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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
08/03/2023 |
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Data da última atualização: |
08/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CORTEZ, T.; MONTENEGRO, H.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; ANDRADE, S. C. S. |
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Afiliação: |
THAINÁ CORTEZ, Universidade de São Paulo; HORÁCIO MONTENEGRO, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo; LUIZ L. COUTINHO, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; SÔNIA C. S. ANDRADE, Universidade de São Paulo. |
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Título: |
Molecular evolution and signatures of selective pressures on Bos, focusing on the Nelore breed (Bos indicus). |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 17, n. 12, e0279091, 2022. |
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Páginas: |
19 p. |
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DOI: |
10.1371/journal.pone.0279091 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Evolutionary history leads to genome changes over time, especially for species that have experienced intense selective pressures over a short period. Here, we investigated the genomic evolution of Bos species by searching for potential selection signatures, focusing on Nelore, an economically relevant cattle breed in Brazil. We assessed the genomic processes determining the molecular evolution across Nelore and thirteen other related taxa by evaluating (i) amino acid sequence conservation, (ii) the dN/dS ratio, and (iii) gene families? turnover rate (lambda. Low conserved regions potentially associated with fatty acid metabolism seem to reflect differences in meat fat content in taxa with different evolutionary histories. All Bos species presented genes under positive selection, especially B. indicus and Nelore, which include transport protein cobalamin, glycolipid metabolism, and hormone signaling. These findings could be explained by constant selective pressures to obtain higher immune resistance and efficient metabolism. The gene contraction rate across the Nelore + B. indicus branch was almost nine times higher than that in other lineages (lambda = 0.01043 vs. 0.00121), indicating gene losses during the domestication process. Amino acid biosynthesis, reproductive and innate immune system-related pathways were associated with genes recognized within the most frequent rapidly evolving gene families and in genes under positive selection, supporting the substantial relevance of such traits from a domestication perspective. Our data provide new insights into how the genome may respond to intense artificial selection in distinct taxa, and reinforces the presence of selective pressures on traits potentially relevant for future animal breeding investments. MenosEvolutionary history leads to genome changes over time, especially for species that have experienced intense selective pressures over a short period. Here, we investigated the genomic evolution of Bos species by searching for potential selection signatures, focusing on Nelore, an economically relevant cattle breed in Brazil. We assessed the genomic processes determining the molecular evolution across Nelore and thirteen other related taxa by evaluating (i) amino acid sequence conservation, (ii) the dN/dS ratio, and (iii) gene families? turnover rate (lambda. Low conserved regions potentially associated with fatty acid metabolism seem to reflect differences in meat fat content in taxa with different evolutionary histories. All Bos species presented genes under positive selection, especially B. indicus and Nelore, which include transport protein cobalamin, glycolipid metabolism, and hormone signaling. These findings could be explained by constant selective pressures to obtain higher immune resistance and efficient metabolism. The gene contraction rate across the Nelore + B. indicus branch was almost nine times higher than that in other lineages (lambda = 0.01043 vs. 0.00121), indicating gene losses during the domestication process. Amino acid biosynthesis, reproductive and innate immune system-related pathways were associated with genes recognized within the most frequent rapidly evolving gene families and in genes under positive selection, supporting the substantial relevance... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Amino acid biosynthesis; Genomic evolution of Bos species; Intense artificial selection in distinct taxa. |
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Thesagro: |
Gado Nelore. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1152197/1/MolecularEvolutionSignatures.pdf
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Marc: |
LEADER 02560naa a2200241 a 4500
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520 $aEvolutionary history leads to genome changes over time, especially for species that have experienced intense selective pressures over a short period. Here, we investigated the genomic evolution of Bos species by searching for potential selection signatures, focusing on Nelore, an economically relevant cattle breed in Brazil. We assessed the genomic processes determining the molecular evolution across Nelore and thirteen other related taxa by evaluating (i) amino acid sequence conservation, (ii) the dN/dS ratio, and (iii) gene families? turnover rate (lambda. Low conserved regions potentially associated with fatty acid metabolism seem to reflect differences in meat fat content in taxa with different evolutionary histories. All Bos species presented genes under positive selection, especially B. indicus and Nelore, which include transport protein cobalamin, glycolipid metabolism, and hormone signaling. These findings could be explained by constant selective pressures to obtain higher immune resistance and efficient metabolism. The gene contraction rate across the Nelore + B. indicus branch was almost nine times higher than that in other lineages (lambda = 0.01043 vs. 0.00121), indicating gene losses during the domestication process. Amino acid biosynthesis, reproductive and innate immune system-related pathways were associated with genes recognized within the most frequent rapidly evolving gene families and in genes under positive selection, supporting the substantial relevance of such traits from a domestication perspective. Our data provide new insights into how the genome may respond to intense artificial selection in distinct taxa, and reinforces the presence of selective pressures on traits potentially relevant for future animal breeding investments.
