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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
Data corrente: |
16/11/2020 |
Data da última atualização: |
17/11/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
FERREIRA, N. dos S.; SANTANNA, F. H.; REIS, V. M.; VOL´PIANO, C. G.; ROTHBALLER, M.; SCHWAB, S.; BAURA, V. A.; BALSANELLI, E.; PEDROSA, F. de OL; PASSAGLIA, L. M. P.; SOUZA, E. M. de; HARTMANN, A.; CASSAN, F.; ZILLI, J. E. |
Afiliação: |
Natalia dos Santos Ferreira, UFRRJ; Fernando Hayashi SantAnna, UFRGS; VERONICA MASSENA REIS, CNPAB; Camila Gazolla Volpiano, UFRGS; Michael Rothballer, University Muenchen, Germany; STEFAN SCHWAB, CNPAB; Valter Antonio Baura, UFPR; Eduardo Balsanelli, UFPR; Fabio de Oliveira Pedrosa, UFPR; Luciane Maria Pereira Passaglia, UFRGS; Emanuel Maltempi de Souza, UFPR; Anton Hartmann, University Muenchen, Germany; Fabricio Cassan, Universidad Nacional de Río Cuarto; JERRI EDSON ZILLI, CNPAB. |
Título: |
Genome-based reclassification of Azospirillum brasilense Sp245 as the type strain of Azospirillum baldaniorum sp. nov. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 15 Oct., 2020 |
DOI: |
10.1099/ijsem.0.004517 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Azospirillum sp. strain Sp245T , originally identified as belonging to Azospirillum brasilense, is recognized as a plant-growthpromoting rhizobacterium due to its ability to fix atmospheric nitrogen and to produce plant-beneficial compounds. Azospirillum sp. Sp245T and other related strains were isolated from the root surfaces of different plants in Brazil. Cells are Gram-negative, curved or slightly curved rods, and motile with polar and lateral flagella. Their growth temperature varies between 20 to 38 °C and their carbon source utilization is similar to other Azospirillum species. A preliminary 16S rRNA sequence analysis showed that the new species is closely related to A. brasilense Sp7T and A. formosense CC-Nfb-7T . Housekeeping genes revealed that Azospirillum sp. Sp245T , BR 12001 and Vi22 form a separate cluster from strain A. formosense CC-Nfb-7T , and a group of strains closely related to A. brasilense Sp7T . Overall genome relatedness index (OGRI) analyses estimated based on average nucleotide identity (ANI) and digital DNA?DNA hybridization (dDDH) between Azospirillum sp. Sp245T and its close relatives to other Azospirillum species type strains, such as A. brasilense Sp7T and A. formosense CC-Nfb-7T , revealed values lower than the limit of species circumscription. Moreover, core-proteome phylogeny including 1079 common shared proteins showed the independent clusterization of A. brasilense Sp7T , A. formosense CC-Nfb-7T and Azospirillum sp. Sp245T , a finding that was corroborated by the genome clustering of OGRI values and housekeeping phylogenies. The DNA G+C content of the cluster of Sp245T was 68.4?68.6%. Based on the phylogenetic, genomic, phenotypical and physiological analysis, we propose that strain Sp245T together with the strains Vi22 and BR12001 represent a novel species of the genus Azospirillum, for which the name Azospirillum baldaniorum sp. nov. is proposed. The type strain is Sp245T (=BR 11005T =IBPPM 219T ) (GCF_007827915.1, GCF_000237365.1, and GCF_003119195.2) MenosAzospirillum sp. strain Sp245T , originally identified as belonging to Azospirillum brasilense, is recognized as a plant-growthpromoting rhizobacterium due to its ability to fix atmospheric nitrogen and to produce plant-beneficial compounds. Azospirillum sp. Sp245T and other related strains were isolated from the root surfaces of different plants in Brazil. Cells are Gram-negative, curved or slightly curved rods, and motile with polar and lateral flagella. Their growth temperature varies between 20 to 38 °C and