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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
12/05/2020 |
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Data da última atualização: |
02/06/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BRITO, F. S. D.; SANTOS, J. R. P.; AZEVEDO, V. C. R.; PEIXOUTO, Y. S.; OLIVEIRA, S. A. S. de; FERREIRA, C. F.; HADDAD, F.; AMORIM, E. P.; FRAAIJE, B.; MILLER, R. N. G. |
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Afiliação: |
FABIANE S. D. BRITO; JANSEN R. P. SANTOS; VÂNIA C. R. AZEVEDO; YSLAI S. PEIXOUTO; SAULO ALVES SANTOS DE OLIVEIRA, CNPMF; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; FERNANDO HADDAD, CNPMF; EDSON PERITO AMORIM, CNPMF; BART FRAAIJE; ROBERT N. G. MILLER. |
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Título: |
Genetic Diversity and Azole fungicide sensitivity in pseudocercospora musae field populations in Brazil. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Microbiology, v, 11, n.99, 2020. |
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ISSN: |
1664-302X |
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DOI: |
10.3389/fmicb.2020.00099 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Pseudocercospora musae, causal agent of Sigatoka leaf spot, or yellow Sigatoka disease, is considered a major pathogen of banana (Musa spp.). Widely disseminated in Brazil, this study explored the genetic diversity in field populations of the pathogen from production areas in the Distrito Federal and the States of Bahia, Minas Gerais, and Rio Grande do Norte. Resistance to demethylation inhibitor (DMI) fungicides was also examined. For 162 isolates from 10 banana growing regions, analysis of mating type idiomorph frequency was conducted, together with estimation of genetic diversity at 15 microsatellite loci. A total of 149 haplotypes were identified across the examined populations, with an average genetic diversity of 4.06. In general, populations displayed 1:1 proportions of idiomorphs MAT1-1 and MAT1-2, providing evidence for sexual recombination. Multilocus linkage disequilibrium also indicated asexual reproduction contributing to the genetic structure of certain populations. AMOVA revealed that 86.3% of the genetic differentiation of the pathogen occurred among isolates within populations. Discriminant Analysis of Principal Components (DAPC) identified six most probable genetic groups, with no population structure associated with geographic origin or collection site. Although genetic similarity was observed among certain populations from different states, data revealed increasing genetic differentiation with increasing geographic distance, as validated by Mantel?s test (r = 0.19, P < 0.001). On the basis of DMI fungicide sensitivity testing and CYP51 gene sequence polymorphism, isolates from the Distrito Federal separated into two main groups, one with generally higher EC50 values against eight DMI fungicides. A clear phenotype-to-genotype relationship was observed for isolates carrying the CYP51 alteration Y461N. Conventionally adopted fungicides for control of Sigatoka leaf spot are likely to be overcome by combined sexual and asexual reproduction mechanisms in P. musae driving genetic variability. Continued analysis of pathogen genetic diversity and monitoring of DMI sensitivity profiles of Brazilian field populations is essential for the development of integrated control strategies based on host resistance breeding and rational design of fungicide regimes. MenosPseudocercospora musae, causal agent of Sigatoka leaf spot, or yellow Sigatoka disease, is considered a major pathogen of banana (Musa spp.). Widely disseminated in Brazil, this study explored the genetic diversity in field populations of the pathogen from production areas in the Distrito Federal and the States of Bahia, Minas Gerais, and Rio Grande do Norte. Resistance to demethylation inhibitor (DMI) fungicides was also examined. For 162 isolates from 10 banana growing regions, analysis of mating type idiomorph frequency was conducted, together with estimation of genetic diversity at 15 microsatellite loci. A total of 149 haplotypes were identified across the examined