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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
22/08/2022 |
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Data da última atualização: |
22/08/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
NICIURA, S. C. M.; BENAVIDES, M. V.; OKINO, C. H.; IBELLI, A. M. G.; MINHO, A. P.; ESTEVES, S. N.; CHAGAS, A. C. de S. |
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Afiliação: |
SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; MAGDA VIEIRA BENAVIDES, CPPSUL; CINTIA HIROMI OKINO, CPPSE; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; ALESSANDRO PELEGRINE MINHO, CPPSE; SERGIO NOVITA ESTEVES, CPPSE; ANA CAROLINA DE SOUZA CHAGAS, CPPSE. |
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Título: |
Genome-wide association study for Haemonchus contortus resistance in Morada Nova sheep. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Pathogens, v. 11, n. 8, aug. 2022, 939. |
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Páginas: |
12 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3390/pathogens11080939 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Among the gastrointestinal nematodes affecting sheep, Haemonchus contortus is the most prevalent and virulent, resulting in health problems and production losses. Therefore, selecting sheep resistant to H. contortus is a suitable and sustainable strategy for controlling endoparasites in flocks. Here, 287 lambs of the native Brazilian Morada Nova hair sheep breed were subjected to two consecutive artificial infections with H. contortus and assessed for fecal egg count (FEC), packed cell volume (PCV), and live weight (LW). Forty-four animals ranked as having extreme resistance phenotypes were genotyped using the Illumina OvineSNP50v3 chip. A case?control genome-wide association study (GWAS) detected 37 significant (p < 0.001) markers in 12 ovine chromosomes in regions harboring quantitative trait loci (QTL) for FEC, Trichostrongylus spp. adults and larvae, weight, and fat; and candidate genes for immune responses, mucins, hematological parameters, homeostasis, and growth. Four single-nucleotide polymorphisms (SNP; OAR1_rs427671974, AR2_rs419988472, OAR5_rs424070217, and OAR17_rs401006318) genotyped by qPCR followed by high-resolution melting (HRM) were associated with FEC and LW. Therefore, molecular markers detected by GWAS for H. contortus resistance in Morada Nova sheep may support animal selection programs aimed at controlling gastrointestinal nematode infections in flocks. Furthermore, genotyping of candidate genes using HRM qPCR may provide a rapid and efficient tool for animal identification. MenosAmong the gastrointestinal nematodes affecting sheep, Haemonchus contortus is the most prevalent and virulent, resulting in health problems and production losses. Therefore, selecting sheep resistant to H. contortus is a suitable and sustainable strategy for controlling endoparasites in flocks. Here, 287 lambs of the native Brazilian Morada Nova hair sheep breed were subjected to two consecutive artificial infections with H. contortus and assessed for fecal egg count (FEC), packed cell volume (PCV), and live weight (LW). Forty-four animals ranked as having extreme resistance phenotypes were genotyped using the Illumina OvineSNP50v3 chip. A case?control genome-wide association study (GWAS) detected 37 significant (p < 0.001) markers in 12 ovine chromosomes in regions harboring quantitative trait loci (QTL) for FEC, Trichostrongylus spp. adults and larvae, weight, and fat; and candidate genes for immune responses, mucins, hematological parameters, homeostasis, and growth. Four single-nucleotide polymorphisms (SNP; OAR1_rs427671974, AR2_rs419988472, OAR5_rs424070217, and OAR17_rs401006318) genotyped by qPCR followed by high-resolution melting (HRM) were associated with FEC and LW. Therefore, molecular markers detected by GWAS for H. contortus resistance in Morada Nova sheep may support animal selection programs aimed at controlling gastrointestinal nematode infections in flocks. Furthermore, genotyping of candidate genes using HRM qPCR may provide a rapid and efficient tool for... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Gastrointestinal nematode control; GWAS; Molecular markers; Ovine; Parasite resistance. |
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Thesagro: |
Marcador Molecular; Ovino; Parasito. |
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Thesaurus Nal: |
Genotyping. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1145606/1/GenomeWideAssociation.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| Registros recuperados : 172 | |
| 5. |  | NICIURA, S. C. M. Genomic imprinting e suas implicações em produção animal. In: SIMPÓSIO DE BIOLOGIA MOLECULAR APLICADA À PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 2007, São Carlos. São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2007. v.1 p.52-66 1 CD-ROM Editado por Luciana Correia de Almeida Regitano, Simone C. Méo.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 7. | | NICIURA, S. C. M. Protocolos genotípicos para nematoides gastrintestinais. In: CHAGAS, A. C. de S.; NICIURA, S. C. M.; MOLENTO, M. B. (Ed.). Manual prático: metodologias de diagnóstico da resistências e de detecção de sustâncias ativas em parasitas de ruminantes. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica, 2011. p. 59-82.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 8. | | NICIURA, S. C. M.; THOLON, P. Absence of CpG observed/expected ratio depletion in Haemonchus contortus evidences a non-methylated genome. In: WORKSHOP ON OMICS STRATEGIES APPLIED TO LIVESTOCK SCIENCE, 1., 2017, Piracicaba, SP. Proceedings... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2017. p. 21. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 125) Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti,...| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 11. | | NICIURA, S. C. M.; PERECIN, F.; SARAIVA, N. Z. Controle epigenético do desenvolvimento e do envelhecimento em mamíferos. In: NICIURA, S. C. M.; SARAIVA, N. Z. (Ed.). Epigenética: bases moleculares, efeitos na fisiologia e na patologia, e implicações para a produção animal e a vegetal. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Cap. 7, p. 155-187.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 12. | | CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; NICIURA, S. C. M. Variabilidade genética para marcadores SNP associados à resistência a Haemonchus contortus em ovinos Morada Nova. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 10., 2018, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste, 2018. p. 19. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 68). Editores técnicos: Daniel Souza Corrêa, Elaine Cristina Paris, Maria Alice Martins, Paulino Ribeiro Villas Boas, Wilson Tadeu Lopes da Silva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 16. | | CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; NICIURA, S. C. M. Genotipagem de marcadores moleculares de resistência ao parasita Haemonchus contortus em ovinos da raça Morada Nova. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 9., 2017, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Instrumentação, 2017. p. 43. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 126). Editores técnicos: Alexandre Berndt, Ana Rita Araujo Nogueira, Bianca Baccili Zanotto Vigna, Juliana Gonçalves Costa, Lea Chapaval, Manuel Antonio Chagas Jacinto, Patricia Menezes Santos.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 17. | | MORAES, C. V.; CRUVINEL, G. G.; NICIURA, S. C. M. Investigação da ocorrência de eventos epigenéticos em Haemonchus contortus em estudo da resistência ao monepantel. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 9., 2017, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Instrumentação, 2017. p. 18. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 126). Editores técnicos: Alexandre Berndt, Ana Rita Araujo Nogueira, Bianca Baccili Zanotto Vigna, Juliana Gonçalves Costa, Lea Chapaval, Manuel Antonio Chagas Jacinto, Patricia Menezes Santos.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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