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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
19/02/2019 |
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Data da última atualização: |
19/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; SOUSA, G. H. M. F.; CESAR, A. S. M.; SIMAS, R. C.; SILVA-VIGNATO, B.; OLIVEIRA, G. B.; ANDRADE, S. C. S.; CAMERON, L. C.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
Mirele D. Poleti, USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Gustavo H. M. F. Souza, MS Applications and Development Laboratory Waters Corporation; Aline S. M. Cesar, USP; Rosineide C. Simas, USP; Bárbara Silva-Vignato, USP; Gabriella B. Oliveira, USP; Sónia C. S. Andrade, USP; Luiz C. Cameron, UNIRIO; Luiz Lehmann Coutinho, USP. |
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Título: |
Longissimus dorsi muscle label-free quantitative proteomic reveals biological mechanisms associated with intramuscular fat deposition. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Proteomics, v. 179, p. 30-41, 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.dib.2018.06.004 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The pathways involved in intramuscular fat (IMF) deposition in Longissimus dorsi muscle were investigated using an integrated transcriptome-assisted label-free quantitative proteomic approach by High Definition Mass Spectrometry. We quantified 1582 proteins, of which 164 were differentially abundant proteins (DAPs, p < 0.05) between animals with high (H) and low (L) genomic estimated breeding values (GEBV) for IMF content. Ingenuity pathway analysis (IPA) revealed that these DAPs were mainly involved in glycolysis metabolism, actin cytoskeleton signaling, cell-cell adherens junction and pathways for MAPK and insulin. A comparative study between transcriptomic (mRNA) and proteomic data showed 17 differentially expressed genes corresponding to DAPs, of which three genes/proteins did not agree on the direction of the fold change between groups. Moreover, we investigated microRNAs data to explain these differences in fold change direction, being able to unravel two of the three unexpected mRNA/protein relationships. Results demonstrated that changes in protein/mRNA levels of sarcomere organization, intracellular signal transduction and regulation of actin cytoskeleton, are involved in IMF deposition. These findings provide a deeper understanding of the highly complex regulatory mechanisms involved in IMF deposition in cattle and indicate target pathways for future studies. Significance: Intramuscular fat is the amount of fat deposited inside muscle and plays an important role in human health and meat quality attributes, influencing energy metabolism of skeletal muscle, as well as, tenderness, flavor, and juiciness of beef. We performed for the first time the utilization of integrated transcriptome-assisted label-free quantitative proteomic approach using High Definition Mass Spectrometry for characterization of the changes in the proteomic profile of the Longissimus dorsi muscle associated with intramuscular fat deposition in cattle. Furthermore, we compared the muscle proteome with the muscle transcriptome (mRNA and microRNAs), obtained by RNA-sequencing, to better understand the relationship between expression of mRNAs and proteins and to unravel essential biological mechanisms involved in bovine skeletal muscle IMF deposition. MenosThe pathways involved in intramuscular fat (IMF) deposition in Longissimus dorsi muscle were investigated using an integrated transcriptome-assisted label-free quantitative proteomic approach by High Definition Mass Spectrometry. We quantified 1582 proteins, of which 164 were differentially abundant proteins (DAPs, p < 0.05) between animals with high (H) and low (L) genomic estimated breeding values (GEBV) for IMF content. Ingenuity pathway analysis (IPA) revealed that these DAPs were mainly involved in glycolysis metabolism, actin cytoskeleton signaling, cell-cell adherens junction and pathways for MAPK and insulin. A comparative study between transcriptomic (mRNA) and proteomic data showed 17 differentially expressed genes corresponding to DAPs, of which three genes/proteins did not agree on the direction of the fold change between groups. Moreover, we investigated microRNAs data to explain these differences in fold change direction, being able to unravel two of the three unexpected mRNA/protein relationships. Results demonstrated that changes in protein/mRNA levels of sarcomere organization, intracellular signal transduction and regulation of actin cytoskeleton, are involved in IMF deposition. These findings provide a deeper understanding of the highly complex regulatory mechanisms involved in IMF deposition in cattle and indicate target pathways for future studies. Significance: Intramuscular fat is the amount of fat deposited inside muscle and plays an important role in... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Adiposidade; Gordura intramuscular; MRNA. |
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Thesagro: |
Gordura Animal. |
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Thesaurus Nal: |
Mass spectrometry; MicroRNA. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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520 $aThe pathways involved in intramuscular fat (IMF) deposition in Longissimus dorsi muscle were investigated using an integrated transcriptome-assisted label-free quantitative proteomic approach by High Definition Mass Spectrometry. We quantified 1582 proteins, of which 164 were differentially abundant proteins (DAPs, p < 0.05) between animals with high (H) and low (L) genomic estimated breeding values (GEBV) for IMF content. Ingenuity pathway analysis (IPA) revealed that these DAPs were mainly involved in glycolysis metabolism, actin cytoskeleton signaling, cell-cell adherens junction and pathways for MAPK and insulin. A comparative study between transcriptomic (mRNA) and proteomic data showed 17 differentially expressed genes corresponding to DAPs, of which three genes/proteins did not agree on the direction of the fold change between groups. Moreover, we investigated microRNAs data to explain these differences in fold change direction, being able to unravel two of the three unexpected mRNA/protein relationships. Results demonstrated that changes in protein/mRNA levels of sarcomere organization, intracellular signal transduction and regulation of actin cytoskeleton, are involved in IMF deposition. These findings provide a deeper understanding of the highly complex regulatory mechanisms involved in IMF deposition in cattle and indicate target pathways for future studies. Significance: Intramuscular fat is the amount of fat deposited inside muscle and plays an important role in human health and meat quality attributes, influencing energy metabolism of skeletal muscle, as well as, tenderness, flavor, and juiciness of beef. We performed for the first time the utilization of integrated transcriptome-assisted label-free quantitative proteomic approach using High Definition Mass Spectrometry for characterization of the changes in the proteomic profile of the Longissimus dorsi muscle associated with intramuscular fat deposition in cattle. Furthermore, we compared the muscle proteome with the muscle transcriptome (mRNA and microRNAs), obtained by RNA-sequencing, to better understand the relationship between expression of mRNAs and proteins and to unravel essential biological mechanisms involved in bovine skeletal muscle IMF deposition.
