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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
08/12/2023 |
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Data da última atualização: |
08/12/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, G. F.; NASCIMENTO, A. C. C.; AZEVEDO, C. F.; CELERI, M. de O.; BARROSO, L. M. A.; SANT’ANNA, I. de C.; VIANA, J. M. S.; RESENDE, M. D. V. de; NASCIMENTO, M. |
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Afiliação: |
GABRIELA FRANÇA OLIVEIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; ANA CAROLINA CAMPANA NASCIMENTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; CAMILA FERREIRA AZEVEDO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; MAURÍCIO DE OLIVEIRA CELERI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; LAÍS MAYARA AZEVEDO BARROSO, INSTITUTO FEDERAL DE EDUCAÇÃO, CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE MATO GROSSO; ISABELA DE CASTRO SANT’ANNA, INSTITUTO AGRONÔMICO DE CAMPINAS; JOSÉ MARCELO SORIANO VIANA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPCa; MOYSÉS NASCIMENTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA. |
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Título: |
Population size in QTL detection using quantile regression in genome‑wide association studies. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 13, Article 9585, 2023. |
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Páginas: |
10 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-023-36730-z |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
The aim of this study was to evaluate the performance of Quantile Regression (QR) in Genome-Wide Association Studies (GWAS) regarding the ability to detect QTLs (Quantitative Trait Locus) associated with phenotypic traits of interest, considering different population sizes. For this, simulated data was used, with traits of different levels of heritability (0.30 and 0.50), and controlled by 3 and 100 QTLs. Populations of 1,000 to 200 individuals were defined, with a random reduction of 100 individuals for each population. The power of detection of QTLs and the false positive rate were obtained by means of QR considering three different quantiles (0.10, 0.50 and 0.90) and also by means of the General Linear Model (GLM). In general, it was observed that the QR models showed greater power of detection of QTLs in all scenarios evaluated and a relatively low false positive rate in scenarios with a greater number of individuals. The models with the highest detection power of true QTLs at the extreme quantils (0.10 and 0.90) were the ones with the highest detection power of true QTLs. In contrast, the analysis based on the GLM detected few (scenarios with larger population size) or no QTLs in the evaluated scenarios. In the scenarios with low heritability, QR obtained a high detection power. Thus, it was verified that the use of QR in GWAS is effective, allowing the detection of QTLs associated with traits of interest even in scenarios with few genotyped and phenotyped individuals. |
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Thesaurus Nal: |
Genome-wide association study; Phenotypic variation; Regression analysis. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1159390/1/Population-size-in-QTL-detection.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Origem |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
19/10/2006 |
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Data da última atualização: |
27/07/2018 |
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Autoria: |
ZANELA, M. B.; FISCHER, V.; RIBEIRO, M. E. R.; BARBOSA, R. S.; MARQUES, L. T.; STUMPF JUNIOR, W.; ZANELA, C. |
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Afiliação: |
Maira Balbinotti Zanela, Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS/Faculdade de Veterinária/Setor de Inspeção e Tecnologia de Produtos de Origem Animal; Vivian Fischer, Universidade Federal de Pelotas - UFPEL/Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel/Departamento de Zootecnia; MARIA EDI ROCHA RIBEIRO, CPACT; Rosângela Silveira Barbosa, Universidade Federal de Pelotas - UFPEL/Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel/Departamento de Zootecnia; Lúcia Treptow Marques, Universidade Federal de Pelotas - UFPEL/Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel/Departamento de Zootecnia; WALDYR STUMPF JUNIOR, CPACT; Claudir Zanela, Universidade Federal de Pelotas - UFPEL/Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel/Departamento de Zootecnia. |
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Título: |
Leite instável não-ácido e composição do leite de vacas Jersey sob restrição alimentar. |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 41, n. 5, p. 835-840, maio 2006 |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: Unstable nonacid milk and milk composition of Jersey cows on feed restriction. |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da restrição alimentar na incidência do leite instável não-ácido (LINA) e na composição do leite de vacas Jersey. Foi realizado um experimento piloto de indução ao LINA, com oito vacas Jersey em lactação, confinadas e separadas em dois grupos, às quais havia sido fornecida uma dieta equilibrada ad libitum. Em dois períodos de 18 dias, foram fornecidos dois tratamentos com 100 e 60% das exigências nutricionais. Foram realizados os testes de acidez titulável e do álcool 76%; pH, densidade, crioscopia, caseína, gordura, proteína bruta, lactose, extrato seco total, número de células somáticas e produção de leite foram determinados. A restrição alimentar aumenta a ocorrência de LINA e diminui a produção de leite e a quantidade total dos componentes produzidos; entretanto, não altera os teores dos componentes lácteos. |
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Palavras-Chave: |
alcohol/etanol test; estabilidade do leite; lactation cows; milk stability; subnutrição; teste do álcool/etanol; undernutrition; vacas em lactação. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/AI-SEDE/36226/1/41n05a16.pdf
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Marc: |
LEADER 01876naa a2200301 a 4500
001 1118977
005 2018-07-27
008 2006 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aZANELA, M. B.
245 $aLeite instável não-ácido e composição do leite de vacas Jersey sob restrição alimentar.
260 $c2006
500 $aTítulo em inglês: Unstable nonacid milk and milk composition of Jersey cows on feed restriction.
520 $aO objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da restrição alimentar na incidência do leite instável não-ácido (LINA) e na composição do leite de vacas Jersey. Foi realizado um experimento piloto de indução ao LINA, com oito vacas Jersey em lactação, confinadas e separadas em dois grupos, às quais havia sido fornecida uma dieta equilibrada ad libitum. Em dois períodos de 18 dias, foram fornecidos dois tratamentos com 100 e 60% das exigências nutricionais. Foram realizados os testes de acidez titulável e do álcool 76%; pH, densidade, crioscopia, caseína, gordura, proteína bruta, lactose, extrato seco total, número de células somáticas e produção de leite foram determinados. A restrição alimentar aumenta a ocorrência de LINA e diminui a produção de leite e a quantidade total dos componentes produzidos; entretanto, não altera os teores dos componentes lácteos.
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653 $aestabilidade do leite
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653 $ateste do álcool/etanol
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700 1 $aMARQUES, L. T.
700 1 $aSTUMPF JUNIOR, W.
700 1 $aZANELA, C.
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 41, n. 5, p. 835-840, maio 2006
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Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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