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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
12/09/2014 |
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Data da última atualização: |
29/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MÜLLER, B. S. de F.; SAKAMOTO, T.; SILVEIRA, R. D. D.; ZAMBUSSI-CARVALHO, P. F.; PEREIRA, M.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; COSTA, M. M. do C.; GUIMARÃES, C. M.; PEREIRA, W. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO-BRONDANI, R. P. |
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Afiliação: |
BÁRBARA SALOMÃO DE FARIA MÜLLER, BIOAGRO - UFV; TETSU SAKAMOTO, UFMG; RICARDO DIÓGENES DIAS SILVEIRA; PATRICIA FERNANDA ZAMBUSSI-CARVALHO, UFG; MARISTELA PEREIRA, UFG; GEORGIOS JOANIS PAPPAS JUNIOR, UNB; MARCOS MOTA DO CARMO COSTA, CENARGEN; CLEBER MORAIS GUIMARAES, CNPAF; WENDELL JACINTO PEREIRA; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
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Título: |
Differentially expressed genes during flowering and grain filling in common bean (Phaseolus vulgaris) grown under drought stress conditions. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Molecular Biology Reporter, Athens, v. 32, p. 438-451, 2014. |
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DOI: |
10.1007/s11105-013-0651-7 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Drought stress, particularly during the flowering and grain-filling stages of growth, contributes to serious yield loss in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The aim of this study was to identify genes induced in response to drought stress using transcriptome analysis of contrasting genotypes. Using leaf tissues of tolerant (BAT 477) and susceptible common bean genotypes (Pérola), collected at the flowering and grain-filling stages, four complementary deoxyribonucleic acid representational difference analysis subtractive libraries were constructed and then sequenced. A total of 7,203 (77.6 %) sequences with an average sequence size of 570 bp were considered valid, for a combined 4 Mbp sequence. According to a differential display analysis, 802 expressed sequence tags, distributed across 67 contigs, were differentially expressed by the tolerant (37 contigs) and susceptible genotypes (30 contigs) after identification under drought conditions during the two investigated plant developmental stages. Of these differential contigs, the 13 most frequent genes were exclusive to the tolerant genotype. Based on BLAST2GO, 73 % of the gene sequences were annotated and 12 % showed mapping results, with the highest similarity rate corresponding to Glycine max (41 %). According to gene ontology functional analysis, 48 % of the sequences were attributed to cell metabolic processes. Overall, 8.3 % of the transcribed sequences exhibited similarity to transcription factors, predominantly those of the AP2-EREBP family (97.8 %). Of the target sequences validated by quantitative real-time polymerase chain reaction, most genes showed an expression level that agreed with that predicted by in silico analysis. Thus, the drought transcriptome dataset is a valuable resource on the variation in these gene sequences, offering the opportunity to identify robust molecular markers tightly linked to trait-controlling loci for use in marker-assisted breeding. MenosDrought stress, particularly during the flowering and grain-filling stages of growth, contributes to serious yield loss in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The aim of this study was to identify genes induced in response to drought stress using transcriptome analysis of contrasting genotypes. Using leaf tissues of tolerant (BAT 477) and susceptible common bean genotypes (Pérola), collected at the flowering and grain-filling stages, four complementary deoxyribonucleic acid representational difference analysis subtractive libraries were constructed and then sequenced. A total of 7,203 (77.6 %) sequences with an average sequence size of 570 bp were considered valid, for a combined 4 Mbp sequence. According to a differential display analysis, 802 expressed sequence tags, distributed across 67 contigs, were differentially expressed by the tolerant (37 contigs) and susceptible genotypes (30 contigs) after identification under drought conditions during the two investigated plant developmental stages. Of these differential contigs, the 13 most frequent genes were exclusive to the tolerant genotype. Based on BLAST2GO, 73 % of the gene sequences were annotated and 12 % showed mapping results, with the highest similarity rate corresponding to Glycine max (41 %). According to gene ontology functional analysis, 48 % of the sequences were attributed to cell metabolic processes. Overall, 8.3 % of the transcribed sequences exhibited similarity to transcription factors, predominantly thos... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Deficiência hídrica; Feijão; Phaseolus vulgaris. |
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Thesaurus Nal: |
