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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
06/11/2017 |
Data da última atualização: |
14/12/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
BRITO, A. C.; OLIVEIRA, S. A. S. de; OLIVEIRA, E. J. de. |
Afiliação: |
A. C. BRITO; SAULO ALVES SANTOS DE OLIVEIRA, CNPMF; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
Título: |
Genome-wide association study for resistance to cassava root rot. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
Journal of Agricultural Science, p.1 of 18, 2017. |
DOI: |
10.1017/S0021859617000612 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Cassava root rot (CRR) disease associated with a complex of soil pathogens has caused great yield losses in the crop. The objective of the current work was to obtain insights about the genetic architecture of CRR resistance caused by Fusarium (dry root rot ? DRR), Phytophthora (soft root rot ? SRR) and Botryosphaeriaceae (black root rot ? BRR) species, using genome-wide association studies (GWAS). Phenotyping data of 263 accessions (artificial inoculation) and 14 094 single-nucleotide polymorphisms (SNP) (missing data <0·10 and minor allele frequency >0·05) were used. The severity of CRR in peel and pulp was variable among accessions, but the pathogens that caused DRR were more aggressive. Broad-sense heritability (h2g ) was of medium magnitude for all groups of resistances for pathogens, with variation from 0·16 ± 0·019 (Fspp Pulp) to 0·31 ± 0·028 (Fspp Peel). The kinship matrix was used to correct for stratification as well as for clustering the accessions. Overall, this analysis showed that there was no relationship between agronomic traits and resistance to CRR and the four clusters obtained from kinship matrix. The GWAS identified 38 significant SNPs, of which eight and 22 are related to the severity of DRR in the pulp and peel, respectively. The other eight SNPs were associated with SRR-peel (1), SRR-pulp (1), BRR-peel (3) and BRR-pulp (3). Half of the SNPs associated with CRR resistance have functional annotations related to defence and response to pathogen attack as well as general cellular processes. The current study revealed that resistance to CRR is controlled by multiple loci with small effects, and significant SNPs can be used to identify putative genes that control these traits. MenosCassava root rot (CRR) disease associated with a complex of soil pathogens has caused great yield losses in the crop. The objective of the current work was to obtain insights about the genetic architecture of CRR resistance caused by Fusarium (dry root rot ? DRR), Phytophthora (soft root rot ? SRR) and Botryosphaeriaceae (black root rot ? BRR) species, using genome-wide association studies (GWAS). Phenotyping data of 263 accessions (artificial inoculation) and 14 094 single-nucleotide polymorphisms (SNP) (missing data <0·10 and minor allele frequency >0·05) were used. The severity of CRR in peel and pulp was variable among accessions, but the pathogens that caused DRR were more aggressive. Broad-sense heritability (h2g ) was of medium magnitude for all groups of resistances for pathogens, with variation from 0·16 ± 0·019 (Fspp Pulp) to 0·31 ± 0·028 (Fspp Peel). The kinship matrix was used to correct for stratification as well as for clustering the accessions. Overall, this analysis showed that there was no relationship between agronomic traits and resistance to CRR and the four clusters obtained from kinship matrix. The GWAS identified 38 significant SNPs, of which eight and 22 are related to the severity of DRR in the pulp and peel, respectively. The other eight SNPs were associated with SRR-peel (1), SRR-pulp (1), BRR-peel (3) and BRR-pulp (3). Half of the SNPs associated with CRR resistance have functional annotations related to defence and response to pathogen attack as ... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Mandioca. |
Thesaurus Nal: |
Cassava. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02263naa a2200181 a 4500 001 2078883 005 2017-12-14 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1017/S0021859617000612$2DOI 100 1 $aBRITO, A. C. 245 $aGenome-wide association study for resistance to cassava root rot.$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aCassava root rot (CRR) disease associated with a complex of soil pathogens has caused great yield losses in the crop. The objective of the current work was to obtain insights about the genetic architecture of CRR resistance caused by Fusarium (dry root rot ? DRR), Phytophthora (soft root rot ? SRR) and Botryosphaeriaceae (black root rot ? BRR) species, using genome-wide association studies (GWAS). Phenotyping data of 263 accessions (artificial inoculation) and 14 094 single-nucleotide polymorphisms (SNP) (missing data <0·10 and minor allele frequency >0·05) were used. The severity of CRR in peel and pulp was variable among accessions, but the pathogens that caused DRR were more aggressive. Broad-sense heritability (h2g ) was of medium magnitude for all groups of resistances for pathogens, with variation from 0·16 ± 0·019 (Fspp Pulp) to 0·31 ± 0·028 (Fspp Peel). The kinship matrix was used to correct for stratification as well as for clustering the accessions. Overall, this analysis showed that there was no relationship between agronomic traits and resistance to CRR and the four clusters obtained from kinship matrix. The GWAS identified 38 significant SNPs, of which eight and 22 are related to the severity of DRR in the pulp and peel, respectively. The other eight SNPs were associated with SRR-peel (1), SRR-pulp (1), BRR-peel (3) and BRR-pulp (3). Half of the SNPs associated with CRR resistance have functional annotations related to defence and response to pathogen attack as well as general cellular processes. The current study revealed that resistance to CRR is controlled by multiple loci with small effects, and significant SNPs can be used to identify putative genes that control these traits. 650 $aCassava 650 $aMandioca 700 1 $aOLIVEIRA, S. A. S. de 700 1 $aOLIVEIRA, E. J. de 773 $tJournal of Agricultural Science, p.1 of 18, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroindústria Tropical. |
