| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
|
Data corrente: |
26/07/2022 |
|
Data da última atualização: |
10/11/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; AFONSO, J.; PETRINI, J.; ANDRADE, B. G. N.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MALHEIROS, J. M.; ROCHA, M. I. P.; ZERLOTINI NETO, A.; FERRAZ, J. B. S.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
|
Afiliação: |
UFSCar; ESALQ/USP; Munster Technological University; UFSCar; Federal University of Latin American Integration, Foz do Iguaçu; UFSCar; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; FZEA/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
|
Título: |
EEF1A1 transcription cofactor gene polymorphism is associated with muscle gene expression and residual feed intake in Nelore cattle. |
|
Ano de publicação: |
2022 |
|
Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 33, n. 4, p. 619-628, Dec. 2022. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-022-09959-8 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Abstract. Cis-acting effects of noncoding variants on gene expression and regulatory molecules constitute a significant factor for phenotypic variation in complex traits. To provide new insights into the impacts of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) on transcription factors (TFs) and transcription cofactors (TcoF) coding genes, we carried out a multi-omic analysis to identify cis-regulatory effects of SNPs on these genes? expression in muscle and describe their association with feed efficiency-related traits in Nelore cattle. As a result, we identified one SNP, the rs137256008C > T, predicted to impact the EEF1A1 gene expression (? = 3.02; P-value = 3.51E-03) and the residual feed intake trait (? = -3.47; P-value = 0.02). This SNP was predicted to modify transcription factor sites and overlaps with several QTL for feed efficiency traits. In addition, coexpression network analyses showed that animals containing the T allele of the rs137256008 SNP may be triggering changes in the gene network. Therefore, our analyses reinforce and contribute to a better understanding of the biological mechanisms underlying gene expression control of feed efficiency traits in bovines. The cis-regulatory SNP can be used as biomarker for feed efficiency in Nelore cattle. |
|
Palavras-Chave: |
Cofatores de transcrição; Expressão gênica; Fatores de transcrição; Loci de característica quantitativa; Nelore cattle; Polimorfismos de nucleotídeo único. |
|
Thesagro: |
Gado Nelore. |
|
Thesaurus Nal: |
Gene expression; Quantitative trait loci; Single nucleotide polymorphism; Transcription (genetics); Transcription factors. |
|
Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
|
Marc: |
LEADER 02647naa a2200421 a 4500
001 2144939
005 2022-11-10
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00335-022-09959-8$2DOI
100 1 $aCARDOSO, T. F.
245 $aEEF1A1 transcription cofactor gene polymorphism is associated with muscle gene expression and residual feed intake in Nelore cattle.$h[electronic resource]
260 $c2022
520 $aAbstract. Cis-acting effects of noncoding variants on gene expression and regulatory molecules constitute a significant factor for phenotypic variation in complex traits. To provide new insights into the impacts of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) on transcription factors (TFs) and transcription cofactors (TcoF) coding genes, we carried out a multi-omic analysis to identify cis-regulatory effects of SNPs on these genes? expression in muscle and describe their association with feed efficiency-related traits in Nelore cattle. As a result, we identified one SNP, the rs137256008C > T, predicted to impact the EEF1A1 gene expression (? = 3.02; P-value = 3.51E-03) and the residual feed intake trait (? = -3.47; P-value = 0.02). This SNP was predicted to modify transcription factor sites and overlaps with several QTL for feed efficiency traits. In addition, coexpression network analyses showed that animals containing the T allele of the rs137256008 SNP may be triggering changes in the gene network. Therefore, our analyses reinforce and contribute to a better understanding of the biological mechanisms underlying gene expression control of feed efficiency traits in bovines. The cis-regulatory SNP can be used as biomarker for feed efficiency in Nelore cattle.
650 $aGene expression
650 $aQuantitative trait loci
650 $aSingle nucleotide polymorphism
650 $aTranscription (genetics)
650 $aTranscription factors
650 $aGado Nelore
653 $aCofatores de transcrição
653 $aExpressão gênica
653 $aFatores de transcrição
653 $aLoci de característica quantitativa
653 $aNelore cattle
653 $aPolimorfismos de nucleotídeo único
700 1 $aBRUSCADIN, J. J.
700 1 $aAFONSO, J.
700 1 $aPETRINI, J.
700 1 $aANDRADE, B. G. N.
700 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. de
700 1 $aMALHEIROS, J. M.
700 1 $aROCHA, M. I. P.
700 1 $aZERLOTINI NETO, A.
700 1 $aFERRAZ, J. B. S.
