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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
24/07/2019 |
Data da última atualização: |
09/01/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. da S.; SOUZA, M. de S.; ANDRADE, B. G.; KOLTES, J. E.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REECY, J. M.; REGITANO, L. C. de A. |
Afiliação: |
PRISCILA S. N. DE OLIVEIRA, CPPSE; LUIZ L. COUTINHO, Esalq/USP; ALINE S. M. CESAR, Esalq/USP; WELLISON J. DA SILVA DINIZ, UFSCar; MARCELA M. DE SOUZA, Iowa State University; BRUNO G. ANDRADE, CPPSE; JAMES E. KOLTES, Iowa State University; GERSON B. MOURÃO, Esalq/USP; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; JAMES M. REECY, Iowa State University; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Título: |
Co-expression networks reveal potential regulatory roles of miRNAs in fatty acid composition of nelore cattle. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Genetics, v. 10, p. 1-14, July 2019. |
DOI: |
10.3389/fgene.2019.00651 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Article 651. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana C.A. Regitano. |
Conteúdo: |
Fatty acid (FA) content affects the sensorial and nutritional value of meat and plays a significant role in biological processes such as adipogenesis and immune response. It is well known that, in beef, the main FAs associated with these biological processes are oleic acid (C18:1 cis9, OA) and conjugated linoleic acid (CLA-c9t11), which may have beneficial effects on metabolic diseases such as type 2 diabetes and obesity. Here, we performed differential expression and co-expression analyses, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) and partial correlation with information theory (PCIT), to uncover the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in skeletal muscle associated with FA content. miRNA and mRNA expression data were obtained from skeletal muscle of Nelore cattle that had extreme genomic breeding values for OA and CLA. Insulin and MAPK signaling pathways were identified by WGCNA as central pathways associated with both of these fatty acids. Co-expression network analysis identified bta-miR-33a/b, bta-miR-100, bta-miR-204, bta-miR-365-5p, btamiR-660, bta-miR-411a, bta-miR-136, bta-miR-30-5p, bta-miR-146b, bta-let-7a-5p, bta-let-7f, bta-let-7, bta-miR 339, bta-miR-10b, bta-miR 486, and the genes ACTA1 and ALDOA as potential regulators of fatty acid synthesis. This study provides evidence and insights into the molecular mechanisms and potential target genes involved in fatty acid content differences in Nelore beef cattle, revealing new candidate pathways of phenotype modulation that could positively benefit beef production and human consumption. MenosFatty acid (FA) content affects the sensorial and nutritional value of meat and plays a significant role in biological processes such as adipogenesis and immune response. It is well known that, in beef, the main FAs associated with these biological processes are oleic acid (C18:1 cis9, OA) and conjugated linoleic acid (CLA-c9t11), which may have beneficial effects on metabolic diseases such as type 2 diabetes and obesity. Here, we performed differential expression and co-expression analyses, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) and partial correlation with information theory (PCIT), to uncover the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in skeletal muscle associated with FA content. miRNA and mRNA expression data were obtained from skeletal muscle of Nelore cattle that had extreme genomic breeding values for OA and CLA. Insulin and MAPK signaling pathways were identified by WGCNA as central pathways associated with both of these fatty acids. Co-expression network analysis identified bta-miR-33a/b, bta-miR-100, bta-miR-204, bta-miR-365-5p, btamiR-660, bta-miR-411a, bta-miR-136, bta-miR-30-5p, bta-miR-146b, bta-let-7a-5p, bta-let-7f, bta-let-7, bta-miR 339, bta-miR-10b, bta-miR 486, and the genes ACTA1 and ALDOA as potential regulators of fatty acid synthesis. This study provides evidence and insights into the molecular mechanisms and potential target genes involved in fatty acid content differences in Nelore beef cattle, revealing new candidate... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Ácido linoleico conjugado; Ácido oleico; Ácidos graxos; Genômica; Integrative genomics; MiRNA; MRNA; Redes de co-expressão. |
Thesagro: |
Bos Indicus; Gado de Corte. |
Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Conjugated linoleic acid; Oleic acid. |
Categoria do assunto: |
-- L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/199817/1/AP-Coexpression-networks.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
Data corrente: |
09/03/2009 |
Data da última atualização: |
09/03/2009 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
LE BOURLEGAT, J. L. G.; NIETO, L. M.; MARSON, T. A.; PEREIRA, G. R.; SILVA, L. N.; TORRES JÚNIOR, R. A. A.; SILVA, L. O. C.; ROSA, A. N. |
Afiliação: |
Jean L. G. Le Bourlegat, UEM; Leonardo Martin Nieto, Técnico Geneplus; Thais Alleoni Marson, Técnico da FUNDAPAM/GENEPLUS; G. R. Pereira, Técnico da FUNDAPAM/GENEPLUS; Lucas N. Silva, UEM; Roberto Augusto de Almeida Torres Júnior, CNPGC; Luiz Otávio Campos da Silva, CNPGC; Antonio do Nascimento Rosa, CNPGC. |
Título: |
Estudo da consangüinidade no rebanho Nelore P.O. da Embrapa Gado de Corte. |
Ano de publicação: |
2007 |
Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 3., 2007, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2007. |
Páginas: |
p. 47 |
Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Neste trabalho foi analisada a evolução da consangüinidade nos produtos nascidos nos 14 últimos anos, como também o grau de parentesco das diferentes linhagens com o rebanho PO da Embrapa Gado de Corte. Para o presente estudo foi calculada a média de consangüinidade (CC) dos produtos nascidos no período de 1992 a 2006. |
Palavras-Chave: |
Avaliação; Bovino de Corte; Brasil; Campo Grande; Evolução; Mato Grosso do Sul; Nelore PO. |
Thesagro: |
Análise Estatística; Consangüinidade; Melhoramento Genético Animal. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 01344naa a2200337 a 4500 001 1326954 005 2009-03-09 008 2007 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aLE BOURLEGAT, J. L. G. 245 $aEstudo da consangüinidade no rebanho Nelore P.O. da Embrapa Gado de Corte. 260 $c2007 300 $ap. 47$c1 CD-ROM. 520 $aNeste trabalho foi analisada a evolução da consangüinidade nos produtos nascidos nos 14 últimos anos, como também o grau de parentesco das diferentes linhagens com o rebanho PO da Embrapa Gado de Corte. Para o presente estudo foi calculada a média de consangüinidade (CC) dos produtos nascidos no período de 1992 a 2006. 650 $aAnálise Estatística 650 $aConsangüinidade 650 $aMelhoramento Genético Animal 653 $aAvaliação 653 $aBovino de Corte 653 $aBrasil 653 $aCampo Grande 653 $aEvolução 653 $aMato Grosso do Sul 653 $aNelore PO 700 1 $aNIETO, L. M. 700 1 $aMARSON, T. A. 700 1 $aPEREIRA, G. R. 700 1 $aSILVA, L. N. 700 1 $aTORRES JÚNIOR, R. A. A. 700 1 $aSILVA, L. O. C. 700 1 $aROSA, A. N. 773 $tIn: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 3., 2007, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2007.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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