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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
21/11/2018 |
Data da última atualização: |
29/11/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A. |
Afiliação: |
Priscila Silva Neubern de Oliveira, Bolsista/Embrapa Pecuária Sudeste; Luiz L. Coutinho, USP; Polyana C. Tizioto, NGS Genomic Solutions; Aline S. M. Cesar, USP; Gabriella B. de Oliveira, USP; Wellison J. da S. Diniz, UFSCAR; Andressa O. de Lima, UFSCAR; James M. Reecy, Iowa State University; Gerson B. Mourão, USP; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Título: |
An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 8, n. 17072, 2018. |
DOI: |
10.1038/s41598-018-35315-5 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Residual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21, bta-miR 29, btamiR- 30b, bta-miR-106b, bta-miR-199a-3p, bta-miR-204, and bta-miR 296 may have a potential role in variation of RFI. Functional enrichment analysis of differentially expressed (DE) miRNA?s target genes and miRNA?mRNA correlated modules revealed that insulin, lipid, immune system, oxidative stress and muscle development signaling pathways might potentially be involved in RFI in this population. Our study identified DE miRNAs, miRNA - mRNA regulatory networks and hub miRNAs related to RFI. These findings suggest a possible role of miRNAs in regulation of RFI, providing new insights into the potential molecular mechanisms that control feed efficiency in Nelore cattle. |
Palavras-Chave: |
MiRNA; RFI. |
Thesagro: |
Gado Nelore. |
Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Nellore; Skeletal muscle. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/186529/1/An-integrative-transcriptome.pdf
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Marc: |
LEADER 02400naa a2200325 a 4500 001 2099755 005 2019-11-29 008 2019 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1038/s41598-018-35315-5$2DOI 100 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. de 245 $aAn integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle.$h[electronic resource] 260 $c2019 520 $aResidual Feed Intake (RFI) is an economically relevant trait in beef cattle. Among the molecular regulatory mechanisms, microRNAs (miRNAs) are an important dimension in post-transcriptional regulation and have been associated with different biological pathways. Here, we performed differential miRNAs expression and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) to better understand the complex interactions between miRNAs and mRNAs expressed in bovine skeletal muscle and liver. MiRNA and mRNA expression data were obtained from Nelore steers that were genetically divergent for RFI (N = 10 [low RFI or feed efficient]; N = 10 [high RFI or feed inefficient]). Differentially expressed and hub miRNAs such as bta-miR-486, bta-miR-7, bta-miR15a, bta-miR-21, bta-miR 29, btamiR- 30b, bta-miR-106b, bta-miR-199a-3p, bta-miR-204, and bta-miR 296 may have a potential role in variation of RFI. Functional enrichment analysis of differentially expressed (DE) miRNA?s target genes and miRNA?mRNA correlated modules revealed that insulin, lipid, immune system, oxidative stress and muscle development signaling pathways might potentially be involved in RFI in this population. Our study identified DE miRNAs, miRNA - mRNA regulatory networks and hub miRNAs related to RFI. These findings suggest a possible role of miRNAs in regulation of RFI, providing new insights into the potential molecular mechanisms that control feed efficiency in Nelore cattle. 650 $aBeef cattle 650 $aNellore 650 $aSkeletal muscle 650 $aGado Nelore 653 $aMiRNA 653 $aRFI 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aTIZIOTO, P. C. 700 1 $aCESAR, A. S. M. 700 1 $aOLIVEIRA, G. B. de 700 1 $aDINIZ, W, J. da S. 700 1 $aLIMA, A. O. de 700 1 $aREECY, J. M. 700 1 $aMOURÃO, G. B. 700 1 $aZERLOTINI NETO, A. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 773 $tScientific Reports$gv. 8, n. 17072, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Registros recuperados : 136 | |
8. | | CARVALHO JUNIOR, W. de; LOIREAU, M.; FARGETTE, M.; CALDERANO FILHO, B.; WÉLÉ, A. Correlation between soil erodibility and satellite data on areas of current desertification: a case study in Senegal. Revista Ciência & Trópico, Recife, v. 41, n. 2, p. 51-66, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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10. | | CALDERANO FILHO, B.; CARVALHO JUNIOR, W.; CALDERANO, S. B.; GUERRA, A. J. T.; POLIVANOV, H. Estudo de erosão dos solos na área do médio alto curso do Rio Grande, Região Serrana do Estado do Rio de Janeiro. Revista Geonorte, Manaus, v. 10, n. 1, p. 514-519, out. 2014. Edição especial 4. Edição dos anais do 10 Simpósio Nacional de Geomorfologia, Manaus, out. 2014.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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12. | | CALDERANO FILHO, B.; WITTERN, K. P.; CONCEIÇÃO, M. da; TAVARES, N. P.; FAGUNDES, S. R. F. Identificação de limitações pedológicas e ambientais causadoras da degradação de áreas do Jardim Botânico do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ: IBAMA, 1992. 101 p. (IBAMA. Estudos e Contribuições, 10). Equipe Técnica: Braz Calderano Filho, Klaus Peter Wittern, Mauro da Conceição, Ney Pinto Tavares, Sergio Renato Franco Fagundes, Estácio Albuquerque Filho, Humberto Goncalves do Santos, Osório O. M. da Fonseca.Biblioteca(s): Embrapa Solos; Embrapa Solos / UEP-Recife. |
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14. | | CALDERANO FILHO, B.; ANDRADE, A. G. de; DONAGEMMA, G. K.; MANZATTO, C. V.; CALDERANO, S. B. Diagnóstico do meio físico dos reassentamentos rurais da UHE de Manso, para fins de planejamento conservacionista. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E DA ÁGUA, 17., 2008, Rio de Janeiro. Manejo e conservação do solo e da água no contexto das mudanças ambientais. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2008. 1 CD-ROM. (Embrapa Solos. Documentos, 101).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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16. | | CUNHA, T. J. F.; CARMO, C. A. F. de S. do; CALDERANO FILHO, B.; BLANCANEAUX, P. Diferenciação pedológica e desenvolvimento da seringueira em Oratórios-MG. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 27., 1999, Brasília, DF. Resumos [...]. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 1999. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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20. | | CALDERANO FILHO, B.; FONSECA, O. O. M. da; SANTOS, H. G. dos; SANTOS, R. D. dos. Levantamento semidetalhado de solos da Fazenda Canchim São Carlos - SP. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 26., 1997, Rio de Janeiro. Informação, globalização, uso do solo: anais. [Viçosa, MG]: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 1997. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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