populations, with an average genetic diversity of 4.06. In general, populations displayed 1:1 proportions of idiomorphs MAT1-1 and MAT1-2, providing evidence for sexual recombination. Multilocus linkage disequilibrium also indicated asexual reproduction contributing to the genetic structure of certain populations. AMOVA revealed that 86.3% of the genetic differentiation of the pathogen occurred among isolates within populations. Discriminant Analysis of Principal Components (DAPC) identified six most probable genetic groups, with no population structure associated with geographic origin or collection site. Although genetic similarity was observed among certain populations from different states, data revealed increasing genetic differentiation with increasing geographic distance, as validated by Mantel?s test ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Banana; Sigatoka Negra. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aPseudocercospora musae, causal agent of Sigatoka leaf spot, or yellow Sigatoka disease, is considered a major pathogen of banana (Musa spp.). Widely disseminated in Brazil, this study explored the genetic diversity in field populations of the pathogen from production areas in the Distrito Federal and the States of Bahia, Minas Gerais, and Rio Grande do Norte. Resistance to demethylation inhibitor (DMI) fungicides was also examined. For 162 isolates from 10 banana growing regions, analysis of mating type idiomorph frequency was conducted, together with estimation of genetic diversity at 15 microsatellite loci. A total of 149 haplotypes were identified across the examined populations, with an average genetic diversity of 4.06. In general, populations displayed 1:1 proportions of idiomorphs MAT1-1 and MAT1-2, providing evidence for sexual recombination. Multilocus linkage disequilibrium also indicated asexual reproduction contributing to the genetic structure of certain populations. AMOVA revealed that 86.3% of the genetic differentiation of the pathogen occurred among isolates within populations. Discriminant Analysis of Principal Components (DAPC) identified six most probable genetic groups, with no population structure associated with geographic origin or collection site. Although genetic similarity was observed among certain populations from different states, data revealed increasing genetic differentiation with increasing geographic distance, as validated by Mantel?s test (r = 0.19, P < 0.001). On the basis of DMI fungicide sensitivity testing and CYP51 gene sequence polymorphism, isolates from the Distrito Federal separated into two main groups, one with generally higher EC50 values against eight DMI fungicides. A clear phenotype-to-genotype relationship was observed for isolates carrying the CYP51 alteration Y461N. Conventionally adopted fungicides for control of Sigatoka leaf spot are likely to be overcome by combined sexual and asexual reproduction mechanisms in P. musae driving genetic variability. Continued analysis of pathogen genetic diversity and monitoring of DMI sensitivity profiles of Brazilian field populations is essential for the development of integrated control strategies based on host resistance breeding and rational design of fungicide regimes.
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700 1 $aMILLER, R. N. G.
773 $tFrontiers in Microbiology, v, 11$gn.99, 2020.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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| Registros recuperados : 88 | |
| 41. |  | MARTINS, A. C. Q.; MORGANTE, C. V.; FARIAS, M. P.; SILVA, A. K.; SILVA, S. K. L.; GALHARDO, I. C.; BRASILEIRO, A. C. M.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; BERTIOLI, D. J.; MILLER, R. N. G.; GUIMARAES, P. M. Análise massal do transcritoma de amendoim silvestre (Arachis stenosperma) inoculado com Passalora personata, o agente c ausal da mancha preta. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICOLOGIA, 6., 2010, Brasília, DF. Anais. São Paulo: Sociedade Brasileira de Micologia, 2010. Resumo R493.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 42. | | MARTINS, A. C. Q.; MORGANTE, C. V.; FARIAS, M. P.; SILVA, A. K.; SILVA, S. K. L.; GALHARDO, I. C.; BRASILEIRO, A. C. M.