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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pantanal; Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
09/05/2016 |
Data da última atualização: |
10/05/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
HADI, S. I. I. A; SANTANA, H.; BRUNALE, P. P. M.; GOMES, T. G.; OLIVEIRA, M. D. de; MATTHIENSEN, A.; OLIVEIRA, M. E. C.; SILVA, F. C. P.; BRASIL, B. dos S. A. F. |
Afiliação: |
SÁMED, I. I. A. HADI, UFT; HUGO SANTANA, UFBA; PATRÍCIA P. M. BRUNALE, UnB; TAÍSA G. GOMES, UFT; MARCIA DIVINA DE OLIVEIRA, CPAP; ALEXANDRE MATTHIENSEN, CNPSA; MARCOS ENE CHAVES OLIVEIRA, CPATU; FLÁVIA C. P. SILVA; BRUNO DOS SANTOS ALVES FIGUEIREDO B, CNPAE. |
Título: |
DNA barcoding green microalgae isolated from neotropical inland waters. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 11, n. 2, Feb. 2016. |
DOI: |
http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0149284 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
This study evaluated the feasibility of using the Ribulose Bisphosphate Carboxylase Large subunit gene (rbcL) and the Internal Transcribed Spacers 1 and 2 of the nuclear rDNA (nuITS1 and nuITS2) markers for identifying a very diverse, albeit poorly known group, of green microalgae from neotropical inland waters. Fifty-one freshwater green microalgae strains isolated from Brazil, the largest biodiversity reservoir in the neotropics, were submitted to DNA barcoding. Currently available universal primers for ITS1-5.8S-ITS2 region amplification were sufficient to successfully amplify and sequence 47 (92%) of the samples. On the other hand, new sets of primers had to be designed for rbcL, which allowed 96% of the samples to be sequenced. Thirty-five percent of the strains could be unambiguously identified to the species level based either on nuITS1 or nuITS2 sequences? using barcode gap calculations. nuITS2 Compensatory Base Change (CBC) and ITS1-5.8S-ITS2 region phylogenetic analysis, together with morphological inspection, confirmed the identification accuracy. In contrast, only 6% of the strains could be assigned to the correct species based solely on rbcL sequences. In conclusion, the data presented here indicates that either nuITS1 or nuITS2 are useful markers for DNA barcoding of freshwater green microalgae, with advantage for nuITS2 due to the larger availability of analytical tools and reference barcodes deposited at databases for this marker. |
Palavras-Chave: |
Análise molecular; Identificação morfológica; Microalgas; Sequenciamento genético. |
Thesagro: |
Alga. |
Thesaurus Nal: |
Algae; Microalgae. |
Categoria do assunto: |
-- P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra V Taxonomia de Organismos |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/176636/1/journal.pone.0149284.PDF
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/152647/1/journal.pone.0149284.PDF
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Marc: |
LEADER 02375naa a2200313 a 4500 001 2046770 005 2018-05-10 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0149284$2DOI 100 1 $aHADI, S. I. I. A 245 $aDNA barcoding green microalgae isolated from neotropical inland waters.$h[electronic resource] 260 $c2016 520 $aThis study evaluated the feasibility of using the Ribulose Bisphosphate Carboxylase Large subunit gene (rbcL) and the Internal Transcribed Spacers 1 and 2 of the nuclear rDNA (nuITS1 and nuITS2) markers for identifying a very diverse, albeit poorly known group, of green microalgae from neotropical inland waters. Fifty-one freshwater green microalgae strains isolated from Brazil, the largest biodiversity reservoir in the neotropics, were submitted to DNA barcoding. Currently available universal primers for ITS1-5.8S-ITS2 region amplification were sufficient to successfully amplify and sequence 47 (92%) of the samples. On the other hand, new sets of primers had to be designed for rbcL, which allowed 96% of the samples to be sequenced. Thirty-five percent of the strains could be unambiguously identified to the species level based either on nuITS1 or nuITS2 sequences? using barcode gap calculations. nuITS2 Compensatory Base Change (CBC) and ITS1-5.8S-ITS2 region phylogenetic analysis, together with morphological inspection, confirmed the identification accuracy. In contrast, only 6% of the strains could be assigned to the correct species based solely on rbcL sequences. In conclusion, the data presented here indicates that either nuITS1 or nuITS2 are useful markers for DNA barcoding of freshwater green microalgae, with advantage for nuITS2 due to the larger availability of analytical tools and reference barcodes deposited at databases for this marker. 