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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
17/07/2023 |
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Data da última atualização: |
22/08/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ROCHA, R. de F. B.; GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; SANTOS, M. G. dos; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; GUIMARÃES, S. E. F. |
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Afiliação: |
RENATA DE FÁTIMA BRETANHA ROCHA, Universidade Federal de Viçosa; ARIELLY OLIVEIRA GARCIA, Universidade Federal de Viçosa; PAMELA ITAJARA OTTO, Universidade Federal de Santa Maria; MATEUS GUIMARÃES DOS SANTOS, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARÃES, Universidade Federal de Viçosa. |
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Título: |
Single-step genome-wide association studies and post-GWAS analyses for the number of oocytes and embryos in Gir cattle. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 34, p. 497-508, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-023-10009-0 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genome-Wide Association Studies (GWAS) are used for identifcation of quantitate trait loci (QTL) and genes associated with several traits. We aimed to identify genomic regions, genes, and biological processes associated with number of total and viable oocytes, and number of embryos in Gir dairy cattle. A dataset with 17,526 follicular aspirations, including the following traits: number of viable oocytes (VO), number of total oocytes (TO), and number of embryos (EMBR) from 1641 Gir donors was provided by fve diferent stock farms. A genotype fle with 2093 animals and 395,524 SNP markers was used to perform a single-step GWAS analysis for each trait. The top 10 windows with the highest percentage of additive genetic variance explained by 100 adjacent SNPs were selected. The genomic regions identifed in our work were overlapped with QTLs from QTL database on chromosomes 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 13, 17, 18, 20, 21, 22, 24, and 29. These QTLs were classifed as External, Health, Meat and carcass, Production or Reproduction traits, and about 38% were related to Reproduction. In total, 117 genes were identifed, of which 111 were protein-coding genes. Exclusively associations were observed for 42 genes with EMBR, and 1 with TO. Also, 42 genes were in common between VO and TO, 28 between VO and EMBR, and four genes were in common among all traits. In conclusion, great part of the identifed genes plays a functional role in initial embryo development or general cell functions. The protein-coding genes ARNT, EGR1, HIF1A, AHR, and PAX2 are good markers for the production of oocytes and embryos in Gir cattle. MenosGenome-Wide Association Studies (GWAS) are used for identifcation of quantitate trait loci (QTL) and genes associated with several traits. We aimed to identify genomic regions, genes, and biological processes associated with number of total and viable oocytes, and number of embryos in Gir dairy cattle. A dataset with 17,526 follicular aspirations, including the following traits: number of viable oocytes (VO), number of total oocytes (TO), and number of embryos (EMBR) from 1641 Gir donors was provided by fve diferent stock farms. A genotype fle with 2093 animals and 395,524 SNP markers was used to perform a single-step GWAS analysis for each trait. The top 10 windows with the highest percentage of additive genetic variance explained by 100 adjacent SNPs were selected. The genomic regions identifed in our work were overlapped with QTLs from QTL database on chromosomes 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 13, 17, 18, 20, 21, 22, 24, and 29. These QTLs were classifed as External, Health, Meat and carcass, Production or Reproduction traits, and about 38% were related to Reproduction. In total, 117 genes were identifed, of which 111 were protein-coding genes. Exclusively associations were observed for 42 genes with EMBR, and 1 with TO. Also, 42 genes were in common between VO and TO, 28 between VO and EMBR, and four genes were in common among all traits. In conclusion, great part of the identifed genes plays a functional role in initial embryo development or general cell functions. The protein-co... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Associação genômica. |
