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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
05/11/2021 |
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Data da última atualização: |
29/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MATOSINHO, C. G. R.; ROSSE, I. C.; FONSECA, P. A. S.; OLIVEIRA, F. S. de; SANTOS, F. G. dos; ARAÚJO, F. M. G.; SALIM, A. C. de M.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA, G.; PIRES, D. E. V.; CARVALHO, M. R. S. |
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Afiliação: |
CAROLINA GUIMARÃES RAMOS MATOSINHO, Universidade Federal de Minas Gerais; IZINARA CRUZ ROSSE, Universidade Federal de Ouro Preto; PABLO AUGUSTO SOUZA FONSECA, University of Guelph; FRANCISLON SILVA DE OLIVEIRA, Fiocruz; FAUSTO GONÇALVES DOS SANTOS, Fiocruz; FLÁVIO MARCOS GOMES ARAÚJO, Fiocruz; ANNA CHRISTINA DE MATOS SALIM, Fiocruz; BEATRIZ CORDENONSI LOPES, Epamig; WAGNER ANTONIO ARBEX, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MARIA GABRIELA CAMPOLINA D PEIXOTO, CNPGL; RUI DA SILVA VERNEQUE, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; GUILHERME OLIVEIRA, Instituto Tecnológico Vale; DOUGLAS EDUARDO VALENTE PIRES, University of Melbourne; MARIA RAQUEL SANTOS CARVALHO, Universidade Federal de Minas Gerais. |
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Título: |
Identifcation and in silico characterization of structural and functional impacts of genetic variants in milk protein genes in the Zebu breeds Guzerat and Gyr. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Animal Health and Production, v. 53, n. 6, 524, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11250-021-02970-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Whole genome sequencing of bovine breeds has allowed identifcation of genetic variants in milk protein genes. However, functional repercussion of such variants at a molecular level has seldom been investigated. Here, the results of a multistep Bioinformatic analysis for functional characterization of recently identifed genetic variants in Brazilian Gyr and Guzerat breeds is described, including predicted efects on the following: (i) evolutionary conserved nucleotide positions/regions; (ii) protein function, stability, and interactions; (iii) splicing, branching, and miRNA binding sites; (iv) promoters and transcription factor binding sites; and (v) collocation with QTL. Seventy-one genetic variants were identifed in the caseins (CSN1S1, CSN2, CSN1S2, and CSN3), LALBA, LGB, and LTF genes. Eleven potentially regulatory variants and two missense mutations were identifed. LALBA Ile60Val was predicted to afect protein stability and fexibility, by reducing the number the disulfde bonds established. LTF Thr546Asn is predicted to generate steric clashes, which could mildly afect iron coordination. In addition, LALBA Ile60Val and LTF Thr546Asn afect exonic splicing enhancers and silencers. Consequently, both mutations have the potential of afecting immune response at individual level, not only in the mammary gland. Although laborious, this multistep procedure for classifying variants allowed the identifcation of potentially functional variants for milk protein genes. |
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Palavras-Chave: |
In silico variant analysis. |
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Thesagro: |
Bovino; Caseína; Leite; Proteína. |
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Thesaurus Nal: |
Casein; Cattle; Lactoferrin; Milk proteins. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pantanal. Para informações adicionais entre em contato com cpap.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
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Data corrente: |
06/06/2012 |
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Data da última atualização: |
25/02/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
FREITAS, D. A. F. de; SILVA, M. L. N.; CARDOSO, E. L.; CURI, N. |
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Afiliação: |
DIEGO ANTONIO FRANÇA DE FREITAS, UFLA; MARX LEANDRO NAVES SILVA, UFLA; EVALDO LUIS CARDOSO, CPAP; NILTON CURI, UFLA. |
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Título: |
Índices de qualidade do solo sob diferentes sistemas de uso e manejo florestal e cerrado nativo adjacente. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Ciência Agronômica, v. 43, n.3, p. 41-428, 2012. |