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; BERTIOLI, D. J.; MILLER, R. N. G.; GUIMARAES, P. M. Análise massal do transcritoma de amendoim silvestre (Arachis stenosperma) inoculado com Passalora personata: mancha preta. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. Resumo 013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 43. | | NETO, C. B. S.; GOMES, T. G.; ARAÚJO, A. P.; SOUZA, A. de; MIDORIKAWA, G. E. O.; ALVES, G. S. C.; SIQUEIRA, F. G. de; MILLER, R. N. G. Análise transcriptômica de genes de macrofungos durante a destoxificação em torta de caroço de algodão. IN: V SIMPÓSIO DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOLOGIA MOLECULAR, 5., Brasília, DF. [Anais...] Brasília: UnB, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 44. | | PIFFANELLI, P.; CIAMPI, A.; RUIZ, M.; SILVA, F. R. da; LESCOT, M.; PAPAS, G.; RONNING, C.; HAAS, B.; WORTMAN, J.; FRISON, E.; ROUX, N.; MILLER, R. N. G.; COTE, F.; D'HONT, A.; SOUZA, M.; GLASZMANN, J. C.; TOWN, C. Analysis of the Musa genome from BAC sequencing and its comparison with rice. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 13., 2005, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2005. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 45. | | MILLER, R. N. G.; BERTIOLI, D. J.; BAURENS, F. C.; SANTOS, C. M. R.; ALVES, P. C.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; PAPPAS JÚNIOR, G. J. Analysis of non-TIR NBS-LRR resistance gene analogs in Musa acuminata Colla: isolation, RFLP marker development, and physical mapping. BMC Plant Biology, v.8, p.15, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 46. | | BRITO NETTO, M. S.; LIMA, W. G.; CORREIA, K. C.; SILVA, C. de F. B. da; THON, M.; MARTINS, R. B.; MILLER, R. N. G.; MICHEREFF, S. J.; CÂMARA, M. P. S. Analysis of phylogeny, distribution, and pathogenicity of Botryosphaeriaceae species associated with gummosis of Anacardium in Brazil, with a new species of Lasiodiplodia. Fungal Biology, v. 121, n. 4, p. 437-451, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 47. | | ANJOS, R. A.; BATISTA, D. S.; PASSOS, M. A. N.; LERIA, H. M. B.; BERTIOLI, D. J.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R. da; MARTINS, N. F.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; MILLER, R. N. G. Analysis of resistance gene analog in Musa acuminata cv Calcutta 4. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 50., 2004, Costão do Santinho, Florianópolis. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2004. não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 48. | | ANJOS, R. A.; BATISTA, D. S.; PASSOS, M. A. N.; LERIA, H. M. B.; BERTIOLI, D. J.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R.; MARTINS, N. F.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; MILLER, R. N. G. Analysis of resistance gene analogs in Musa acuminata cv Calcutta 4. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 50., 2004, Costão do Santinho, Florianópolis. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2004. p. 1200.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 49. | | MILLER, R. N. G; ALVES, P. C. S.; SANTOS, C. M. R.; COELHO, M. C. F.; SILVA, F. R. da; MARTINS, N. F.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; BERTIOLI, D. J. Analysis of resistance gene analogs in Musa acuminata VAR. Calcutta 4, An. In: ENCONTRO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE MELHORAMENTO DE PLANTAS REGIONAL DF, 1., 2005, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 92. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 144).| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 50. | | MIDORIKAWA, G. E. O.; CORREA, C. L.; NORONHA, E. F.; FERREIRA FILHO, E. X.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G. Analysis of the transcriptome in Aspergillus tamarii during enzymatic degradation of sugarcane bagasse. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, v 6, article 123, 2018. Na publicação: Orzenil Bonfim Silva-Junior.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 51. | | MIDORIKAWA, G. E. O.; PINHEIRO, M. R. R.; VIDIGAL, B. S.; ARRUDA, M. C.; COSTA, F. F.