Abiotic stress; Beans; Water stress. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/180004/1/Muller2014-Article-DifferentiallyExpressedGenesDu.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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| Registros recuperados : 99 | |
| 41. |  | SILVA JUNIOR, O. B. da; ROSADO, T. B.; LAVIOLA, B. G.; PAPPAS, M. de C. R.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; GRATTAPAGLIA, D. Genome-wide SNP discovery from a pooled sample of accessions of the biofuel plant Jatropha curcas based on whole-transcriptome illumina resequencing. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2011, Arraial D'Ajuda, Brazil. From genomes do integration and delivery: extended abstracts proceedings. Brasília, DF: Embrapa, 2011. p. 151-152.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 42. | | DHONT, A.; PIFFANELLI, P.; LESCOT, M.; TOWN, C.; LEEBENS-MACK, J.; BLANC, G.; SOUZA, M.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; ROUX, N.; SASAKI, T. Insights into the genome of musa (banana), a giant herb bearing fleshy fruits. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009. w263| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 43. | | FARIAS, L. R. de; BÁO, S. N.; ZHOU, J. J.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; MORAES, M. C. B.; LAUMANN, R. A.; BORGES, M. Estudo da expressão de genes relacionados à olfação no percevejo-marrom, Euschistus Heros (Hemiptera: Pentatimidae), praga da soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal, RN. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 44. | | MARTINS, C.; REIS CUNHA, J. L.; SILVA, M. N.; PEREIRA, E. G.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; BARTHOLOMEU, D. C.; ZINGALES, B. Identification of genes encoding hypothetical proteins in open-reading frame expressed sequence tags from mammalian stages of Trypanosoma cruzi. Genetics and Molecular Research, v. 10, n. 3, p. 1589-1630, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 45. | | PASSOS, M. A. N.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C.; MILLER, R. N. G. Identificação e caracterização de components genéticos de resistência a Mycosphaerella musicola em Musa acuminata. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 45., 2012, Manaus. Fito 2012. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 37, 2012. Suplemento. Resumo 470. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 47. | | MILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J. Gene expression analysis in Musa acuminata-Mycosphaerella interactions. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 45., 2012, Manaus. Fito 2012. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 37, 2012. Suplemento. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 48. | | BERGMANN, J. C.; BOARI, A. de J.; KRUGER, R. H.; TAVARES P.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; QUIRINO, B. F. New strategies to look at old problems: fatal yellowing in palm oil tree. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 49. | | BERGMANN, J. C.; BOARI, A. de J.; KRUGER, R. H.; TAVARES, P.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; QUIRINO, B. F. New strategies to look at old problems: fatal yellowing in palm oil tree. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 50. | | MENEZES, N. P.; MILLER, R. N. G.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; PAPPAS, M. de C. R.; PERITO, E.; OLIVEIRA, S. S.; CIAMPI, A. Y. Otimização de marcadores SSRs de bananeira Musa sp. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica - FUNCREDI, 2008. p.235.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 51. | | SILVA, D. C. da; FALAVIGNA, V. da S.; FASOLI, M.; BUFFON, V.; PORTO, D. D.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; PEZZOTTI, M.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F. Transcriptome analyses of the Dof-like gene family in grapevine reveal its involvement in berry, flower and seed development. Horticulture Research, v. 3, p. 1-10, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
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| 52. | | CASTRO, A. P. de; ARAÚJO JÚNIOR, S. D.; REIS, A. M. M.; MOURA, R. L.; FRANCINI FILHO, R. B.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; RODRIGUES, T. B.; THOMPSON, F. L.; KRÜGER, R. H. Bacterial community associated with healthy and diseased reef coral Mussismilia hispida from Eastern Brazil. Microbial Ecology, v. 59, p. 658-667, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 53. | | MÜLLER, B. S. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; COSTA, M. M. C.; PEREIRA, M.; GUIMARÃES, C. M.; ZAMBUZZI-CARVALHO, P. F.; SILVEIRA, R. D. D.; BRONDANI, C.; BRONDANI, R. P. V. Análise do transcriptoma de Phaseolus vulgaris em resposta ao déficit hídrico. In: CONGRESSO DE PESQUISA, ENSINO E EXTENSÃO, 7., 2010, Goiânia. Conhecimento e desenvolvimento sustentável: anais... Goiânia: UFG, 2010. p. 4248-4252. Conpeex 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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