650 $aAlgae 650 $aMicroalgae 650 $aAlga 653 $aAnálise molecular 653 $aIdentificação morfológica 653 $aMicroalgas 653 $aSequenciamento genético 700 1 $aSANTANA, H. 700 1 $aBRUNALE, P. P. M. 700 1 $aGOMES, T. G. 700 1 $aOLIVEIRA, M. D. de 700 1 $aMATTHIENSEN, A. 700 1 $aOLIVEIRA, M. E. C. 700 1 $aSILVA, F. C. P. 700 1 $aBRASIL, B. dos S. A. F. 773 $tPlos One$gv. 11, n. 2, Feb. 2016.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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41. | | CARMONA, P. A. O.; GUIMARÃES, M. B.; CAMPANHA, R. B.; GARCIA, L. C.; OLIVEIRA, M. E. C.; SIQUEIRA, F. G. de; MENDONCA, S. Estudo da vida útil das fibras da prensagem de dendê híbrido. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 3., 2016, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 275-282.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Oriental. |
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42. | | ANTONIASSI, R.; MACHADO, A. F. de F.; WILHELM, A. E.; GUEDES, A. M. M.; BIZZO, H. R.; OLIVEIRA, M. E. C.; YOKOYAMA, R.; LOPES, R. Óleo de palma de alto oleico produzido no Brasil no ano de 2016. Rio de Janeiro Embrapa Agroindústria de Alimentos, 2018. 6 p. (Embrapa Agroindústria de Alimentos. Comunicado Técnico, 229).Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental. |
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43. | | MACHADO, A. F. de F.; WILHELM, A. E.; GUEDES, A. M. M.; BIZZO, H. R.; OLIVEIRA, M. E. C.; YOKOYAMA, R.; BORGES, P. P. V.; ANTONIASSI, R. Óleo de palma de alto oleico produzido no Brasil. In: CONGRESSO LUSO-BRASILEIRO DE HORTICULTURA, 1., 2018, Lisboa. Lisboa: Associação Portuguesa de Horticultura, mar., 2018. p. 581-586. (Actas Portuguesas de Horticultura, 29). Suporte eletrônico. ISBN: 978-972-8936-28-0. I CLBHort. Editores Paulo César Tavares de Melo, António Calado. 1-4 nov. 2018.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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44. | | MACHADO, A. F. de F.; WILHELM, A. E.; OLIVEIRA, M. E. C.; GUEDES, A. M. M.; YOKOYAMA, R.; BORGES, P. P. V.; BIZZO, H. R.; ANTONIASSI, R. Óleo de palma de alto oleico produzido no Brasil. In: CONGRESSO LUSO-BRASILEIRO DE HORTICULTURA, 1., 2017, Lisboa. Livro de Resumos. Lisboa: Associação Portuguesa de Horticultura, 2017. p. 231. Po145 - Outras áreas. 1 a 4 de novembro de 2017. Observar quando o trabalho completo for publicado para contar como produção.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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45. | | TAVARES, E. J. M.; PEREIRA, W. L. A.; VASCONCELOS, F.; FRACETO, L. F.; OLIVEIRA, M. E. C.; MOURA, M. R. de; MATTOSO, L. H. C.; AOUADA, F. A.; MELO, N. F. S. de; ALVES, R. M. Assessment of the citotoxicity and acute oral toxicity of a new spherical chitosan-polymethacrylic acid (CS-PMAA) nanoparticle In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON FOOD AND AGRICULTURE APPLICATIONS OF NANOTECHNOLOGIES - NanoAgri, 2010, São Pedro, SP. [Anais?] São Pedro: Aptor Software, 2010. Editors: Caue Ribeiro, Odílio Benedito Garrido de Assis, Luiz Henrique Capparelli Mattoso, Sérgio Mascarenhas.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Instrumentação. |
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48. | | TAVARES, E. J. M.; PEREIRA, W. L. A.; FRACETO, L. F.; VASCONCELOS, F.; OLIVEIRA, M. E. C.; GUILHERME, M. R.; MATTOSO, L. H. C.; MELO, N. F. S. de. Citotoxicity and acute oral toxicity tests of nanometer- and submicrometer-sized hollow spheres of chondroitin sulfate as a potential formulation strategy for anti-inflammatory encapsulation. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON FOOD AND AGRICULTURE APPLICATIONS OF NANOTECHNOLOGIES, 2010, São Pedro, SP. [Anais...]. São Pedro, SP: Aptor Software, 2010. p. 241. NanoAgri 2010. Editors: Caue Ribeiro, Odílio Benedito Garrido de Assis, Luiz Henrique Capparelli Mattoso, Sérgio Mascarenhas.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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49. | | VASCONCELOS, M. A. M. de; MOURÃO JUNIOR, M.; ABREU, L. F.; OLIVEIRA, M. E. C.; VENTURIERI, A.; SANTANA, M. de F. S. de; CUNHA, R. L.; FRANÇA, L. F. de. Definição de classes para teor de óleo em tucumã do Pará (Astrocarium vulgare, Martius), espécie nativa com potencial para agroenergia. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 3., 2009, Brasília, DF. Artigos técnicos-científicos. Brasília, DF: MCT: MBC, 2009. v. 3, p. 169-170.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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50. | | OLIVEIRA, M. S. de; PEREIRA, D. S.; CRUZ, J. N.; HOLANDA-NETO, J. P. de; CARVALHO, C. J. R. de; SOUZA FILHO, A. P. da S.; OLIVEIRA, M. E. C. Determinação rápida de umidade, nitrogênio total e carbono total em pólen de Apis mellifera da região nordeste do estado do Pará, Brasil, utilizando NIRs e regressão PLS. Brazilian Journal of Development, Curitiba, v. 6, n. 9, p. 65948-65960, Sep. 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