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; RIBEIRO, S. G.; FREIRE, F.; MILLER, R. N. G. Characterization of Aspergillus flavus strains from Brazilian Brazil nuts and cashew by RAPD and ribosomal DNA anlysis. Letters in Applied Microbiology, 47, p. 12-18, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 52. | | MILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; MENEZES, N. N. P.; SOUZA JUNIOR, M. T.; COSTA, M. M. do C.; AZEVEDO, V. C. R.; AMORIM, E. P.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; CIAMPI, A. Y. Characterization of novel microsatellite markers in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4. BMC Research Notes, v.3, n.148, 2010. Disponível em:.Acesso em: 16 ago. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 53. | | MILLER, R. N. G.; PASSOS, M. A. N.; MENEZES, N. N. P.; SOUZA JUNIOR, M. T.; COSTA, M. M. do C.; AZEVEDO, V. C. R.; AMORIM, E. P.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; CIAMPI, A. Y. Characterization of novel microsatellite markers in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4. BMC Research Notes, v. 3, p. 148-153, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 54. | | SOARES NETO, C. B.; CONCEIÇÃO, A. A.; GOMES, T. G.; RIBEIRO, J. A. de A.; CAMPANHA, R. B.; BARROSO, P. A. V.; MACHADO, A. E. V.; MENDONCA, S.; SIQUEIRA, F. G. de; MILLER, R. N. G. A Comparison of Physical, Chemical, Biological and Combined Treatments for Detoxifcation of Free Gossypol in Crushed Whole Cottonseed. Waste and Biomass Valorization, v. 12, p. 3965-3975, 2021. PDF: il. color.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Territorial. |
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| 55. | | SOARES NETO, C. B.; CONCEIÇÃO, A. A.; GOMES, T. G.; RIBEIRO, J. A. de A.; CAMPANHA, R. B.; BARROSO, P. A. V.; MACHADO, A. E. V.; MENDONCA, S.; SIQUEIRA, F. G. de; MILLER, R. N. G. A Comparison of Physical, Chemical, Biological and Combined Treatments for Detoxification of Free Gossypol in Crushed Whole Cottonseed. Waste and Biomass Valorization, nov. 2020. On-line first. Data Availability: Sequences enabling molecular identification were deposited in GenBank (https://www.ncbi.nlm.nih.gov) under accession numbers MK603977, MK603978, MK603976, MK603979 and MK603975.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 56. | | GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; FREITAS, L. D. de; ANTONINO, J. D.; RANCUREL, C.; COSTA, M. M. do C.; GROSSI-DE-SA, M. F.; MILLER, R. N. G.; BRASILEIRO, A. C. M.; GUIMARAES, P. M.; DANCHIN, E. G. J. Comparative genomics reveals novel target genes towards specific control of plant-parasitic nematodes. Genes, v. 11, 1347, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 57. | | CARMO, L. S. T.; MARTINS, A. C. Q.; MARTINS, C. C. C.; PASSOS, M. A. S.; SILVA, L. P. da; ARAUJO, A. C. G. de; BRASILEIRO, A. C. M.; MILLER, R. N. G.; GUIMARAES, P. M.; REIS, A. M. dos. Comparative proteomics and gene expression analysis in Arachis duranensis reveal stress response proteins associated to drought tolerance. Journal of Proteomics, v. 192, p. 299-310, 2019. Na publicação: Luciano P. Silva, Ana C.G. Araujo, Angela Mehta.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 58. | | BRITO, F. S. D.; SANTOS, J. R. P.; AZEVEDO, V. C. R.; PEIXOUTO, Y. S.; OLIVEIRA, S. A. S. de; FERREIRA, C. F.; HADDAD, F.; AMORIM, E. P.; FRAAIJE, B.; MILLER, R. N. G. Genetic Diversity and Azole fungicide sensitivity in pseudocercospora musae field populations in Brazil. Frontiers in Microbiology, v, 11, n.99, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 59. | | CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G. Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. Annals of Botany, v. 119, p. 915-930, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 60. | | PASSOS, M. A. N.; MENEZES, N. N. P.; EMEDIATO, F. L.; VILARINHOS, A. D.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; MILLER, R. N. G.; CIAMPI, A. Y. Caracterização de marcadores microsatélites derivados de sequências de BAC e EST em Musa acuminata. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. P. 275.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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