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700 1 $aCOUTINHO, L. L.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| Registros recuperados : 71 | |
| 41. |  | OLIVEIRA, G. B. de; CESAR, A. S. M.; FELICIO, A. M.; POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L. Gene network regulated by microRNAs suggests modulation of fat deposition in cattle. Journal of Animal Science, v. 94, e-suppl. 5; Journal of Dairy Science, v. 99, e-suppl. 1, p. 159, jul. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 43. | | CARDOSO, I. M.; SOUZA, H. N. de; BONFIM, V. R.; SOUTO, R. L.; CARVALHO, A. F. de; OLIVEIRA, G. B. de; FEITAL, D. G. Sistemas agroflorestais: contribuições para a sustentabilidade. In: MONTOYA VILCAHUAMAN, L. J.; RIBASKI, J.; MACHADO, A. M. B. (Ed.). Sistemas agroflorestais e desenvolvimento com proteção ambiental: perspectivas, análises e tendências. Colombo: Embrapa Florestas, 2006. p. 97-113.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 44. | | SILVA, D. M. da; SILVA, U. T. F. da; NASCIMENTO, A. S. do; SANCHES, N. F.; OLIVEIRA, G. B. de; GAMA, F. de C.; PARANHOS, B. A. J. Preferência de Cryptolaemus montrouzieri (Col.: Coccinellidae) sobre ninfas de Maconellicoccus hirsutus (Hemip.: Pseudococcidae) e ovos de Ceratitis capitata (Dip.: Tephritidae). In : JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 12., 2018. Ciência profissional : resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2019. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 45. | | SILVA, D. M. da; SILVA, U. T. F. da; NASCIMENTO, A. S. do; SANCHES, N. F.; OLIVEIRA, G. B. de; GAMA, F. de C.; PARANHOS, B. A. J. Preferência de Cryptolaemus montrouzieri (Col.: Coccinellidae) sobre ninfas de Maconellicoccus hirsutus (Hemip.: Pseudococcidae) e ovos de Ceratitis capitata (Dip.: Tephritidae). In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 12., 2018. Ciência profissional: resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2019.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 46. | | SILVA, C. E.; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; MANDARINO, J. M. G.; OLIVEIRA, M. A.; LEITE, R. S.; OLIVEIRA, G. B. A.; MOREIRA, A. A.; SANTOS, H. M. C.; MÔNACO, A. P. A. Avaliação de ácidos graxos da soja: grão inteiro, casca, cotilédones e hipocótilo. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 31-34. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 47. | | NASCIMENTO, A. S. do; JOACHIM-BRAVO, I. S.; BENEVIDES, C. M. de J.; LOPES, M. V.; OLIVEIRA, G. B. de; BENEVIDES, L. de J.; SILVA NETO, A. M.; DIAS, V. S. Aprimorando a técnica do inseto estéril para fruticultura do Semiárido: avaliação de dietas de baixo custo para criação massal da mosca do mediterrâneo, ceratitis capitata. In: FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DA BAHIA. Semiárido: Edital Temático de Apoio a Pesquisas voltadas à resolução de problemas do Semiárido baiano 2007. Salvador, 2012, p. 135-140.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 48. | | SANTOS, H. M. C.; OLIVEIRA, M. A. de; OLIVEIRA, A. F.; MANDARINO, J. M. G.; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; OLIVEIRA, G. B. A.; LEITE, R. S.; MOREIRA, A. A.; SILVA, C. E. Análise sensorial de biscoitos com farinha de soja orgânica de cultivares especiais para a alimentação humana. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 83-86. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 49. | | SILVA, J. B. da; OLIVEIRA, G. B. A. de; SILVA, S. O.; OLIVEIRA, E. F. de; CAMPOS FILHO, P. J. de; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; MANDARINO, J. M. G. Avaliação da preferência sensorial de extratos solúveis de soja, obtidos de cultivares especiais para a alimentação humana. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 3., 2008, Londrina. Resumos expandidos...Londrina: Embrapa Soja, 2008. p. 31-37 (Embrapa Soja. Documentos, 297).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 50. | | OLIVEIRA, P. S. N. de; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, G. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Differentially expressed miRNAs in skeletal muscle related to feed efficiency in Nellore cattle. Journal of Animal Science, v. 94, e-suppl. 