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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
26/05/2017 |
Data da última atualização: |
14/06/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SOMAVILLA, A. L.; REGITANO, L. C. de A.; ROSA, G. J. M.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M. de; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P. |
Afiliação: |
Adriana Luiza Somavilla, Unesp; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Guilherme Jordão Magalhães Rosa, University of Wisconsin; Fabiana Barichello Mokry, UFSCar; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; Polyana Cristine Tizioto, UFSCar; Priscila Silva Neubern de Oliveira, UFSCar; Marcela Maria de Souza, UFSCar; Luiz Lehmann Coutinho, USP; Danísio Prado Munari, Unesp. |
Título: |
Genome-enabled prediction of breeding values for feedlot average daily weight gain in nelore cattle. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
G3: Genes, Genomes, Genetics, v. 7, p. 1-17, 2017. |
DOI: |
https://doi.org/10.1534/g3.117.041442 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Nelore is the most economically important cattle breed in Brazil, and the use of genetically improved animals has contributed to increase beef production efficiency. The Brazilian beef feedlot industry has grown considerably in the last decade, so the selection of animals with higher growth rates on feedlot has become quite important. Genomic selection could be used to reduce generation intervals and improve the rate of genetic gains. The aim of this study was to evaluate the prediction of genomic estimated breeding values for average daily gain in 718 feedlot-finished Nelore steers. Analyses of three Bayesian model specifications (Bayesian GBLUP, BayesA, and BayesCπ) were performed with four genotype panels (Illumina BovineHD BeadChip, TagSNPs, GeneSeek High and Low-density indicus). Estimates of Pearson correlations, regression coefficients, and mean squared errors were used to assess accuracy and bias of predictions. Overall, the BayesCπ model resulted in less biased predictions. Accuracies ranged from 0.18 to 0.27, which are reasonable values given the heritability estimates (from 0.40 to 0.44) and sample size (568 animals in the training population). Furthermore, results from Bos taurus indicus panels were as informative as those from Illumina BovineHD, indicating that they could be used to implement genomic selection at lower costs. |
Palavras-Chave: |
Bayesian model; Bos taurus indicus; Feedlot performance; Genomic selection; Growth; Modelos de regressão; Polimorfismo de nucleotídeo único; Regression models. |
Thesagro: |
Gado nelore. |
Thesaurus Nal: |
Feedlots; Marker-assisted selection; Models; Single nucleotide polymorphism. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/160256/1/g3.117.041442.full.pdf
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Marc: |
LEADER 02571naa a2200397 a 4500 001 2070097 005 2019-06-14 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1534/g3.117.041442$2DOI 100 1 $aSOMAVILLA, A. L. 245 $aGenome-enabled prediction of breeding values for feedlot average daily weight gain in nelore cattle.$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aNelore is the most economically important cattle breed in Brazil, and the use of genetically improved animals has contributed to increase beef production efficiency. The Brazilian beef feedlot industry has grown considerably in the last decade, so the selection of animals with higher growth rates on feedlot has become quite important. Genomic selection could be used to reduce generation intervals and improve the rate of genetic gains. The aim of this study was to evaluate the prediction of genomic estimated breeding values for average daily gain in 718 feedlot-finished Nelore steers. Analyses of three Bayesian model specifications (Bayesian GBLUP, BayesA, and BayesCπ) were performed with four genotype panels (Illumina BovineHD BeadChip, TagSNPs, GeneSeek High and Low-density indicus). Estimates of Pearson correlations, regression coefficients, and mean squared errors were used to assess accuracy and bias of predictions. Overall, the BayesCπ model resulted in less biased predictions. Accuracies ranged from 0.18 to 0.27, which are reasonable values given the heritability estimates (from 0.40 to 0.44) and sample size (568 animals in the training population). Furthermore, results from Bos taurus indicus panels were as informative as those from Illumina BovineHD, indicating that they could be used to implement genomic selection at lower costs. 