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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrossilvipastoril. |
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Data corrente: |
18/02/2019 |
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Data da última atualização: |
19/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GIUSTINA, L. D.; CABRAL, J. C.; BALDONI, A. B.; NEVES, L. G. |
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Afiliação: |
LUANA DELLA GIUSTINA, ESTUDANTE DE PhD, UFMT, CUIABA; JULIANE COSTA CABRAL, MESTRANDA DA UNEMAT, ALTA FLORESTA; AISY BOTEGA BALDONI TARDIN, CPAMT; LEONARDA GRILLO NEVES, UNEMAT, CACERES, MT. |
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Título: |
Protocol adaptation for brazil nut (Bertholletia excelsa Bonpl) DNA extraction. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
International Journal of Current Research, v. 10, n. 02, p. 65270-65275, 2018. |
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ISSN: |
0975-833X |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Brazil nut (Bertholletia excelsa Bonpl.) is an Amazonian Forest species, which is acknowledged for the commercialization of its almonds. It is an endangered species, fact that reinforces the need of conducting conservation studies. Molecular markers are tools that may be used in conservation studies and the primordial stage preceding the use of molecular markers lies on DNA extraction. A well-designed protocol allows isolating DNA in sufficient amount and quality to conduct molecular studies. Thus, the aim of the current study is to adapt a total DNA extraction protocol to be applied to Brazil nut plants. Tests were conducted at different CTAB (2% and 4%) and β-Mercaptoethanol (0.2%, 0.8% and 1.4%) concentrations; washes using chloroform: isoamyl alcohol (CIA) were performed (one or two washes). The extraction products were confirmed in 0.8% agarose gel and quantified in spectrophotometer (in ng μL-1). Plant tissue (vascular cambium and leaf) was collected from 30 Brazil nut individuals in order to confirm the efficiency of the protocol adapted to the species. Samples were subjected to PCR amplification using 10 microsatellite markers. CTAB and β-Mercaptoethanol at concentrations 4% and 0.2%, respectively, along with one wash using CIA, showed the best results when the quality of the extracted material was assessed through its absorbance ratios. The vascular cambium oxidized more easily than the leaf during the DNA isolation process. Thus, it is essential taking some precautions at the time to handle it during collection and storage to assure process efficiency. MenosBrazil nut (Bertholletia excelsa Bonpl.) is an Amazonian Forest species, which is acknowledged for the commercialization of its almonds. It is an endangered species, fact that reinforces the need of conducting conservation studies. Molecular markers are tools that may be used in conservation studies and the primordial stage preceding the use of molecular markers lies on DNA extraction. A well-designed protocol allows isolating DNA in sufficient amount and quality to conduct molecular studies. Thus, the aim of the current study is to adapt a total DNA extraction protocol to be applied to Brazil nut plants. Tests were conducted at different CTAB (2% and 4%) and β-Mercaptoethanol (0.2%, 0.8% and 1.4%) concentrations; washes using chloroform: isoamyl alcohol (CIA) were performed (one or two washes). The extraction products were confirmed in 0.8% agarose gel and quantified in spectrophotometer (in ng μL-1). Plant tissue (vascular cambium and leaf) was collected from 30 Brazil nut individuals in order to confirm the efficiency of the protocol adapted to the species. Samples were subjected to PCR amplification using 10 microsatellite markers. CTAB and β-Mercaptoethanol at concentrations 4% and 0.2%, respectively, along with one wash using CIA, showed the best results when the quality of the extracted material was assessed through its absorbance ratios. The vascular cambium oxidized more easily than the leaf during the DNA isolation process. Thus, it is essential taki... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
B-Mercaptoethanol; CTAB; Mato Grosso; Molecular analyze; Molecular marker; Sinop; SSR. |
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Thesagro: |
Bertholletia Excelsa; DNA; Marcador Molecular. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/192934/1/2018-cpamt-aisy-baldoni-protocol-adaptation-brazil-bertholletia-dna-extraction.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrossilvipastoril (CPAMT) |
