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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Café. Para informações adicionais entre em contato com biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
25/01/2022 |
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Data da última atualização: |
11/04/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CINTRA, L. A.; SOUZA, T. B. de; PARTEKA, L. M.; BARRETO, L. M.; PEREIRA, L. F. P.; GAETA, M. L.; GUYOT, R.; VANZELA, A. L. L. |
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Afiliação: |
LEONARDO ADABO CINTRA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; THAÍSSA BOLDIERI DE SOUZA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; LETÍCIA MARIA PARTEKA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; LUCAS MESQUITA BARRETO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa; MARCOS LETAIF GAETA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA; ROMAIN GUYOT, CIRAD; ANDRÉ LUÍS LAFORGA VANZELA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA. |
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Título: |
An 82 bp tandem repeat family typical of 3' non-coding end of Gypsy/TAT LTR retrotransposons is conserved in Coffea spp. pericentromeres. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Genome, v.65, n. 3, p. 137-181, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1139/gen-2021-0045 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Date of Electronic Publication: 2021 Nov 02. |
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Conteúdo: |
Coffea spp. chromosomes are very small and accumulate a variety of repetitive DNA families around the centromeres. However, the proximal regions of Coffea chromosomes remain poorly understood, especially regarding the nature and organisation of the sequences. Taking advantage of the genome sequences of C. arabica (2n = 44), C. canephora, and C. eugenioides (C. arabica progenitors with 2n = 22) and good coverage genome sequencing of dozens of other wild Coffea spp., repetitive DNA sequences were identified, and the genomes were compared to decipher particularities of pericentromeric structures. The searches revealed a short tandem repeat (82 bp length) typical of Gypsy/TAT LTR retrotransposons, named Coffea_sat11. This repeat organises clusters with fragments of other transposable elements, comprising regions of non-coding RNA production. Cytogenomic analyses showed that Coffea_sat11 extends from the pericentromeres towards the middle of the chromosomal arms. This arrangement was observed in the allotetraploid C. arabica chromosomes, as well as in its progenitors. This study improves our understanding of the role of the Gypsy/TAT LTR retrotransposon lineage in the organisation of Coffea pericentromeres, as well as the conservation of Coffea_sat11 within the genus. The relationships between fragments of other transposable elements and the functional aspects of these sequences on the pericentromere chromatin were also evaluated. Highlights: A scattered short tandem repeat, typical of Gypsy/TAT LTR retrotransposons, associated with several fragments of other transposable elements, accumulates in the pericentromeres of Coffea chromosomes. This arrangement is preserved in all clades of the genus and appears to have a strong regulatory role in the organisation of chromatin around centromeres. MenosCoffea spp. chromosomes are very small and accumulate a variety of repetitive DNA families around the centromeres. However, the proximal regions of Coffea chromosomes remain poorly understood, especially regarding the nature and organisation of the sequences. Taking advantage of the genome sequences of C. arabica (2n = 44), C. canephora, and C. eugenioides (C. arabica progenitors with 2n = 22) and good coverage genome sequencing of dozens of other wild Coffea spp., repetitive DNA sequences were identified, and the genomes were compared to decipher particularities of pericentromeric structures. The searches revealed a short tandem repeat (82 bp length) typical of Gypsy/TAT LTR retrotransposons, named Coffea_sat11. This repeat organises clusters with fragments of other transposable elements, comprising regions of non-coding RNA production. Cytogenomic analyses showed that Coffea_sat11 extends from the pericentromeres towards the middle of the chromosomal arms. This arrangement was observed in the allotetraploid C. arabica chromosomes, as well as in its progenitors. This study improves our understanding of the role of the Gypsy/TAT LTR retrotransposon lineage in the organisation of Coffea pericentromeres, as well as the conservation of Coffea_sat11 within the genus. The relationships between fragments of other transposable elements and the functional aspects of these sequences on the pericentromere chromatin were also evaluated. Highlights: A scattered short tandem repeat, typi... Mostrar Tudo |
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Thesaurus Nal: |
Chromosomes; Coffea; DNA probes; Genome. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
18/11/2010 |
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Data da última atualização: |
10/08/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
FERNANDES JÚNIOR, G. A. |
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Título: |
Desempenho produtivo e qualidade da carne de ovinos terminados em pastagem irrigada no semiárido nordestino. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
2010. |
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Páginas: |
43 p. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Zootecnia. Área de concentração: Produção e melhoramento animal) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza. Orientador: Raimundo Nonato Braga Lôbo. |
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Conteúdo: |
