transgênicas sobre insetos não-alvo (LIU et al, 2005). Nesses estudos, são realizados experimentos onde dados de oviposição e sobrevivência são coletados, ao longo do tempo, e condensados em tabelas de vida e fertilidade (TBVF) para posterior estimação dos parâmetros: taxa líquida de reprodução (Ro), taxa intrínseca de crescimento (Rm), tempo de duplicação (TD), intervalo entre gerações (TMG) e razão finita de crescimento (_), para cada um dos tratamentos avaliados. Os parâmetros da TBVF são estimados para cada grupo (tratamento) e não para cada fêmea o que impossibilita a estimação da variância via métodos tradicionais. Uma abordagem largamente utilizada para quantificar a incerteza associada a esses parâmetros é o método jackknife, onde cada parâmetro em questão é recalculado retirando-se do conjunto de dados, as informações de uma fêmea a cada iteração (MEYER, 1986). Os pseudovalores, estimativas obtidas a cada iteração, são então usados na estimação da variância, informação necessária para construção de intervalos de confiança, realização de testes para comparação de tratamentos qualitativos ou ainda ajuste de modelos de regressão para avaliar o efeito de níveis... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Artrópode. |
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Thesagro: |
Entomologia; Estatística agrícola; Programa de computador. |
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Categoria do assunto: |
O Insetos e Entomologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/77802/1/2012AA92.pdf
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Marc: |
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520 $aParâmetros populacionais são importantes indicadores em estudos envolvendo a interação entre artrópodes e o meio ambiente, como, por exemplo: quantificação de efeitos de concentrações de produtos (MARINHO-PRADO et al., 2011), avaliação de risco ambiental do uso de biopesticidas (NASCIMENTO et al., 1998), culturas transgênicas sobre insetos não-alvo (LIU et al, 2005). Nesses estudos, são realizados experimentos onde dados de oviposição e sobrevivência são coletados, ao longo do tempo, e condensados em tabelas de vida e fertilidade (TBVF) para posterior estimação dos parâmetros: taxa líquida de reprodução (Ro), taxa intrínseca de crescimento (Rm), tempo de duplicação (TD), intervalo entre gerações (TMG) e razão finita de crescimento (_), para cada um dos tratamentos avaliados. Os parâmetros da TBVF são estimados para cada grupo (tratamento) e não para cada fêmea o que impossibilita a estimação da variância via métodos tradicionais. Uma abordagem largamente utilizada para quantificar a incerteza associada a esses parâmetros é o método jackknife, onde cada parâmetro em questão é recalculado retirando-se do conjunto de dados, as informações de uma fêmea a cada iteração (MEYER, 1986). Os pseudovalores, estimativas obtidas a cada iteração, são então usados na estimação da variância, informação necessária para construção de intervalos de confiança, realização de testes para comparação de tratamentos qualitativos ou ainda ajuste de modelos de regressão para avaliar o efeito de níveis de tratamentos quantitativos (ex. doses subletais de produtos) sobre os parâmetros da TBVF. HULTING et al (1990) desenvolveram um programa em linguagem Fortran para obter estimativas jackknife de Ro, Rm, DT, TMD e _, intervalo de confiança para o Rm, e testes para comparar grupos quanto ao Rm. Esse programa, no entanto, apresenta algumas limitações tais como: a) considera a sobrevivência na fase imatura igual para todos os grupos; b) o algoritmo para estimar a porcentagem de fêmeas na descendência não é adequado para casos onde algumadas fêmeas de quaisquer dos grupos avaliados tem postura zero durante todo o período de avaliação e c) não calcula os níveis de significância nominal (valores p) associados aos testes de comparação de grupos. Face a essas limitações, Maia et al (2000) desenvolveram um programa alternativo em ambiente SAS (Lifetable.sas, disponível em http://www.cnpma.embrapa.br/forms/sastat.php3) para estimação de parâmetros da TBVF e comparação entre tratamentos qualitativos. No presente trabalho, é apresentada uma versão do referido programa SAS, em linguagem R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010), acrescida das seguintes inovações: a) uso do método iterativo de Brent para estimação do Rm, ao invés da busca entre valores pontuais num intervalo arbritário em torno Rm, estimado pelo método aproximado, b) um módulo para testes de comparação múltipla e c) um módulo para ajuste de modelos de regressão linear quando os tratamentos são quantitativos, incluindo diagnósticos de resíduos e análise de influência. O programa em R é mais acessível aos usuários potenciais por tratar-se de um software livre de código aberto. Para demonstração da utilidade do programa e interpretação das análises descritivas e inferenciais implementadas, é apresentado um estudo de caso onde se avalia o efeito de concentrações de berenil, um inibidor de proteases, sobre parâmetros populacionais de Thyrinteina arnobia (Stoll) (Lepidoptera: Geometridae), lagarta desfolhadora da cultura do eucalipto (MARINHO-PRADO et al., 2011).
