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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
10/12/2018 |
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Data da última atualização: |
08/08/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
OLIVEIRA, F. A. de. |
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Afiliação: |
Fernanda Ancelmo de Oliveira, UNICAMP. |
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Título: |
Estudos genético-genômicos em gramíneas forrageiras tropicais dos gêneros Urochloa e Paspalum. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, 2017. |
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Páginas: |
212 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Co-Orientadora: Bianca Baccili Zanotto Vigna, Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Conteúdo: |
A pecuária bovina brasileira é baseada, predominantemente, na utilização de pastagens para a alimentação animal. Estas cobrem extensas áreas, o que viabiliza o maior rebanho comercial do mundo e a posição de maior exportador de carne bovina. U. humidicola está entre as forrageiras exóticas mais cultivadas nas pastagens brasileiras; ocorre em locais úmidos, de drenagem deficiente ou com inundação sazonal, razão pela qual ocupa extensas áreas no cerrado e na região amazônica. Espécies nativas do gênero Paspalum, apresentam potencial forrageiro e ornamental, e destacam-se pela grande variabilidade intra-específica a ser explorada. O lançamento de novas cultivares é uma alternativa para a diversificação das pastagens, e é a principal forma de atenuar problemas provenientes do monocultivo. Contudo, essas gramíneas têm seu perfil genético-molecular-genômico pouco estudado. E conhecer a extensão da variabilidade genética contida dentro dos bancos de germoplasma auxilia no planejamento de estratégias para maximizar os ganhos genéticos em programas de melhoramento. Nesse contexto, esta tese teve como objetivo contribuir para o conhecimento sobre a genética e genômica de espécies desses dois importantes gêneros de forrageiras tropicais. A partir do método RNA-seq e, montagem de novo, foi obtido o perfil transcriptômico global de folha de U. humidicola e folha e flor de P. notatum. Para U. humidicola foram obtidos 35.093 unigenes, representando o primeiro transcriptoma para a espécie. Esses foram anotados e relacionados à vias de fixação de carbono C4, síntese de lignocelulose e à resposta ao stress por alagamento. A busca por potenciais marcadores revelou 4.489 microssatélites (SSR) e 560.298 single nucleotide polymorphisms (SNP). Foram identificados genes únicos e diferencialmente expressos, corroborados por qPCR, entre os dois genótipos do banco de germoplasma da Embrapa utilizados para análise, o acesso apomítico BH16 ?cultivar BRS Tupi (CIAT 26149) e o único genótipo sexual da espécie, o acesso BH031 (CIAT 26146). Sugere-se, ainda, uma provável origem híbrida para o BH031. Para P. notatum, foi gerado um transcriptoma altamente representativo, a partir de dois tecidos (folha e flor) de seis genótipos com réplicas biológicas, que apresentam diferentes ploidias e modo de reprodução (sexual ou apomítico), resultando em mais de 100.000 unigenes montados com métricas robustas. Através de abordagens de expressão diferencial de genes entre sexuais e apomíticos, enriquecimento dos termos GO (Gene Ontology) e rede de coexpressão gênica, foram identificados genes candidatos a apomixia. Esses podem ser melhor investigados, visando elucidar esse intrigante mecanismo de reprodução, como também, desenvolver marcadores ligados a apomixia. Adicionalmente, no estudo de Paspalum, foram desenvolvidos marcadores SSR genômicos inéditos para P. plicatulum, e transferidos para outras espécies que compõem grupo botânico Plicatula, constituindo uma ferramenta valiosa para o estudo da variabilidade genética de acessos de banco de germoplasma das espécies estudadas. Ainda, buscando aprofundar o conhecimento sobre o complexo grupo Plicatula, obteve-se um expressivo conjunto de dados genômicos através de RAD-seq para as espécies. De modo que podem ser usados para auxiliar na classificação taxonômica e delimitação de espécies, bem como nos programas de coleta, conservação e melhoramento das espécies de Paspalum. MenosA pecuária bovina brasileira é baseada, predominantemente, na utilização de pastagens para a alimentação animal. Estas cobrem extensas áreas, o que viabiliza o maior