5; Journal of Dairy Science, v. 99, e-suppl. 1, p. 159, jul. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 51. | | SANTOS, H. M. C.; OLIVEIRA, M. A.; OLIVEIRA, A. F.; MANDARINO, J. M. G.; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; LEITE, R. S.; OLIVEIRA, G. B. A.; MOREIRA, A. A.; SILVA, C. E. Desenvolvimento e caracterização físico-química de biscoitos com farinha de soja orgânica de cultivares especiais para a alimentação humana. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 79-82. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 52. | | POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; SOUZA, G. H. M. F.; CESAR, A. S. M.; SIMAS, R. C.; SILVA-VIGNATO, B.; OLIVEIRA, G. B.; ANDRADE, S. C. S; CAMERON, L. C.; COUTINHO, L. L. Data from proteomic analysis of bovine Longissimus dorsi muscle associated with intramuscular fat content. Data in Brief, v. 19, p. 1314-1317, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 53. | | OLIVEIRA, G. B. A.; TERRILE, A. E.; OLIVEIRA, M. A. de; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; MANDARINO, J. M. G.; LEITE, R. S.; SANTOS, H. M. C.; MOREIRA, A. A.; SILVA, C. E. Teste de aceitabilidade de brotos de soja da cultivar BRS 216. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 73-75. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 54. | | MOREIRA, A. A.; MANDARINO, J. M. G.; CARRÃO PANIZZI, M. C.; OLIVEIRA, M. A. de; LEITE, R. S.; OLIVEIRA, G. B. A.; SANTOS, H. M. C.; SILVA, C. E. Teste para comprovar a eficiência do método de extração e determinação de ácido fítico em sementes de soja utilizado na Embrapa Soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 13-15. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 55. | | BENEVIDES, L. de J.; SILVA NETO, A. M. da; DIAS, V. S.; BENEVIDES, C. M. de J.; LOPES, M. V.; BRAVO, I. S. J.; OLIVEIRA, G. B. de; NASCIMENTO, A. S. do. Subprodutos agroindustriais na elaboração de dietas para moscas-das-frutas (Ceratitis capitata). In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 3., 2009, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 56. | | POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; SOUSA, G. H. M. F.; CESAR, A. S. M.; SIMAS, R. C.; SILVA-VIGNATO, B.; OLIVEIRA, G. B.; ANDRADE, S. C. S.; CAMERON, L. C.; COUTINHO, L. L. Longissimus dorsi muscle label-free quantitative proteomic reveals biological mechanisms associated with intramuscular fat deposition. Journal of Proteomics, v. 179, p. 30-41, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 57. | | BENEVIDES, L. de J.; SILVA NETO, A. M. da; DIAS, V. S.; BENEVIDES, C. M. de J.; LOPES, M. V.; JOACHIM-BRAVO, I. S.; OLIVEIRA, G. B. de; NASCIMENTO, A. S. do. Low-cost artificial diets for the Mediterranean fruit fly, Ceratitis capitata Wiedemann (Diptera: Tephritidae). Magistra, Cruz das Almas-BA, v. 24, número especial, p. 01-07, dez. 2012. Semana Entomológica da Bahia (SINSECTA), 03 a 09 de dezembro de 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 58. | | OLIVEIRA, P. S. N. de; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; TIZIOTO, P. C.; POLETI, M. D.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. miRNAs related to fatty acids composition in Nellore cattle. Journal of Animal Science, v. 94, e-suppl. 5; Journal of Dairy Science, v. 99, e-suppl. 1, p. 159, jul. 2016. p. 160.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 59. | | OLIVEIRA, G. B.; REGITANO, L. C. de A.; CESAR, A. S. M.; REECY, J. M.; DEGAKI, K. Y.; POLETI, M. D.; FELICIO, A. M.; KOLTES, J. E.; COUTINHO, L. L. Integrative analysis of microRNAs and mRNAs revealed regulation of composition and metabolism in Nelore cattle. BMC Genomics, v. 19, n. 126, p. 2-16, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 60. | | SILVA NETO, A. M. da; NASCIMENTO, A. S. do; BRAVO, I. S. J.; DIAS, V. S.; BENEVIDES, C. M. de J.; SILVA, M. V. L.; BENEVIDES, L.; OLIVEIRA, G. B. de. Fontes protéicas oriundas de produtos comerciais nacionais como potenciais substitutos do hidrolisado importado para a criação massal de Ceratitis capitata. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 3., 2009, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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