|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Hortaliças. Para informações adicionais entre em contato com cnph.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças. |
Data corrente: |
05/02/2024 |
Data da última atualização: |
05/02/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
DUARTE, M. F.; ANDRADE, I. A. de; SILVA, J. M. F.; MELO, F. L. de; MACHADO, A. M.; INOUE-NAGATA, A. K.; NAGATA, T. |
Afiliação: |
MACÁRIA FERREIRA DUARTE, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; IKARO ALVES DE ANDRADE, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; JOÃO MARCOS FAGUNDES SILVA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; FERNANDO LUCAS DE MELO, UNIVERSIDADE DE BRASILIA; ANA MARIA MACHADO, COMPANHIA DE SANEAMENTO AMBIENTAL DO DF; ALICE KAZUKO INOUE NAGATA, CNPH; TATSUYA NAGATA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
Título: |
Metagenomic analyses of plant virus sequences in sewage water for plant viruses monitoring. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, v. 48, p. 408-416, 2023. |
DOI: |
10.1007/s40858-023-00575-8 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Frequent monitoring of emerging viruses of agricultural crops is one of the most important missions for plant virologists. A fast and precise identifcation of potential harmful viruses may prevent the occurrence of serious epidemics. Nowadays, highthroughput sequencing (HTS) technologies became an accessible and powerful tool for this purpose. The major discussion of this strategy resides in the process of sample collection, which is usually laborious, costly and nonrepresentative. In this study, we assessed the use of sewage water samples for monitoring the widespread, numerous, and stable plant viruses using HTS analysis and RT-qPCR. Plant viruses belonged to 12 virus families were found, from which Virgaviridae, Solemoviridae, Tymoviridae, Alphafexiviridae, Betafexiviridae, losteroviridae and Secoviridae were the most abundant ones with more than 20 species. Additionally, we detected one quarantine virus in Brazil and a new tobamovirus species. To assess the importance of the processed foods as virus release origins to sewage, we selected two viruses, the tobamovirus pepper mild mottle virus (PMMoV) and the carlavirus garlic common latent virus (GarCLV), to detect in processed food materials by RT-qPCR. PMMoV was detected in large amount in pepper-based processed foods and in sewage samples, while GarCLV was less frequent in dried and fresh garlic samples, and in the sewage samples. This suggested a high correlation of virus abundance in sewage and processed food sources. The potential use of sewage for a virus survey is discussed in this study. MenosFrequent monitoring of emerging viruses of agricultural crops is one of the most important missions for plant virologists. A fast and precise identifcation of potential harmful viruses may prevent the occurrence of serious epidemics. Nowadays, highthroughput sequencing (HTS) technologies became an accessible and powerful tool for this purpose. The major discussion of this strategy resides in the process of sample collection, which is usually laborious, costly and nonrepresentative. In this study, we assessed the use of sewage water samples for monitoring the widespread, numerous, and stable plant viruses using HTS analysis and RT-qPCR. Plant viruses belonged to 12 virus families were found, from which Virgaviridae, Solemoviridae, Tymoviridae, Alphafexiviridae, Betafexiviridae, losteroviridae and Secoviridae were the most abundant ones with more than 20 species. Additionally, we detected one quarantine virus in Brazil and a