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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
09/01/2018 |
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Data da última atualização: |
10/01/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. |
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Afiliação: |
Fernanda de Araújo Carneiro, UFLA; Pierre Marraccini, Cirad UMR DAP Montpellier-França; ORZENIL BONFIM DA SILVA JUNIOR, Cenargen; DARIO GRATTAPAGLIA, Cenargen; ALAN CARVALHO ANDRADE, SAPC. |
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Título: |
Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UFLA, 26., 2017, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2017. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A produção mundial de café é altamente afetada pelas mudanças climáticas, consequentemente, obter plantas adaptadas a este cenário de clima alterado torna-se muito importante. Com os recentes avanços na genômica do cafeeiro, como o sequenciamento do genoma de C. canephora, o objetivo deste trabalho foi desenvolver e validar o chip de genotipagem de DNA para C. canephora (26K Axiom SNP array), visando uma plataforma de genotipagem confiável e de alto rendimento, a ser utilizada nos programas de melhoramento da espécie. A construção do chip foi feita utilizando-se dados gerados a partir do resequenciamento genômico de pools formados por indivíduos dos diferentes grupos de diversidade encontrados na espécie e por indivíduos de C. canephora Conilon, pertencentes aos principais programas de melhoramento no Brasil. Este painel de resequenciamento foi escolhido visando cobrir a maior parte da diversidade genética presente na espécie estudada. |
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Palavras-Chave: |
Genotipagem; Melhoramento genético; SNP array. |
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Thesagro: |
Coffea canephora; DNA; Gene; Genoma. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/170689/1/Desenvolvimento-e-validacao-do-chip-de-genotipagem-26K-Axiom-SNP.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
06/11/2020 |
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Data da última atualização: |
06/11/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
LEMOS, M. P. L.; SARAIVA, M. M. S.; LEITE, E. L.; SILVA, N. M. V.; VASCONCELOS, P. C.; GIACHETTO, P. F.; FREITAS NETO, O. C.; GIVISIEZ, P. E. N.; GEBREYES, W. A.; OLIVEIRA, C. J. B. |
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Afiliação: |
MATEUS P. L. LEMOS, CCA/UFPB; MAURO M. S. SARAIVA, CCA/UFPB; ELMA L. LEITE, CCA/UFPB; NÚBIA M. V. SILVA, CCA/UFPB; PRISCYLLA C. VASCONCELOS, CCA/UFPB; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; OLIVEIRO C. FREITAS NETO, UFMG; PATRÍCIA E. N. GIVISIEZ, CCA/UFPB; WONDWOSSEN A. GEBREYES, The Ohio State University, Columbus; CELSO J. B. OLIVEIRA, CCA/UFPB, The Ohio State University, Columbus. |
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Título: |
The posthatch prophylactic use of ceftiofur affects the cecalmicrobiota similar to the dietary sanguinarine supplementationin broilers. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Poultry Science, v. 99, n. 11, p. 6013-6021, Nov. 2020. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.psj.2020.06.078 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract. The prophylactic administration of ceftiofur to newly hatched chicks is a common practice in some hatcheries worldwide to mitigate early gastrointestinal infections caused by Enterobacteriaceae. In spite of the crucial role of the gut microbiome for the broiler's health, there is still limited information on how the microbial composition is affected by such procedure. We investigated the effects of posthatch prophylactic application of ceftiofur on the cecal microbiota of 14-day-old broilers fed regular or sanguinarine-supplemented diets. DNA samples were extracted from cecal contents, amplified for the V3-V4 regions of the microbial 16S rRNA gene, and sequenced in a high-throughput sequencing platform (Illumina MiSeq). After downstream bioinformatics and statistical analyses, our results demonstrated that both ceftiofur and sanguinarine treatments similarly increased the proportions of the phylum Bacteroidetes and the genera Bacteroides and Megamonas, whereas reduced the relative abundances of Firmicutes and Lachnospiraceae in the ceca of the birds. Such changes are probably associated with increased carbohydrate fermentation processes favoring the production of short-chain fatty acids. This was also corroborated by the functional prediction findings, which suggest an increase in some metabolic pathways associated with digestibility in broilers receiving ceftiofur. Considering that antimicrobial stewardship in animal production systems is strongly needed to mitigate the threat of antimicrobial resistance, our findings show that supplementation with a phytogenic feed additive can lead to a similar microbial composition in the ceca of commercial broiler chickens, suggesting that the use of alternative products could lead to functional modifications without increasing pressure for antimicrobial resistance. MenosAbstract. The prophylactic administration of ceftiofur to newly hatched chicks is a common practice in some hatcheries worldwide to mitigate early gastrointestinal infections caused by Enterobacteriaceae. In spite of the crucial role of the gut microbiome for the broiler's health, there is still limited information on how the microbial composition is affected by such procedure. We investigated the effects of posthatch prophylactic application of ceftiofur on the cecal microbiota of 14-day-old broilers fed regular or sanguinarine-supplemented diets. DNA samples were extracted from cecal contents, amplified for the V3-V4 regions of the microbial 16S rRNA gene, and sequenced in a high-throughput sequencing platform (Illumina MiSeq). After downstream bioinformatics and statistical analyses, our results demonstrated that both ceftiofur and sanguinarine treatments similarly increased the proportions of the phylum Bacteroidetes and the genera Bacteroides and Megamonas, whereas reduced the relative abundances of Firmicutes and Lachnospiraceae in the ceca of the birds. Such changes are probably associated with increased carbohydrate fermentation processes favoring the production of short-chain fatty acids. This was also corroborated by the functional prediction findings, which suggest an increase in some metabolic pathways associated with digestibility in broilers receiving ceftiofur. Considering that antimicrobial stewardship in animal production systems is strongly needed to mitiga... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
16S rRNA; Aplicação profilática pós-parto; Bioinformática; Broiler; Cecal microbiota. |
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Thesagro: |
Análise Estatística; Frango; Frango de Corte. |
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Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; Broiler chickens; Ceftiofur; Sanguinarine; Statistical analysis. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/217539/1/AP-Posthatch-prophylactic-2020.pdf
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Marc: |
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520 $aAbstract. The prophylactic administration of ceftiofur to newly hatched chicks is a common practice in some hatcheries worldwide to mitigate early gastrointestinal infections caused by Enterobacteriaceae. In spite of the crucial role of the gut microbiome for the broiler's health, there is still limited information on how the microbial composition is affected by such procedure. We investigated the effects of posthatch prophylactic application of ceftiofur on the cecal microbiota of 14-day-old broilers fed regular or sanguinarine-supplemented diets. DNA samples were extracted from cecal contents, amplified for the V3-V4 regions of the microbial 16S rRNA gene, and sequenced in a high-throughput sequencing platform (Illumina MiSeq). After downstream bioinformatics and statistical analyses, our results demonstrated that both ceftiofur and sanguinarine treatments similarly increased the proportions of the phylum Bacteroidetes and the genera Bacteroides and Megamonas, whereas reduced the relative abundances of Firmicutes and Lachnospiraceae in the ceca of the birds. Such changes are probably associated with increased carbohydrate fermentation processes favoring the production of short-chain fatty acids. This was also corroborated by the functional prediction findings, which suggest an increase in some metabolic pathways associated with digestibility in broilers receiving ceftiofur. Considering that antimicrobial stewardship in animal production systems is strongly needed to mitigate the threat of antimicrobial resistance, our findings show that supplementation with a phytogenic feed additive can lead to a similar microbial composition in the ceca of commercial broiler chickens, suggesting that the use of alternative products could lead to functional modifications without increasing pressure for antimicrobial resistance.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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