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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
26/01/2017 |
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Data da última atualização: |
25/04/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, D. C. da; FALAVIGNA, V. da S.; FASOLI, M.; BUFFON, V.; PORTO, D. D.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; PEZZOTTI, M.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F. |
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Afiliação: |
DANIELLE COSTENARO DA SILVA, Universidade Federal do Rio Grande do Sul; VÍTOR DA SILVEIRA FALAVIGNA, Universidade Federal do Rio Grande do Sul; MARIANNA FASOLI, Dipartimento di Biotecnologie, Università degli Studi di Verona; VANESSA BUFFON, CNPUV; DIOGO DENARDI PORTO, CPATSA; GEORGIOS JOANNIS PAPPAS JÚNIOR, UnB; MARIO PEZZOTTI, Dipartimento di Biotecnologie, Università degli Studi di Verona; GIANCARLO PASQUALI, Universidade Federal do Rio Grande do Sul; LUIS FERNANDO REVERS, CNPUV. |
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Título: |
Transcriptome analyses of the Dof-like gene family in grapevine reveal its involvement in berry, flower and seed development. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Horticulture Research, v. 3, p. 1-10, 2016. |
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DOI: |
10.1038/hortres.2016.42 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The Dof (DNA-binding with one finger) protein family spans a group of plant transcription factors involved in the regulation of several functions, such as plant responses to stress, hormones and light, phytochrome signaling and seed germination. Here we describe the Dof-like gene family in grapevine (Vitis vinifera L.), which consists of 25 genes coding for Dof. An extensive in silico characterization of the VviDofL gene family was performed. Additionally, the expression of the entire gene family was assessed in 54 grapevine tissues and organs using an integrated approach with microarray (cv Corvina) and real-time PCR (cv Pinot Noir) analyses. The phylogenetic analysis comparing grapevine sequences with those of Arabidopsis, tomato, poplar and already described Dof genes in other species allowed us to identify several duplicated genes. The diversification of grapevine DofL genes during evolution likely resulted in a broader range of biological roles. Furthermore, distinct expression patterns were identified between samples analyzed, corroborating such hypothesis. Our expression results indicate that several VviDofL genes perform their functional roles mainly during flower, berry and seed development, highlighting their importance for grapevine growth and production. The identification of similar expression profiles between both approaches strongly suggests that these genes have important regulatory roles that are evolutionally conserved between grapevine cvs Corvina and Pinot Noir. MenosThe Dof (DNA-binding with one finger) protein family spans a group of plant transcription factors involved in the regulation of several functions, such as plant responses to stress, hormones and light, phytochrome signaling and seed germination. Here we describe the Dof-like gene family in grapevine (Vitis vinifera L.), which consists of 25 genes coding for Dof. An extensive in silico characterization of the VviDofL gene family was performed. Additionally, the expression of the entire gene family was assessed in 54 grapevine tissues and organs using an integrated approach with microarray (cv Corvina) and real-time PCR (cv Pinot Noir) analyses. The phylogenetic analysis comparing grapevine sequences with those of Arabidopsis, tomato, poplar and already described Dof genes in other species allowed us to identify several duplicated genes. The diversification of grapevine DofL genes during evolution likely resulted in a broader range of biological roles. Furthermore, distinct expression patterns were identified between samples analyzed, corroborating such hypothesis. Our expression results indicate that several VviDofL genes perform their functional roles mainly during flower, berry and seed development, highlighting their importance for grapevine growth and production. The identification of similar expression profiles between both approaches strongly suggests that these genes have important regulatory roles that are evolutionally conserved between grapevine cvs Corvina and Pino... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Berry; Desenvolvimento da semente; Diversification of grapevine; Flower; Grapevine; Pinot Noir; Videira. |
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Thesagro: |
Conservação; Corvina; Gene; Genética; Uva. |
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Thesaurus Nal: |
Seed development. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/154037/1/Diogo-2016.pdf
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Marc: |
LEADER 02577naa a2200385 a 4500
001 2061878
005 2017-04-25
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1038/hortres.2016.42$2DOI
100 1 $aSILVA, D. C. da
245 $aTranscriptome analyses of the Dof-like gene family in grapevine reveal its involvement in berry, flower and seed development.$h[electronic resource]
260 $c2016
520 $aThe Dof (DNA-binding with one finger) protein family spans a group of plant transcription factors involved in the regulation of several functions, such as plant responses to stress, hormones and light, phytochrome signaling and seed germination. Here we describe the Dof-like gene family in grapevine (Vitis vinifera L.), which consists of 25 genes coding for Dof. An extensive in silico characterization of the VviDofL gene family was performed. Additionally, the expression of the entire gene family was assessed in 54 grapevine tissues and organs using an integrated approach with microarray (cv Corvina) and real-time PCR (cv Pinot Noir) analyses. The phylogenetic analysis comparing grapevine sequences with those of Arabidopsis, tomato, poplar and already described Dof genes in other species allowed us to identify several duplicated genes. The diversification of grapevine DofL genes during evolution likely resulted in a broader range of biological roles. Furthermore, distinct expression patterns were identified between samples analyzed, corroborating such hypothesis. Our expression results indicate that several VviDofL genes perform their functional roles mainly during flower, berry and seed development, highlighting their importance for grapevine growth and production. The identification of similar expression profiles between both approaches strongly suggests that these genes have important regulatory roles that are evolutionally conserved between grapevine cvs Corvina and Pinot Noir.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 99 | |