Data corrente: |
20/12/2018 |
Data da última atualização: |
30/01/2019 |
Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
Autoria: |
PEREIRA, A. L. S. |
Afiliação: |
ANDRÉ LUÍS SOUSA PEREIRA, Universidade Federal do Ceará. |
Título: |
Aerogéis de nanocelulose funcionalizados para absorção seletiva de solventes orgânicos. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
2018 |
Páginas: |
115 p. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza. Orientadora: Judith Pessoa de Andrade Feitosa. Coorientadora: Morsyleide de Freitas Rosa |
Conteúdo: |
O aerogel é um material sólido que apresenta alta porosidade, baixa densidade e grande área superficial, com características apropriadas para novas aplicações de alto valor. Como conseqüência, observam-se estudos focados em novas fontes de matéria-prima, processos e tratamentos objetivando a redução do alto custo envolvido na sua obtenção. Nesse contexto, destacam-se as fibras vegetais, em especial a celulose, o polímero natural mais abundante e um dos principais constituintes das paredes celulares das plantas, também sintetizado por alguns microrganismos. Para ampliar o leque de aplicações, alguns estudos têm investigado a funcionalização de aerogéis, sendo uma área com elevado potencial a ser explorado. No presente trabalho, com o objetivo de estabelecer uma metodologia para obtenção de aerogéis, a celulose bacteriana foi oxidada por TEMPO, nanofibrilada em ?blender? e silanizada com metiltrimetoxisilano. A oxidação e a silanização foram evidenciados por FTIR. Aerogéis foram produzidos desta suspensão funcionalizada (CBOXNS) e comparados a outros aerogéis não oxidados (CBN e CBNS) e não silanizados (CBOXN). Todos os aerogéis são muito leves (densidade de 0,010 a 0,014 g.cm-3 ) e muito porosos (porosidade de 99,8 a 99,4%). Os aerogéis apresentaram na sua morfologia uma estrutura organizada em lamelas formadas de teias de microfibrilas. Os aerogéis de CBOXNS apresentaram capacidade de absorção de óleos e solventes orgânicos (35 a 75 vezes o próprio peso) menor que os de CBN e CBNS, mas propriedades mecânicas superiores (tensão de 13,0 kPa e módulo de elasticidade de 39,4 kPa), o que possibilitou sua utilização por 7 ciclos de absorção-secagem, mantendo uma capacidade de absorção de 83%. O aerogel de CBOXNS apresentou o melhor equilíbrio entre todas as propriedades testadas e foi utilizado como modelo para a celulose bacteriana de permeado de suco de caju (CBP) e a celulose de eucalipto (CE). Os aerogéis de CBP oxidado e silanizado (CBPOXNS) e de CE oxidado e silanizado (CEOXNS) também são muito leves (~0,011 g.cm-3) e muito porosos (~99,4%), possuem propriedades mecânicas inferiores (tensão de 3,1 kPa e módulo de elasticidade de 10,7 e 3,1 kPa) quando comparados às do aerogel de CBOXNS, mas possuem elevada capacidade de absorção de óleos e solventes orgânicos, sendo o aerogel de CBPOXNS um ótimo absorvedor de óleos (65 vezes o próprio peso) e o aerogel de CEOXNS um ótimo absorvedor de solventes orgânicos (55 a 80 vezes o próprio peso). MenosO aerogel é um material sólido que apresenta alta porosidade, baixa densidade e grande área superficial, com características apropriadas para novas aplicações de alto valor. Como conseqüência, observam-se estudos focados em novas fontes de matéria-prima, processos e tratamentos objetivando a redução do alto custo envolvido na sua obtenção. Nesse contexto, destacam-se as fibras vegetais, em especial a celulose, o polímero natural mais abundante e um dos principais constituintes das paredes celulares das plantas, também sintetizado por alguns microrganismos. Para ampliar o leque de aplicações, alguns estudos têm investigado a funcionalização de aerogéis, sendo uma área com elevado potencial a ser explorado. No presente trabalho, com o objetivo de estabelecer uma metodologia para obtenção de aerogéis, a celulose bacteriana foi oxidada por TEMPO, nanofibrilada em ?blender? e silanizada com metiltrimetoxisilano. A oxidação e a silanização foram evidenciados por FTIR. Aerogéis foram produzidos desta suspensão funcionalizada (CBOXNS) e comparados a outros aerogéis não oxidados (CBN e CBNS) e não silanizados (CBOXN). Todos os aerogéis são muito leves (densidade de 0,010 a 0,014 g.cm-3 ) e muito porosos (porosidade de 99,8 a 99,4%). Os aerogéis apresentaram na sua morfologia uma estrutura organizada em lamelas formadas de teias de microfibrilas. Os aerogéis de CBOXNS apresentaram capacidade de absorção de óleos e solventes orgânicos (35 a 75 vezes o próprio peso) menor que os de CBN ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Aerogel; Celulose bacteriana; Silanização. |
Thesagro: |
Oxidação. |
Thesaurus NAL: |
Oxidation. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/189053/1/Tese-Andre.pdf
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Marc: |
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