new tobamovirus species. To assess the importance of the processed foods as virus release origins to sewage, we selected two viruses, the tobamovirus pepper mild mottle virus (PMMoV) and the carlavirus garlic common latent virus (GarCLV), to detect in processed food materials by RT-qPCR. PMMoV was detected in large amount in pepper-based processed foods and in sewage samples, while GarCLV was less frequent in dried and fresh garlic samples, and in the sewage samples. This suggested a high correlation of virus abundance in sewage and processed food sources.... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
High-throughput sequencing. |
Thesagro: |
Vírus. |
Thesaurus Nal: |
Wastewater. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
Marc: |
LEADER 02294naa a2200241 a 4500 001 2161643 005 2024-02-05 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1007/s40858-023-00575-8$2DOI 100 1 $aDUARTE, M. F. 245 $aMetagenomic analyses of plant virus sequences in sewage water for plant viruses monitoring.$h[electronic resource] 260 $c2023 520 $aFrequent monitoring of emerging viruses of agricultural crops is one of the most important missions for plant virologists. A fast and precise identifcation of potential harmful viruses may prevent the occurrence of serious epidemics. Nowadays, highthroughput sequencing (HTS) technologies became an accessible and powerful tool for this purpose. The major discussion of this strategy resides in the process of sample collection, which is usually laborious, costly and nonrepresentative. In this study, we assessed the use of sewage water samples for monitoring the widespread, numerous, and stable plant viruses using HTS analysis and RT-qPCR. Plant viruses belonged to 12 virus families were found, from which Virgaviridae, Solemoviridae, Tymoviridae, Alphafexiviridae, Betafexiviridae, losteroviridae and Secoviridae were the most abundant ones with more than 20 species. Additionally, we detected one quarantine virus in Brazil and a new tobamovirus species. To assess the importance of the processed foods as virus release origins to sewage, we selected two viruses, the tobamovirus pepper mild mottle virus (PMMoV) and the carlavirus garlic common latent virus (GarCLV), to detect in processed food materials by RT-qPCR. PMMoV was detected in large amount in pepper-based processed foods and in sewage samples, while GarCLV was less frequent in dried and fresh garlic samples, and in the sewage samples. This suggested a high correlation of virus abundance in sewage and processed food sources. The potential use of sewage for a virus survey is discussed in this study. 650 $aWastewater 650 $aVírus 653 $aHigh-throughput sequencing 700 1 $aANDRADE, I. A. de 700 1 $aSILVA, J. M. F. 700 1 $aMELO, F. L. de 700 1 $aMACHADO, A. M. 700 1 $aINOUE-NAGATA, A. K. 700 1 $aNAGATA, T. 773 $tTropical Plant Pathology$gv. 48, p. 408-416, 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Hortaliças (CNPH) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 236 | |
221. | | MORAIS, J. P. S.; MEDEIROS, E. P. de; SILVA, J. A. da; ROSA, M. de F.; SOUZA FILHO, M. de S. M. de; ALEXANDRE, L. C.; CASSALES, A. R.; SANTOS, M. A. Valorização de coprodutos da cadeia do dendê. Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2013. 37 p. (Embrapa Agroindústria Tropical. Documentos, 163).Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
| |
222. | | SOARES, R. L.; OLIVEIRA, J. S. de; SANTOS, E. M.; ARAUJO, G. G. L. de; SANTOS, F. N. de S.; GOMES, P. G. B.; JUSTINO, E. da S.; PEREIRA, D. M.; CAVALCANTI, H. S.; LEITE, G. M.; TORRES JÚNIOR, P. da C.; SANTOS, M. A. C.; VIANA, N. B. Corn grain rehydration methods: water vs. cactus pear in the diet for feedlot lambs. Small Ruminant Research, v. 230, 107151, Jan. 2024.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
