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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Arroz e Feijão. Para informações adicionais entre em contato com cnpaf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
07/05/2021 |
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Data da última atualização: |
07/05/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BRUNES, L. C.; BALDI, F.; NARCISO, M. G.; LOBO, R. B.; ESPIGOLAN, R.; COSTA, M. F. O.; MAGNABOSCO, C. U. |
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Afiliação: |
LUDMILLA C. BRUNES, UFG; FERNANDO BALDI, UNESP, Jaboticabal-SP; MARCELO GONCALVES NARCISO, CNPAF; RAYSILDO B. LOBO, ASSOCIAÇÃO NACIONAL DE CRIADORES, Ribeirão Preto-SP; R. ESPIGOLAN, USP; MARCOS FERNANDO OLIVEIRA E COSTA, CNPAF; CLAUDIO DE ULHOA MAGNABOSCO, CPAC. |
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Título: |
Genomic prediction ability for feed efficiency traits using different models and pseudo-phenotypes under several validation strategies in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Animal. The International Journal of Animal Biosciences, v. 15, 100085, 2021. |
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ISSN: |
1751-7311 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.animal.2020.100085 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
There is a growing interest to improve feed efficiency (FE) traits in cattle. The genomic selection was proposed to improve these traits since they are difficult and expensive to measure. Up to date, there are scarce studies about the implementation of genomic selection for FE traits in indicine cattle under different scenarios of pseudo-phenotypes, models, and validation strategies on a commercial large scale. Thus, the aim was to evaluate the feasibility of genomic selection implementation for FE traits in Nelore cattle applying different models and pseudo-phenotypes under validation strategies. Phenotypic and genotypic information from 4 329 and 3 467 animals were used, respectively, which were tested for residual feed intake, DM intake, feed efficiency, feed conversion ratio, residual BW gain, and residual intake and BW gain. Six prediction methods were used: single-step genomic best linear unbiased prediction, Bayes A, Bayes B, Bayes Cπ, Bayesian least absolute shrinkage and selection operator (BLASSO), and Bayes R. Phenotypes adjusted for fixed effects (Y*), estimated breeding value (EBV), and EBV deregressed (DEBV) were used as pseudo-phenotypes. The validation approaches used were: (1) random: the data was randomly divided into ten subsets and the validation was done in each subset at a time; (2) age: the partition into training and testing sets was based on year of birth and testing animals were born after 2016; and (3) EBV accuracy: the data was split into two groups, being animals with accuracy above 0.45 the training set; and below 0.45 the validation set. In the analyses that used the Y* as pseudo-phenotype, prediction ability (PA) was obtained by dividing the correlation between pseudo-phenotype and genomic EBV (GEBV) by the square root of the heritability of the trait. When EBV and DEBV were used as the pseudo-phenotype, the simple correlation of this quantity with the GEBV was considered as PA. The prediction methods show similar results for PA and bias. The random cross-validation presented higher PA (0.17) than EBV accuracy (0.14) and age (0.13). The PA was higher for Y* than for EBV and DEBV (30.0 and 34.3%, respectively). Random validation presented the highest PA, being indicated for use in populations composed mainly of young animals and traits with few generations of data recording. For high heritability traits, the validation can be done by age, enabling the prediction of the next-generation genetic merit. These results would support breeders to identify genomic approaches that are more viable for genomic prediction for FE-related traits. MenosThere is a growing interest to improve feed efficiency (FE) traits in cattle. The genomic selection was proposed to improve these traits since they are difficult and expensive to measure. Up to date, there are scarce studies about the implementation of genomic selection for FE traits in indicine cattle under different scenarios of pseudo-phenotypes, models, and validation strategies on a commercial large scale. Thus, the aim was to evaluate the feasibility of genomic selection implementation for FE traits in Nelore cattle applying different models and pseudo-phenotypes under validation strategies. Phenotypic and genotypic information from 4 329 and 3 467 animals were used, respectively, which were tested for residual feed intake, DM intake, feed efficiency, feed conversion ratio, residual BW gain, and residual intake and BW gain. Six prediction methods were used: single-step genomic best linear unbiased prediction, Bayes A, Bayes B, Bayes Cπ, Bayesian least absolute shrinkage and selection operator (BLASSO), and Bayes R. Phenotypes adjusted for fixed effects (Y*), estimated breeding value (EBV), and EBV deregressed (DEBV) were used as pseudo-phenotypes. The validation approaches used were: (1) random: the data was randomly divided into ten subsets and the validation was done in each subset at a time; (2) age: the partition into training and testing sets was based on year of birth and testing animals were born after 2016; and (3) EBV accuracy: the data was split into two... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Residual body weight gain; Residual feed intake; Single nucleotide polymorphisms. |
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Thesagro: |
Gado Nelore; Gado Zebu; Genética Animal. |
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Thesaurus Nal: |
Animal breeding; Feed intake; Genomics; Zebu. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
01/02/2017 |
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Data da última atualização: |
09/02/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 2 |