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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| 23. |  | MALAGODI-BRAGA, K. S.; MORICONI, W.; QUEIROGA, J. L. de; URCHEI, M. A.; PAZIANOTTO, R. A. A.; RONCON, K. Active phloem sap collection by Trigona spinipes (Fabricius) (Hymenoptera, Apidae) in Artemisia annua Linn (Asteraceae). Acta Scientiarum. Biological Sciences, v. 41, e47548, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 24. | | MAIA, A. de H. N.; PAZIANOTTO, R. A. A.; LUIZ, A. J. B.; PRADO, J. S. M.; PERVEZ, A. Inference on arthropod demographic parameters: computational advances using R. Journal of Economic Entomology, College Park, v. 107, n. 1, p. 432-439, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 25. | | HOLTZ, A. M.; MARINHO-PRADO, J. S.; PALLINI, A.; CLFLER, T. P.; ROCHA, TATIANE MARTINS; PAZIANOTTO, R. A. A. Host plant and the predator Podisus nigrispinus: when the defense compounds of the plant affect the third trophic level. Entomologia Experimentalis et Applicata, v. 167, n. 4, p. 306-312, 2019. Special issue: Host Plant Selection and feeding Ecology.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 28. | | PARAIBA, L. C.; PAZIANOTTO, R. A. A.; LUIZ, A. J. B.; MAIA, A. de H. N.; JONSSON, C. M. A mathematical model to estimate the volume of grey water of pesticide mixtures. In: REUNIÃO ANUAL DA REGIÃO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA, 58.; SIMPÓSIO DE ESTATÍSTICA APLICADA À EXPERIMENTAÇÃO AGRONÔMICA, 15., 2013, Campina Grande. Modelagem estatística em áreas multidisciplinares: impactos causados pelas mudanças climáticas na Região Nordeste: anais. Campina Grande: Sociedade Internacional de Biometria, 2013. 1 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 29. | | PARAIBA, L. C.; PAZIANOTTO, R. A. A.; LUIZ, A. J. B.; MAIA, A. de H. N.; JONSSON, C. M. A mathematical model to estimate the volume of grey water of pesticide mixtures. Spanish Journal of Agricultural Research, Madrid, v. 12, n. 2, p. 509-518, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 32. | | PENTEADO, L. F.; NOGUEIRA, S. F.; ANDRADE, C. A. de; RAMOS, N. P.; PAZIANOTTO, R. A. A.; GAROFALO, D. T. N2O emission factors for nitrogen fertilizers and animal excreta in pastures: a meta-analysis for Brazil. In: SEMINAR ON NATURE BASED SOLUTIONS IN AGRICULTURE AND FORESTRY, 1., 2023, São Paulo. Strategies for carbon capture and reduction of GHG emissions in Brasil: book of abstracts. São Paulo: USP/RCGI, 2023. Evento on-line. 2 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 36. | | SOUZA, D. R. C. de; PARAIBA, L. C.; PAZIANOTTO, R. A. A.; FERRACINI, V. L.; FERREIRA, J. M. S.; TALAMINI, V. Coeficiente de partição e fator de retardamento de pesticidas em estipe de coqueiros. In: ENCONTRO NACIONAL DE QUÍMICA ANALÍTICA, 19.; CONGRESSO IBERO-AMERICANO DE QUÍMICA ANALÍTICA, 7., 2018, Caldas Novas, GO. Inovação para a química analítica sustentável: livro de resumos... Caldas Novas: SBQ: UFG: UnB, 2018. p. 400.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 37. | | DONKE, A. C. G.; NOVAES, R. M. L.; PAZIANOTTO, R. A. A.; RUIZ, E. M.; REINHARD, J.; MATSUURA, M. I. da S. F. Integrating land use change estimates at state level in the ecoinvent database structure v3.3. In: CONGRESSO BRASILEIRO SOBRE GESTÃO DO CICLO DE VIDA, 6., 2018, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Ibict, 2018. p. 199-205.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 38. | | DONKE, A. C. G.; NOVAES, R. M. L.; PAZIANOTTO, R. A. A.; MORENO-RUIZ, E.; REINHARD, J.; PICOLI, J. F.; MATSUURA, M. I. da S. F. Integrating regionalized Brazilian land use change datasets into the ecoinvent database: new data, premises and uncertainties have large effects in the results. The International Journal of Life Cycle Assessment, v. 25, n. 6, p. 1027-1042, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 39. | | SILVA, M. G. da; PACKER, A. P.; SAMPAIO, F. G.; MARANI, L.; MARIANO, E. V. C.; PAZIANOTTO, R. A. A.; FERREIRA, W. J.; ALVALÁ, P. C. Impact of intensive fish farming on methane emission in a tropical hydropower reservoir. Climatic Change, v. 150, n. 3-4, p. 150-195, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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