223. | | COSTA, M. B.; SANTOS, M. A.; ALENCAR, R. S. de; COZZOLINO, A. C. R.; ROCHA, C. F. D. da; BERGALLO, H. de G.; ALVES, M. A. dos S.; SLUYS, M. V.; UZEDA, M. C.; FIDALGO, E. C. C.; COSTA, T. C. e C. da. Conservação da biodiversidade da Mata Atlântica, no Estado do Rio de Janeiro: condições atuais e propostas de estratégias e ações. Revista da Economia Fluminense, Niterói, v. 4, n. 7, p. 22-23, jun. 2008.Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
224. | | COSTA, M. B.; SANTOS, M. A.; ALENCAR, R. S. de; COZZOLINO, A. C. R.; ROCHA, C. F. D.; BERGALLO, H. G.; ALVES, M. A. S.; VAN SLUYS, M.; UZEDA, M. C.; FIDALGO, E. C. C.; COSTA, T. C. e C. da. Conservação da biodiversidade da Mata Atlântica, no estado do Rio de Janeiro: condições atuais e propostas de estratégias e ações. Revista de Economia Fluminense, Niterói, ano 4, n. 7, p. 22-25, jun. 2008.Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
| |
225. | | BERGALLO, H. de G.; UZEDA, M. C.; FIDALGO, E. C. C.; ALVES, M. A. S.; ROCHA, C. F. D.; VAN SLUYS, M.; COSTA, T. C. e C. da; COSTA, M. B.; SANTOS, M. A.; COZZOLINO, A. C. R.; ALENCAR, R. S. de. Conservação da biodiversidade da Mata Atlântica no estado do Rio de Janeiro: uma nova abordagem. In: BERGALLO, H. de G.; FIDALGO, E. C. C.; ROCHA, C. F. D.; UZEDA, M. C.; COSTA, M. B.; ALVES, M. A. S.; VAN SLUYS, M.; SANTOS, M. A.; COSTA, T. C. e C. da; COZZOLINO, A. C. R. (org.). Estratégias e ações para a conservação da biodiversidade no estado do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro: Instituto Biomas, 2009. cap. 1, p. 23-32.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Solos. |
| |
226. | | MARIANO, G. H.; SÁ, L. G. G. de; SILVA, E. M. C. da; SANTOS, M. A.; CARDOZO FILHO, J. L.; LIRA, B. O. V.; BARBOSA, E. A.; ARAUJO, A. R.; LEITE, J. R. S. A.; RAMADA, M. H. S.; BLOCH JUNIOR, C.; OLIVEIRA, A. L.; CHAKER, J. A.; BRAND, G. D. Characterization of novel human intragenic antimicrobial peptides, incorporation and release studies from ureasil-polyether hybrid matrix. Materials Science & Engineering C, v. 119, 111581, 2021. Na publicação: C. Bloch Jr.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
227. | | CARRÉRA, A. G. P.; AGUIAR, R. O.; CUNHA, R. L.; OLIVEIRA, I. V. de; BERNARDINO, P. D. L. da; SILVA, C. R. da; CARVALHO, F. I. M.; OLIVEIRA NETO, C. F. de; SANTOS, M. A. S. dos; OLIVEIRA, J. T. de; SILVA, P. A.; CUNHA, E. F. M. Characterization of sweet and bitter cassava (Manihot esculenta Crantz) genotypes through multivariate analysis. Australian Journal of Crop Science, v. 15, n. 10, p. 1269-1278, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
228. | | SOARES, B. C.; LOURENÇO JÚNIOR, J. de B.; SANTOS, M. A. S. dos; SENA, A. L. dos S.; RODRIGUES FILHO, J. A.; SANTANA, A. C. de S.; HOMMA, A. K. O.; SILVA, A. G. M. e; ANDRADE, S. J. T. de. Caracterização da cadeia produtiva da pecuária leiteira em Rondon do Pará, Pará, Brasil. Nucleus Animalium, v. 11, n. 1, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
229. | | BRAND, G. D.; RAMADA, M. H. S.; MANICKCHAND, J. R.; CORREA, R.; RIBEIRO, D. J. S.; SANTOS, M. A.; VASCONCELOS, A. G.; ABRÃO, F. Y.; PRATES, M. V.; MURAD, A. M.; CARDOZO FILHO, J. L.; LEITE, R. S. A.; MAGALHÃES, K. G.; OLIVEIRA, A. L.; BLOCH JUNIOR, C. Intragenic antimicrobial peptides (IAPs) from human proteins with potent antimicrobial and anti-inflammatory activity. PLoS ONE, v.14, n. 8, article e0220656, 2019. Na publicação: José L. Cardozo Fh, Carlos Bloch, Jr.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
