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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
26/01/2017 |
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Data da última atualização: |
25/04/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, D. C. da; FALAVIGNA, V. da S.; FASOLI, M.; BUFFON, V.; PORTO, D. D.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; PEZZOTTI, M.; PASQUALI, G.; REVERS, L. F. |
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Afiliação: |
DANIELLE COSTENARO DA SILVA, Universidade Federal do Rio Grande do Sul; VÍTOR DA SILVEIRA FALAVIGNA, Universidade Federal do Rio Grande do Sul; MARIANNA FASOLI, Dipartimento di Biotecnologie, Università degli Studi di Verona; VANESSA BUFFON, CNPUV; DIOGO DENARDI PORTO, CPATSA; GEORGIOS JOANNIS PAPPAS JÚNIOR, UnB; MARIO PEZZOTTI, Dipartimento di Biotecnologie, Università degli Studi di Verona; GIANCARLO PASQUALI, Universidade Federal do Rio Grande do Sul; LUIS FERNANDO REVERS, CNPUV. |
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Título: |
Transcriptome analyses of the Dof-like gene family in grapevine reveal its involvement in berry, flower and seed development. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Horticulture Research, v. 3, p. 1-10, 2016. |
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DOI: |
10.1038/hortres.2016.42 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The Dof (DNA-binding with one finger) protein family spans a group of plant transcription factors involved in the regulation of several functions, such as plant responses to stress, hormones and light, phytochrome signaling and seed germination. Here we describe the Dof-like gene family in grapevine (Vitis vinifera L.), which consists of 25 genes coding for Dof. An extensive in silico characterization of the VviDofL gene family was performed. Additionally, the expression of the entire gene family was assessed in 54 grapevine tissues and organs using an integrated approach with microarray (cv Corvina) and real-time PCR (cv Pinot Noir) analyses. The phylogenetic analysis comparing grapevine sequences with those of Arabidopsis, tomato, poplar and already described Dof genes in other species allowed us to identify several duplicated genes. The diversification of grapevine DofL genes during evolution likely resulted in a broader range of biological roles. Furthermore, distinct expression patterns were identified between samples analyzed, corroborating such hypothesis. Our expression results indicate that several VviDofL genes perform their functional roles mainly during flower, berry and seed development, highlighting their importance for grapevine growth and production. The identification of similar expression profiles between both approaches strongly suggests that these genes have important regulatory roles that are evolutionally conserved between grapevine cvs Corvina and Pinot Noir. MenosThe Dof (DNA-binding with one finger) protein family spans a group of plant transcription factors involved in the regulation of several functions, such as plant responses to stress, hormones and light, phytochrome signaling and seed germination. Here we describe the Dof-like gene family in grapevine (Vitis vinifera L.), which consists of 25 genes coding for Dof. An extensive in silico characterization of the VviDofL gene family was performed. Additionally, the expression of the entire gene family was assessed in 54 grapevine tissues and organs using an integrated approach with microarray (cv Corvina) and real-time PCR (cv Pinot Noir) analyses. The phylogenetic analysis comparing grapevine sequences with those of Arabidopsis, tomato, poplar and already described Dof genes in other species allowed us to identify several duplicated genes. The diversification of grapevine DofL genes during evolution likely resulted in a broader range of biological roles. Furthermore, distinct expression patterns were identified between samples analyzed, corroborating such hypothesis. Our expression results indicate that several VviDofL genes perform their functional roles mainly during flower, berry and seed development, highlighting their importance for grapevine growth and production. The identification of similar expression profiles between both approaches strongly suggests that these genes have important regulatory roles that are evolutionally conserved between grapevine cvs Corvina and Pino... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Berry; Desenvolvimento da semente; Diversification of grapevine; Flower; Grapevine; Pinot Noir; Videira. |
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Thesagro: |
Conservação; Corvina; Gene; Genética; Uva. |
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Thesaurus Nal: |
Seed development. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/154037/1/Diogo-2016.pdf
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Marc: |
LEADER 02577naa a2200385 a 4500
001 2061878
005 2017-04-25
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1038/hortres.2016.42$2DOI
100 1 $aSILVA, D. C. da
245 $aTranscriptome analyses of the Dof-like gene family in grapevine reveal its involvement in berry, flower and seed development.$h[electronic resource]
260 $c2016