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Thesagro: |
Bovino; Embrião Animal; Gado Gir; Genética Animal. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02508naa a2200289 a 4500
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| Registros recuperados : 103 | |
| 84. |  | GUIZELINE, J.; SEIXAS, C. D. S.; DIANESE, A. de C.; ALMEIDA, A. M. R.; ARIAS, C. A. A.; OLIVEIRA, M. F. de; LOPES, E. F. Interação diferencial de genótipos de soja em espécies do complexo Fusarium solani causadoras da podridão vermelha da raiz. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MOFO BRANCO, 2014, Londrina. Desafios futuros: anais. Londrina: SBF, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 85. | | TORRES, G.; CONSOLI, L.; BONOW, S.; GOULART, A.; ROESE, A.; SEIXAS, C.; DIANESE, A. de C.; PEREIRA, J.; BONATO, A. L.; MACIEL, J. Wheat blast, a menace for tropical agriculture. In: INTERNATIONAL TRITICEAE MAPPING INICIATIVE, 21 ., 2011, Mexico. Workshop... Mexico: CIMMYT, 2011. p. 115.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 86. | | AMABILE, R. F.; MONTALVÃO, A. P. L.; SALA, P. I. A. L.; DIANESE, A. de C.; LIRA, E. G.; SAYD, R. M.; CARVALHO, C. G. P.; FAGIOLI, M. Severidade de mancha de alternaria em genótipos de girassol no Cerrado do Distrito Federal. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE GIRASSOL, 21.; SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE A CULTURA DO GIRASSOL, 9., 2015, Londrina. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2015. (Embrapa Soja. Documentos, 363). p. 87-89.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Soja. |
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| 87. | | LIRA, E. G.; AMABILE, R. F.; DIANESE, A. de C.; FAGIOLI, M.; SALA, P. I. A. L.; MONTALVÃO, A. P. L.; CARVALHO, C. G. P. Severidade de Mancha-de-alternária em genótipos de girassol no Cerrado do Distrito Federal. Evaluation of Alternaria leaf spot severity on sunflower in the Cerrado region of the Distrito Federal. Brazilian Journal of Animal and Environmental Research, v.4, n.3, p. 3517-3524, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Soja. |
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| 88. | | TORRES, G. A. M.; GOULART, A. C. P.; ROESE, A. D.; SEIXAS, C. D. S.; MACIEL, J.; DIANESE, A. de C. Trigo: como enfrentar. Cultivar: Grandes Culturas, ano 12, n. 136, p. 16-17, set. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 89. | | FERREIRA, J. R.; VANCINI, C.; DEUNER, C. C.; TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; SEIXAS, C. D. S.; DIANESE, A. de C.; GOULART, A. C. P.; SOTO-GONZÁLES, H. H. Ausência da translocação 2NS/2AS em fontes de resistência de trigo a Magnaporthe oryzae no Brasil. Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2017. 16 p. (Embrapa Trigo. Boletim de pesquisa e desenvolvimento online, 86).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Trigo. |
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| 90. | | SANO, S. M.; RAMOS, F. T. de M.; SOUSA, A. C. da S. A. de; FRAZÃO, C. R.; ALBUQUERQUE, M. P.; ELIAS, P. S.; DALLASTA, R. A.; DIANESE, A. de C. Avaliação de progênies de mangabeira, espécie nativa do Cerrado. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2012. 2012 (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 307).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 91. | | FERREIRA, J. R.; VANCINI, C.; DEUNER, C. C.; TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; SEIXAS, C. D. S.; DIANESE, A. de C.; GOULART, A. C. P.; SOTO-GONZÁLES, H. H. Absence of 2NS/2AS in wheat resistance sources to Magnaporthe oryzae in Brazil. Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2018. 21 p. (Embrapa Trigo. Boletim de pesquisa e desenvolvimento online, 91).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Soja; Embrapa Trigo. |