their carbon source utilization is similar to other Azospirillum species. A preliminary 16S rRNA sequence analysis showed that the new species is closely related to A. brasilense Sp7T and A. formosense CC-Nfb-7T . Housekeeping genes revealed that Azospirillum sp. Sp245T , BR 12001 and Vi22 form a separate cluster from strain A. formosense CC-Nfb-7T , and a group of strains closely related to A. brasilense Sp7T . Overall genome relatedness index (OGRI) analyses estimated based on average nucleotide identity (ANI) and digital DNA?DNA hybridization (dDDH) between Azospirillum sp. Sp245T and its close relatives to other Azospirillum species type strains, such as A. brasilense Sp7T and A. formosense CC-Nfb-7T , revealed values lower than the limit of species circumscription. Moreover, core-proteome phylogeny including 1079 common shared proteins showed the independent clusterization of A. brasilense Sp7T , A. formosense CC-Nfb-7T and Azospirillum sp. Sp245T , a finding tha... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Phenotypical analysis; Phylogenetic; Plant-growth promoting bacteria. |
Categoria do assunto: |
V Taxonomia de Organismos |
Marc: |
LEADER 03035naa a2200325 a 4500 001 2126643 005 2020-11-17 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1099/ijsem.0.004517$2DOI 100 1 $aFERREIRA, N. dos S. 245 $aGenome-based reclassification of Azospirillum brasilense Sp245 as the type strain of Azospirillum baldaniorum sp. nov.$h[electronic resource] 260 $c2020 520 $aAzospirillum sp. strain Sp245T , originally identified as belonging to Azospirillum brasilense, is recognized as a plant-growthpromoting rhizobacterium due to its ability to fix atmospheric nitrogen and to produce plant-beneficial compounds. Azospirillum sp. Sp245T and other related strains were isolated from the root surfaces of different plants in Brazil. Cells are Gram-negative, curved or slightly curved rods, and motile with polar and lateral flagella. Their growth temperature varies between 20 to 38 °C and their carbon source utilization is similar to other Azospirillum species. A preliminary 16S rRNA sequence analysis showed that the new species is closely related to A. brasilense Sp7T and A. formosense CC-Nfb-7T . Housekeeping genes revealed that Azospirillum sp. Sp245T , BR 12001 and Vi22 form a separate cluster from strain A. formosense CC-Nfb-7T , and a group of strains closely related to A. brasilense Sp7T . Overall genome relatedness index (OGRI) analyses estimated based on average nucleotide identity (ANI) and digital DNA?DNA hybridization (dDDH) between Azospirillum sp. Sp245T and its close relatives to other Azospirillum species type strains, such as A. brasilense Sp7T and A. formosense CC-Nfb-7T , revealed values lower than the limit of species circumscription. Moreover, core-proteome phylogeny including 1079 common shared proteins showed the independent clusterization of A. brasilense Sp7T , A. formosense CC-Nfb-7T and Azospirillum sp. Sp245T , a finding that was corroborated by the genome clustering of OGRI values and housekeeping phylogenies. The DNA G+C content of the cluster of Sp245T was 68.4?68.6%. Based on the phylogenetic, genomic, phenotypical and physiological analysis, we propose that strain Sp245T together with the strains Vi22 and BR12001 represent a novel species of the genus Azospirillum, for which the name Azospirillum baldaniorum sp. nov. is proposed. The type strain is Sp245T (=BR 11005T =IBPPM 219T ) (GCF_007827915.1, GCF_000237365.1, and GCF_003119195.2) 653 $aPhenotypical analysis 653 $aPhylogenetic 653 $aPlant-growth promoting bacteria 700 1 $aSANTANNA, F. H. 700 1 $aREIS, V. M. 700 1 $aVOL´PIANO, C. G. 700 1 $aROTHBALLER, M. 700 1 $aSCHWAB, S. 700 1 $aBAURA, V. A. 700 1 $aBALSANELLI, E. 700 1 $aPEDROSA, F. de OL 700 1 $aPASSAGLIA, L. M. P. 700 1 $aSOUZA, E. M. de 700 1 $aHARTMANN, A. 700 1 $aCASSAN, F. 700 1 $aZILLI, J. E. 773 $tInternational Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 15 Oct., 2020