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ISSN: |
1806-6690 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Existe uma dificuldade em quantificar diferentes atributos do solo que estão relacionados com a sustentabilidade e traduzir estes indicadores na forma de índices de qualidade do solo. Assim, objetivou-se neste trabalho estabelecer tais índices sob diferentes sistemas de uso e manejo florestal e cerrado nativo adjacente através da avaliação integrada de atributos físicos e químicos. Para isto, foram desenvolvidos dois índices de qualidade (IQS1 e IQS2) utilizando um banco de dados sobre sistemas de manejo do eucalipto e cerrado nativo em Latossolos de Minas Gerais. No IQS1 os ecossistemas naturais, caracterizados pela mínima intervenção antrópica e de esperado equilíbrio, foram considerados como referência. O IQS2 foi gerado a partir de um modelo aditivo que considera as funções principais do solo e os indicadores de qualidade a elas associados, sendo atribuídos pesos para as funções e indicadores. O IQS1 e o IQS2 apresentaram diferentes valores para os solos e sistemas de manejo analisados. Os sistemas sofreram reduções do IQS1 quando comparados aos sistemas nativos, sendo que apenas os sistemas agrossilvopastoris apresentaram valores superiores de qualidade do solo quando comparados aos sistemas de referência. Pelo IQS2, os Latossolos Vermelho-Amarelos (LVA1 e LVA2) apresentaram qualidade do solo superior aos Latossolos Vermelhos (LV1 e LV2), sendo este resultado devido às menores limitações dos atributos químicos e físicos nas funções principais dos solos, influenciadas pelos sistemas de manejo daqueles solos. Apenas os sistemas agrossilvopastoris que utilizam eucalipto com arroz e eucalipto com soja proporcionaram melhoria da qualidade do solo pelos dois sistemas analisados. It is difficult to quantify the different soil characteristics that are related to sustainability, and to translate these indicators into soil-quality indexes. Therefore, this study aimed to establish such indexes for different forestry and adjacent native scrubland use and management systems by the integrated evaluation of physical and chemical properties. To this end, two quality indexes were developed (IQS1 and IQS2), using a database of eucalyptus and native scrubland management systems for latosols in the state of Minas Gerais. In IQS1, natural ecosystems, characterized by minimal anthropic intervention and having the expected equilibrium, were used as reference. IQS2 was generated from an additive model that considers the main soil functions and the quality indicators associated with them by assigning weights to those functions and indicators. IQS1 and IQS2 presented different values f or the soils and management systems analyzed. The systems suffered reductions in SQI1 when compared to the native systems, with only the agro-forestry systems having higher soil-quality values, when compared to the reference systems. Using IQS2 the red-yellow latosols (LVA1 and LVA2) showed higher soil quality than the red latosols (LV1 and LV2), this result being due to the lower limitations of the chemical and physical attributes on the principal soil functions, influenced by the management systems of those soils. Only the agro-forestry systems employing eucalyptus with rice and eucalyptus with soybeans provided improved soil quality when using the two systems analyzed. MenosExiste uma dificuldade em quantificar diferentes atributos do solo que estão relacionados com a sustentabilidade e traduzir estes indicadores na forma de índices de qualidade do solo. Assim, objetivou-se neste trabalho estabelecer tais índices sob diferentes sistemas de uso e manejo florestal e cerrado nativo adjacente através da avaliação integrada de atributos físicos e químicos. Para isto, foram desenvolvidos dois índices de qualidade (IQS1 e IQS2) utilizando um banco de dados sobre sistemas de manejo do eucalipto e cerrado nativo em Latossolos de Minas Gerais. No IQS1 os ecossistemas naturais, caracterizados pela mínima intervenção antrópica e de esperado equilíbrio, foram considerados como referência. O IQS2 foi gerado a partir de um modelo aditivo que considera as funções principais do solo e os indicadores de