520 $aThe Dof (DNA-binding with one finger) protein family spans a group of plant transcription factors involved in the regulation of several functions, such as plant responses to stress, hormones and light, phytochrome signaling and seed germination. Here we describe the Dof-like gene family in grapevine (Vitis vinifera L.), which consists of 25 genes coding for Dof. An extensive in silico characterization of the VviDofL gene family was performed. Additionally, the expression of the entire gene family was assessed in 54 grapevine tissues and organs using an integrated approach with microarray (cv Corvina) and real-time PCR (cv Pinot Noir) analyses. The phylogenetic analysis comparing grapevine sequences with those of Arabidopsis, tomato, poplar and already described Dof genes in other species allowed us to identify several duplicated genes. The diversification of grapevine DofL genes during evolution likely resulted in a broader range of biological roles. Furthermore, distinct expression patterns were identified between samples analyzed, corroborating such hypothesis. Our expression results indicate that several VviDofL genes perform their functional roles mainly during flower, berry and seed development, highlighting their importance for grapevine growth and production. The identification of similar expression profiles between both approaches strongly suggests that these genes have important regulatory roles that are evolutionally conserved between grapevine cvs Corvina and Pinot Noir.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 99 | |
| 3. |  | NEVES, L. G.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PAQUALI, G.; KIRST, M.; GRATTAPAGLIA, D. Advancing to a high density gene-rich map based on single feature polymorphisms in tropical eucalyptus. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009. W185| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 5. | | TESSELE, C.; REVERS, L. F.; ALENCAR, S. A.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; DELATORRE, C. A. Construção de um mapa genético de macieira de alta densidade utilizando marcadores funcionais tipo SNP. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 22., 2012, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: SBF, p. 4574-4577, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 9. | | SOARES, G. B.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J. Geração e análise de seqüências genômicas por meio de serviços Web pela ferramenta taverna. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 036. p. 76.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | SENA, J. S.; MAMANI, E. M.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; GRATTAPAGLIA, D. Mapeamento e caracterização genética de novos microssatélites derivados de EST em Eucalyptus grandis x Eucalyptus urophylla. In : ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 12., 2007, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. P. 179. Disponível também em: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007. CDR0057.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | COSTA, M. B. W.; TREPTOW, W.; ARAÚJO, A. F. P.; PAPPAS JUNIOR, G. J. Predição de enterramentos atômicos de proteínas globulares utilizando-se estatística Bayesiana e linguagem Perl de bioinformática. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 14., 2009, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2009. Resumo 028. p. 64| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | SENA, J. S.; PÁDUA, J. G.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GRATTAPAGLIA, D. Mapeamento de microssatélites derivados de EST em cruzamentos intra e interespecíficos de Eucalyptus. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 11., 2006, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2006. p. 91.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 16. | | SENA, J. S.; PÁDUA, J. G.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; GRATTAPAGLIA, D. Utilização de microssatélites derivados de est para a construção de mapas genéticos em cruzamentos intra e interespecíficos de Eucalyptus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 1148.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 17. | | EMEDIATO, F. L.; PASSOS, M. A. N.; TEIXEIRA, C. de C.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; MILLER, R. N. G. Análise de expressão de genes análogos de resistência em musa acuminata durante as interações compatíveis e incompatíveis com Mycosphaerella musicola. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 45., 2012, Manaus. Fito 2012. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 37, 2012. Suplemento. Resumo 708. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 18. | | LACERDA, T. S.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JUNIOR. G. J.; RANGEL, P. H. N.; FERREIRA, M. E. Desenvolvimento de painéis multiplex de marcadores microssatélites para programas de melhoramento assistido para qualidade de grãos em arroz. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 130. p. 180.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 19. | | LACERDA, T. S.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JUNIOR. G. J.; RANGEL, P. H. N.; FERREIRA, M. E. Desenvolvimento de painéis multiplex de marcadores microssatélites para programas de melhoramento assistido para qualidade de grãos em arroz. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 180. Resumo 130.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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