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| Registros recuperados : 45 | |
| 21. |  | VIEIRA, A. F.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; CASTRO, A. P. de; NEVES, L. G.; BRONDANI, C. Marcadores SNPs relacionados a tolerância à seca em arroz a partir do sequenciamento de 2500 genes candidatos. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 12., 2018, Santo Antônio de Goiás. Resumos. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2018. p. 65. (Embrapa Arroz e Feijão. Eventos técnicos & científicos, 2)| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 22. | | BOTIN, A. A.; BALDONI, A. B.; PEREIRA, M. C.; TARDIN, F. D.; PALUDZYSZYN FILHO, E.; SILVA, A. J. R.; MARQUES, J. A. de B.; NEVES, L. G. Caracterização morfológica de sementes de paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum). In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 2.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 7., 2018. Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2018. p. 187-190.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 23. | | BOTIN, A. A.; BALDONI, A. B.; PEREIRA, M. C.; TARDIN, F. D.; PALUDZYSZYN FILHO, E.; SILVA, A. J. R.; MARQUES, J. A. de B.; NEVES, L. G. Caracterização morfológica de sementes de paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum). In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 2.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 7., 2018. Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2018. p. 187-190.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 24. | | BOTIN, A. A.; BALDONI, A. B.; PEREIRA, M. C.; TARDIN, F. D.; PALUDZYSZYN FILHO, E.; SILVA, A. J. R.; MARQUES, J. A. de B.; NEVES, L. G. Caracterização morfológica de sementes de paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum). In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 2.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 7., 2018. Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2018. p. 187-190.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 25. | | OLIVEIRA, T. C. de; GONÇALVES, D. de L.; RODRIGUES, A. P. S.; BARELLI, M. A. A.; TARDIN, F. D.; NEVES, L. G. Caracterização da divergência genética de sorgo sacarino na região de Cáceres-MT. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 26. | | MÜLLER, B. S. F.; NEVES, L. G.; RESENDE JÚNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P. R.; KIRST, M.; SANTOS, P. E. T. dos; PALUDZYSZYN FILHO, E.; GRATTAPAGLIA, D. Genomic selection for growth traits in Eucalyptus benthamii and E. pellita populations using a genome-wide Eucalyptus 60K SNPs chip. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2015, Florence. Forests: the importance to the planet and society. [S.l.]: IBBR: ICCOM, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 27. | | MÜLLER, B. S. F.; NEVES, L. G.; RESENDE JÚNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P. R.; KIRST, M.; SANTOS, P. E. T. dos; PALUDZYSZYN FILHO, E.; GRATTAPAGLIA, D. Genomic selection for growth traits in Eucalyptus benthamii and E. pellita populations using a genome-wide Eucalyptus 60K SNPs chip. In: IUFRO TREE BIOTECHNOLOGY CONFERENCE, 2015, Florence. Forests: the importance to the planet and society. [S.l.]: IBBR: ICCOM, 2015. Pen-drive.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 28. | | ZAGO, B. W.; BARELLI, M. A. A.; SILVA, V. P. da; AZEVEDO, R. F.; CORRÊA, C. L.; NEVES, L. G.; HOOGERHEIDE, E. S. S. Genetic diversity among cassava genotypes (Manihot esculenta crantz) collected in the south-central mesoregion of the state of Mato Grosso-Brazil. Bioscience journal, v. 37, n. 4, e37048, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 29. | | GIUSTINA, L. D.; BALDONI, A. B.; TARDIN, F. D.; GREGOLIN, F. S.; TONINI, H.; NEVES, L. G.; RIBEIRO, L. P.; TEODORO, P. E. Genetic diversity between and within half-sib families of Brazil nut tree (Bertholletia excelsa Bonpl.) originating from native forest of the Brazilian Amazon. Genetics and Molecular Research, v. 16, n. 4, 2017. gmr16039839.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 30. | | VIEIRA, A. F.; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. de O.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; NEVES, L. G.; BRONDANI, C. Marcadores SNPs derivados de captureseq associados a tolerância à seca em arroz. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz do Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Foz do Iguaçu: SBMP, 2017. p. 86.