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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
23/01/2020 |
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Data da última atualização: |
20/04/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DEFANT, H.; MEIRA, A. N.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; POLETI, M. D.; MOREIRA, G. C. M.; PADUAN, M.; MARIANI, P.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; CESAR, A. S. M. |
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Afiliação: |
HELOISA DEFANT, Esalq/USP; ARIANA N. MEIRA, Esalq/USP; LUIZ L. COUTINHO, Esalq/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; MIRELE D. POLETI, USP; GABRIEL C. M. MOREIRA, Esalq/USP; MARCELA PADUAN, Esalq/USP; PILAR MARIANI, Esalq/USP; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; GERSON B. MOURÃO, Esalq/USP; ALINE S. M. CESAR, Esalq/USP. |
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Título: |
Novel polymorphisms in the PLIN2 gene of Nellore cattle. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 18, n. 3, 2019. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Na publicação: Luciana CA Regitano, Adhemar Zerlotini. gmr16039963. |
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Conteúdo: |
ABSTRACT. Genetic variations in genes involved in lipid storage, which also may interfere with important phenotypic traits such as intramuscular fat deposition in cattle, can represent useful markers in marker assisted selection programs. An important candidate gene is perilipin 2 (PLIN2) that plays a role in the capture of long chain fatty acids and in the formation and stabilization of lipid droplets in different tissues including muscle. As reported by our group, PLIN2 expression level was associated with trans-eQTL (expression quantitative loci distant of gene associated) at chr3: 87, 253, 086 in Nellore cattle, where animals with different genotypes showed different expression level of PLIN2 among the 193 animals and the co-expression analysis detected correlation with intramuscular fat, palmitoleic, oleic and linoleic acids. Then, the objective of this study was to identify and characterize polymorphisms present in the PLIN2 gene of Nellore cattle. To date, there is not much information on mutations in the PLIN2 gene in Bos indicus animals. A total of 134 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified in the genomic region of PLIN2 gene and five of those are novel with a moderate impact. These SNPs may change the protein effectiveness and, after further association studies and functional validation, could be used as genomic markers in animal breeding program. |
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Palavras-Chave: |
Biological process; Expressão gênica; Gordura intramuscular; Gota lipídica; Lipid droplet; Perilipin 2; PLIN2; Polimorfismo de nucleotídeo único; Processos biológicos; SNP; Variants. |
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Thesagro: |
Bos Indicus; Gado. |
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Thesaurus Nal: |
Cattle; Gene expression; Intramuscular fat; Nellore; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/209752/1/NovelPolymorphismsPLIN2.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 36 | |
| 2. |  | MOREIRA, G. C. M.; PÉRTILLE, F.; GODOY, T. F.; BRASSOLOTI, R.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Discovery of candidate genes for fatness in chickens based on genotyping with 600K SNP chip in a QTL region. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos? Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 64| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 3. | | TREVISOLI, P. A.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; PETRINI, J.; MOURÃO, G. B.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Single nucleotide polymorphism associated with breast trait in chickens. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 26., 2018, San Diego. Abstracts... [S.l. : s.n.], 2018. Paper 29820. Organizers: Sébastien Praud and Kellye Eversole. PAG XXVI.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 4. | | MOREIRA, G. C. M.; CESAR, A. S. M.; GODOY, T. F.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GARRICK, D. J.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L. Genome-wide association studies reveal genomic windows and candidate genes related to fat deposition in chickens. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Pôster P0647.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 5. | | GODOY, T. F.; SILVA, V. H. da; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; CROOIJAMANS, R. P.; GROENEN, M. A. M.; COUTINHO, L. L. Inherited CNVs in regions related to breast muscle development in a broiler population. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 26., 2018, San Diego. Abstracts... [S.l. : s.n.], 2018. Paper 29816. Organizers: Sébastien Praud and Kellye Eversole. PAG XXVI.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 6. | | KAPPELER, B. I. G.; REGITANO, L. C. de A.; POLETI, M. D.; CESAR, A. S. M.; MOREIRA, G. C. M.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L. MiRNAs differentially expressed in skeletal muscle of animals with divergent estimated breeding values for beef tenderness. Molecular Biology, v. 20, n. 1, p. 2-11, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 7. | | GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; SILVA, V. H.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L. Identification of CNVs on the genome of Brazilian chicken lines. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Pôster P0646.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 8. | | MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GASPARIN, G.; ANDRADE, S. C. da S.; PADUAN, M.; COUTINHO, L. L. Identification of mutations in a QTL region on chromosome 3 associated with fatness in chickens. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Programme and abstract book... [S.l.: s.n.], 2013. p. 38. ISAFG 2013. AB.31| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 9. | | GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GASPARIN, G.; ANDRADE, S. C. da S.; PADUAN, M.; COUTINHO, L. L. Identification of polymorphisms in a QTL region on chicken chromosome 2 associated with muscle deposition. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Programme and abstract book... [S.l.: s.n.], 2013. p. 39. ISAFG 2013.AB.32| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 10. | | MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; BOSCHIERO, C.; GHEYAS, A. A.; GASPARIN, G.; PADUAN, M.; ANDRADE, S. C. S.; MONTENEGRO, H.; BURT, D. W.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Discovery of SNPs potentially associated with fatness in a QTL region on chicken chromosome 3. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: WCGALP: American Society of Animal Science, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 11. | | MOREIRA, G. C. M.; POLETI, M. D.; PÉRTILLE, F.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; GODOY, T. F.; LEDUR, M. C.; REECY, J. M.; GARRICK, D. J.; COUTINHO, L. L. Unraveling genomic associations with feed efficiency and body weight traits in chickens through an integrative approach. BMC Genetics, v. 20, n. 83, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 12. | | MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; BOSCHIERO, C.; GHEYAS, A. A.; GASPARIN, G.; ANDRADE, S. C. S.; PADUAN, M.; MONTENEGRO, H.; BURT, D. W.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Variant discovery in a QTL region on chromosome 3 associated with fatness in chickens. Animal Genetic, v. 46, n. 2, p. 141-147, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 14. | | MARCHESI, J. A. P.; ONO, R. K.; CANTAO, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P.; LEDUR, M. C. Exploring the genetic architecture of feed efficiency traits in chickens. Scientific Reports, v. 11, n. 4622, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 15. | | MOREIRA, G. C. M.; SALVIAN, M.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; REECY, J. M.; GODOY, T. F.; LEDUR, M. C.; GARRICK, D.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L. Genome-wide association scan for QTL and their positional candidate genes associated with internal organ traits in chickens. BMC Genomics, v. 20, n. 669, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 16. | | ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; SOLLERO, B. P.; SUREK, D.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Genome-wide association study for femur-related traits in broilers. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland, New Zealand. Proceedings... Massey University, 2018. Digital Archive.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 19. | | BOSCHIERO, C.; MOREIRA, G. C. M.; GHEYAS, A.; GODOY, T. F.; GASPARIN, G.; MARIANI, P. D. S. C.; PADUAN, M.; CESAR, A. S. M.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Genome-wide characterization of genetic variants and putative regions under selection in meat and egg-type chicken lines. BMC Genomics, v. 19, n. 83, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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