650 $aFeedlots 650 $aMarker-assisted selection 650 $aModels 650 $aSingle nucleotide polymorphism 650 $aGado nelore 653 $aBayesian model 653 $aBos taurus indicus 653 $aFeedlot performance 653 $aGenomic selection 653 $aGrowth 653 $aModelos de regressão 653 $aPolimorfismo de nucleotídeo único 653 $aRegression models 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 700 1 $aROSA, G. J. M. 700 1 $aMOKRY, F. B. 700 1 $aMUDADU, M. de A. 700 1 $aTIZIOTO, P. C. 700 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. de 700 1 $aSOUZA, M. M. de 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aMUNARI, D. P. 773 $tG3: Genes, Genomes, Genetics$gv. 7, p. 1-17, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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61. | | ALEXANDRE, P. A.; GOMES, R. da C.; SANTANA, M. H. A.; SILVA, S. L.; LEMES, P. R.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; MEIRELLES, F. V.; FERRAZ, J. B. S.; FUKUMASU, H. Bovine NR1I3 gene polymorphisms and its association with feed efficiency traits in Nellore cattle. Meta Gene, v. 2, p. 206-217, dec. 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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62. | | CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; LANNA, D. P. D.; POLETI, M. D.; KOLTES, J. E.; REECY, J. M.; FRITZ-WATERS, E.; KRAMER, L.; GARRICK, D.; MUDADU, M. de A.; TULLIO, R. R.; COUTINHO, L. L. Expression quantitative trait loci (eQTL) hotspot regions from whole genome analysis of Nellore steers. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego. Anais... San Diego: PAG, 2016.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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63. | | SOMAVILLA, A. L.; REGITANO, L. C. de A.; ROSA, G. J. M.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M. de; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P. Genome-enabled prediction of breeding values for feedlot average daily weight gain in nelore cattle. G3: Genes, Genomes, Genetics, v. 7, p. 1-17, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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64. | | SOMAVILLA, A. L.; MOTA, M. D. S.; ALENCAR, M. M. de; ROSA, A. do N.; COUTINHO, L. L.; TULLIO, R. R.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide association study of weight gain in feedlot Nellore cattle: comparison of single nucleotide polymorphism and haplotype blocks approaches. In: ANNUAL MEETING BRAZILIAN SOCIETY OF ANIMAL SCIENCE, 50., 2013, Campinas. The integration of Knowledge in animal production - Abstracts. Campinas: SBZ, 2013. 1 CD-ROMTipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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65. | | BUSS, C. E.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MUDADU, M. de A.; CESAR, A. S. M.; VENTURA, R. V.; AFONSO, J.; LIMA, A. O. de; COUTINHO, L. L.; TULLIO, R. R.; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide efficient mixed-model study for meat quality in Nellore cattle. Journal of Animal Science, v. 94, e-suppl. 5; Journal of Dairy Science, v. 99, e-suppl. 1, p. 159, jul. 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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66. | | BUSS, C. E.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; MUDADU, M. de A.; CESAR, A. S. M.; VENTURA, R. V.; AFONSO, J.; LIMA, A. O. D.; COUTINHO, L. L.; TULLIO, R. R.; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide efficient mixed-model study for meat quality in Nellore cattle. Journal of Animal Science, v. 94, p. 428-429, 2016. Supplement 5. Na publicação: M. A. Mudadu.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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67. | | SOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. A genome-wide scan for selection signatures in Nellore cattle. Animal Genetics, v. 45, n. 6, p. 771-781, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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68. | | MORÉ, D. D.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; ZERLOTINI NETO, A.; GULIAS-GOMES, C. C.; IBELLI, A. M. G.; CATOIA, V.; CARDOSO, F. F.; REGITANO, L. C. de A. Genetics mechanisms of resistance and response to tick infestation in Hereford cattle: a global view. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Abstract... Guarujá:[ s.n.], 2013. AB.59.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
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69. | | MOKRY, F. B.; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B.; CARDOSO, F. F.; NICIURA, S. C. M. Descriptive analysis of haplotypes in a population of Canchim beef cattle. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Anais... Foz do Igauaçu: SBG, 2012. 1 CD-ROMTipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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70. | | MORÉ, D. D.; CARDOSO, F. F.; MUDADU, M. de A.; MALAGO JUNIOR, W.; GULIAS GOMES, C. C.; SOLLERO, B. P.; IBELLI, A. M. G.