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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
17/08/2006 |
Data da última atualização: |
17/05/2022 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; BORRO, L. C.; OLIVEIRA, S. R. de M.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; NESHICH, G. |
Afiliação: |
MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; LUIZ C. BORRO; STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA; EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA; JOSÉ GILBERTO JARDINE, CNPTIA; FÁBIO DANILO VIEIRA, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; MARCELO GONCALVES NARCISO, CNPTIA; GORAN NESHICH, CNPTIA. |
Título: |
Analysing protein-protein interface using JPIV. |
Ano de publicação: |
2006 |
Fonte/Imprenta: |
In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. |
Páginas: |
Não paginado. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-14. Na publicação: Paula R. Kuser-Falcão, Stanley R. M. Oliveira, Edgard H. Santos. |
Conteúdo: |
Short Abstract: In this work we present Java Protein Interface Viewer (JPIV). It is a web-based software designed to visualize and analyse protein-protein interfaces. It uses Delaunay triangulation in order to define the interface, and the STING_DB physical-chemical parameters to the analysis process. |
Palavras-Chave: |
Análise de proteína; Interface de proteínas. |
Thesaurus Nal: |
Proteins. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173850/1/I-14-ISMB-2006.pdf
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Marc: |
LEADER 01305nam a2200277 a 4500 001 1009317 005 2022-05-17 008 2006 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aYAMAGISHI, M. E. B. 245 $aAnalysing protein-protein interface using JPIV.$h[electronic resource] 260 $aIn: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB$c2006 300 $aNão paginado. 500 $aISMB, X-MEETING 2006. Poster I-14. Na publicação: Paula R. Kuser-Falcão, Stanley R. M. Oliveira, Edgard H. Santos. 520 $aShort Abstract: In this work we present Java Protein Interface Viewer (JPIV). It is a web-based software designed to visualize and analyse protein-protein interfaces. It uses Delaunay triangulation in order to define the interface, and the STING_DB physical-chemical parameters to the analysis process. 650 $aProteins 653 $aAnálise de proteína 653 $aInterface de proteínas 700 1 $aFALCAO, P. R. K. 700 1 $aBORRO, L. C. 700 1 $aOLIVEIRA, S. R. de M. 700 1 $aSANTOS, E. H. dos 700 1 $aJARDINE, J. G. 700 1 $aVIEIRA, F. D. 700 1 $aMAZONI, I. 700 1 $aNARCISO, M. G. 700 1 $aNESHICH, G.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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141. | | JARDINE, J. G.; NESHICH, G.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; NESHICH, I. P. A.; SALIM, J. A; DE MORAES, F. R. Molecular modeling and structural analysis of the protein twitching motility of Xylella fastidiosa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA E RODADA E FEIRA DE NEGÓCIOS, 4., 2012, Guarujá. [Resumos]... [S.l.: s.n.], 2012. Não paginado. Brasil Biotec 2012.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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142. | | SALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; VON ZUBEN, F.; NESHICH, G. A pattern recognition approach for catalytic site residues prediction using STING structural protein descriptors. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 41., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... [S.l]: SBBq, 2012. Não paginado. 1 pôster.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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143. | | DUARTE, F.; SEPULVEDA, R.; ARAYA, R.; FLORES, S.; PEREZ-ACLE, T.; GONZALES, W.; GONZALES, D.; NESHICH, G.; NESHICH, I.; MAZONI, I.; HOLMES, D. S. Mechanisms of protein stabilization at very low pH. In: INTERNATIONAL BIOHYDROMETALLURGY SYMPOSIUM, 19.; 2011, Changsha, China. Biohydrometallurgy: biotech key to unlock mineral resources value: proceedings. Changsha: Central South University Press, 2011. v. 1. IBS 2011.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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145. | | BRANDÃO, M. M.; ARRUDA, L. H.; NESHICH, G.; NESHICH, I. P.; PEREIRA, J. G. C.; MALAGÓ JÚNIOR, W.; SILVA-FILHO, M. C. Structural and phylogenetic analysis of Spodoptera frugiperda chymotrypsins involved on insect chemical protective barrier against plant Proteinase Inhibitors (PIs). In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 40., 2011, Foz do Iguaçu. [Proceedings...]. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Não paginado.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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152. | | HIGA, R. H.; CRUZ, S. A. B. da; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FILETO, R.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Building multiple sequence alignments with a flavor of HSSP alignments. Genetics and Molecular Research, v. 5, n. 1, p. 127-137, 2006.Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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153. | | NESHICH, I. A. P.; NISHIMURA, L.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; VILLALTA-ROMERO, F.; BORRO, L.; YANO, I. H.; MAZONI, I.; TASIC, L.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Computational Biology tools for identifying specific ligand binding residues for novel agrochemical and drug design. Current Protein and Peptide Science, v. 16, n. 8, p. 701-717, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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154. | | YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; MAZONI, I.; VIEIRA, F. D.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Rotâmeros raros no Java Protein Dossier. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2006. 6 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 76).Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
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156. | | SOARES, F. X. S.; SILVA, C. M. da; ROCHA, T. L.; MARCELINO, L. H.; CARNEIRO, M.; GANDER, E. S.; SAMPAIO, M. J. A. M.; CASTRO, L. A. B. de; NESHICH, G. Theoretical model of the secondary and tertiary structure of Brazil nut 2s storage albumins. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON CRYSTALLOGRAPHY AND MOLECULAR BIOLOGY, 1990, GUARUJA, SP. Abstracts.[S.l.]: Institute of Advanced Studies, Sao Carlos: Universidade Federal de Sao Carlos, 1990. PS1-02.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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158. | | NESHICH, G.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; CRUZ, S. A. B. da; MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; HIGA, R. H. What makes the active site amino acids so different from the others: defining the structural descriptors specific for activity. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 149. Na publicação: Paula Kuser, Michel Yamagishi, Stanley Oliveira, Edgard Santos, Fabio Vieira, Sergio Cruz, Adauto Mancini, Roberto Higa. X-meeting 2005. Presented Posters.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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159. | | YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Identificando Pockets na superfície protéica usando o Java Protein Dossier - JPD. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2005. 4 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 67).Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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160. | | CARDOSO, C. M. Y.; MORAES, F. R. de; NESHICH, G.; MOREIRA, E. C. de O.; COSTA, C. de N. M.; SANTOS, R. C. dos; SOUZA, C. R. B. de. Identification of cDNA sequences coding for bZIP regulatory proteins predicted to interact with putative cis-acting elements from Be2S1 gene. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Forlaleza. Programas e resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 212-213. Congresso da SBBiotec 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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