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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
18/01/2022 |
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Data da última atualização: |
18/01/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
NONATO, J. V. A.; CARVALHO, H. F.; BORGES, K. L. R.; PADILHA, L.; MALUF, M. P.; FRITSCHE NETO, R.; GUERREIRO FILHO, O. |
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Afiliação: |
JULIANA VIEIRA ALMEIDA NONATO, IAC; HUMBERTO FANELLI CARVALHO, IAC; KARINA LIMA REIS BORGES, ESALQ; LILIAN PADILHA, CNPCa; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa; ROBERTO FRITSCHE NETO, ESALQ; OLIVEIRO GUERREIRO FILHO, IAC. |
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Título: |
Association mapping reveals genomic regions associated with bienniality and resistance to biotic stresses in arabica coffee. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Euphytica, v. 217, n. 10, p. 1-19, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s10681-021-02922-9 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The bienniality of production and the incidence of pests and diseases, such as coffee leaf miner and coffee leaf rust, stands out among the factors that limit coffee crop yield. Obtaining cultivars with greater stability in production and resistance to these biotic agents are among the main objectives of coffee breeding programs. In this way, biotechnological tools such as Genomic Wide Association Studies (GWAS) can increase these programs' efficacy since they allow the identification of molecular markers significantly associated with phenotypes of interest. In this context, the aim here is to identify genomic regions associated with yield, bienniality, and resistance to coffee leaf miner and coffee leaf rust in arabica coffee progenies. Thus, a population (n=597) was evaluated for resistance to biotic stresses and for the eight designed scenarios to study yield and bienniality. A matrix of 4,666 SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) was built through Genotyping by Sequencing (GBS). After the genomic association analyses, we identified 12 potential SNPs markers associated with resistance to coffee leaf miner and coffee leaf rust, 32 associated with the eight designed scenarios to study yield and bienniality. Of the 44 SNPs significantly associated with this study's traits, 36 were noted in genomic regions responsible for biological processes related to plant response to biotic and abiotic stresses. In addition, four markers were coincident with yield and traits related to coffee leaf rust resistance. The genomic regions identified in this study can be incorporated into the coffee breeding program, through assisted selection, leading to more efficient breeding strategies in coffee. MenosThe bienniality of production and the incidence of pests and diseases, such as coffee leaf miner and coffee leaf rust, stands out among the factors that limit coffee crop yield. Obtaining cultivars with greater stability in production and resistance to these biotic agents are among the main objectives of coffee breeding programs. In this way, biotechnological tools such as Genomic Wide Association Studies (GWAS) can increase these programs' efficacy since they allow the identification of molecular markers significantly associated with phenotypes of interest. In this context, the aim here is to identify genomic regions associated with yield, bienniality, and resistance to coffee leaf miner and coffee leaf rust in arabica coffee progenies. Thus, a population (n=597) was evaluated for resistance to biotic stresses and for the eight designed scenarios to study yield and bienniality. A matrix of 4,666 SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) was built through Genotyping by Sequencing (GBS). After the genomic association analyses, we identified 12 potential SNPs markers associated with resistance to coffee leaf miner and coffee leaf rust, 32 associated with the eight designed scenarios to study yield and bienniality. Of the 44 SNPs significantly associated with this study's traits, 36 were noted in genomic regions responsible for biological processes related to plant response to biotic and abiotic stresses. In addition, four markers were coincident with yield and traits related to co... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Coffea Arábica; Genoma; Mapa; Stress. |
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Thesaurus Nal: |
Biotic stress; Coffea arabica var. arabica; Genetic resistance; Yield mapping. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230370/1/Association-mapping-reveals-genomic.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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| Registros recuperados : 148 | |
| 81. |  | JAPIASSÚ, L. B.; GARCIA, A. L. A.; GUIMARÃES, R. J.; PADILHA, L.; CARVALHO, C. H. S. de. Pruning cycles and nitrogen fertilization of coffee fields conducted in the "safra zero" system. Coffee Science, Lavras, v. 4, n. 1, p. , jan/jun. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 82. | | NONATO, J. V. A.; CARVALHO, H. F.; BORGES, K. L. R.; PADILHA, L.; MALUF, M. P.; FRITSCHE NETO, R.; GUERREIRO FILHO, O. Association mapping reveals genomic regions associated with bienniality and resistance to biotic stresses in arabica coffee. Euphytica, v. 217, n. 10, p. 1-19, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 83. | | NETTO, D. A. M.; ANDRADE, R. V.; PADILHA, L.; OLIVEIRA, A. C.; GAMA, E. E. G.; TEIXEIRA, T. G. H.; TEIXEIRA, F. F. Avaliação da maturação fisiológica e qualidade de sementes de híbridos simples de milho doce. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte. Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 84. | | PÁDUA, J. G.; JOSÉ, S. C. B. R.; QUEIROZ, A. P. de; PADILHA, L. S.; VIEIRA, R. da C.; PAIS, V. de O. Avaliação da qualidade fisiológica da coleção de base de arroz da Embrapa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 85. | | ANDRADE, R. V.; TEIXEIRA, F. F.; NETTO, D. A. M.; PADILHA, L.; FERREIRA, A. S.; PITTA, G. V. E.; SANTOS, M. X.; LEITE, C. E. P. Banco ativo de germoplasma de milho. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 5., 2005, Montevideo, Uruguay. Resúmenes... Montevideo: Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria: Universidad de la República, Facultad de Agronomía, 2005. p. 25.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 86. | | RANGEL, P. H. N.; PADUA, J. G.; ABREU, A. G. de; QUEIROZ, A. P. de; VIEIRA, R. da C.; PADILHA, L. S. Comparação de dois métodos para avaliação do poder germinativo de sementes de acessos de arroz. Revista RG News, v. 4, n. 3, p. 401, 2018 Edição especial dos Anais do 5 Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos, Fortaleza, nov. 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 87. | | PEREIRA, G. S.; VON PINHO, E. V. de R.; PADILHA, L.; RESENDE, L. de; CARVALHO, B. L.; VON PINHO, I. V. Coleta de folhas do cafeeiro e extração de DNA genômico de alta qualidade. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 88. | | RABELLO, C. A. M.; MATIELLO, J. B.; PADILHA, L.; CARVALHO, C. H. S. de; GARCIA, J. A. L. A.; FERREIRA, R. A. Combinação de cultivo do Coffea arabica, com cedro australiano Toona ciliata var.australis na Região Sul de Minas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISAS CAFEEIRAS, 35., 2009, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 89. | | PEREIRA, G. S.; PADILHA, L.; TEIXEIRA, R. K.; CARVALHO, C. H. S. de; ALMEIDA, S. R.; CARVALHO, B. L.; VON PINHO, E. V. R. Caracterização de cafeeiros resistentes e susceptíveis ao bicho-mineiro por meio de marcadores moleculares. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISA CAFEEIROAS, 36., 2010, Guarapari. Anais...Brasília, DF: Embrapa Café, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 90. | | MATIELLO, J. B.; PADILHA, L.; ALMEIDA, S. R.; CARVALHO, C. H. S. de; FERREIRA, R. A.; MENDONÇA, S. M.; L. FILHO, S. Caracterização inicial de materiais genéticos F3 do híbrido Durandé. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISA CAFEEIROAS, 33., 2007, Lavras. Anais...Brasília, DF: Embrapa Café, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 91. | | SIMÕES, B. I. E.; SCHENK, J. C. M.; SILVA, K. A. da; GUIMARÃES, P. de S.; MALUF, M. P.; PADILHA, L. Diversidade genética de populações do bicho-mineiro em regiões cafeeiras do Brasil. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 92. | | CARVALHO, C. H. S. de; MATIELLO, J. B.; ALMEIDA, S. R. de; BENTO, M. A.; FERREIRA, R. A.; FERREIRA, I. B.; PADILHA, L. Desenvolvimento de cultivares de café com resistência ao bicho-mineiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Café, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 93. | | CARVALHO, C. H. S. de; MATIELLO, J. B.; ALMEIDA, S. R.; BENTO, M. A.; FERREIRA, R. A.; FERREIRA, I. B.; PADILHA, L.; GALDINO, P. A. A. D. Desenvolvimento de cultivares de café com resistência ao bicho-mineiro e tolerância à ferrugem e à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISAS CAFEEIRAS, 37., 2011, Poços de Caldas. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 94. | | CARVALHO, C. H. S. de; MATIELLO, J. B.; ALMEIDA, S. R.; BENTO, M. A.; FERREIRA, R. A.; FERREIRA, I. B.; PADILHA, L. Desenvolvimento de cultivares de café com ressistência ao bicho-mineiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISA CAFEEIROAS, 36., 2010, Guarapari. Anais...Brasília, DF: Embrapa Café, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 95. | | BAZIOLI, J. M.; GUIMARÃES, P. de S.; STRAZZA, B. A.; SCHENK, J. C. M.; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. Desenvolvimento de marcadores associados à resistência do bicho-mineiro: seleção e validação de SNPs. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2019. Título em inglês: Development of molecular markers associated with leaf-miner resistance: selection and validation of SNPs.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 96. | | PADUA, J. G.; ALMEIDA, F. F. de; SOARES, F. M.; QUEIROZ, A. P. de; PAIS, V. de O.; PADILHA, L. S. Efeito de diferentes métodos de secagem sobre a qualidade de sementes de cevada. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA E O CARIBE, 10., 2015, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Aptor Software, 2015. p. 163.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 97. | | TEIXEIRA, F. F.; VASCONCELOS, J. H.; ANDRADE, R. V.; SANTOS, M. X.; NETTO, D. A. M.; PADILHA, L.; NOVOTNY, E. H.; MONTEIRO, M. A. R. Avaliação de variedades quanto a palha de milho para artesanato. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 5., 2005, Montevideo, Uruguay. Resúmenes... Montevideo: Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria: Universidad de la República, Facultad de Agronomía, 2005. p. 95.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 98. | | LACERDA, G. R.; PADILHA, L.; GARCIA, A. L. A.; CARVALHO, C. H. S. de; RABELLO JUNIOR, C. A. M.; MARIANO, L. F. M. Comportamento de cultivares de café na presença do Meloidogyne exigua na Região do sul de Minas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISA CAFEEIROAS, 36., 2010, Guarapari. Anais...Brasília, DF: Embrapa Café, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 99. | | CARVALHO, C. H. S. de; MATIELLO, J. B.; ALMEIDA, S. R.; FERREIRA, R. A.; PADILHA, L.; FERREIRA, I. B.; GALDINO, P. Comportamento de cultivares de café com resistência à ferrugem-do-cafeeiro no Sul do Estado de Minas Gerais. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 100. | | CARVALHO, C. H. S. de; MATIELLO, J. B.; ALMEIDA, R. A.; FERREIRA, R. A.; BENTO, M. A.; FERREIRA, I. B.; PADILHA, L.; GALDINO, P. A. A. D. Comportamento de cultivares de café resistentes à ferrugem em Vagrinha e Coromandel, MG. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISA CAFEEIROAS, 36., 2010, Guarapari. Anais...Brasília, DF: Embrapa Café, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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