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51. | | HADI, S. I. I. A; SANTANA, H.; BRUNALE, P. P. M.; GOMES, T. G.; OLIVEIRA, M. D. de; MATTHIENSEN, A.; OLIVEIRA, M. E. C.; SILVA, F. C. P.; BRASIL, B. dos S. A. F. DNA barcoding green microalgae isolated from neotropical inland waters. Plos One, v. 11, n. 2, Feb. 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pantanal; Embrapa Suínos e Aves. |
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52. | | HADI, S. I. I. A.; SANTANA, H.; BRUNALE, P. P. de M.; GOMES, T. G.; OLIVEIRA, M. D. de; MATTHIENSEN, A.; OLIVEIRA, M. E. C.; SILVA, F. C. P.; BRASIL, B. dos S. A. F. DNA barcoding of microalgae using rbcL and nuITS2 markers reveals putative new species. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. p. 92-94Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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53. | | MORAIS, K. dos S.; MARQUEZ, A. F.; GOMES, T. G.; MACHADO, A. E. V.; LEMOS, M.; OLIVEIRA, M. E. C.; MARTINS JUNIOR, H.; MENDONCA, S.; SIQUEIRA, F. G. de. Subprodutos da agroindústria do óleo de palma (dendê) para cultivo de cogumelos comestíveis e nutrição de peixes. Revista de Biotecnologia e Ciência, v. 6, n. 1, p. 25-54, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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54. | | OLIVEIRA, M. E. C.; LIMA, C. B. da S.; ALVES, R. M. de O.; SODRE, G. da S.; SOUZA, B. de A.; RIBEIRO, M. de F.; CARVALHO, C. A. L. de. The southern limit of natural occurrence of the stingless bee Melipona subnitida (Hymenoptera: Apidae) Journal of Entomological Research, v. 41, n. 4, p. 353-360, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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55. | | TAVARES, E. J. M.; PEREIRA, W. L. A.; AOUADA, F. A.; VASCONCELOS, F. de; MOURA, M. R. de; ALVES, R. M.; MATTOSO, L. H. C.; OLIVEIRA, M. E. C. Teste da toxicidade aguda oral de um novo hidrogel para liberação controlada de insumos agropecuários. In: WORKSHOP DA REDE DE NANOTECNOLOGIA APLICADA AO AGRONEGÓCIO, 5., 2009, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2009. p. 136-138. Editado por: Odílio Benedito Garrido de Assis, Wilson Tadeu Lopes da Silva, Luiz Henrique Capparelli Mattoso.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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56. | | TAVARES, E. J. M.; PEREIRA, W. L. A.; AOUADA, F. A.; VASCONCELOS, F. de; MOURA, M. R. de; ALVES, R. M.; MATTOSO, L. H. C.; OLIVEIRA, M. E. C. Teste da toxicidade aguda oral de um novo hidrogel para liberação controlada de insumos agropecuários. In: WORKSHOP DA REDE DE NANOTECNOLOGIA APLICADA AO AGRONEGÓCIO, 5., 2009, São Carlos. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2009. p. 136-138. Editado por Odílio Benedito Garrido de Assis; Wilson Tadeu Lopes da Silva; Luiz Henrique Capparelli Mattoso.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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57. | | ALVES, T. V. G.; TAVARES, E. J. M.; AOUADA, F. A.; NEGRÃO, C. A. B.; OLIVEIRA, M. E. C.; DUARTE JÚNIOR, A. P.; COSTA, C. E. F. da; SILVA JÚNIOR, J. O. C.; COSTA, R. M. R. Thermal analysis characterization of PAAm-co-MC hydrogels. Journal of Thermal Analysis and Calorimetry, v. 106, n. 3, p. 717-724, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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58. | | ALVES, T. V. G.; DUARTE JUNIOR, A. P.; TAVARES, E. J. M.; AOUADA, F. A.; OLIVEIRA, M. E. C.; COSTA, C. E. F. da; SILVA JUNIOR, J. O. C.; COSTA, R. M. R. Estudo termoanalítico de hidrogel de PAAM-C-MC e dos manômeros AAm E MC. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ANÁLISE TÉRMICA E CALORIMETRIA, 7., 2010, São Pedro. [Anais]. [São Paulo]: ABRATEC, 2010.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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59. | | BARBOSA, N. G. S.; RODRIGUEZ, N. M.; FERNANDES, P. C. C.; GARCIA, A. R.; NAHUM, B. de S.; SALIBA, E. S.; BORGES, I.; ÁVILA, S. C.; MENEZES, B. P.; RIBEIRO, O. A. V.; OLIVEIRA, M. E. C.; QUINZEIRO NETO, T. Intake and digestibility of river buffalo steers (Bubalus bubalis) fed different levels of palm kernel cake: effect of diet neutral detergent fiber, digestible energy, crude protein and extract ether. Revista Veterinaria, v. 21, supl. 1, p. 146-150, 2010. Proceeding of World Buffalo Congress, 9., 2010, Buenos Aires.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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