650 $aGado Nelore
653 $aAmino acid biosynthesis
653 $aGenomic evolution of Bos species
653 $aIntense artificial selection in distinct taxa
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
12/12/2018 |
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Data da última atualização: |
12/12/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 2 |
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Autoria: |
LEAO, N. V. M.; SHIMIZU, E. S. C.; FELIPE, S. H. S.; BENCHIMOL, R. L.; NASCIMENTO, M. R. S. M. do. |
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Afiliação: |
NOEMI VIANNA MARTINS LEAO, CPATU; ELIZABETH SANTOS CORDEIRO SHIMIZU, CPATU; Sérgio Heitor Sousa Felipe, DOUTORANDO UFV; RUTH LINDA BENCHIMOL, CPATU; Maria Ruth Socorro Melo do Nascimento, GRADUANDA UFRA. |
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Título: |
Morfometria, germinação e sanidade de sementes de tachi-peludo. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Enciclopédia Biosfera, v. 15, n. 27, p. 142-154, 2018. |
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DOI: |
10.18677/EnciBio_2018A60 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O sucesso dos projetos de recuperação ambiental depende da qualidade fisiológica e sanitária das sementes. Nesse sentido, pesquisas sobre o manejo e a tecnologia de sementes contribuem diretamente para a produção de mudas. O objetivo deste estudo foi avaliar a morfometria, germinação e sanidade de sementes de Tachigali guianensis. A morfometria das sementes foi realizada mensurando-se comprimento, largura e espessura de 100 sementes. O teste de germinação foi realizado em delineamento inteiramente ao acaso, constando de duas temperaturas (25 e 30 °C) e quatro repetições de 25 sementes. A presença de fungos foi monitorada durante os ensaios. As sementes apresentaram dimensões médias e coeficiente de variação igual a 10,69 mm e 10,50%; 5,70 mm e 17,26%; e 1,57 mm e 15,33% para comprimento, largura e espessura, respectivamente. As sementes sob 25 e 30 °C apresentaram média de germinação igual a 85 e 88%, respectivamente, o tempo médio foi 4,57 e 4,07, respectivamente, e o índice de velocidade de germinação foi 4,95 e 5,53, respectivamente. Foram detectados os gêneros de fungos Lasiodiplodia, Penicillium e Aspergillus associados às sementes e plântulas. Os dados evidenciam que há elevada variação morfométrica para os parâmetros largura e espessura das sementes; a temperatura de 30 °C aumenta a velocidade de germinação das sementes; e as sementes de T. guianensis devem ser tratadas fitossanitariamente para evitar danos durante a germinação e formação das plântulas. |
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Palavras-Chave: |
Tachigali guianensis. |
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Thesagro: |
Biometria; Patologia de Semente; Semente Florestal. |
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Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/188277/1/BSTRA.pdf
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Marc: |
LEADER 02217naa a2200229 a 4500
001 2101345
005 2018-12-12
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100 1 $aLEAO, N. V. M.
245 $aMorfometria, germinação e sanidade de sementes de tachi-peludo.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aO sucesso dos projetos de recuperação ambiental depende da qualidade fisiológica e sanitária das sementes. Nesse sentido, pesquisas sobre o manejo e a tecnologia de sementes contribuem diretamente para a produção de mudas. O objetivo deste estudo foi avaliar a morfometria, germinação e sanidade de sementes de Tachigali guianensis. A morfometria das sementes foi realizada mensurando-se comprimento, largura e espessura de 100 sementes. O teste de germinação foi realizado em delineamento inteiramente ao acaso, constando de duas temperaturas (25 e 30 °C) e quatro repetições de 25 sementes. A presença de fungos foi monitorada durante os ensaios. As sementes apresentaram dimensões médias e coeficiente de variação igual a 10,69 mm e 10,50%; 5,70 mm e 17,26%; e 1,57 mm e 15,33% para comprimento, largura e espessura, respectivamente. As sementes sob 25 e 30 °C apresentaram média de germinação igual a 85 e 88%, respectivamente, o tempo médio foi 4,57 e 4,07, respectivamente, e o índice de velocidade de germinação foi 4,95 e 5,53, respectivamente. Foram detectados os gêneros de fungos Lasiodiplodia, Penicillium e Aspergillus associados às sementes e plântulas. Os dados evidenciam que há elevada variação morfométrica para os parâmetros largura e espessura das sementes; a temperatura de 30 °C aumenta a velocidade de germinação das sementes; e as sementes de T. guianensis devem ser tratadas fitossanitariamente para evitar danos durante a germinação e formação das plântulas.
650 $aBiometria
650 $aPatologia de Semente
650 $aSemente Florestal
653 $aTachigali guianensis
700 1 $aSHIMIZU, E. S. C.
700 1 $aFELIPE, S. H. S.
700 1 $aBENCHIMOL, R. L.
700 1 $aNASCIMENTO, M. R. S. M. do
773 $tEnciclopédia Biosfera$gv. 15, n. 27, p. 142-154, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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