rebanho comercial do mundo e a posição de maior exportador de carne bovina. U. humidicola está entre as forrageiras exóticas mais cultivadas nas pastagens brasileiras; ocorre em locais úmidos, de drenagem deficiente ou com inundação sazonal, razão pela qual ocupa extensas áreas no cerrado e na região amazônica. Espécies nativas do gênero Paspalum, apresentam potencial forrageiro e ornamental, e destacam-se pela grande variabilidade intra-específica a ser explorada. O lançamento de novas cultivares é uma alternativa para a diversificação das pastagens, e é a principal forma de atenuar problemas provenientes do monocultivo. Contudo, essas gramíneas têm seu perfil genético-molecular-genômico pouco estudado. E conhecer a extensão da variabilidade genética contida dentro dos bancos de germoplasma auxilia no planejamento de estratégias para maximizar os ganhos genéticos em programas de melhoramento. Nesse contexto, esta tese teve como objetivo contribuir para o conhecimento sobre a genética e genômica de espécies desses dois importantes gêneros de forrageiras tropicais. A partir do método RNA-seq e, montagem de novo, foi obtido o perfil transcriptômico global de folha de U. humidicola e folha e flor de P. notatum. Para U. humidicola foram obtidos 35.093 unigenes, representando o primeiro transcriptoma para a espécie. ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Grupo Plicatula. |
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Thesagro: |
Gramínea Forrageira. |
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Thesaurus Nal: |
Paspalum; Urochloa. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
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500 $aCo-Orientadora: Bianca Baccili Zanotto Vigna, Embrapa Pecuária Sudeste.
520 $aA pecuária bovina brasileira é baseada, predominantemente, na utilização de pastagens para a alimentação animal. Estas cobrem extensas áreas, o que viabiliza o maior rebanho comercial do mundo e a posição de maior exportador de carne bovina. U. humidicola está entre as forrageiras exóticas mais cultivadas nas pastagens brasileiras; ocorre em locais úmidos, de drenagem deficiente ou com inundação sazonal, razão pela qual ocupa extensas áreas no cerrado e na região amazônica. Espécies nativas do gênero Paspalum, apresentam potencial forrageiro e ornamental, e destacam-se pela grande variabilidade intra-específica a ser explorada. O lançamento de novas cultivares é uma alternativa para a diversificação das pastagens, e é a principal forma de atenuar problemas provenientes do monocultivo. Contudo, essas gramíneas têm seu perfil genético-molecular-genômico pouco estudado. E conhecer a extensão da variabilidade genética contida dentro dos bancos de germoplasma auxilia no planejamento de estratégias para maximizar os ganhos genéticos em programas de melhoramento. Nesse contexto, esta tese teve como objetivo contribuir para o conhecimento sobre a genética e genômica de espécies desses dois importantes gêneros de forrageiras tropicais. A partir do método RNA-seq e, montagem de novo, foi obtido o perfil transcriptômico global de folha de U. humidicola e folha e flor de P. notatum. Para U. humidicola foram obtidos 35.093 unigenes, representando o primeiro transcriptoma para a espécie. Esses foram anotados e relacionados à vias de fixação de carbono C4, síntese de lignocelulose e à resposta ao stress por alagamento. A busca por potenciais marcadores revelou 4.489 microssatélites (SSR) e 560.298 single nucleotide polymorphisms (SNP). Foram identificados genes únicos e diferencialmente expressos, corroborados por qPCR, entre os dois genótipos do banco de germoplasma da Embrapa utilizados para análise, o acesso apomítico BH16 ?cultivar BRS Tupi (CIAT 26149) e o único genótipo sexual da espécie, o acesso BH031 (CIAT 26146). Sugere-se, ainda, uma provável origem híbrida para o BH031. Para P. notatum, foi gerado um transcriptoma altamente representativo, a partir de dois tecidos (folha e flor) de seis genótipos com réplicas biológicas, que apresentam diferentes ploidias e modo de reprodução (sexual ou apomítico), resultando em mais de 100.000 unigenes montados com métricas robustas. Através de abordagens de expressão diferencial de genes entre sexuais e apomíticos, enriquecimento dos termos GO (Gene Ontology) e rede de coexpressão gênica, foram identificados genes candidatos a apomixia. Esses podem ser melhor investigados, visando elucidar esse