230. | | MOURA, J. C. de; LISBOA, M. A. N.; GONÇALVES, B. L. M.; CRUZ, G. V.; BARRETO, E. S. S. T.; PINHO, A, I.; SANTOS, M. A. F. dos; CORDEIRO, L. da S.; MENDONÇA, A. C. A. M.; SILVA, M. A. P. da; BARROS, L. M.; SILVA, T. I. da; ROCHA, L. S. G.; DRUMOND, M. A.; CALIXTO JÚNIOR, J. T. Influence of soil type and rocky outcrops on the species distribution in a woody plant community at brazilian Semiarid. Journal of Agricultural Science, v. 12, n. 5, p, 155-166, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
231. | | OLIVEIRA, M. A. S.; NUNES, T.; SANTOS, M. A. dos; GOMES, D. F.; COSTA, I.; VAN-LUME, B.; SILVA, S. S. M. da; OLIVEIRA, R. S.; SIMON, M. F.; LIMA, G. S. A.; GISSI, D. S.; ALMEIDA, C. C. de S.; SOUZA, G.; MARQUES, A. High-throughput genomic data reveal complex phylogenetic relationships in stylosanthes Sw (Leguminosae). Frontiers in Genetics, v. 12, 727314, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
232. | | MARTINS, M. do P. S. C.; OLIVEIRA, A. S. da S. S.; MARTINS, M. do C. de C. e; CARVALHO, V. B. L. de; RODRIGUES, L. A. R. L.; ARCANJO, D. D. R.; SANTOS, M. A. P. dos; MACHADO, J. S. R.; ROCHA, M. de M. Effects of zinc supplementation on glycemic control and oxidative stress in experimental diabetes: A systematic review. Clinical Nutrition ESPEN, v. 51, p. 28-36, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
233. | | FREITAS, T. V. de; KARMAKAR, U.; VASCONCELOS, A. G.; SANTOS, M. A.; LIRA, B. O. do V.; COSTA, S. R.; BARBOSA, E. A.; CARDOZO FILHO, J.; CORREA, R.; RIBEIRO, D. J. S.; PRATES, M. V.; MAGALHÃES, K. G.; RAMADA, M. H. S.; LEITE, J. R. de S. A.; BLOCH JUNIOR, C.; OLIVEIRA, A. L. de; VENDRELL, M.; BRAND, G. D. Release of immunomodulatory peptides at bacterial membrane interfaces as a novel strategy to fight microorganisms. Journal of Biological Chemistry, v. 299, n. 4, 2023. 103056. Na publicação: José Cardozo-Fh; Carlos Bloch Jr.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
234. | | SOBRAL, G. de C.; OLIVEIRA, J. S. de; SANTOS, E. M.; ARAUJO, G. G. L. de; SANTOS, F. N. de S.; CAMPOS. F. S.; CAVALCANTI, H. S.; VIEIRA, D. de S.; LEITE, G. M.; COELHO, D. F. O.; SANTANA, L. P.; GOMES, P. G. B.; TORRES JÚNIOR, P. da C.; SANTOS, M. A. C.; VIANA, N. B. Optimizing silage quality in drylands: corn stover and forage cactus mixture on nutritive value, microbial activity, and aerobic stability. Journal of Arid Environments, v. 220, 105123, 2024.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
235. | | SANTOS, M. A.; SILVA, F. L.; LIRA, B. O. V.; CARDOZO FILHO, J. L.; VASCONCELOS, A. G.; ARAUJO, A. R.; MURAD, A. M.; GARAY, A. V.; FREITAS, S. M.; LEITE, J. R. S. A.; BLOCH JUNIOR, C.; RAMADA, M. H. S.; OLIVEIRA, A. L. de; BRAND, G. D. Probing human proteins for short encrypted antimicrobial peptides reveals Hs10, a peptide with selective activity for gram-negative bacteria. Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, v. 1867, 2023. 130265. Na publicação: José L. Cardozo Fh; Carlos Bloch Jr.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
236. | | CARVALHO, L. C. de S. A.; FREITAS, M. C. de; SILVA, A. S.; BIASOTO, A. C. T.; MARTINS, M. do C. de C. e; MOURA, R. C. de; BRITO. A K. da S.; SILVA, A. S. V. e; RIBEIRO, S. L. G.; ROSSI, F. E.; SANTOS, M. A. P. dos. Syzygium cumini nectar supplementation reduced biomarkers of oxidative stress, muscle damage, and improved psychological response in highly trained young handball players. Frontiers in Physiology, v. 9, oct. 2018. Article 1508Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
Registros recuperados : 236 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|