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Autoria: |
SANTOS, M. dos; DONATO, S. L. R.; COELHO, E. F.; COELHO FILHO, M. A. |
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Afiliação: |
MARCELO ROCHA DOS SANTOS, IF Baiano; SÉRGIO LUIZ RODRIGUES DONATO, IF Baiano; EUGENIO FERREIRA COELHO, CNPMF; MAURICIO ANTONIO COELHO FILHO, CNPMF. |
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Título: |
Irrigação lateralmente alternada em Lima Ácida 'Tahiti' na região Norte de Minas Gerais. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Irriga, Botucatu, Edição Especial, Irrigação, p. 71-88, 2016. |
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ISSN: |
1413-7895 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
As condições hídricas do solo e clima alteram as condições hídricas e fisiológicas das plantas, que influenciam o desenvolvimento e a produção. Objetivou-se com este estudo avaliar características fisiológicas, estado nutricional e produtividade em lima ácida 'Tahiti' com irrigação lateralmente alternada (partial rootzone drying – PRD). Nove tratamentos foram constituídos por diferentes reposições de lâmina de água aplicada, conforme a demanda evapotranspirométrica da cultura (ETc) e diferentes frequências de alternância no período compreendido entre a floração e a colheita, em dois ciclos produtivos da cultura, dispostos em delineamento em blocos casualizados com quatro repetições. O sistema de irrigação utilizado foi por gotejamento com duas linhas laterais e doze gotejadores por planta. Dos nutrientes analisados ficaram abaixo da faixa de suficiência apenas o teor de B nas plantas sob PRD a 50% da ETc e frequência de alternância (FA) de 7 dias, e de B e Mn sob PRD a 50% da ETc e FA de 21 dias e PRD a 75% da ETc e FA de 14 dias. Fotossíntese, transpiração, condutância estomática, concentração interna de CO2, radiação fotossinteticamente ativa e temperatura foliar variaram com a época e o horário de mensuração. Eficiência de carboxilação, eficiência quântica da fotossíntese e eficiência instantânea de uso da água (EUA) são maximizadas nos meses e horas dos dias com menores temperaturas. A PRD altera a concentração interna de CO2, transpiração, razão de carboxilação, razão de concentração de CO2 e produtividade. Há manutenção da produtividade com irrigação alternada a cada sete dias e PRD de 50% da ETc em relação à irrigação plena. MenosAs condições hídricas do solo e clima alteram as condições hídricas e fisiológicas das plantas, que influenciam o desenvolvimento e a produção. Objetivou-se com este estudo avaliar características fisiológicas, estado nutricional e produtividade em lima ácida 'Tahiti' com irrigação lateralmente alternada (partial rootzone drying – PRD). Nove tratamentos foram constituídos por diferentes reposições de lâmina de água aplicada, conforme a demanda evapotranspirométrica da cultura (ETc) e diferentes frequências de alternância no período compreendido entre a floração e a colheita, em dois ciclos produtivos da cultura, dispostos em delineamento em blocos casualizados com quatro repetições. O sistema de irrigação utilizado foi por gotejamento com duas linhas laterais e doze gotejadores por planta. Dos nutrientes analisados ficaram abaixo da faixa de suficiência apenas o teor de B nas plantas sob PRD a 50% da ETc e frequência de alternância (FA) de 7 dias, e de B e Mn sob PRD a 50% da ETc e FA de 21 dias e PRD a 75% da ETc e FA de 14 dias. Fotossíntese, transpiração, condutância estomática, concentração interna de CO2, radiação fotossinteticamente ativa e temperatura foliar variaram com a época e o horário de mensuração. Eficiência de carboxilação, eficiência quântica da fotossíntese e eficiência instantânea de uso da água (EUA) são maximizadas nos meses e horas dos dias com menores temperaturas. A PRD altera a concentração interna de CO2, transpiração, razão de carboxilação, razão d... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Irrigação. |
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Thesaurus NAL: |
Irrigation. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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260 $c2016
520 $aAs condições hídricas do solo e clima alteram as condições hídricas e fisiológicas das plantas, que influenciam o desenvolvimento e a produção. Objetivou-se com este estudo avaliar características fisiológicas, estado nutricional e produtividade em lima ácida 'Tahiti' com irrigação lateralmente alternada (partial rootzone drying – PRD). Nove tratamentos foram constituídos por diferentes reposições de lâmina de água aplicada, conforme a demanda evapotranspirométrica da cultura (ETc) e diferentes frequências de alternância no período compreendido entre a floração e a colheita, em dois ciclos produtivos da cultura, dispostos em delineamento em blocos casualizados com quatro repetições. O sistema de irrigação utilizado foi por gotejamento com duas linhas laterais e doze gotejadores por planta. Dos nutrientes analisados ficaram abaixo da faixa de suficiência apenas o teor de B nas plantas sob PRD a 50% da ETc e frequência de alternância (FA) de 7 dias, e de B e Mn sob PRD a 50% da ETc e FA de 21 dias e PRD a 75% da ETc e FA de 14 dias. Fotossíntese, transpiração, condutância estomática, concentração interna de CO2, radiação fotossinteticamente ativa e temperatura foliar variaram com a época e o horário de mensuração. Eficiência de carboxilação, eficiência quântica da fotossíntese e eficiência instantânea de uso da água (EUA) são maximizadas nos meses e horas dos dias com menores temperaturas. A PRD altera a concentração interna de CO2, transpiração, razão de carboxilação, razão de concentração de CO2 e produtividade. Há manutenção da produtividade com irrigação alternada a cada sete dias e PRD de 50% da ETc em relação à irrigação plena.
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773 $tIrriga, Botucatu, Edição Especial, Irrigação, p. 71-88, 2016.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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