intrigante mecanismo de reprodução, como também, desenvolver marcadores ligados a apomixia. Adicionalmente, no estudo de Paspalum, foram desenvolvidos marcadores SSR genômicos inéditos para P. plicatulum, e transferidos para outras espécies que compõem grupo botânico Plicatula, constituindo uma ferramenta valiosa para o estudo da variabilidade genética de acessos de banco de germoplasma das espécies estudadas. Ainda, buscando aprofundar o conhecimento sobre o complexo grupo Plicatula, obteve-se um expressivo conjunto de dados genômicos através de RAD-seq para as espécies. De modo que podem ser usados para auxiliar na classificação taxonômica e delimitação de espécies, bem como nos programas de coleta, conservação e melhoramento das espécies de Paspalum.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
17/06/2009 |
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Data da última atualização: |
15/06/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
BASSINELLO, P. Z.; DEL PELOSO, M. J.; SILVA, W. M. R. da; MELO, L. C.; GUIMARÃES, C. M.; CALGARO, M.; MENEZES, E.; BEEBE, S.; NUTTI, M. R. |
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Afiliação: |
PRISCILA ZACZUK BASSINELLO, CNPAF; MARIA JOSE DEL PELOSO, CNPAF; WELLINGTON M. R. DA SILVA, bolsista Uni-Anhanguera; LEONARDO CUNHA MELO, CNPAF; CLEBER MORAIS GUIMARAES, CNPAF; MARCELO CALGARO, CPATSA; EDUARDO ASSIS MENEZES, CPATSA; STEVE BEEBE, CIAT; MARILIA REGINI NUTTI, CTAA. |
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Título: |
Desenvolvimento de cultivares de feijoeiro comum adaptadas e biofortificadas com ferro e zinco. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DE BIOFORTIFICAÇÃO NO BRASIL, 3., 2009, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2009. |
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Série: |
(Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 148). |
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ISSN: |
1678-1953 |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Resumo também em inglês. |
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Conteúdo: |
Dentro do escopo do projeto de biofortificação de produtos agrícolas para melhor nutrição humana da Embrapa, foram identificados genótipos de feijoeiro comum provenientes do Banco Ativo de Germoplasma (BAG) da Embrapa Arroz e Feijão e do CIAT para determinar os teores de ferro e zinco nos grãos, bem como de famílias selecionadas de populações segregantes direcionadas para esse fim. Foi feita a caracterização agronômica e a quantificação dos teores de ferro e zinco de 72 acessos selecionados do VAM-2005/CIAT- Viveiro de Altos Minerais, em dois locais: Porangatu-GO e Santo Antônio de Goiás-GO, com e sem estresse hídrico. |
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Palavras-Chave: |
Biofortificação; BRS Agreste; BRS Pontal. |
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Thesagro: |
Feijão; Ferro; Phaseolus Vulgaris; Zinco. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/217282/1/06biofort.pdf
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Marc: |
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245 $aDesenvolvimento de cultivares de feijoeiro comum adaptadas e biofortificadas com ferro e zinco.$h[electronic resource]
260 $aIn: REUNIÃO ANUAL DE BIOFORTIFICAÇÃO NO BRASIL, 3., 2009, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros$c2009
490 $a(Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 148).
500 $aResumo também em inglês.
520 $aDentro do escopo do projeto de biofortificação de produtos agrícolas para melhor nutrição humana da Embrapa, foram identificados genótipos de feijoeiro comum provenientes do Banco Ativo de Germoplasma (BAG) da Embrapa Arroz e Feijão e do CIAT para determinar os teores de ferro e zinco nos grãos, bem como de famílias selecionadas de populações segregantes direcionadas para esse fim. Foi feita a caracterização agronômica e a quantificação dos teores de ferro e zinco de 72 acessos selecionados do VAM-2005/CIAT- Viveiro de Altos Minerais, em dois locais: Porangatu-GO e Santo Antônio de Goiás-GO, com e sem estresse hídrico.
650 $aFeijão
650 $aFerro
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700 1 $aMELO, L. C.
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700 1 $aMENEZES, E.
700 1 $aBEEBE, S.
700 1 $aNUTTI, M. R.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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