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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  19/09/2023
Data da última atualização:  19/09/2023
Tipo da produção científica:  Capítulo em Livro Técnico-Científico
Autoria:  ZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F.
Afiliação:  ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; ANTONIO NHANI JUNIOR, CNPTIA; FABIO DANILO VIEIRA, CNPTIA; LEANDRO CARRIJO CINTRA, CNPTIA; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA.
Título:  Applications of bioinformatics in agriculture.
Ano de publicação:  2023
Fonte/Imprenta:  In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MEIRA, C. A. A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BOLFE, E. L. (ed.). Digital agriculture: research, development and innovation in production chains. Brasília, DF: Embrapa, 2023. cap. 10, p. 179-194.
ISBN:  978-65-89957-72-0
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Introduction. LMB computational infrastructure to support bioinformatics projects applied to agriculture. Applications: ioinformatics and the tambaqui production chain; Bioinformatics in vaccine development: reverse vaccinology. Bioinformatics tools: Machado: a genomic data integration framework; DBGAP: web system for retrieving information on pedigree, phenotypes and genotypes. Final considerations.
Palavras-Chave:  Agricultura digital; Banco de dados BDPFG; Bioinformática; Digital agriculture; Ferramenta Machado; Laboratório Multiusuário de Bioinformática (LMB) da Embrapa; Transformação digital.
Thesagro:  Agricultura.
Thesaurus Nal:  Agriculture; Bioinformatics.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1156761/1/LV-Digital-agriculture-2023-cap10.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA21814 - 1UMTPL - DD
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21.Imagem marcado/desmarcadoSOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. Não paginado. SBMA 2012.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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22.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; LOBO, F. P.; REGITANO, L. C. A. Estudo de associação genômica ampla utilizando Random Forest: estudo de caso em bovinos de corte. In: ARBEX, W.; MARTINS, N. F.; MARTINS, M. F. Talking about computing and genomics TACG. Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 71-99.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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23.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; LOBO, F. P.; REGITANO, L. C. de A. Estudo de associação genômica empla utilizando Random Forest: estudo de caso em bovinos de corte. In: ARBEX, A.; MARTINS, N. F.; MARTINS, M. F. Talking about computing and genomics - TACG: modelos e métodos computacionais em Bioinformática. Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 71-99.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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24.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, P. S. N. de; SOMAVILLA, A. L.; MOURÃO, G. B.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A. Identificação de genes candidatos posicionais para eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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25.Imagem marcado/desmarcadoDINIZ, W. J. da S.; TIZIOTO, P.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A. Refinamento de uma região de QTL associada à maciez de carne em bovinos da raça Nelore. Ciência e Tecnologia, v. 6, p. 39-43, 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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26.Imagem marcado/desmarcadoBARBOSA, L. A. F.; GERHARDT, I. R.; BARIANI, J. M.; MUDADU, M. de A.; DANTE, R. A.; ARRUDA, P. Sequence analysis. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2016.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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27.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. de L.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; MOURÃO, G. B.; ROSA, G. J. M. Accuracy of genotype imputation in a Nellore Cattle population in Brazil. In: INTERNATIONAL PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 21., 2013, San Diego. Abstract... [S.l.: s.n.], 2013. Não paginado. P0540.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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28.Imagem marcado/desmarcadoREGITANO, L. C. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MUDADU, M. de A.; MOURÃO, G. B.; REDE BIFEQUALI. Associação genômica com maciez de carne na raça Nelore. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. SBMA 2012.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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29.Imagem marcado/desmarcadoREGITANO, L. C. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MUDADU, M. de A.; MOURÃO, G. B.; REDE BIFEQUALI. Associação genômica com maciez de carne na raça Nelore. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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30.Imagem marcado/desmarcadoSOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; REDE BIFEQUALI. Aplicação da metodologia de homozigose do haplótipo estendido (EHH) para genes relacionados com crescimento e deposição de gordura em bovinos da raça Nelore. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. Não paginado. SBMA 2012.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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31.Imagem marcado/desmarcadoZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Aplicações da bioinformática na agricultura. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MEIRA, C. A. A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BOLFE, E. L. (Ed.). Agricultura digital: pesquisa, desenvolvimento e inovação nas cadeias produtivas. Brasília, DF: Embrapa, 2020. cap. 10, p. 234-257.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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32.Imagem marcado/desmarcadoDINIZ, W. J. da S.; TIZIOTO, P. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; SOUZA, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Análise de haplótipos em QTL associado ao conteúdo de ferro no músculo de bovinos Nelore. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 6., 2014, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. p. 28. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 57) Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Caue Ribeiro, Maria Alice Martins, Elaine Cristina Paris, Paulino Ribeiro Villas Boas, Ladislau Marcelino Rabello.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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33.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Analysis of Paspalum notatum transcriptome under drought condition. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 14., 2018, São Pedro. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2018. p. 210. X-meeting 2018.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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34.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Analysis of paspalum notatum transcriptome under drought condition. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 10., 2015, São Pedro, SP. Proceedings...São Pedro, SP: Meeting, 2018. p. 210. p. 210
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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35.Imagem marcado/desmarcadoZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Applications of bioinformatics in agriculture. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MEIRA, C. A. A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BOLFE, E. L. (ed.). Digital agriculture: research, development and innovation in production chains. Brasília, DF: Embrapa, 2023. cap. 10, p. 179-194.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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36.Imagem marcado/desmarcadoSOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; REDE BIFEQUALI. Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. Não paginado. SBMA 2012.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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37.Imagem marcado/desmarcadoSOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; REDE BIFEQUALI. Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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38.Imagem marcado/desmarcadoARAKAKI, J. E.; VIGNA, B. B. Z.; PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; MUDADU, M. de A.; RIOS, E.; FAVERO, A. P. A chromosome scale genome assembly of pensacola bahiagrass (paspalum notatum cv. pensacola) In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 12., 2023, Caxambu, MG. Anais. Piracicaba: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2023.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Cerrados; Embrapa Pecuária Sudeste.
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39.Imagem marcado/desmarcadoKASARAPU, P.; PORTO-NETO, L. R.; FORTES, M. R. S.; LEHNERT, S. A.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L.; REGITANO, L. C. de A.; GEORGE, A.; REVERTER, A. The Bos taurus-Bos indicus balance in fertility and milk related genes. Plos One, v. 12, n. 8, p. 1-20, 2017. Artigo e0181930. Na publicação: Mauricio A. Mudadu, Luciana Regitano.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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40.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, B. L.; LIMA, A. O. de; MOKRY, F. B.; BRESSANI, F.; MALAGO JUNIOR, W.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A. Validação de um SNP associado à área de olho de lombo em uma população de animais Canchim. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 43. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56).
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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