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 31. | | VIEIRA, A. F.; PANTALIÃO, G. F.; ABREU, F. M.; SILVEIRA, R. D.; GARCIA, A. L. B.; NEVES, L. G.; VIANELLO, R. P.; CASTRO, A. P. de; BRONDANI, C. Marker-assisted elimination of drought-susceptible accessions in upland rice breeding. Genetics and Molecular Research, v. 17, n. 1, gmr16039886, Feb. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 32. | | VIEIRA, A. F.; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. de O.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; NEVES, L. G.; BRONDANI, C. Identificação de marcadores SNPs associados à tolerância à deficiência hídrica em arroz por meio de sequenciamento de DNA por captura (CaptureSeq). In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 11., 2017, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2017. p. 77. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 316).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 33. | | GUSTINA, L. D.; BALDONI, A. B.; TONINI, H.; AZEVEDO, V. C. R.; NEVES, L. G.; TARDIN, F. D.; SEBBENN, A. M. Hierarchical outcrossing among and within fruits in Bertholletia excelsa Bonpl. (Lecythidaceae) open-pollinated seeds. Genetics and Molecular Research, v. 17, n. 1, p. 1-11, 2018. Article gmr16039872.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 34. | | GUSTINA, L. D.; BALDONI, A. B.; TONINI, H.; AZEVEDO, V. C. R.; NEVES, L. G.; TARDIN, F. D.; SEBBENN, A. M. Hierarchical outcrossing among and within fruits in Bertholletia excelsa Bonpl. (Lecythidaceae) open-pollinated seeds. Genetics and Molecular Research, v. 17, n. 1, p. 1-11, 2018. Article gmr16039872.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 35. | | BOTIN, A. A.; MARQUES, J. A. de B.; OLIVEIRA, F. L. de; SILVA, E. S. da; AWABDI, C. P.; SILVA, A. J. R.; TARDIN, F. D.; BALDONI, A. B.; NEVES, L. G. Desenvolvimento de árvores de paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum) após 1 ano de plantio. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 3.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 8., 2019, Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2019. p. 58.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 36. | | BOTIN, A. A.; MARQUES, J. A. de B.; OLIVEIRA, F. L. de; SILVA, E. S. da; AWABDI, C. P.; SILVA, A. J. R.; TARDIN, F. D.; BALDONI, A. B.; NEVES, L. G. Desenvolvimento de árvores de paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum) após 1 ano de plantio. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 3.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 8., 2019, Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2019. p. 58.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 37. | | BOTIN, A. A.; BALDONI, A. B.; TARDIN, F. D.; PEREIRA, M. C.; PALUDZYSZYN FILHO, E.; SILVA, A. J. R.; MARQUES, J. A. de B.; OLIVEIRA, K. P. de; NEVES, L. G. Desenvolvimento inicial de mudas de paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum) em telado. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 2.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 7., 2018. Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2018. p. 183-186.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 38. | | BOTIN, A. A.; BALDONI, A. B.; TARDIN, F. D.; PEREIRA, M. C.; PALUDZYSZYN FILHO, E.; SILVA, A. J. R.; MARQUES, J. A. de B.; OLIVEIRA, K. P. de; NEVES, L. G. Desenvolvimento inicial de mudas de paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum) em telado. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 2.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 7., 2018. Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2018. p. 183-186.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 39. | | BOTIN, A. A.; BALDONI, A. B.; TARDIN, F. D.; PEREIRA, M. C.; PALUDZYSZYN FILHO, E.; SILVA, A. J. R.; MARQUES, J. A. de B.; OLIVEIRA, K. P. de; NEVES, L. G. Desenvolvimento inicial de mudas de paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum) em telado. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 2.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 7., 2018. Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2018. p. 183-186.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 40. | | BALDONI, A. B.; TARDIN, F. D.; BOTIN, A. A.; MARQUES, J. A. de B.; OLIVEIRA, F. L. de; SILVA, A. J. R.; SPIERING, B.; PARISOTTO, D. C.; NEVES, L. G. Variabilidade genética entre genótipos de paricá (Schizolobium parahyba var. amazonicum) quanto ao crescimento inicial em Sinop - Mato Grosso. Pesquisa Florestal Brasileira, v. 39, p. 328, 2019. Special issue. Abstracts of the XXV IUFRO World Congress.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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