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
Data corrente: |
27/03/2012 |
Data da última atualização: |
11/11/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
B - 4 |
Autoria: |
RAMOS, T. de J. N.; SOUZA, C. M. de A.; CARVALHO, C. J. R. de; VIEIRA, I. M. S. |
Afiliação: |
NERY RAMOS, UFRA; CLEO MARCELO DE ARAUJO SOUZA, CPATU; CLAUDIO JOSE REIS DE CARVALHO, CPATU; IRENICE MARIA SANTOS VIEIRA, UFRA. |
Título: |
Respostas fisiológicas e metabólicas de gramíneas ao alagamento. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Revista de Ciências Agrárias, Belém, PA, v. 54, n. 1, p. 78-84, jan./abr. 2011. |
DOI: |
10.4322/rca.2011.041 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Vários estudos têm mostrado que o alagamento do solo é capaz de interferir na capacidade fotossintética e, consequentemente, no desenvolvimento de gramíneas. Visando obter mais informações sobre a tolerância de plantas ao alagamento, estudou-se as respostas morfológicas e metabólicas em plantas de Brachiaria brizantha e Paspalum fasciculatum, submetidas a 21 dias de alagamento. Em B. brizantha, o alagamento reduziu significativamente a taxa fotossintética e alterou o padrão de alocação e translocação de componentes bioquímicos, com aumento significativo nos teores de açúcares solúveis totais nas folhas e raízes, açúcares redutores e amido nas folhas, e aminoácidos nas raízes. Nas plantas alagadas de P. fasciculatum não ocorreu diferença significativa na taxa fotossintética, amido e aminoácidos, apresentando acúmulo de açúcares solúveis totais somente nas raízes. As respostas apresentadas pelas plantas B. brizantha permitem afirmar que esta espécie é mais sensível ao alagamento, enquanto a espécie P. fasciculatum é mais tolerante. |
Palavras-Chave: |
Aminoácidos. |
Thesagro: |
Açúcar; Amido. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/56494/1/181.pdf
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Marc: |
LEADER 01709naa a2200205 a 4500 001 1920500 005 2022-11-11 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.4322/rca.2011.041$2DOI 100 1 $aRAMOS, T. de J. N. 245 $aRespostas fisiológicas e metabólicas de gramíneas ao alagamento.$h[electronic resource] 260 $c2011 520 $aVários estudos têm mostrado que o alagamento do solo é capaz de interferir na capacidade fotossintética e, consequentemente, no desenvolvimento de gramíneas. Visando obter mais informações sobre a tolerância de plantas ao alagamento, estudou-se as respostas morfológicas e metabólicas em plantas de Brachiaria brizantha e Paspalum fasciculatum, submetidas a 21 dias de alagamento. Em B. brizantha, o alagamento reduziu significativamente a taxa fotossintética e alterou o padrão de alocação e translocação de componentes bioquímicos, com aumento significativo nos teores de açúcares solúveis totais nas folhas e raízes, açúcares redutores e amido nas folhas, e aminoácidos nas raízes. Nas plantas alagadas de P. fasciculatum não ocorreu diferença significativa na taxa fotossintética, amido e aminoácidos, apresentando acúmulo de açúcares solúveis totais somente nas raízes. As respostas apresentadas pelas plantas B. brizantha permitem afirmar que esta espécie é mais sensível ao alagamento, enquanto a espécie P. fasciculatum é mais tolerante. 650 $aAçúcar 650 $aAmido 653 $aAminoácidos 700 1 $aSOUZA, C. M. de A. 700 1 $aCARVALHO, C. J. R. de 700 1 $aVIEIRA, I. M. S. 773 $tRevista de Ciências Agrárias, Belém, PA$gv. 54, n. 1, p. 78-84, jan./abr. 2011.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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