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Network analysis uncovers putative genes affecting resistance to tick infestation in Braford cattle skin. BMC Genomics, v. 20, n. 998, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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71. | | AZEVEDO, D. A. A. de; MONTEIRO, J. P.; PINHEIRO, R. R.; MUDADU, M. de A.; ANDRIOLI, A.; ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M. de; SIDER, L. H.; PEIXOTO, R. M.; TEIXEIRA, M. F. da S. Molecular characterization of circulating strains of small ruminant lentiviruses in Brazil based on complete gag and pol genes. Small Ruminant Research, v. 177, p. 160-166, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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72. | | DINIZ, M. R. V.; PAIVA, A. L. B.; GUERRA-DUARTE, C.; NISHIYAMA JÚNIOR, M. Y.; MUDADU, M. de A.; OLIVEIRA, U. de; BORGES, M. H.; YATES, J. R.; JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, I. de. An overview of Phoneutria nigriventer spider venom using combined transcriptomic and proteomic approaches. Plos One, v. 13, n. 8, p. 1-29, 2018. Artigo e0200628. Na publicação: Mauricio A. Mudadu.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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73. | | TIZIOTO, P. C.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; MUDADU, M. de A.; SOUZA, M. M.; MALAGO JUNIOR, W.; DONATONI, F. A. B.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; REGITANO, L. C. de A. MyoD1 expression levels affect meat tenderness in Nellore beef cattle. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: American Society of animal Science, 2014. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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74. | | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; GIGLIOTI, R.; MEIRELLHES, S. L. C.; COUTINHO, L. L.; BENVENUTI, C. L.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; VIEIRA, L. da S.; ZAROS, L. G.; CARRILHO, E.; REGITANO, L. C. de A. Single nucleotide polymorphisms in candidate genes associated with gastrointestinal nematode infection in goats. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 4, p. 8530-8436, Oct. 2014.Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
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75. | | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; GIGLIOTI, R.; MEIRELLHES, S. L. C.; COUTINHO, R.; BENVENUTI, C. L.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; VIEIRA, L. C.; ZAROS, L. G.; CARRILHO, E.; REGITANO, L. C. de A. Single nucleotide polymorphisms in candidate genes associated with gastrointestinal nematode infection in goats. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 4, p. 8530-8436, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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76. | | CHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; CARVALHEIRO, R.; BUZANSKAS, M. E.; ROSA, J. O.; MUDADU, M. de A.; SILVA, M. V. G. B.; MARCONDES, C. R.; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Strategies for genotype imputation in composite beef cattle BMC Genetics, v. 16, p. 99, 2015. 10 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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77. | | SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; ROCHA, M. I. P.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: a candidate for meat tenderness in cattle. Genetics and Molecular Research, v.15, n.3, aug. 2016. 15Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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78. | | SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; ROCHA, M. I. P.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; CARDOSO, T. F.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; ANDRADE, B. G. N.; MUDADU, M. de A.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Allele-specific expression is widespread in Bos indicus muscle and affects meat quality candidate genes. Scientific Reports, v. 10, n. 1, p. 1-11, 2020. Na publicação: Adhemar Zerlotini. Article number: 10204.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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79. | | LIMA, A. O. de; OLIVEIRA, P. S. N. de; TIZIOTO, P. C.; AFONSO, J.; SOMAVILLA, A. L.; DINIZ, W. J. da S.; SILVA, J. V. da; ROCHA, M. I. P.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Association analyses pointed the TIPARP as a potential candidate gene influencing residual feed intake variation in Nelore cattle. INTERNATIONAL MEETING OF ADVANCES IN ANIMAL SCIENCE, 1., 2016, Jaboticabal. Resumos... Jaboticabal: PPGZ Unesp, 2016. ref. 45135.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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80. | | TIZIOTO, P. C.; SOUZA, M. M. de; MUDADU, M. de A.; THOLON, P.; MEIRELLES, S. L. C.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; ROSA, A. do N.; MEDEIROS, S. R. de; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; REGITANO, L. C. de A. Association of KCNJ11 gene variants with tenderness in Nelore breed. In: CONFERENCE OF INTERNATIONAL SOCIETY FOR ANIMAL GENETICS, 33., 2012, Cairns, AU. Abstracts... Cairns: ISAG, 2012. p.109-110 P4046Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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