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| 92. | | FERREIRA, J. R.; TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; BINNECK, E.; CAMILOTTI, G. A.; SCAGLIUSI, S. M. M.; DEUNER, C. C.; DIANESE, A. de C.; GOULART, A. C. P.; SEIXAS, C. D. S.; COELHO, M. A. de O. Genetic and Molecular Basis of Wheat-Magnaporthe oryzae Triticum Interaction. In: KUMAR, S.; KASHYAP, P. L.; SINGH, G. P. (Ed.). Wheat Blast. Boca Raton: CRC Press. 2020. cap. 5. p. 69-104.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Soja; Embrapa Trigo. |
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| 93. | | DIANESE, A. de C.; ZACARONI, A. B.; SOUZA, B. C. P. de; PAGANI, A. P. da S.; PINHEIRO, N. O.; GOMES, E. M. de C.; TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; CAFÉ-FILHO, A. CORRÊA. Evaluation of wheat genotypes for field resistance to wheat blast caused by Magnaporthe oryzae pathotype Triticum (MoT) and correlation between yield loss and disease incidence in the Brazilian Cerrado. Euphytica, v. 217, n. 5, p. 84, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Trigo. |
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| 94. | | GUIMARAES, T. G.; DIANESE, A. de C.; OLIVEIRA, C. M. de; MADALENA, J. O. de M.; FALEIRO, F. G.; JUNQUEIRA, N. T. V.; LIMA, H. C. de; CAMPOS, G. A. Recomendações técnicas para o cultivo de Passiflora setaceae cv. BRS Pérola do Cerrado. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2013. 6 p. (Embrapa Cerrados. Comunicado Técnico, 174).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
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| 95. | | VANCINI, C.; FERREIRA, J. R.; WEBBER, N. F.; DEUNER, C. C.; TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; SEIXAS, C. D. S.; DIANESE, A. de C.; GOULART, A. C. P.; SOTO-GONZÁLES, H. H. Resistência de trigo à brusone: novas possibilidades de identificação. Plantio Direto, v. 29, n. 171, p. 29-34, set./out. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
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| 96. | | FARIAS NETO, A. L. de; SOUZA, P. I. de M. de; MOREIRA, C. T.; BROGIN, R. L.; CARNEIRO, L. C.; SANTIN, M. R.; ALBUQUERQUE, B.; DIANESE, A. de C.; SILVA, S. A. Reação de cultivares de soja à ferrugem asiática, causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi Sydow. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 97. | | PEREIRA, A. V.; FIALHO, J. de F.; PEREIRA, E. B. C.; JUNQUEIRA, N. T. V.; MARTINS, M. A.; MATTOSO, L. H. C.; LIMA, W. A. A. de; DIANESE, A. de C.; ALVES, R. T.; VEIGA, A. D.; FALEIRO, F. G.; CONCEIÇÃO, L. D. H. C. S. DA; BRAGA, M. F.; MALAQUIAS, J. V. Desempenho de clones de seringueira na região Centro-Oeste do Brasil. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2020. 82 p. (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 360).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Instrumentação. |
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| 98. | | PEREIRA, A. V.; FIALHO, J. de F.; PEREIRA, E. B. C.; JUNQUEIRA, N. T. V.; MARTINS, M. A.; MATTOSO, L. H. C.; LIMA, W. A. A. de; DIANESE, A. de C.; ALVES, R. T.; VEIGA, A. D.; FALEIRO, F. G.; CONCEIÇÃO, L. D. H. C. S. DA; BRAGA, M. F.; MALAQUIAS, J. V. Clones de seringueira selecionados para cultivo no estado de Goiás e no Distrito Federal. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2020. 7 p. (Embrapa Cerrados. Comunicado Técnico, 184).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Instrumentação. |
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| 99. | | TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; GONZÁLES, H. H. S.; BINNECK, E.; DIANESE, A. de C.; SEIXAS, C. D. S.; GOULART, A. C. P.; SANTANA, F. M.; WEBBER, N. F.; COELHO, M. A. O.; SCAGLIUSI, S. M. M.; NHANI JUNIOR, A.; BONATO, A. L. V.; NICOLAU, M.; BONOW, S. Blast (Magnaporthe oryzae), a potential threat to wheat production in South America. In: SEMINARIO INTERNACIONAL: 1914-2014, UN SIGLO DE MEJORAMIENTO DE TRIGO EN LA ESTANZUELA, 2014, La Estanzuela, Uruguai. [Anales...]. Montevideo: INIA, 2018. p. 167-175. (INIA. Serie técnica, 241).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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