qualidade a elas associados, sendo atribuídos pesos para as funções e indicadores. O IQS1 e o IQS2 apresentaram diferentes valores para os solos e sistemas de manejo analisados. Os sistemas sofreram reduções do IQS1 quando comparados aos sistemas nativos, sendo que apenas os sistemas agrossilvopastoris apresentaram valores superiores de qualidade do solo quando comparados aos sistemas de referência. Pelo IQS2, os Latossolos Vermelho-Amarelos (LVA1 e LVA2) apresentaram qualidade do solo superior aos Latossolos Vermelhos (LV1 e LV2), sendo este resultado devido às menores limitações dos atributos químicos e físicos nas funções principais dos solos, influenciadas pe... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Soil-quality; Solo-qualidade; Sustainability; Sustentabilidade. |
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Thesagro: |
Eucalipto. |
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Thesaurus NAL: |
Eucalyptus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aExiste uma dificuldade em quantificar diferentes atributos do solo que estão relacionados com a sustentabilidade e traduzir estes indicadores na forma de índices de qualidade do solo. Assim, objetivou-se neste trabalho estabelecer tais índices sob diferentes sistemas de uso e manejo florestal e cerrado nativo adjacente através da avaliação integrada de atributos físicos e químicos. Para isto, foram desenvolvidos dois índices de qualidade (IQS1 e IQS2) utilizando um banco de dados sobre sistemas de manejo do eucalipto e cerrado nativo em Latossolos de Minas Gerais. No IQS1 os ecossistemas naturais, caracterizados pela mínima intervenção antrópica e de esperado equilíbrio, foram considerados como referência. O IQS2 foi gerado a partir de um modelo aditivo que considera as funções principais do solo e os indicadores de qualidade a elas associados, sendo atribuídos pesos para as funções e indicadores. O IQS1 e o IQS2 apresentaram diferentes valores para os solos e sistemas de manejo analisados. Os sistemas sofreram reduções do IQS1 quando comparados aos sistemas nativos, sendo que apenas os sistemas agrossilvopastoris apresentaram valores superiores de qualidade do solo quando comparados aos sistemas de referência. Pelo IQS2, os Latossolos Vermelho-Amarelos (LVA1 e LVA2) apresentaram qualidade do solo superior aos Latossolos Vermelhos (LV1 e LV2), sendo este resultado devido às menores limitações dos atributos químicos e físicos nas funções principais dos solos, influenciadas pelos sistemas de manejo daqueles solos. Apenas os sistemas agrossilvopastoris que utilizam eucalipto com arroz e eucalipto com soja proporcionaram melhoria da qualidade do solo pelos dois sistemas analisados. It is difficult to quantify the different soil characteristics that are related to sustainability, and to translate these indicators into soil-quality indexes. Therefore, this study aimed to establish such indexes for different forestry and adjacent native scrubland use and management systems by the integrated evaluation of physical and chemical properties. To this end, two quality indexes were developed (IQS1 and IQS2), using a database of eucalyptus and native scrubland management systems for latosols in the state of Minas Gerais. In IQS1, natural ecosystems, characterized by minimal anthropic intervention and having the expected equilibrium, were used as reference. IQS2 was generated from an additive model that considers the main soil functions and the quality indicators associated with them by assigning weights to those functions and indicators. IQS1 and IQS2 presented different values f or the soils and management systems analyzed. The systems suffered reductions in SQI1 when compared to the native systems, with only the agro-forestry systems having higher soil-quality values, when compared to the reference systems. Using IQS2 the red-yellow latosols (LVA1 and LVA2) showed higher soil quality than the red latosols (LV1 and LV2), this result being due to the lower limitations of the chemical and physical attributes on the principal soil functions, influenced by the management systems of those soils. Only the agro-forestry systems employing eucalyptus with rice and eucalyptus with soybeans provided improved soil quality when using the two systems analyzed.
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