| 41. |  | SILVA JUNIOR, O. B. da; ROSADO, T. B.; LAVIOLA, B. G.; PAPPAS, M. de C. R.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; GRATTAPAGLIA, D. Genome-wide SNP discovery from a pooled sample of accessions of the biofuel plant Jatropha curcas based on whole-transcriptome illumina resequencing. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2011, Arraial D'Ajuda, Brazil. From genomes do integration and delivery: extended abstracts proceedings. Brasília, DF: Embrapa, 2011. p. 151-152.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 42. | | DHONT, A.; PIFFANELLI, P.; LESCOT, M.; TOWN, C.; LEEBENS-MACK, J.; BLANC, G.; SOUZA, M.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; ROUX, N.; SASAKI, T. Insights into the genome of musa (banana), a giant herb bearing fleshy fruits. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009. w263| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 43. | | FARIAS, L. R. de; BÁO, S. N.; ZHOU, J. J.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; MORAES, M. C. B.; LAUMANN, R. A.; BORGES, M. Estudo da expressão de genes relacionados à olfação no percevejo-marrom, Euschistus Heros (Hemiptera: Pentatimidae), praga da soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal, RN. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 44. | | MARTINS, C.; REIS CUNHA, J. L.; SILVA, M. N.; PEREIRA, E. G.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; BARTHOLOMEU, D. C.; ZINGALES, B. Identification of genes encoding hypothetical proteins in open-reading frame expressed sequence tags from mammalian stages of Trypanosoma cruzi. Genetics and Molecular Research, v. 10, n. 3, p. 1589-1630, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 45. | | PASSOS, M. A. N.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C.; MILLER, R. N. G. Identificação e caracterização de components genéticos de resistência a Mycosphaerella musicola em Musa acuminata. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 45., 2012, Manaus. Fito 2012. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 37, 2012. Suplemento. Resumo 470. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 47. | | MILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J. Gene expression analysis in Musa acuminata-Mycosphaerella interactions. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 45., 2012, Manaus. Fito 2012. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 37, 2012. Suplemento. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 48. | | BERGMANN, J. C.; BOARI, A. de J.; KRUGER, R. H.; TAVARES P.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; QUIRINO, B. F. New strategies to look at old problems: fatal yellowing in palm oil tree. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 49. | | BERGMANN, J. C.; BOARI, A. de J.; KRUGER, R. H.; TAVARES, P.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; QUIRINO, B. F. New strategies to look at old problems: fatal yellowing in palm oil tree. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 50. | | MENEZES, N. P.; MILLER, R. N. G.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; PAPPAS, M. de C. R.; PERITO, E.; OLIVEIRA, S. S.; CIAMPI, A. Y. Otimização de marcadores SSRs de bananeira Musa sp. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica - FUNCREDI, 2008. p.235.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 51. | | SILVA, D. C. da; FALAVIGNA, V. da S.; FASOLI, M.; BUFFON, V.; PORTO, D. D.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; PEZZOTTI, M.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F. Transcriptome analyses of the Dof-like gene family in grapevine reveal its involvement in berry, flower and seed development. Horticulture Research, v. 3, p. 1-10, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 52. | | CASTRO, A. P. de; ARAÚJO JÚNIOR, S. D.; REIS, A. M. M.; MOURA, R. L.; FRANCINI FILHO, R. B.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; RODRIGUES, T. B.; THOMPSON, F. L.; KRÜGER, R. H. Bacterial community associated with healthy and diseased reef coral Mussismilia hispida from Eastern Brazil. Microbial Ecology, v. 59, p. 658-667, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 55. | | ANJOS, R. A.; BATISTA, D. S.; PASSOS, M. A. N.; LERIA, H. M. B.; BERTIOLI, D. J.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R. da; MARTINS, N. F.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; MILLER, R. N. G. Analysis of resistance gene analog in Musa acuminata cv Calcutta 4. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 50., 2004, Costão do Santinho, Florianópolis. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2004. não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 56. | | ANJOS, R. A.; BATISTA, D. S.; PASSOS, M. A. N.; LERIA, H. M. B.; BERTIOLI, D. J.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R.; MARTINS, N. F.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; MILLER, R. N. G. Analysis of resistance gene analogs in Musa acuminata cv Calcutta 4. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 50., 2004, Costão do Santinho, Florianópolis. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2004. p. 1200.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 57. | | MILLER, R. N. G; ALVES, P. C. S.; SANTOS, C. M. R.; COELHO, M. C. F.; SILVA, F. R. da; MARTINS, N. F.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; BERTIOLI, D. J. Analysis of resistance gene analogs in Musa acuminata VAR. Calcutta 4, An. In: ENCONTRO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE MELHORAMENTO DE PLANTAS REGIONAL DF, 1., 2005, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 92. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 144).| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 58. | | FIRMINO, A. A. P.; FONSECA, F. C. A.; MACEDO, L. L. P.; TOGAWA, R. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; SA, M. F. G. de. Cotton boll weevil (Anthonomus Grandis) transcriptome pyrosequencing and insect-pest control by RNAI gene silencing. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 279.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 59. | | MILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; MENEZES, N. N. P.; SOUZA JUNIOR, M. T.; COSTA, M. M. do C.; AZEVEDO, V. C. R.; AMORIM, E. P.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; CIAMPI, A. Y. Characterization of novel microsatellite markers in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4. BMC Research Notes, v.3, n.148, 2010. Disponível em:.Acesso em: 16 ago. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 60. | | MILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; MENEZES, N. N. P.; SOUZA JUNIOR, M. T.; COSTA, M. M. do C.; AZEVEDO, V. C. R.; AMORIM, E. P.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; CIAMPI, A. Y. Characterization of novel microsatellite markers in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4. BMC Research Notes, v. 3, p. 148-153, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
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