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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
26/07/2022 |
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Data da última atualização: |
10/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; AFONSO, J.; PETRINI, J.; ANDRADE, B. G. N.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MALHEIROS, J. M.; ROCHA, M. I. P.; ZERLOTINI NETO, A.; FERRAZ, J. B. S.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
UFSCar; ESALQ/USP; Munster Technological University; UFSCar; Federal University of Latin American Integration, Foz do Iguaçu; UFSCar; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; FZEA/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
EEF1A1 transcription cofactor gene polymorphism is associated with muscle gene expression and residual feed intake in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 33, n. 4, p. 619-628, Dec. 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-022-09959-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract. Cis-acting effects of noncoding variants on gene expression and regulatory molecules constitute a significant factor for phenotypic variation in complex traits. To provide new insights into the impacts of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) on transcription factors (TFs) and transcription cofactors (TcoF) coding genes, we carried out a multi-omic analysis to identify cis-regulatory effects of SNPs on these genes? expression in muscle and describe their association with feed efficiency-related traits in Nelore cattle. As a result, we identified one SNP, the rs137256008C > T, predicted to impact the EEF1A1 gene expression (? = 3.02; P-value = 3.51E-03) and the residual feed intake trait (? = -3.47; P-value = 0.02). This SNP was predicted to modify transcription factor sites and overlaps with several QTL for feed efficiency traits. In addition, coexpression network analyses showed that animals containing the T allele of the rs137256008 SNP may be triggering changes in the gene network. Therefore, our analyses reinforce and contribute to a better understanding of the biological mechanisms underlying gene expression control of feed efficiency traits in bovines. The cis-regulatory SNP can be used as biomarker for feed efficiency in Nelore cattle. |
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Palavras-Chave: |
Cofatores de transcrição; Expressão gênica; Fatores de transcrição; Loci de característica quantitativa; Nelore cattle; Polimorfismos de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Gado Nelore. |
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Thesaurus Nal: |
Gene expression; Quantitative trait loci; Single nucleotide polymorphism; Transcription (genetics); Transcription factors. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 6 | |
| 1. |  | ROMMEL, C. C.; MARKOSKI, M. M.; VALDEBENITO-SANHUEZA, R. M.; DUARTE, V. Caracterização de isolados bacterianos fluorescentes associados à necrose de flores de pereira euriopéia no Rio Grande do Sul. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 32, p. S 270, ago. 2007. Suplemento. Edição dos resumos do XL Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Maringá, 13 a 17 de agosto de 2007. Resumo 806.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 4. | | CARVALHO, J. P. G.; PONTES, L. da S.; PORFIRIO-DA-SILVA, V.; BARRO, R.; ROMMEL, C. C.; MICHETTI, M.; CORTADA, C. N. M. Características morfológicas de avena blanca y raigrás en sistema silvopastoril y al pleno sol. In: CONGRESO NACIONAL DE SISTEMAS SILVOPASTORILES, 2., 2012, Santiago del Estero. Actas. [S.l.]: INTA, 2012. Resúmene.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 5. | | COMIRAN, F.; ROMMEL, C. C.; FINGER, M. I. F.; GONZATTO, M. P.; GIANLUPPI, G. D. F.; WERNZ NETO, A.; CASTRO, B. de; SMIDERLE, V. G. Diagnóstico e planejamento para diversificação de um sistema de produção com base na cultura do fumo. Cadernos de Ciência & Tecnologia, Brasília, DF., v. 29, n. 1, p. 159-194, jan./abr. 2012| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | ROMMEL, C. C.; ARENOU, D.; MUSSIO, C.; GOMES, G. S.; HAUER, M.; COMIRAN, F.; MAZZA, M. C. M.; AHRENS, D. C. Identificação de plantas potenciais na Serra da Esperança: embrião de gestão participativa e conservação pelo uso. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE AGROECOLOGÍA, 4., 2013, Lima. Potenciación agroecológica de la pequeña agricultura para la soberanía alimentaria y la resiliencia frente al cambio climático y la crisis económica. Lima: Universidad Nacional Agraria La Molina, 2013. p. 17. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| Registros recuperados : 6 | |
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