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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Uva e Vinho. |
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Data corrente: |
14/03/2023 |
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Data da última atualização: |
24/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FAJARDO, T. V. M.; NHANI JUNIOR, A.; NICKEL, O. |
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Afiliação: |
THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; ANTONIO NHANI JUNIOR, CNPTIA; OSMAR NICKEL, CNPUV. |
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Título: |
Analysis of virome by high-throughput sequencing disclosed multiple infection in a single grapevine plant. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Ciência Rural, v. 53, n. 10, e20220284, 2023. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Among phytosanitary problems of the grapevine, viruses stand out for their capacity of reducing the quality and yield of grapes. however, detecting and identifying viral infections in grapevines can be challenging. This study performed a high throughput sequencing (hTS) of the viral pathogens present in a vine showing virus-like symptoms to elucidate the etiology. hTS analysis reported in a hybrid grapevine with mild curling down of leaf edges, the presence of four viruses and viroids, which were probably implicated in the observed symptoms. The determined complete genomes showed high genetic identities with previously characterized isolates of homologous pathogens. Key words: diagnosis, symptoms, hTS, diversity, virus. Resumo: Dentre os problemas fitossanitários da videira, os vírus se destacam pela capacidade de reduzir a qualidade e o rendimento da uva. No entanto, detectar e identificar infecções virais em videiras pode ser um desafio. O objetivo do estudo foi realizar um sequenciamento de alto rendimento (hTS) para determinar os patógenos virais presentes em uma videira com sintomas de virose e elucidar a etiologia. com o hTS foi detectada, em uma videira híbrida com leve enrolamento dos bordos foliares, a presença de quatro vírus e viroides, os quais provavelmente estavam implicados com os sintomas observados. Os genomas completos determinados mostraram altas identidades genéticas com isolados previamente caracterizados de patógenos homólogos. Palavras-chave: diagnose, sintomas, hTS, diversidade, vírus. MenosAmong phytosanitary problems of the grapevine, viruses stand out for their capacity of reducing the quality and yield of grapes. however, detecting and identifying viral infections in grapevines can be challenging. This study performed a high throughput sequencing (hTS) of the viral pathogens present in a vine showing virus-like symptoms to elucidate the etiology. hTS analysis reported in a hybrid grapevine with mild curling down of leaf edges, the presence of four viruses and viroids, which were probably implicated in the observed symptoms. The determined complete genomes showed high genetic identities with previously characterized isolates of homologous pathogens. Key words: diagnosis, symptoms, hTS, diversity, virus. Resumo: Dentre os problemas fitossanitários da videira, os vírus se destacam pela capacidade de reduzir a qualidade e o rendimento da uva. No entanto, detectar e identificar infecções virais em videiras pode ser um desafio. O objetivo do estudo foi realizar um sequenciamento de alto rendimento (hTS) para determinar os patógenos virais presentes em uma videira com sintomas de virose e elucidar a etiologia. com o hTS foi detectada, em uma videira híbrida com leve enrolamento dos bordos foliares, a presença de quatro vírus e viroides, os quais provavelmente estavam implicados com os sintomas observados. Os genomas completos determinados mostraram altas identidades genéticas com isolados previamente caracterizados de patógenos homólogos. Palavras-chave: diagnose,... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Diagnose; Diagnosis; Diversidade; Diversity; HTS; Sequenciamento de alto rendimento; Sintomas; Symptoms; Videira. |
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Thesagro: |
Vírus. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1152340/1/Fajardo-2023-CienciaRural.pdf
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Marc: |
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700 1 $aNICKEL, O.
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 63 | |
| 8. |  | MAR, T. B.; LAU, D.; NHANI JUNIOR, A.; SCHONS, J.; YAMAZAKI-LAU, E.; PEREIRA, J. F. Barley and cereal yellow dwarf virus genetic diversity in Brazil. Virus: reviews and research, v. 14, p. 77-78, 2009. Suplemento, ref. 060. Edição dos Resumos do XX National Meeting of Virology, Brasília, DF, nov. 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 9. | | MAR, T. B.; LAU, D.; SCHONS, J.; YAMAZAKI-LAU, E.; BRAMMER, S. P.; NHANI JUNIOR, A. Caracterização molecular de isolados virais associados ao nanismo amarelo dos cereais visando à seleção e o desenvolvimento de genótipos de trigo resistentes. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA TRIGO, 3., 2007, Passo Fundo. Resumos... Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2007. 1 p. html. (Embrapa Trigo. Documentos Online, 82).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 10. | | MAR, T. B.; LAU, D.; YAMAZAKI-LAU, E.; SCHONS, J.; NHANI JUNIOR, A. Caracterização molecular de isolados virais do Barley/Cereal Yellow Dwarf Virus (B/CYDV) do Rio Grande do Sul. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA TRIGO, 4., 2008, Passo Fundo. Resumos... Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2008. 1 p. html. (Embrapa Trigo. Documentos online, 94).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 11. | | YAMAZAKI-LAU, E.; LAU, D.; SCHONS, J.; NHANI JUNIOR, A.; BRAMMER, S. P. Caracterização molecular de isolados do vírus do nanismo amarelo do Rio Grande do Sul. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 2., 2008, Passo Fundo. Atas e resumos... Passo Fundo: Comissão Brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale: Embrapa Trigo: Embrapa Transferência de Tecnologia, 2008. 1 p. 1 CD-ROM. Fitopatologia, 6. Área: Fitopatologia.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 12. | | MAR, T. B.; LAU, D.; SCHONS, J.; YAMAZAKI-LAU, E.; NHANI JUNIOR, A. Molecular identification based on coat protein sequences of the Barley yellow dwarf virus from Brazil. Scientia Agrícola, Piracicaba, v. 70, n. 6, p. 428-434, Nov./Dec. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 15. | | MAR, T. B.; LAU, D.; NHANI JUNIOR, A.; SCHONS, J.; YAMAZAKI-LAU, E.; PEREIRA, J. F. Diversidade genética do barley e cereal yellow dwarf virus no Brasil. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA TRIGO, 5., 2009, Passo Fundo. Resumos... Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2009. 1 p. html. (Embrapa Trigo. Documentos online, 115).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 16. | | BUENO, P.; LAU, E. Y.; BINNECK, E.; NHANI JUNIOR, A.; SCAGLIUSI, S. M. M. RNA-Seq para análise de genes diferencialmente expressos em micrósporos de trigo. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 15.; MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TRIGO, 12., 2020, Passo Fundo. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2021. p. 48.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Soja. |
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| 17. | | BUENO, P.; LAU, E. Y.; BINNECK, E.; NHANI JUNIOR, A.; SCAGLIUSI, S. M. M. RNA-Seq para análise de genes diferencialmente expressos em micrósporos de trigo. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 15.; MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TRIGO, 12., 2020, Passo Fundo. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2021. p. 48.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 18. | | BRAMMER, S. P.; SCAGLIUSI, S. M. M.; BONATO, A. L. V.; TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; NHANI JUNIOR, A. Biotecnologia aplicada à cultura do trigo. In: PIRES, J. L. F.; VARGAS, L.; CUNHA, G. R. da (Ed.). Trigo no Brasil: bases para produção competitiva e sustentável. Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2011. Cap. 18, p. 453-488.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 19. | | NHANI JUNIOR, A.; PEREIRA, J. F.; FERREIRA, J. R.; BONATO, A. L. V.; MACIEL, J. L. N. Mapping highly informative SSR markers in the genome of Magnaportheoryzae from wheat. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 41, n. 5, p. 331-335, oct. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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