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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
26/07/2011 |
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Data da última atualização: |
21/07/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
GIACHETTO, P. F.; OKURA, V. K.; IBELLI, A. M. G.; SALMAN, A. K.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; VAGNER KATSUMI OKURA, PÓS-GRADUAÇÃO EM GENÉTICA E BIOLOGIA MOLECULAR/CBMEG/UNICAMP, CAMPINAS; ADRIANA MÉRCIA GUARATINI IBELLI, PÓS-GRADUAÇÃO EM GENÉTICA E EVOLUÇÃO/UFSCAR/SÃO CARLOS, SP.; ANA KARINA DIAS SALMAN, CPAF-RO; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Identificação de mecanismos envolvidos na resposta de bovinos ao carrapato Rhipicephalus microplus. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém. O Desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios. Anais... Belém: SBZ: UFRA, 2011. |
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Páginas: |
3 p. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O objetivo desse trabalho foi identificar grupos de genes envolvidos na resposta de bovinos à infestação artificial com o carrapato Rhipicephalus microplus, por meio da construção de redes gênicas. Dados de um experimento com microarranjos, provenientes da hibridização de amostras de pele de fêmeas cruzadas Senepol x Nelore, Angus x Nelore e Nelore, obtidas antes (A) e (D) após a infestação artificial com o carrapato, foram analisados por meio de uma metodologia de construção de redes baseada em co-expressão gênica (WGCNA). Os dados foram pré-processados usando os pacotes affy e gcrma do R/Bioconductor e as redes de co-expressão identificadas separadamente para cada grupo (A e D), pelo pacote R/WGCNA. As redes foram comparadas e os módulos não conservados entre os dois grupos foram identificados a partir de um teste de correlação dos valores de conectividade. Nossa análise identificou 8 módulos de genes co-expressos, sendo um deles (6) não conservado entre os grupos. O modulo 6 (n=85 genes) mostrou-se enriquecido para o processo biológico Proteólise, sugerindo o envolvimento desse processo e dos genes identificados (ADAMTS4, CASP4, C3, CFB, PRSS22 e SPCS3) na resposta dos animais à infestação. |
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Palavras-Chave: |
Expressão gênica; Microarranjos; Redes gênicas. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/38618/1/PROCI-2011.00069.pdf
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Marc: |
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520 $aO objetivo desse trabalho foi identificar grupos de genes envolvidos na resposta de bovinos à infestação artificial com o carrapato Rhipicephalus microplus, por meio da construção de redes gênicas. Dados de um experimento com microarranjos, provenientes da hibridização de amostras de pele de fêmeas cruzadas Senepol x Nelore, Angus x Nelore e Nelore, obtidas antes (A) e (D) após a infestação artificial com o carrapato, foram analisados por meio de uma metodologia de construção de redes baseada em co-expressão gênica (WGCNA). Os dados foram pré-processados usando os pacotes affy e gcrma do R/Bioconductor e as redes de co-expressão identificadas separadamente para cada grupo (A e D), pelo pacote R/WGCNA. As redes foram comparadas e os módulos não conservados entre os dois grupos foram identificados a partir de um teste de correlação dos valores de conectividade. Nossa análise identificou 8 módulos de genes co-expressos, sendo um deles (6) não conservado entre os grupos. O modulo 6 (n=85 genes) mostrou-se enriquecido para o processo biológico Proteólise, sugerindo o envolvimento desse processo e dos genes identificados (ADAMTS4, CASP4, C3, CFB, PRSS22 e SPCS3) na resposta dos animais à infestação.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 8 | |
| 2. |  | GERHARDT, I. R.; OKURA, V. K.; DANTE, R. A.; ARRUDA, P. A gene expression atlas of Vellozia nivea, a desiccation-tolerant species from the Brazilian campos rupestres. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 28., 2020, San Diego. Abstracts... Livingston, NJ: Scherago International, 2020. PE1028.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 3. | | FERRARI, F.; ZANCA, A. S.; JORDÃO, H.; GIACHETTO, P. F.; OKURA, V. K.; MACCHERONI, W.; FORNI-MARTINS, E. R. Sugarcane BAC selection for BAC-FISH in currents hybrids varieties. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 96.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 6. | | GOZZO, V. C.; OKURA, V. K.; FONSECA, I.; MARTINS, M. F.; CARDOSO, F. F.; GIACHETTO, P. F. Identification of mechanisms involved in mastitis response by means of gene network building. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. Não paginado. X-MEETING 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | FIGUEIRA, T. R. e S.; OKURA, V.; SILVA, F. R. da; SILVA, M. J. da; KUDRNA, D.; AMMIRAJU, J. S. S.; TALAG, J.; WING, R.; ARRUDA, P. A BAC library of the SP80-3280 sugarcane variety (saccharum sp.) and its inferred microsynteny with the sorghum genome. BMC Research Notes, v. 5, 2012. 11 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 8. | | GERHARDT, I. R.; FILIPPI, S. B.; OKURA, V.; COUTINHO, J.; RIAZZATO, A. P.; GUI, K.; VESSALI, N.; PONTES, J. H. M.; CORDEIRO, T.; SILVA, S. M.; GARCIA, A. F.; ARRUDA, P.; et. al. Overexpression of walldof transcription factor increases secondary wall deposition and alters carbon partitioning in poplar. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2011, Arraial d'Ajuda. From genomes do integration and delivery: extended abstracts proceedings. [S.l.]: Embrapa: Veracel: IUFRO, 2011. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| Registros recuperados : 8 | |
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