700 1 $aMOURÃO, G. B.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
773 $tMammalian Genome$gv. 33, n. 4, p. 619-628, Dec. 2022.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
|
Data corrente: |
11/12/2007 |
|
Data da última atualização: |
18/07/2011 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
Nacional - B |
|
Autoria: |
ANDRADE, G. de C.; BELLOTE, A. F. J.; SILVA, H. D. da; RIZZI, N. E.; GAVA, J. L. |
|
Afiliação: |
Guilherme de Castro Andrade, Embrapa Florestas; Antônio Francisco Jurado Bellote, Embrapa Florestas; Helton Damin da Silva, Embrapa Florestas; Nivaldo Eduardo Rizzi, UFPR; José Luiz Gava, Suzano. |
|
Título: |
Acúmulo de nutrientes na biomassa e na serapilheira de Eucalyptus grandis em função da aplicação de lixo urbano e de nutrientes minerais. |
|
Ano de publicação: |
2006 |
|
Fonte/Imprenta: |
Boletim de Pesquisa Florestal, Colombo, n. 53, p. 109-136, jul./dez. 2006. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Quantidades significativas de resíduos orgânicos são produzidas a cada ano pela população, tornando-se indispensável obter práticas econômicas e seguras para a disposição e utilização destes. A aplicação de resíduos orgânicos em plantios florestais é uma alternativa a ser considerada. Este trabalho avaliou os efeitos da aplicação de lixo urbano e da adubação mineral em Eucalyptus grandis W. Hill ex Maiden sobre o acúmulo de nutrientes na serapilheira e na biomassa aérea das árvores aos 86 meses de idade, em Itatinga, SP, em Neossolo Quartzarênico Órtico típico. Verificou-se, nas pcarcelas experimentais com lixo urbano, maiores valores para biomassa arbórea (36,9 % de ganho com relação à testemunha) e maiores conteúdos de N, P, K e Ca no sítio antes do corte das árvores. Após a retirada de madeira (alburno e cerne), observou-se também que com a manutenção das outras partes da árvore nessas parcelas, houve uma maior disponibilização desses nutrientes no sítio, cujos valores foram entre 18 % e 49 % a mais dos conteúdos encontrados para a testemunha, que poderão contribuir para a manutenção da produtividade. Os resultados evidenciaram a importância de se manter a casca das 110 árvores no sítio, pois o descascamento feito no local propiciou, em média, um retorno de 32 % do total de nutrientes acumulados na biomassa aérea. Também, na colheita da madeira, galhos, folhas, ponteiras e serapilheira, devem ser mantidos no campo como um meio de se aumentar o estoque de nutrientes das próximas rotações. MenosQuantidades significativas de resíduos orgânicos são produzidas a cada ano pela população, tornando-se indispensável obter práticas econômicas e seguras para a disposição e utilização destes. A aplicação de resíduos orgânicos em plantios florestais é uma alternativa a ser considerada. Este trabalho avaliou os efeitos da aplicação de lixo urbano e da adubação mineral em Eucalyptus grandis W. Hill ex Maiden sobre o acúmulo de nutrientes na serapilheira e na biomassa aérea das árvores aos 86 meses de idade, em Itatinga, SP, em Neossolo Quartzarênico Órtico típico. Verificou-se, nas pcarcelas experimentais com lixo urbano, maiores valores para biomassa arbórea (36,9 % de ganho com relação à testemunha) e maiores conteúdos de N, P, K e Ca no sítio antes do corte das árvores. Após a retirada de madeira (alburno e cerne), observou-se também que com a manutenção das outras partes da árvore nessas parcelas, houve uma maior disponibilização desses nutrientes no sítio, cujos valores foram entre 18 % e 49 % a mais dos conteúdos encontrados para a testemunha, que poderão contribuir para a manutenção da produtividade. Os resultados evidenciaram a importância de se manter a casca das 110 árvores no sítio, pois o descascamento feito no local propiciou, em média, um retorno de 32 % do total de nutrientes acumulados na biomassa aérea. Também, na colheita da madeira, galhos, folhas, ponteiras e serapilheira, devem ser mantidos no campo como um meio de se aumentar o estoque de nutrientes das pr... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Nutrição mineral; Plantio florestal. |
|
Thesagro: |
Adubação; Resíduo Orgânico. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPF/42122/1/BPF_53_p109-136.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02268naa a2200217 a 4500
001 1313789
005 2011-07-18
008 2006 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aANDRADE, G. de C.
245 $aAcúmulo de nutrientes na biomassa e na serapilheira de Eucalyptus grandis em função da aplicação de lixo urbano e de nutrientes minerais.
260 $c2006
520 $aQuantidades significativas de resíduos orgânicos são produzidas a cada ano pela população, tornando-se indispensável obter práticas econômicas e seguras para a disposição e utilização destes. A aplicação de resíduos orgânicos em plantios florestais é uma alternativa a ser considerada. Este trabalho avaliou os efeitos da aplicação de lixo urbano e da adubação mineral em Eucalyptus grandis W. Hill ex Maiden sobre o acúmulo de nutrientes na serapilheira e na biomassa aérea das árvores aos 86 meses de idade, em Itatinga, SP, em Neossolo Quartzarênico Órtico típico. Verificou-se, nas pcarcelas experimentais com lixo urbano, maiores valores para biomassa arbórea (36,9 % de ganho com relação à testemunha) e maiores conteúdos de N, P, K e Ca no sítio antes do corte das árvores. Após a retirada de madeira (alburno e cerne), observou-se também que com a manutenção das outras partes da árvore nessas parcelas, houve uma maior disponibilização desses nutrientes no sítio, cujos valores foram entre 18 % e 49 % a mais dos conteúdos encontrados para a testemunha, que poderão contribuir para a manutenção da produtividade. Os resultados evidenciaram a importância de se manter a casca das 110 árvores no sítio, pois o descascamento feito no local propiciou, em média, um retorno de 32 % do total de nutrientes acumulados na biomassa aérea. Também, na colheita da madeira, galhos, folhas, ponteiras e serapilheira, devem ser mantidos no campo como um meio de se aumentar o estoque de nutrientes das próximas rotações.
650 $aAdubação
650 $aResíduo Orgânico
653 $aNutrição mineral
653 $aPlantio florestal
700 1 $aBELLOTE, A. F. J.
700 1 $aSILVA, H. D. da
700 1 $aRIZZI, N. E.
700 1 $aGAVA, J. L.
773 $tBoletim de Pesquisa Florestal, Colombo$gn. 53, p. 109-136, jul./dez. 2006.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