Resumo: A realização do diagnóstico teve por objetivo conhecer os sistemas de produção, tipificar os produtores cooperados da COOPAMNU; identificar problemas; e estreitar as relações da Embrapa com a cooperativa e os técnicos que atuam na região. As atividades do subprojeto em questão, iniciaram-se no final de 1996 com a obtenção de dados secundários sobre os polos agropecuários do estado e a escolha da região para as atividades de intervenção. Posteriormente foram coletados mais dados enfocando a região selecionada (Ouro Preto do Oeste, região central do estado e sua maior bacia leiteira) dando ênfase aos dados referentes as organizações sociais rurais. Em abril de 1997 foram realizadas reuniões com orgãos locais de assistência técnica e fomento, visitas aos principais laticínios do município e finalmente visita as sete organizações ligadas a pecuária leiteira com maior potencial para desenvolver o subprojeto. Destas, a COOPAMNU foi escolhida para dar inicio ao trabalho. Na escolha, foram levados em conta os seguintes critérios: tempo de existência da entidade; número de projetos de financiamentos; número de sócios efetivos; localização; representatividade dos associados em relação a média dos produtores da região; assistência técnica recebida; parcerias existentes com orgãos como a própria Embrapa, prefeitura municipal, etc.; interesse demostrado pelos associados; e a impressão do grupo de trabalho no contato direto através das palestras promovidas nas sedes das associações. [Productive performance and meat quality of sheep finished in irrigated pasture in the northeastern semi arid]. Abstract: The aim of this study was to evaluate the productive performance and meat quality of animals of Santa Inês (SI), Somalis Brasileira (SO) and Morada Nova (MN) breeds and ½ Dorper x ½ Morada Nova crossbreds (F1) finished in irrigated cultivated pasture. Breeding season was done simultaneously for SI, SO and MN breeds and half of the Morada Nova females was crossed with Dorper rams. In lambing phase, ewes and lambs were raised in native pasture. After weaning, thirty-three males lambs (thirteen Santa Inês, seven Somalis Brasileira, six Morada Nova and seven F1) were selected to be finished in irrigated cultivated pasture. The animals were housed in paddocks of Panicum maximum cv. Tanzania on a rotational system in a randomized design. Each week the animals were weighed and evaluated for body condition score (ECC), FAMACHA © degree, number of eggs per gram of faeces (OPG), packed cell volume (VG) and total plasma protein (PPT). At the end of the field trial the animals were slaughtered and evaluated for quantitative and qualitative traits of carcass and commercial cuts, as well as qualitative aspects of meat. Statistical analyses were performed by SAS software using the GLM procedure. The Morada Nova breed presented lower variation in the values of VG and FAMACHA © over time even with the highest peak of OPG, indicating this breed as more resilient to helminthic natural infection. For carcass traits Somalis Brasileira breed showed the best hot and cold carcass dressing and the greatest finishing degree. Genetic groups Santa Inês and F1 showed a better carcass conformation. AOL was similar between Santa Inês, Somalis 17 Brasileira and F1, the latter being also similar to Morada Nova. Considering the compactness indexes for body, carcass and leg, Santa Inês, Somalis and Brazilian F1 group were similar showing greater specialization for meat production. It can be concluded that for the conditions of management employed in this study, the genotypes ranged their performances in relation to traits evaluated, since no group was superior or inferior for all traits, which shows that all groups can be improved. Good meat quality characteristics presented by genetic groups Santa Inês, Morad Nova and Somalis Brasileira, and the crossbreed ½ Dorper x ½ Morada Nova, make them excellent choices to fill a more demanding market, with no significant differences between them. MenosResumo: A realização do diagnóstico teve por objetivo conhecer os sistemas de produção, tipificar os produtores cooperados da COOPAMNU; identificar problemas; e estreitar as relações da Embrapa com a cooperativa e os técnicos que atuam na região. As atividades do subprojeto em questão, iniciaram-se no final de 1996 com a obtenção de dados secundários sobre os polos agropecuários do estado e a escolha da região para as atividades de intervenção. Posteriormente foram coletados mais dados enfocando a região selecionada (Ouro Preto do Oeste, região central do estado e sua maior bacia leiteira) dando ênfase aos dados referentes as organizações sociais rurais. Em abril de 1997 foram realizadas reuniões com orgãos locais de assistência técnica e fomento, visitas aos principais laticínios do município e finalmente visita as sete organizações ligadas a pecuária leiteira com maior potencial para desenvolver o subprojeto. Destas, a COOPAMNU foi escolhida para dar inicio ao trabalho. Na escolha, foram levados em conta os seguintes critérios: tempo de existência da entidade; número de projetos de financiamentos; número de sócios efetivos; localização; representatividade dos associados em relação a média dos produtores da região; assistência técnica recebida; parcerias existentes com orgãos como a própria Embrapa, prefeitura municipal, etc.; interesse demostrado pelos associados; e a impressão do grupo de trabalho no contato direto através das palestras promovidas nas sedes das associaçõe... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Qualidade da carne. |
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Thesagro: |
Alimentação; Ovino; Performance; Peso; Ração. |
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Thesaurus NAL: |
Animal performance; Meat quality; Sheep. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/89267/1/TS-Desempenho-produtivo.pdf
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Marc: |
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245 $aDesempenho produtivo e qualidade da carne de ovinos terminados em pastagem irrigada no semiárido nordestino.
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300 $a43 p.
500 $aDissertação (Mestrado em Zootecnia. Área de concentração: Produção e melhoramento animal) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza. Orientador: Raimundo Nonato Braga Lôbo.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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